See download stats for:     Bioconductor annotation packages     Bioconductor experiment packages     Bioconductor workflow packages    

Download stats for Bioconductor software packages

Data as of Sun. 18 Oct 2026.

The number reported next to each package name is the download score, that is, the average number of distinct IPs that "hit" the package each month for the last 12 months (not counting the current month).

Top 75

1 BiocVersion (76878) 26 BiocFileCache (29516) 51 assorthead (18833)
2 BiocGenerics (74251) 27 clusterProfiler (28950) 52 preprocessCore (18543)
3 S4Vectors (73092) 28 fgsea (28701) 53 BiocSingular (18201)
4 IRanges (67938) 29 Rhdf5lib (28360) 54 ScaledMatrix (17275)
5 Biobase (63656) 30 DOSE (28334) 55 cigarillo (15982)
6 XVector (63110) 31 Rhtslib (27697) 56 BiocNeighbors (15949)
7 BiocParallel (60687) 32 qvalue (27324) 57 GEOquery (15498)
8 SparseArray (58388) 33 rhdf5 (27152) 58 AnnotationHub (15331)
9 Biostrings (57909) 34 GOSemSim (27094) 59 genefilter (15109)
10 DelayedArray (56450) 35 GenomicAlignments (26582) 60 BiocBaseUtils (14954)
11 GenomicRanges (56129) 36 UCSC.utils (26272) 61 h5mread (14612)
12 SummarizedExperiment (52639) 37 rhdf5filters (25865) 62 BSgenome (14320)
13 S4Arrays (52407) 38 rtracklayer (25599) 63 impute (14255)
14 MatrixGenerics (52047) 39 graph (25374) 64 multtest (14174)
15 AnnotationDbi (47367) 40 biomaRt (24672) 65 scuttle (13590)
16 KEGGREST (45537) 41 SingleCellExperiment (23697) 66 GSEABase (13107)
17 limma (44655) 42 ComplexHeatmap (23566) 67 ProtGenerics (13028)
18 Seqinfo (44467) 43 BiocIO (22644) 68 AnnotationFilter (12742)
19 GenomeInfoDb (40177) 44 annotate (22185) 69 dir.expiry (12538)
20 ggtree (34055) 45 beachmat (21591) 70 GSVA (12445)
21 DESeq2 (31845) 46 zlibbioc (21591) 71 scater (11874)
22 treeio (31557) 47 sparseMatrixStats (20951) 72 Rgraphviz (11049)
23 edgeR (31065) 48 HDF5Array (19802) 73 ensembldb (10971)
24 Rsamtools (30396) 49 DelayedMatrixStats (19524) 74 ExperimentHub (10831)
25 enrichplot (29749) 50 GenomicFeatures (19163) 75 sva (10785)

All software packages

All software package stats in one file:  bioc_pkg_stats.tab

All software download scores in one file:  bioc_pkg_scores.tab

See Download stats for Bioconductor software repository (all packages combined)

A

a4 (761)

a4Base (823)

a4Classif (687)

a4Core (700)

a4Preproc (844)

a4Reporting (559)

ABAEnrichment (240)

ABarray (809)

abseqR (632)

ABSSeq (775)

acde (793)

ACE (679)

aCGH (1105)

ACME (1010)

ADaCGH2 (801)

ADAM (585)

ADAMgui (544)

ADAPT (219)

adaptest (83)

adductomicsR (409)

ADImpute (625)

adSplit (873)

adverSCarial (426)

Aerith (354)

AffiXcan (653)

affxparser (3098)

affy (10216)

affycomp (1009)

AffyCompatible (356)

affyContam (719)

affycoretools (1206)

affydata (29)

AffyExpress (315)

affyILM (723)

affyio (10300)

affylmGUI (966)

affyPara (340)

affypdnn (298)

affyPLM (2191)

affyQCReport (299)

AffyRNADegradation (629)

AffyTiling (176)

AGDEX (699)

aggregateBioVar (654)

Agi4x44PreProcess (125)

agilp (530)

AgiMicroRna (893)

AHMassBank (410)

AIMS (1076)

airpart (564)

alabaster (428)

alabaster.base (5659)

alabaster.bumpy (424)

alabaster.files (436)

alabaster.mae (444)

alabaster.matrix (5380)

alabaster.ranges (5300)

alabaster.sce (1701)

alabaster.schemas (5165)

alabaster.se (5281)

alabaster.sfe (238)

alabaster.spatial (486)

alabaster.string (443)

alabaster.vcf (444)

ALDEx2 (2311)

alevinQC (721)

AllelicImbalance (884)

AlphaBeta (591)

AlphaMissenseR (504)

alpine (322)

ALPS (86)

AlpsNMR (717)

alsace (187)

altcdfenvs (911)

AMARETTO (699)

AMOUNTAIN (595)

amplican (927)

ampliQueso (195)

AnalysisPageServer (126)

anamiR (109)

anansi (445)

Anaquin (576)

ANCOMBC (2783)

AneuFinder (475)

ANF (571)

anglemania (507)

animalcules (795)

annaffy (984)

AnnBuilder (78)

anndataR (1511)

annmap (688)

annoLinker (342)

annotate (22185)

AnnotationDbi (47367)

AnnotationFilter (12742)

AnnotationForge (2918)

AnnotationFuncs (234)

AnnotationHub (15331)

AnnotationHubData (1330)

annotationTools (771)

annotatr (1337)

anota (694)

anota2seq (701)

antiProfiles (526)

AnVIL (1203)

AnVILAz (386)

AnVILBase (876)

AnVILBilling (466)

AnVILGCP (420)

AnVILPublish (454)

AnVILVRS (92)

AnVILWorkflow (279)

APAlyzer (536)

apComplex (824)

apeglm (7160)

APL (577)

applera (47)

appreci8R (705)

aroma.light (2333)

ArrayExpress (1030)

ArrayExpressHTS (234)

arrayMagic (142)

arrayMvout (851)

arrayQCplot (34)

arrayQuality (745)

arrayQualityMetrics (1150)

ArrayTools (332)

ArrayTV (256)

ARRmNormalization (559)

artMS (599)

ASAFE (442)

ASEB (537)

ASGSCA (589)

ASICS (779)

asmn (45)

ASpediaFI (165)

ASpli (924)

AssessORF (704)

ASSET (647)

ASSIGN (770)

assorthead (18833)

ASURAT (644)

asuri (358)

ATACCoGAPS (119)

atacInferCnv (285)

ATACseqQC (984)

ATACseqTFEA (628)

atena (595)

AtlasRDF (89)

atSNP (665)

attract (968)

AUCell (4433)

augere.core (109)

augere.de (115)

augere.gsea (118)

augere.screen (93)

augere.solo (123)

autonomics (698)

Autotuner (82)

AWAggregator (331)

AWFisher (558)

awst (519)

B

BaalChIP (622)

BAC (311)

bacon (782)

BADER (555)

BadRegionFinder (664)

BAGS (506)

ballgown (1883)

bambu (927)

BamScale (118)

bamsignals (2023)

BANDITS (634)

bandle (645)

Banksy (1042)

banocc (452)

barbieQ (468)

barcodetrackR (234)

barmixR (78)

basecallQC (462)

BaseSpaceR (647)

Basic4Cseq (737)

BASiCS (994)

BASiCStan (477)

BasicSTARRseq (579)

basilisk (5456)

basilisk.utils (3393)

batchCorr (386)

BatChef (257)

batchelor (5560)

BatchQC (662)

BatchSVG (404)

Battlefield (356)

BayesKnockdown (515)

BayesPeak (255)

BayesSpace (1134)

bayNorm (643)

baySeq (1167)

BBCAnalyzer (777)

BCRANK (924)

bcSeq (471)

BDMMAcorrect (185)

beachmat (21591)

beachmat.hdf5 (580)

beachmat.tiledb (278)

beadarray (1511)

beadarraySNP (447)

BeadDataPackR (1065)

BeadExplorer (39)

BEARscc (238)

BEAT (870)

BEclear (602)

bedbaser (403)

beer (423)

benchdamic (653)

BenchHub (123)

BERT (402)

betaHMM (501)

betr (206)

betterChromVAR (284)

bettr (468)

BG2 (417)

bgafun (273)

BgeeCall (764)

BgeeDB (667)

BGmix (285)

bgx (531)

BHC (293)

BicARE (787)

BiFET (531)

BiGGR (323)

bigmelon (742)

bigmemoryExtras (155)

bigPint (213)

bim (41)

BindingSiteFinder (666)

bioassayR (676)

Biobase (63656)

biobroom (755)

biobtreeR (433)

Bioc.gff (366)

bioCancer (842)

BioCartaImage (445)

BiocAzul (266)

BiocBaseUtils (14954)

BiocBook (459)

BiocBuildReporter (280)

BiocCaseStudies (335)

BiocCheck (3141)

biocDatasets (31)

BiocDockerManager (113)

BiocDuckDB (8)

BiocFHIR (527)

BiocFileCache (29516)

BiocGenerics (74251)

biocGraph (855)

BiocHail (299)

BiocHubsShiny (479)

BiocInstaller (304)

BiocIO (22644)

BiocMaintainerApp (269)

biocmake (6688)

BiocNeighbors (15949)

BiocOncoTK (353)

BioCor (690)

BiocParallel (60687)

BiocPkgDash (296)

BiocPkgTools (834)

biocroxytest (361)

BiocSet (792)

BiocSingular (18201)

BiocSklearn (532)

BiocStyle (8533)

biocthis (1073)

BiocVersion (76878)

biocViews (5834)

BiocWorkflowTools (622)

biodb (669)

biodbChebi (267)

biodbExpasy (112)

biodbHmdb (183)

biodbKegg (151)

biodbLipidmaps (118)

biodbMirbase (89)

biodbNcbi (172)

biodbNci (166)

biodbUniprot (169)

bioDist (837)

BioGA (377)

biomaRt (24672)

BioMedR (44)

biomformat (7699)

BioMM (190)

BioMVCClass (703)

biomvRCNS (749)

BioNAR (572)

BioNERO (766)

BioNet (1074)

BioNetStat (224)

BioPlex (45)

BioQC (830)

BioSeqClass (289)

biosigner (675)

Biostrings (57909)

biosvd (195)

BioTIP (685)

biotmle (647)

biovizBase (6517)

BiRewire (519)

birta (231)

birte (151)

biscuiteer (795)

BiSeq (872)

BitSeq (425)

blacksheepr (658)

blase (490)

blima (698)

BLMA (732)

BloodGen3Module (519)

bluster (10255)

bnbc (773)

bnem (605)

BOBaFIT (545)

borealis (524)

BPRMeth (463)

BRAIN (839)

brainflowprobes (204)

brainImageR (43)

BrainSABER (125)

BrainStars (226)

branchpointer (777)

breakpointR (665)

BreastSubtypeR (506)

brendaDb (565)

BREW3R.r (468)

BRGenomics (336)

bridge (334)

BridgeDbR (711)

broadSeq (464)

BrowserViz (650)

BrowserVizDemo (46)

BSgenome (14320)

BSgenomeForge (581)

bsseq (2478)

BubbleTree (397)

BufferedMatrix (611)

BufferedMatrixMethods (584)

bugsigdbr (702)

BulkSignalR (606)

BUMHMM (653)

bumphunter (3911)

BumpyMatrix (1183)

BUS (698)

BUScorrect (664)

BUSpaRse (795)

BUSseq (600)

C

CaDrA (440)

CAEN (448)

CAFE (984)

CAGEfightR (889)

cageminer (572)

CAGEr (918)

CALIB (304)

CalibraCurve (379)

calm (398)

CAMERA (1348)

CAMTHC (94)

CaMutQC (505)

canceR (612)

cancerclass (950)

CancerInSilico (205)

CancerMutationAnalysis (299)

CancerSubtypes (308)

CAnD (209)

caOmicsV (281)

cardelino (617)

Cardinal (1157)

CardinalIO (634)

CARDspa (558)

carnation (280)

CARNIVAL (647)

casper (744)

CATALYST (1094)

Category (2193)

categoryCompare (906)

CatsCradle (483)

CausalR (578)

cbaf (611)

CBEA (168)

cBioPortalData (1138)

CBN2Path (320)

CBNplot (559)

cbpManager (552)

CCAFE (485)

ccfindR (501)

ccImpute (520)

ccmap (293)

CCPlotR (489)

CCPROMISE (597)

ccrepe (528)

CDI (530)

celaref (734)

celda (2010)

CellaRepertorium (207)

CellBarcode (641)

cellbaseR (665)

CellBench (767)

cellGrowth (200)

cellHTS (321)

cellHTS2 (610)

CelliD (583)

cellity (690)

CellMapper (609)

CellMentor (317)

cellmig (443)

cellmigRation (486)

CellMixS (825)

cellNexus (83)

CellNOptR (855)

cellscape (439)

CellScore (293)

CellTrails (706)

cellTree (299)

cellxgenedp (501)

CEMiTool (772)

censcyt (539)

Cepo (694)

ceRNAnetsim (466)

CeTF (722)

CexoR (832)

CFAssay (464)

cfdnakit (556)

cfDNAPro (644)

cfTools (268)

CGEN (564)

CGHbase (1125)

CGHcall (1070)

cghMCR (764)

CGHnormaliter (732)

CGHregions (706)

CGRphylo2 (95)

ChAMP (1447)

CHARGE (84)

charm (282)

ChemmineOB (877)

ChemmineR (1649)

CHETAH (658)

chevreulPlot (359)

chevreulProcess (472)

chevreulShiny (491)

ChIC (140)

Chicago (709)

chihaya (614)

chimera (327)

chimeraviz (857)

ChIPanalyser (722)

ChIPComp (554)

chipenrich (815)

ChIPexoQual (759)

ChIPpeakAnno (1689)

ChIPQC (1018)

ChIPseeker (3660)

chipseq (1403)

ChIPseqR (877)

ChIPSeqSpike (126)

ChIPsim (805)

ChIPXpress (586)

chopsticks (696)

chroGPS (280)

Chromatograms (414)

chromDraw (560)

ChromHeatMap (786)

ChromoViz (83)

chromPlot (726)

ChromSCape (770)

chromstaR (485)

chromswitch (242)

chromVAR (2025)

CHRONOS (581)

cicero (948)

cigarillo (15982)

CIMICE (506)

CINdex (358)

circRNAprofiler (788)

CircSeqAlignTk (457)

cisPath (272)

CiteFuse (691)

CLAMP (124)

ClassifyR (1015)

cleanUpdTSeq (968)

CleanUpRNAseq (525)

cleaver (877)

clevRvis (457)

clippda (747)

clipper (929)

cliProfiler (554)

cliqueMS (571)

Clomial (541)

Clonality (290)

ClonalSim (305)

clonotypeR (211)

clst (635)

clstutils (648)

CluMSID (586)

ClustAll (461)

clustComp (564)

clusterExperiment (970)

ClusterFoldSimilarity (457)

ClusterGVis (420)

ClusterJudge (599)

clusterProfiler (28950)

clusterSeq (625)

ClusterSignificance (580)

clusterStab (723)

clustifyr (792)

ClustIRR (484)

clustSIGNAL (435)

CMA (857)

cmapR (1085)

cn.farms (878)

cn.mops (1070)

CNAnorm (637)

CNEr (2496)

CNORdt (550)

CNORfeeder (766)

CNORfuzzy (692)

CNORode (627)

CNPBayes (173)

CNTools (736)

CNVfilteR (642)

CNVgears (143)

cnvGSA (642)

CNViz (461)

CNVMetrics (573)

CNVPanelizer (695)

CNVRanger (701)

CNVrd2 (807)

CNVtools (190)

cobindR (237)

CoCiteStats (626)

COCOA (778)

codelink (1037)

CODEX (804)

coexnet (188)

CoGAPS (804)

cogena (850)

cogeqc (603)

Cogito (498)

coGPS (644)

COHCAP (255)

cola (904)

comapr (514)

combi (582)

coMET (373)

coMethDMR (618)

compartmap (281)

COMPASS (623)

compcodeR (922)

CompensAID (321)

compEpiTools (856)

CompGO (217)

ComplexHeatmap (23566)

CompoundDb (992)

ComPrAn (426)

compSPOT (377)

CONCERTDR (8)

conclus (102)

concordexR (523)

condcomp (34)

condiments (663)

CONFESS (743)

consensus (531)

ConsensusClusterPlus (3808)

consensusDE (371)

consensusOV (743)

consensusSeekeR (707)

consICA (569)

CONSTANd (504)

contiBAIT (417)

conumee (799)

convert (813)

copa (698)

COPDSexualDimorphism (47)

copynumber (485)

CopyNumber450k (104)

CopyNumberPlots (673)

CopywriteR (310)

Coralysis (427)

coRdon (845)

CoRegFlux (79)

CoRegNet (349)

CoreGx (1026)

Cormotif (658)

CorMut (160)

coRNAi (177)

CorNetto (6)

corral (599)

CORREP (299)

coseq (766)

CoSIA (494)

cosmiq (640)

cosmo (141)

cosmoGUI (85)

cosmosR (579)

COSNet (571)

COTAN (567)

CountClust (191)

countsimQC (873)

covEB (559)

CoverageView (707)

covRNA (612)

CPSM (445)

cpvSNP (757)

cqn (928)

CrcBiomeScreen (302)

CRImage (932)

CRISPRball (438)

crisprBase (661)

crisprBowtie (588)

crisprBwa (403)

crisprDesign (687)

crisprScore (688)

CRISPRseek (786)

crisprseekplus (249)

crisprShiny (442)

CrispRVariants (895)

crisprVerse (473)

crisprViz (642)

crlmm (1227)

CrossICC (56)

crossmeta (364)

crumblr (430)

crupR (482)

CSAR (740)

csaw (1326)

csdR (426)

CSOA (375)

CSSP (224)

CSSQ (633)

ctc (822)

CTdata (581)

CTDquerier (811)

ctdR (0)

CTexploreR (557)

ctgGEM (107)

cTRAP (760)

ctsGE (636)

CTSV (465)

cummeRbund (658)

CuratedAtlasQueryR (366)

customCMPdb (527)

customProDB (660)

CVE (127)

cyanoFilter (572)

cycle (691)

cydar (754)

cypress (494)

CySA (14)

CytoDx (500)

cytofast (89)

cytofkit (148)

CyTOFpower (499)

cytofQC (475)

CytoGLMM (504)

cytoKernel (534)

cytolib (3643)

cytomapper (1007)

CytoMDS (501)

cytoMEM (519)

CytoML (1404)

CytoPipeline (562)

CytoPipelineGUI (448)

CytoTree (96)

cytoviewer (579)

D

dada2 (3900)

dagLogo (913)

daMA (751)

DAMEfinder (753)

damidBind (405)

DaMiRseq (850)

Damsel (500)

dandelionR (363)

DAPAR (803)

DaparToolshed (100)

dar (493)

DART (731)

DASC (18)

DASiR (112)

dasper (134)

DAssemble (77)

DAVIDQuery (124)

daVis (120)

DBChIP (267)

dbSequence (83)

dcanr (769)

DCATS (456)

dce (263)

dcGSA (474)

DChIPRep (219)

ddCt (792)

ddgraph (159)

ddPCRclust (597)

dearseq (647)

debCAM (322)

debrowser (758)

decemedip (346)

DECIPHER (4603)

deco (210)

DEComplexDisease (198)

decompTumor2Sig (616)

DeconRNASeq (686)

decontam (2805)

decontX (1039)

DeconvoBuddies (510)

deconvR (668)

decoupleR (3357)

DEDS (351)

DeeDeeExperiment (482)

DeepBlueR (278)

DeepPINCS (483)

deepSNV (1047)

DeepTarget (446)

DEFormats (863)

DegCre (484)

DegNorm (659)

DEGraph (520)

DEGreport (1270)

DEGseq (855)

DelayedArray (56450)

DelayedDataFrame (623)

DelayedMatrixStats (19524)

DelayedRandomArray (483)

DelayedTensor (552)

DELocal (508)

deltaCaptureC (534)

deltaGseg (572)

DeMAND (435)

DeMixT (702)

demuxmix (532)

demuxSNP (537)

DenoIST (337)

densvis (1058)

DEP (1037)

DepecheR (598)

DepInfeR (505)

DeProViR (44)

DEqMS (901)

derfinder (1351)

derfinderHelper (1058)

derfinderPlot (908)

DEScan2 (806)

DESeq (726)

DESeq2 (31845)

DEsingle (663)

DESpace (705)

destiny (1822)

DEsubs (770)

DEWSeq (697)

DExMA (565)

DEXSeq (2563)

dexus (250)

DFP (720)

DFplyr (440)

DIAlignR (181)

DiffBind (2193)

diffcoexp (554)

diffcyt (1016)

DifferentialRegulation (553)

diffGeneAnalysis (524)

diffHic (962)

DiffLogo (586)

diffloop (324)

diffuStats (590)

diffUTR (617)

diggit (582)

Dino (581)

dinoR (476)

dir.expiry (12538)

Director (190)

DirichletMultinomial (6146)

discordant (608)

DiscoRhythm (677)

distinct (707)

dittoSeq (1759)

divergence (543)

dks (510)

DMCFB (625)

DMCHMM (631)

dmGsea (451)

DMRcaller (870)

DMRcate (1707)

DMRforPairs (326)

DMRScan (775)

dmrseq (992)

DNABarcodeCompatibility (452)

DNABarcodes (627)

DNAcopy (4916)

DNAcycP2 (418)

dnaEPICO (163)

DNAfusion (639)

DNaseR (64)

DNAshapeR (828)

DNEA (412)

domainsignatures (185)

dominatR (351)

DominoEffect (625)

dominoSignal (484)

doppelgangR (711)

DOQTL (226)

Doscheda (729)

DOSE (28334)

doseR (660)

DOtools (372)

DOTSeq (371)

doubletrouble (617)

dpeak (145)

drawProteins (627)

dreamlet (779)

DRIMSeq (1046)

DriverNet (542)

DropletUtils (3818)

drugfindR (340)

drugTargetInteractions (507)

DrugVsDisease (723)

dSimer (144)

DspikeIn (492)

DSS (1521)

dStruct (500)

DTA (555)

dualKS (316)

DuckDBArray (36)

DuckDBDataFrame (26)

DuckDBGRanges (31)

DuckDBSpatial (17)

Dune (477)

DupChecker (129)

DuplexDiscovereR (433)

dupRadar (658)

dyebias (839)

DynDoc (2342)

E

easier (696)

EasyCellType (545)

easylift (475)

EasyqpcR (229)

easyreporting (588)

easyRNASeq (842)

EBarrays (1088)

EBcoexpress (729)

EBImage (3887)

EBSEA (508)

EBSeq (1022)

EBSeqHMM (251)

ecolitk (885)

EDASeq (2422)

edd (142)

EDDA (221)

edge (742)

edgeR (31065)

EDIRquery (448)

eds (597)

eegc (287)

EGAD (621)

EGSEA (917)

eiR (650)

eisa (389)

eisaR (723)

ELBOW (224)

ELMER (721)

ELViS (454)

EMDomics (656)

EMMA (122)

EmpiricalBrownsMethod (551)

EMTscore (90)

ENCODExplorer (172)

EnhancedVolcano (7614)

enhancerHomologSearch (605)

EnMCB (638)

ENmix (943)

EnrichDO (467)

EnrichedHeatmap (1773)

EnrichmentBrowser (1235)

enrichplot (29749)

enrichTF (221)

enrichViewNet (502)

ensembldb (10971)

ensemblVEP (314)

ENVISIONQuery (192)

epialleleR (630)

EpiCompare (596)

epidecodeR (555)

EpiDISH (1585)

epigenomix (782)

epigraHMM (728)

epihet (141)

EpiMix (619)

epimutacions (618)

epiNEM (687)

EpipwR (328)

epiregulon (477)

epiregulon.extra (503)

epiRomics (264)

epiSeeker (375)

epistack (640)

epistasisGA (503)

EpiTxDb (654)

epivizr (915)

epivizrChart (749)

epivizrData (739)

epivizrServer (584)

epivizrStandalone (662)

erccdashboard (819)

erma (417)

ERSSA (655)

esATAC (898)

escape (989)

escheR (685)

esetVis (734)

eudysbiome (769)

evaluomeR (595)

EventPointer (699)

EWCE (819)

ExCluster (464)

ExiMiR (806)

exomeCopy (586)

exomePeak (281)

exomePeak2 (264)

exonmap (89)

ExperimentHub (10831)

ExperimentHubData (1098)

ExperimentSubset (576)

explorase (183)

ExploreModelMatrix (750)

exploreSE (34)

ExpoRiskR (276)

ExpressionAtlas (685)

ExpressionView (282)

exprExternal (34)

externalVector (80)

extraChIPs (682)

F

fabia (787)

facopy (212)

factDesign (758)

factR (485)

faers (573)

FamAgg (680)

famat (646)

Fancy (14)

farms (371)

fastLiquidAssociation (622)

FastqCleaner (741)

fastRanges (352)

fastreeR (526)

fastseg (1727)

fbat (94)

FCBF (229)

fCCAC (774)

fCI (594)

fcoex (184)

fcScan (540)

fdrame (613)

FEAST (749)

FeatSeekR (422)

fedup (532)

FELLA (822)

FEM (196)

fenr (500)

ffpe (732)

fgga (544)

FGNet (784)

fgsea (28701)

FilterFFPE (625)

findIPs (461)

FindIT2 (633)

FindMyFriends (216)

FinfoMDS (323)

FISHalyseR (515)

fishash (56)

fishpond (1228)

FitHiC (414)

flagme (661)

FLAMES (646)

flipflop (189)

flowAI (1132)

flowBeads (725)

flowBin (684)

flowcatchR (866)

flowCHIC (695)

flowCL (230)

flowClean (823)

flowClust (2075)

flowCore (4289)

flowCut (743)

flowCyBar (483)

flowDensity (945)

flowFit (189)

flowFlowJo (135)

flowFP (1040)

flowGate (511)

flowGraph (516)

flowMap (345)

flowMatch (802)

flowMeans (956)

flowMerge (751)

flowPeaks (736)

flowPhyto (117)

flowPloidy (582)

flowPlots (522)

flowQ (265)

flowQB (189)

FlowRepositoryR (180)

FlowSOM (1920)

flowSpecs (707)

flowSpy (81)

flowStats (1573)

flowTime (663)

flowTrans (694)

flowType (271)

flowUtils (374)

flowViz (2153)

flowVS (786)

flowWorkspace (2532)

fmcsR (931)

fmrs (440)

fobitools (601)

focalCall (159)

FoldGO (241)

FourCSeq (294)

fourSynergy (361)

fRagmentomics (357)

fraq (279)

FRASER (806)

frenchFISH (350)

FRGEpistasis (466)

frma (892)

frmaTools (711)

FScanR (109)

FunChIP (259)

FunciSNP (305)

funOmics (352)

funtooNorm (651)

FuseSOM (563)

G

G4SNVHunter (448)

GA4GHclient (602)

GA4GHshiny (574)

gaga (788)

gage (1713)

gaggle (377)

gaia (230)

GAPGOM (140)

GAprediction (471)

garfield (437)

GARS (577)

GateFinder (556)

gatom (543)

gaucho (131)

GBScleanR (510)

gcapc (859)

gcatest (549)

gCMAP (239)

gCMAPWeb (254)

GCPtools (607)

gCrisprTools (911)

gcrma (2127)

GCSConnection (70)

GCSFilesystem (56)

GCSscore (205)

GDCRNATools (891)

gDNAx (522)

gDR (408)

gDRcore (462)

gDRimport (536)

gDRstyle (492)

gDRutils (441)

GDSArray (617)

gdscloud (7)

gdsfmt (3191)

GeDi (397)

geecc (177)

GEM (550)

gemini (495)

gemma.R (590)

genArise (637)

genbankr (396)

GENE.E (100)

gene2pathway (81)

GeneAccord (165)

GeneAnswers (309)

geneAttribution (609)

GeneBreak (775)

geneClassifiers (615)

geneClusterPattern (6)

GeneExpressionSignature (805)

genefilter (15109)

genefu (1357)

GeneGA (356)

GeneGeneInteR (323)

GeneGroupAnalysis (46)

GeneMeta (1029)

GeneNetworkBuilder (923)

GeneOverlap (1521)

geneplast (704)

geneplotter (4619)

GeneR (115)

geneRecommender (643)

GeneRegionScan (1036)

GeneRfold (37)

geneRxCluster (619)

GeneSelectMMD (734)

GeneSelector (247)

GENESIS (1246)

GeneSpring (98)

GeneStructureTools (685)

geNetClassifier (825)

GeneticsBase (87)

GeneticsDesign (188)

GeneticsPed (538)

GeneTonic (818)

GeneTraffic (86)

GeneTS (72)

geneXtendeR (631)

GENIE3 (2154)

genoCN (319)

GenoGAM (244)

genomation (1578)

GenomAutomorphism (566)

GenomeBase (31)

GenomeGraphs (294)

GenomeInfoDb (40177)

genomeIntervals (834)

genomes (536)

GenomicAlignments (26582)

GenomicCoordinates (269)

GenomicDataCommons (1716)

GenomicDistributions (716)

GenomicFeatures (19163)

GenomicFiles (1613)

genomicInstability (521)

GenomicInteractionNodes (490)

GenomicInteractions (1211)

GenomicOZone (602)

GenomicPlot (550)

GenomicRanges (56129)

GenomicScores (1299)

GenomicSuperSignature (734)

GenomicTuples (753)

Genominator (287)

genoset (301)

genotypeeval (247)

GenoView (70)

genphen (217)

GenProSeq (382)

GenRank (110)

GenVisR (979)

GeoDiff (598)

GEOexplorer (224)

GEOfastq (344)

GEOmetadb (873)

geomeTriD (492)

GeomxTools (904)

GEOquery (15498)

GEOsearch (87)

GEOsubmission (630)

GeoTcgaData (588)

gep2pep (502)

gesel (86)

gespeR (354)

getDEE2 (455)

geva (524)

GEWIST (490)

GExPipe (122)

geyser (410)

gff3Plotter (40)

gg4way (516)

GGBase (370)

ggbio (3301)

ggcyto (1934)

ggkegg (860)

ggmanh (620)

ggmsa (1138)

GGPA (538)

ggsc (506)

ggseqalign (379)

ggspavis (991)

GGtools (435)

ggtree (34055)

ggtreeDendro (427)

ggtreeExtra (2607)

ggtreeSpace (385)

GIGSEA (466)

ginmappeR (386)

gINTomics (461)

girafe (641)

GISPA (253)

GLAD (921)

GladiaTOX (570)

Glimma (1633)

glmGamPoi (6903)

glmSparseNet (708)

GlobalAncova (1886)

globalSeq (568)

globaltest (2684)

GloScope (507)

glycoTraitR (299)

gmapR (607)

GmicR (619)

gmoviz (736)

GMRP (673)

GNET2 (387)

GNOSIS (498)

GOaGO (344)

goatea (414)

goCluster (33)

GOexpress (857)

GOfan (290)

GOfuncR (723)

GOFunction (288)

GoogleGenomics (143)

GOpro (736)

goProfiles (883)

GOSemSim (27094)

goseq (2175)

GOSim (366)

goSorensen (489)

goSTAG (730)

GOstats (2235)

GOsummaries (321)

GOTHiC (973)

goTools (702)

GPA (414)

gpart (193)

GPlinksR (67)

gpls (884)

gprege (232)

gpuMagic (259)

gQTLBase (217)

gQTLstats (222)

GrafGen (499)

gramm4R (55)

GRaNIE (824)

granulator (204)

graper (519)

graph (25374)

GraphAlignment (537)

GraphAT (819)

GraphExperiment (336)

graphite (6792)

GraphPAC (339)

GRENITS (531)

GreyListChIP (1760)

GRmetrics (705)

groHMM (917)

growkar (11)

GRridge (245)

GSABenchmark (280)

GSALightning (549)

GSAR (829)

GSCA (663)

gscreend (607)

GSEABase (13107)

GSEABenchmarkeR (680)

GSEAlens (52)

GSEAlm (866)

GSEAmining (516)

gsean (584)

GSgalgoR (556)

GSReg (653)

GSRI (759)

GSVA (12445)

gtrellis (800)

GUIDEseq (1002)

Guitar (829)

gVenn (396)

Gviz (4415)

GWAS.BAYES (546)

gwascat (1326)

GWASTools (1438)

gwasurvivr (591)

GWENA (657)

gypsum (5099)

H

h5mread (14612)

h5vc (1096)

hammers (308)

hapFabia (706)

Harman (811)

HarmonizR (424)

Harshlight (477)

hca (231)

HCABrowser (91)

HCAExplorer (55)

HCAMatrixBrowser (33)

HCsnip (171)

HDF5Array (19802)

HDTD (458)

hdxmsqc (525)

heatmaps (954)

Heatplus (972)

HelloRanges (782)

HELP (745)

HEM (750)

hermes (691)

HERON (490)

Herper (386)

hexbin (149)

HGC (453)

hiAnnotator (415)

HIBAG (729)

HicAggR (512)

HiCaptuRe (406)

HiCBricks (820)

HiCcompare (982)

HiCDCPlus (608)

HiCDOC (608)

HiCExperiment (613)

HiContacts (713)

HiCool (296)

HiCParser (383)

HiCPotts (365)

hicrep (77)

hicVennDiagram (467)

hierGWAS (590)

hierinf (375)

HilbertCurve (784)

HilbertVis (825)

HilbertVisGUI (309)

HiLDA (694)

hipathia (821)

HIPPO (482)

hiReadsProcessor (371)

HIREewas (548)

HiSpaR (237)

HistoImagePlot (320)

HiTC (998)

hmdbQuery (475)

HMMcopy (929)

HoloFoodR (458)

hoodscanR (552)

hopach (1137)

HPAanalyze (726)

hpar (1157)

HPAStainR (83)

HPiP (547)

HTqPCR (911)

HTSanalyzeR (297)

HTSeqGenie (182)

htSeqTools (277)

HTSFilter (981)

HuBMAPR (416)

HubPub (995)

HumanTranscriptomeCompendium (243)

hummingbird (546)

HVP (378)

HybridExpress (480)

HybridMTest (637)

hypeR (514)

hyperdraw (690)

hypergraph (763)

I

iASeq (466)

iasva (600)

iBBiG (465)

Ibex (370)

ibh (560)

iBMQ (447)

iCARE (579)

Icens (1023)

icetea (686)

iCheck (658)

iChip (741)

iClusterPlus (794)

iCNV (545)

iCOBRA (1027)

ideal (930)

IdeoViz (735)

idiogram (974)

IdMappingAnalysis (227)

IdMappingRetrieval (194)

idpr (613)

idr2d (633)

IFAA (385)

iFlow (55)

igblastr (764)

iGC (619)

IgGeneUsage (573)

igvR (831)

igvShiny (550)

IHW (1738)

illuminaio (4127)

ILoReg (612)

ImageArray (344)

imageFeatureTCGA (266)

imageHTS (387)

imageTCGA (380)

imageTCGAutils (326)

IMAS (455)

imcRtools (887)

Imetagene (175)

IMMAN (471)

immApex (837)

immGLIPH (98)

immLynx (296)

immReferent (398)

ImmuneSpaceR (275)

immunoClust (718)

immunogenViewer (362)

immunotation (460)

iModMix (313)

IMPCdata (422)

ImpulseDE (84)

ImpulseDE2 (120)

impute (14255)

INDEED (423)

iNETgrate (535)

infercnv (2517)

infinityFlow (561)

Informeasure (438)

InPAS (938)

INPower (558)

inSilicoDb (168)

inSilicoMerging (116)

INSPEcT (949)

INTACT (441)

InTAD (666)

intansv (778)

interacCircos (398)

InteractionSet (2340)

InteractiveComplexHeatmap (992)

interactiveDisplay (723)

interactiveDisplayBase (2909)

InterCellar (586)

IntEREst (771)

InterMineR (323)

IntOMICS (72)

IntramiRExploreR (542)

inveRsion (205)

IONiseR (812)

iontree (136)

iPAC (383)

iPath (449)

ipdDb (574)

IPO (666)

IPPD (219)

IRanges (67938)

IRISFGM (148)

IrisSpatialFeatures (41)

ISAnalytics (658)

iscream (436)

iSEE (1090)

iSEEde (531)

iSEEfier (438)

iSEEhex (529)

iSEEhub (599)

iSEEid (106)

iSEEindex (495)

iSEEpathways (517)

iSEEtree (513)

iSEEu (697)

iSeq (560)

ISLET (529)

islify (387)

iSNetwork (51)

isobar (924)

IsoBayes (490)

IsoCorrectoR (544)

IsoCorrectoRGUI (468)

IsoformSwitchAnalyzeR (1183)

IsoGeneGUI (376)

ISoLDE (467)

isomiRs (816)

iSPlot (51)

ITALICS (738)

iterativeBMA (623)

iterativeBMAsurv (514)

iterClust (191)

iteremoval (137)

IVAS (736)

ivygapSE (538)

IWTomics (640)

J

JASPAR2018 (22)

jazzPanda (515)

jmosaics (118)

joda (227)

JunctionSeq (176)

jvecfor (256)

K

karyoploteR (1822)

katdetectr (581)

KBoost (375)

KCsmart (816)

kebabs (891)

KEGGemUP (56)

KEGGgraph (6790)

KEGGlincs (682)

keggorth (52)

keggorthology (934)

KEGGprofile (231)

KEGGREST (45537)

KEGGSOAP (124)

kimod (113)

KinSwingR (527)

kissDE (612)

kmcut (406)

KnowSeq (582)

knowYourCG (338)

koinar (404)

L

LACE (697)

LACHESIS (390)

lapmix (396)

LBE (767)

lcmsPlot (335)

ldblock (628)

LEA (1279)

leapR (272)

LedPred (497)

lefser (1166)

lemur (564)

les (711)

levi (515)

lfa (632)

Lheuristic (338)

limma (44655)

limmaGUI (904)

limpa (483)

limpca (489)

LimROTS (437)

LINC (145)

LineagePulse (200)

lineagespot (445)

LinkHD (576)

linkSet (194)

Linnorm (888)

LinTInd (265)

lionessR (673)

LIPIDIFy (2)

lipidr (673)

LipidTrend (338)

LiquidAssociation (653)

lisaClust (663)

lmdme (664)

LMGene (337)

lncRna (302)

LOBSTAHS (593)

loci2path (607)

logicFS (702)

logitT (318)

Logolas (120)

lol (160)

LOLA (888)

looking4clusters (371)

LoomExperiment (1001)

LowMACA (259)

LPE (689)

LPEadj (313)

lpNet (549)

lpsymphony (1859)

LRBaseDbi (570)

LRcell (557)

LRDE (247)

lumi (2157)

lute (114)

LVSmiRNA (251)

LymphoSeq (697)

M

M3C (952)

M3D (216)

M3Drop (902)

m6Aboost (554)

maanova (419)

Maaslin2 (1550)

maaslin3 (711)

Macarron (449)

macat (495)

maCorrPlot (649)

MACPET (176)

MACSQuantifyR (500)

MACSr (541)

maDB (158)

made4 (1081)

MADSEQ (421)

maftools (3419)

MAGAR (553)

MAGeCKFlute (344)

magpie (564)

magrene (505)

MAI (549)

maigesPack (479)

MAIT (617)

makecdfenv (1064)

makePlatformDesign (58)

MANOR (672)

manta (269)

MantelCorr (601)

MAPFX (480)

mAPKL (312)

maPredictDSC (574)

mapscape (535)

mariner (481)

markeR (440)

marr (583)

marray (2984)

martini (578)

maser (792)

maSigPro (1086)

maskBAD (700)

MassArray (541)

massiR (739)

MassSpecWavelet (2887)

MAST (3512)

mastR (629)

matchBox (517)

matchprobes (112)

MatrixGenerics (52047)

MatrixQCvis (637)

MatrixRider (684)

matter (987)

MaxContrastProjection (103)

MBAmethyl (438)

MBASED (734)

MBCB (565)

MBECS (530)

mbkmeans (1233)

mbOmic (57)

mBPCR (772)

MBQN (555)

mbQTL (419)

MBttest (660)

mcaGUI (223)

MCbiclust (836)

MCRestimate (244)

mCSEA (776)

mdgsa (249)

mdp (593)

mdqc (644)

MDSvis (275)

MDTS (515)

MEAL (835)

MeasurementError.cor (510)

MEAT (747)

MEB (598)

MEDIPS (915)

MEDME (725)

megadepth (583)

MEIGOR (639)

Melissa (373)

MeLSI (275)

memes (708)

MergeMaid (338)

Mergeomics (641)

MeSHDbi (835)

meshes (722)

meshr (828)

MeSHSim (71)

MesKit (727)

messina (677)

metaArray (320)

Metab (291)

metabCombiner (598)

metabinR (555)

MetaboAnnotation (729)

MetaboAnnotatoR (285)

MetaboCoreUtils (3850)

MetaboDynamics (442)

metabolomicsWorkbenchR (641)

metabom8 (324)

metabomxtr (625)

MetaboSignal (804)

metaCCA (484)

MetaCyto (564)

MetaDICT (376)

metagene (462)

metagene2 (783)

metagenomeFeatures (202)

metagenomeSeq (2721)

MetaGxOvarian (14)

metahdep (510)

metaMS (816)

MetaNeighbor (429)

MetaPathNet (68)

MetaPhOR (529)

metapod (8647)

metapone (574)

MetaProViz (341)

metaSeq (740)

metaseqR (294)

metaseqR2 (764)

metavizr (228)

MetaVolcanoR (179)

metaX (49)

MetCirc (645)

MethCP (161)

methimpute (681)

methInheritSim (650)

methodical (445)

MethPed (855)

MethReg (557)

methrix (788)

MethTargetedNGS (557)

methVisual (251)

methyAnalysis (319)

MethylAid (894)

methylCC (777)

methylclock (741)

methylGSA (786)

methyLImp2 (441)

methylInheritance (722)

methylKit (1660)

MethylMix (787)

methylMnM (854)

methylPipe (831)

methylscaper (630)

MethylSeekR (927)

methylSig (651)

methylumi (2513)

methyvim (123)

MetID (513)

MetMashR (479)

MetNet (786)

mfa (375)

Mfuzz (2147)

MGFM (736)

MGFR (623)

MGnifyR (536)

mgsa (652)

mia (2796)

miaDash (412)

miaSim (532)

miaTime (507)

miaViz (926)

MiChip (681)

microbiome (2982)

microbiomeDASim (510)

microbiomeExplorer (609)

microbiomeMarker (497)

MicrobiomeProfiler (511)

MicrobiotaProcess (1056)

microRNA (1434)

microSTASIS (124)

MICSQTL (497)

midasHLA (472)

MIGSA (251)

miloR (1908)

mimager (667)

MIMOSA (271)

mina (492)

MineICA (625)

minet (1409)

minfi (3714)

MinimumDistance (941)

MiPP (726)

miQC (730)

MIRA (718)

MiRaGE (941)

miRBaseConverter (766)

miRcomp (760)

mirIntegrator (755)

MIRit (499)

miRLAB (703)

miRmine (309)

miRNAmeConverter (553)

miRNApath (573)

miRNAtap (753)

miRSM (711)

miRsponge (71)

miRspongeR (608)

Mirsynergy (168)

mirTarRnaSeq (615)

missMethyl (1816)

missRows (574)

mist (397)

mistyR (585)

mitch (563)

mitoClone2 (550)

mitology (471)

mitoODE (159)

mixOmics (5181)

MLInterfaces (1417)

mlm4omics (45)

MLP (959)

MLSeq (783)

MMAPPR2 (122)

MMDiff (165)

MMDiff2 (800)

mmgmos (50)

mmnet (119)

MmPalateMiRNA (258)

MMUPHin (687)

mnem (750)

moanin (473)

mobileRNA (466)

MobilityTransformR (110)

MODA (538)

ModCon (411)

Modstrings (700)

MOFA (88)

MOFA2 (1791)

MOGAMUN (456)

mogsa (873)

MoleculeExperiment (459)

MOMA (697)

monaLisa (864)

monocle (4346)

Moonlight2R (581)

MoonlightR (815)

MoPS (169)

mosaics (961)

mosbi (399)

MOSClip (471)

mosdef (748)

MOSim (789)

Motif2Site (592)

motifbreakR (722)

motifcounter (421)

MotifDb (1686)

motifmatchr (2469)

MotifPeeker (366)

motifRG (249)

motifStack (1561)

motifTestR (511)

MotIV (314)

MouseFM (531)

MPAC (381)

MPFE (442)

mpra (768)

MPRAnalyze (567)

MQmetrics (136)

mQTL.NMR (154)

msa (2822)

MSA2dist (578)

MsBackendMassbank (536)

MsBackendMassIVE (64)

MsBackendMetaboLights (396)

MsBackendMetabolomicsWorkbench (61)

MsBackendMgf (1235)

MsBackendMsp (781)

MsBackendRawFileReader (541)

MsBackendSql (535)

MsCoreUtils (4930)

MsDataHub (604)

MSEADbi (38)

MsExperiment (2170)

MsFeatures (2397)

msgbsR (619)

MSGFgui (226)

MSGFplus (187)

msImpute (605)

mslp (349)

msmsEDA (757)

msmsTests (797)

MSnbase (5178)

MSnID (1027)

mspms (507)

MSPrep (434)

msPurity (634)

msqrob2 (829)

MsQuality (559)

MsStash (72)

MSstats (1385)

MSstatsBig (387)

MSstatsBioNet (418)

MSstatsConvert (1077)

MSstatsLiP (621)

MSstatsLOBD (430)

MSstatsPTM (775)

MSstatsQC (602)

MSstatsQCgui (414)

MSstatsResponse (418)

MSstatsSampleSize (176)

MSstatsShiny (524)

MSstatsTMT (897)

MSstatsTMTPTM (47)

MSTree (75)

MTseeker (69)

MuData (578)

Mulcom (715)

MultiAssayExperiment (9291)

MultiAssaySpatialExperiment (12)

MultiBaC (517)

multiClust (691)

multicrispr (655)

MultiDataSet (2649)

multiGSEA (643)

multiHiCcompare (831)

MultiMed (581)

multiMiR (1366)

MultimodalExperiment (561)

MultiOmicsBridge (114)

multiOmicsViz (249)

MultipleAlignment (132)

multipletR (0)

multipointR (60)

MultiRNAflow (541)

multiscan (694)

multiSight (133)

multistateQTL (438)

multiWGCNA (525)

multtest (14174)

mumosa (601)

MungeSumstats (1116)

muscat (1717)

muscle (934)

musicatk (725)

MutationalPatterns (1095)

mutscan (439)

MutSeqR (376)

MVCClass (675)

mvGST (144)

MWASTools (772)

mygene (930)

myvariant (700)

mzID (4398)

mzR (5344)

N

NADfinder (856)

NanoMethViz (661)

NanoStringDiff (629)

NanoStringNCTools (1033)

NanoStringQCPro (262)

nanotatoR (192)

NanoTube (602)

NarrowPeaks (239)

NBAMSeq (555)

NBSplice (171)

ncdfFlow (2347)

ncGTW (576)

NCIgraph (450)

ncRNAtools (569)

ndexr (499)

neaGUI (117)

nearBynding (411)

Nebulosa (1899)

NeighborNet (191)

nem (475)

nempi (510)

NetActivity (510)

netbenchmark (135)

netbiov (313)

netboost (470)

netboxr (125)

netDx (159)

nethet (690)

netOmics (135)

NetPathMiner (603)

netprioR (437)

netReg (100)

netresponse (746)

NetSAM (677)

netSmooth (714)

networkBMA (239)

netZooR (246)

NeuCA (169)

NewWave (531)

NGScopy (163)

ngsReports (691)

nipalsMCIA (572)

nnNorm (683)

nnSVG (694)

NOISeq (1168)

nondetects (661)

NoRCE (630)

normalize450K (652)

NormalyzerDE (796)

NormqPCR (739)

normr (865)

normScore (7)

notame (424)

notameStats (342)

notameViz (381)

NPARC (597)

npGSEA (759)

NTW (537)

nucleoSim (630)

nucleR (949)

nuCpos (532)

nudge (220)

nullranges (719)

NuPoP (645)

NxtIRFcore (147)

O

OAtools (285)

occugene (528)

OCplus (866)

octad (548)

ODER (112)

odseq (518)

OGRE (549)

OGSA (173)

oligo (3919)

oligoClasses (3276)

OLIN (908)

OLINgui (693)

omada (325)

OmaDB (651)

omicade4 (816)

OmicCircos (773)

omicplotR (503)

omicRexposome (722)

omicsGMF (391)

OmicsLonDA (194)

OmicsMarkeR (153)

OmicsMLRepoR (305)

OMICsPCA (696)

omicsPrint (804)

omicsViewer (572)

Omixer (487)

OmnipathR (2420)

ompBAM (516)

omXplore (458)

Onassis (156)

oncomix (583)

oncoscanR (501)

OncoScore (626)

OncoSimulR (661)

oneChannelGUI (277)

oneSENSE (164)

onlineFDR (439)

ontoCAT (184)

ontoProc (763)

ontoProc2 (78)

ontoTools (148)

openCyto (1842)

openPrimeR (770)

openPrimeRui (210)

OpenStats (411)

OperaMate (82)

oposSOM (686)

oppar (798)

oppti (195)

optimalFlow (504)

OPWeight (578)

OrderedList (732)

ORFhunteR (558)

ORFik (925)

Organism.dplyr (505)

OrganismDbi (3518)

orthogene (1195)

orthos (520)

OSAT (649)

Oscope (715)

OSTA.data (458)

OTUbase (805)

OutlierD (283)

OUTRIDER (918)

OutSplice (567)

OVESEG (605)

P

PAA (863)

packFinder (611)

padma (590)

PADOG (862)

pageRank (483)

PAIRADISE (604)

paircompviz (580)

pairedGSEA (491)

pairkat (530)

pairseqsim (23)

pamr (144)

pandaR (825)

panelcn.mops (697)

PAnnBuilder (196)

PanomiR (579)

panoramic (107)

panp (876)

PANR (678)

PanViz (148)

PanVizGenerator (172)

PAPi (215)

parati (312)

pareg (124)

parglms (652)

parody (704)

partCNV (265)

PAST (627)

Path2PPI (632)

pathifier (602)

pathlinkR (538)

pathMED (241)

PathNet (591)

PathoStat (676)

pathprint (111)

pathRender (724)

pathVar (265)

pathview (5667)

pathwayPCA (634)

PathwaySplice (166)

PatientGeneSets (51)

paxtoolsr (260)

Pbase (235)

pbcmc (104)

pcaExplorer (1003)

pcaGoPromoter (192)

pcaMethods (7213)

PCAN (728)

PCAtools (1731)

pcot2 (386)

PCpheno (391)

pcxn (173)

PDATK (639)

pdInfoBuilder (978)

pdmclass (282)

PeacoQC (837)

peakCombiner (364)

peakPantheR (589)

PECA (655)

peco (580)

Pedixplorer (487)

pengls (401)

PepSetTest (395)

PepsNMR (600)

pepStat (737)

pepVet (14)

pepXMLTab (547)

PERFect (169)

periodicDNA (711)

perturbatr (115)

pfamAnalyzeR (631)

PFP (111)

PGA (312)

pgca (404)

pgen2gds (73)

PGSEA (451)

pgUtils (90)

pgxRpi (336)

phantasus (745)

phantasusLite (427)

PharmacoGx (1129)

phemd (243)

phenoDist (180)

PhenoGeneRanker (335)

phenomis (444)

phenopath (785)

phenoTest (913)

PhenStat (380)

philr (799)

PhIPData (588)

phosphonormalizer (500)

PhosR (885)

phylobar (119)

PhyloProfile (615)

phyloseq (8121)

Pi (335)

piano (1318)

PICB (490)

pickgene (566)

PICS (557)

Pigengene (752)

PING (546)

PinPath (134)

pint (184)

pipeComp (693)

pipeFrame (614)

PIPETS (372)

Pirat (461)

PIUMA (503)

pkgDepTools (371)

plaid (331)

planet (716)

planttfhunter (481)

plasmut (378)

plateCore (306)

plethy (340)

plgem (878)

plier (780)

PlinkMatrix (322)

PloGO2 (163)

plotgardener (793)

plotGrouper (506)

PLPE (648)

plrs (261)

PLSDAbatch (479)

plw (290)

plyinteractions (589)

plyranges (1802)

plyxp (592)

pmm (471)

pmp (694)

PMScanR (374)

PoDCall (485)

podkat (945)

poem (464)

pogos (624)

polyester (455)

Polyfit (181)

polyICSFlow (7)

PolySTest (440)

Polytect (361)

POMA (703)

posDemux (359)

POST (107)

PostChicago (74)

postNet (438)

PoTRA (123)

PowerExplorer (92)

powerTCR (698)

POWSC (575)

ppcseq (567)

PPInfer (605)

ppiStats (430)

pqsfinder (857)

prada (354)

pram (709)

prebs (736)

preciseTAD (739)

PrecisionTrialDrawer (121)

PREDA (879)

predictionet (203)

preprocessCore (18543)

primirTSS (727)

PrInCE (596)

Prize (117)

proActiv (734)

proBAMr (722)

proBatch (625)

PROcess (714)

procoil (819)

ProCoNA (194)

proDA (864)

proFIA (210)

profileplyr (770)

profileScoreDist (568)

progeny (1742)

projectR (737)

pRoloc (1400)

pRolocGUI (796)

PROMISE (648)

PRONE (545)

PROPER (725)

PROPS (659)

Prostar (692)

prot2D (204)

proteasy (111)

ProteinBatcher (10)

proteinProfiles (476)

ProteoDisco (658)

ProteomicsAnnotationHubData (182)

ProteoMM (592)

proteoQC (190)

protGear (603)

ProtGenerics (13028)

PSEA (353)

psichomics (832)

PSICQUIC (243)

PSMatch (3732)

psygenet2r (385)

ptairMS (630)

PTMods (1067)

PubScore (110)

pulsedSilac (121)

puma (1033)

PureCN (1082)

pvac (669)

pvca (865)

Pviz (703)

pwalign (9244)

PWMEnrich (1028)

pwOmics (433)

pwrEWAS (139)

Q

qckitfastq (198)

qcmetrics (940)

QDNAseq (1130)

QFeatures (4411)

QFeaturesGUI (6)

qmtools (554)

qpcrNorm (735)

qpgraph (1233)

qPLEXanalyzer (716)

qrqc (339)

QRscore (406)

qsea (786)

qsmooth (665)

QSutils (678)

qsvaR (578)

QTLExperiment (478)

Qtlizer (514)

QUALIFIER (238)

quantiseqr (1592)

quantMSImageR (24)

quantro (1045)

quantsmooth (1179)

QuartPAC (299)

QuasR (1333)

QuaternaryProd (432)

QUBIC (606)

queeems (274)

qusage (1180)

qvalue (27324)

R

R3CPET (726)

r3Cseq (944)

R453Plus1Toolbox (862)

R4RNA (1242)

RadioGx (689)

raer (612)

RaggedExperiment (1696)

RAIDS (513)

rain (724)

rama (353)

RamiGO (140)

ramr (601)

ramwas (789)

RandomWalkRestartMH (194)

randPack (632)

randRotation (344)

RankMap (295)

RankProd (968)

RAREsim (400)

RareVariantVis (799)

Rariant (316)

Rarr (822)

rawDiag (390)

rawrr (572)

RbcBook1 (1088)

Rbec (359)

RBedMethyl (316)

RBGL (10652)

RBioFormats (708)

RBioinf (490)

rBiopaxParser (1186)

rBLAST (487)

RBM (590)

Rbowtie (1032)

Rbowtie2 (755)

RbowtieCuda (157)

RBPEqBind (4)

RBPSpecificity (96)

rbsurv (670)

Rbwa (365)

Rcade (422)

RCAS (839)

RCASPAR (480)

rcellminer (813)

rCGH (1029)

Rchemcpp (224)

RchyOptimyx (215)

RcisTarget (1657)

RCM (675)

Rcollectl (164)

Rcpi (798)

RCSL (534)

Rcwl (514)

RcwlPipelines (490)

RCX (545)

RCy3 (1638)

RCyjs (689)

RCytoscape (148)

RDAVIDWebService (227)

Rdbi (108)

RdbiPgSQL (45)

rDGIdb (208)

Rdisop (1339)

RDRToolbox (643)

ReactomeContentService4R (123)

ReactomeGraph4R (108)

ReactomeGSA (702)

ReactomePA (6533)

readat (141)

ReadqPCR (751)

reb (366)

REBET (466)

rebook (527)

receptLoss (183)

reconsi (413)

recount (1203)

recount3 (1386)

recountmethylation (706)

recoup (900)

RedeR (1044)

RedisParam (460)

REDseq (759)

ReducedExperiment (454)

RefNet (219)

RefPlus (511)

Rega (274)

RegEnrich (609)

regionalpcs (402)

RegionalST (560)

regioneR (2797)

regioneReloaded (525)

regionReport (847)

regsplice (641)

regutools (632)

REMP (695)

Repitools (673)

ReportingTools (1438)

reposTools (46)

RepViz (517)

ReQON (349)

ResidualMatrix (5448)

RESOLVE (516)

Resourcerer (133)

restfulSE (285)

retrofit (498)

ReUseData (382)

rexposome (923)

rfaRm (569)

Rfastp (634)

rfcdmin (35)

RFGeneRank (175)

RFLOMICS (537)

rflowcyt (154)

rfPred (761)

rGADEM (586)

RGalaxy (273)

rGenomeTracks (451)

Rgin (116)

RGMQL (187)

RgnTX (234)

rgoslin (580)

RGraph2js (663)

Rgraphviz (11049)

rGREAT (1447)

RGSEA (723)

rgsepd (775)

rhdf5 (27152)

rhdf5client (648)

rhdf5filters (25865)

Rhdf5lib (28360)

rhinotypeR (429)

Rhisat2 (710)

Rhtslib (27697)

rHVDM (371)

RiboCrypt (593)

RiboDiPA (602)

RiboProfiling (569)

ribor (588)

riboSeqR (856)

ribosomeProfilingQC (743)

rifi (490)

rifiComparative (428)

Rigraphlib (2495)

rigvf (297)

RImmPort (511)

Ringo (630)

Rintact (68)

RIPAT (186)

RIPSeeker (272)

Risa (434)

RITAN (588)

RIVER (638)

RJMCMCNucleosomes (691)

RLassoCox (417)

RLMM (565)

RLSeq (130)

RMAGEML (63)

Rmagpie (678)

RMAPPER (101)

RMassBank (922)

rMAT (224)

rmelting (484)

RmiR (240)

Rmmquant (590)

rmspc (518)

RmzTabM (55)

RNAAgeCalc (679)

RNAdecay (492)

rnaEditr (578)

RNAinteract (355)

RNAither (329)

RNAmodR (724)

RNAmodR.AlkAnilineSeq (641)

RNAmodR.ML (671)

RNAmodR.RiboMethSeq (595)

RNAprobR (208)

RNAsense (539)

rnaseqcomp (644)

RNAseqCovarImpute (460)

RnaSeqGeneEdgeRQL (29)

rnaSeqMap (338)

RNASeqPower (617)

RNASeqR (144)

RnaSeqSampleSize (675)

RNAshapeQC (312)

RnBeads (1065)

Rnits (724)

roar (807)

roastgsa (509)

ROC (1997)

ROCpAI (508)

RolDE (474)

Roleswitch (216)

Rolexa (167)

rols (1153)

ROntoTools (870)

ropls (2736)

ROSeq (676)

ROTS (802)

RPA (776)

rprimer (605)

RProtoBufLib (3557)

RpsiXML (492)

rpx (1193)

Rqc (990)

rqt (543)

rqubic (527)

rRDP (433)

Rredland (61)

RRHO (580)

rrvgo (1306)

Rsamtools (30396)

rsbml (574)

rScudo (624)

rsemmed (494)

RSeqAn (488)

rSFFreader (193)

RSNPper (73)

Rsubread (2722)

RSVSim (767)

rSWeeP (527)

rTANDEM (246)

RTCA (623)

RTCGA (1028)

RTCGAToolbox (1312)

RTN (845)

RTNduals (582)

RTNsurvival (611)

RTools4TB (42)

RTopper (813)

Rtpca (560)

rtracklayer (25599)

Rtreemix (466)

rTRM (898)

rTRMui (649)

RUCova (493)

runibic (321)

Ruuid (117)

RUVcorr (625)

RUVnormalize (609)

RUVSeq (1598)

Rvisdiff (496)

RVS (555)

RWebServices (69)

rWikiPathways (890)

S

S4Arrays (52407)

S4Cartographer (87)

S4Vectors (73092)

safe (1401)

SAGElyzer (58)

sagenhaft (687)

SAGx (354)

SAIGEgds (565)

samExploreR (97)

sampleClassifier (544)

SamSPECTRAL (640)

sangeranalyseR (773)

sangerseqR (1260)

SanityR (375)

SANTA (733)

sapFinder (248)

saps (49)

SARC (132)

sarks (552)

saseR (466)

satuRn (966)

savR (183)

SBGNview (653)

sbgr (20)

SBMLR (670)

SC3 (1175)

scafari (520)

Scale4C (668)

ScaledMatrix (17275)

scAlign (127)

SCAN.UPC (863)

scanMiR (587)

scanMiRApp (613)

scAnnotatR (590)

SCANVIS (481)

SCArray (622)

SCArray.sat (466)

SCATE (134)

scater (11874)

scatterHatch (435)

scBatchQC (94)

scBFA (594)

SCBN (458)

scBubbletree (554)

scCB2 (570)

scCertify (8)

scClassifR (63)

scClassify (710)

sccomp (715)

scCompoundDE (82)

scConform (301)

scDataviz (672)

scDblFinder (5352)

scDD (844)

scDDboost (521)

scde (1032)

scDesign3 (518)

scDiagnostics (508)

scDotPlot (479)

scds (1366)

scECODA (419)

SCFA (521)

scFastDE (85)

scFeatureFilter (676)

scFeatures (581)

scfind (93)

scGPS (668)

scGraphVerse (367)

schex (669)

scHiCcompare (385)

scHOT (660)

scider (494)

scifer (517)

ScISI (449)

scLANE (461)

scLang (337)

scMAGeCK (89)

scmap (1095)

scMerge (996)

scMET (563)

scmeth (691)

scMitoMut (432)

scMultiSim (555)

SCnorm (800)

scone (816)

Sconify (582)

SCOPE (615)

scoreInvHap (656)

scoup (388)

scp (735)

scPassport (250)

scPCA (650)

scPipe (719)

scQTLtools (425)

scran (9391)

scrapper (2736)

scReClassify (592)

scRecover (536)

screenCounter (492)

ScreenR (470)

scRepertoire (1392)

scRNAseqApp (550)

scruff (756)

scry (975)

scShapes (394)

scsR (222)

scTensor (674)

scTGIF (683)

scTHI (521)

scToppR (371)

scTreeViz (602)

scTypeEval (307)

scuttle (13590)

scviR (317)

SDAMS (559)

seahtrue (441)

sechm (640)

segmenter (641)

segmentSeq (949)

selectKSigs (474)

SELEX (689)

SemDist (725)

semisup (489)

SEMPLR (371)

SemSim (66)

SEPA (113)

SEPIRA (247)

seq.hotSPOT (396)

seq2pathway (607)

seqArchR (225)

seqArchRplus (206)

SeqArray (1753)

seqbias (375)

seqCAT (680)

seqCNA (276)

seqcombo (458)

SeqGate (515)

SeqGSEA (823)

Seqinfo (44467)

seqLogo (4382)

seqPattern (1580)

seqplots (298)

seqsetvis (725)

SeqSQC (808)

Seqtometry (312)

seqTools (363)

SeqVarTools (1261)

SEraster (416)

sesame (1536)

SETA (420)

SEtools (580)

sevenbridges (707)

sevenC (733)

sfi (324)

SGCP (315)

SGSeq (1056)

SharedObject (634)

shiny.gosling (382)

shinybiocloader (298)

shinyDSP (440)

shinyepico (612)

shinyMethyl (867)

shinyTANDEM (176)

ShortRead (7811)

SIAMCAT (679)

SICtools (593)

sigaR (236)

SigCheck (712)

sigFeature (746)

SigFuge (444)

siggenes (4613)

sights (596)

signatureSearch (769)

signeR (787)

signet (72)

signifinder (496)

sigPathway (383)

SigsPack (616)

sigsquared (587)

sigvar (8)

SIM (693)

SIMAT (629)

SimBindProfiles (330)

SimBu (496)

SIMD (497)

SimFFPE (567)

SimiCviz (73)

similaRpeak (717)

SIMLR (824)

simona (1314)

simPIC (530)

simpleaffy (418)

simpleSeg (721)

simplifyEnrichment (1734)

simulatorAPMS (85)

simulatorZ (232)

sincell (684)

singIST (260)

single (208)

SingleCellAlleleExperiment (488)

SingleCellExperiment (23697)

SingleCellSignalR (755)

singleCellTK (1032)

SingleMoleculeFootprinting (359)

SingleR (6588)

singscore (2758)

SiPSiC (407)

SISPA (215)

sitadela (538)

Site2Target (385)

sitePath (552)

sizepower (586)

SJava (64)

sketchR (490)

skewr (676)

slalom (383)

SLGI (444)

slingshot (4321)

slinky (142)

SLqPCR (550)

SMAD (483)

SMAP (376)

smartid (435)

SmartPhos (270)

SMITE (782)

smoothclust (433)

smoppix (445)

SMTrackR (322)

SNAData (54)

SNAGEE (556)

snapCGH (511)

snapcount (553)

snifter (945)

snm (643)

SNPchip (378)

SNPediaR (477)

SNPhood (957)

snpMatrix (82)

SNPRelate (2583)

snpStats (3161)

soGGi (639)

sojourner (136)

SomatiCA (132)

SomaticSignatures (846)

SOMNiBUS (529)

sosta (538)

SpaceMarkers (472)

SpacePAC (388)

SpaceTrooper (503)

spacexr (814)

spade (127)

Spaniel (703)

SpaNorm (571)

spARI (349)

sparrow (854)

SparseArray (58388)

sparseDOSSA (215)

sparseMatrixStats (20951)

sparsenetgls (477)

SparseSignatures (695)

spaSim (553)

SpatialArtifacts (395)

SpatialCPie (588)

spatialdataR (17)

spatialDE (644)

SpatialDecon (764)

SpatialExperiment (10257)

SpatialExperimentIO (483)

spatialFDA (447)

SpatialFeatureExperiment (757)

spatialHeatmap (491)

SpatialOmicsOverlay (588)

spatialSimGP (389)

spatzie (217)

speckle (1120)

specL (718)

SpeCond (712)

Spectra (4360)

SpectralTAD (616)

SpectraQL (397)

SpectraStash (7)

SpectriPy (435)

SPEM (627)

SPIA (1627)

SPIAT (654)

SPICEY (390)

spicyR (781)

SpidermiR (255)

SpiecEasi (453)

spikeLI (595)

spiky (513)

spillR (425)

spkTools (691)

splatter (1333)

splicegear (289)

SpliceImpactR (319)

splicelogic (275)

spliceR (223)

spliceSites (214)

SpliceWiz (764)

SplicingFactory (470)

SplicingGraphs (926)

SplineDV (436)

splineTCDiffExpr (8)

splineTimeR (668)

SPLINTER (705)

splots (707)

SpNeigh (322)

SPONGE (861)

spoon (410)

SpotClean (604)

SPOTlight (978)

spotSegmentation (202)

SpotSweeper (627)

spqn (608)

SPsimSeq (591)

SQLDataFrame (253)

SQUADD (261)

squallms (408)

sRACIPE (633)

SRAdb (1088)

sRAP (180)

SRGnet (120)

srnadiff (689)

sscore (415)

sscu (650)

sSeq (697)

ssize (631)

sSNAPPY (610)

SSPA (378)

ssPATHS (583)

ssrch (502)

ssviz (672)

StabMap (466)

STADyUM (378)

stageR (839)

stam (86)

STAN (306)

standR (706)

staRank (289)

StarBioTrek (286)

staRgate (374)

Starr (316)

STATegRa (946)

StatescopeR (363)

Statial (579)

statTarget (757)

STdeconvolve (167)

stepNorm (655)

stepwiseCM (147)

stJoincount (370)

stPipe (474)

strandCheckR (645)

Streamer (455)

STRINGdb (4238)

STROMA4 (281)

struct (715)

Structstrings (651)

structToolbox (676)

StructuralVariantAnnotation (757)

SubCellBarCode (603)

subSeq (795)

SUITOR (437)

SummarizedBenchmark (295)

SummarizedExperiment (52639)

Summix (390)

SuperCellCyto (436)

supersigs (527)

supraHex (516)

surfaltr (575)

SurfR (444)

survClust (373)

survcomp (2271)

survtype (510)

Sushi (335)

sva (10785)

svaNUMT (580)

SVAPLSseq (139)

svaRetro (618)

SVM2CRM (154)

SVMDO (405)

SVP (455)

SwarnSeq (13)

SWATH2stats (638)

SwathXtend (383)

swfdr (607)

SwimR (198)

switchBox (565)

switchde (621)

synapsis (540)

synapter (543)

synergyfinder (728)

SynExtend (585)

synlet (561)

SynMut (500)

syntenet (658)

systemPipeR (2234)

systemPipeShiny (600)

systemPipeTools (553)

T

tadar (501)

TADCompare (555)

tanggle (558)

TAPseq (695)

target (664)

TargetDecoy (565)

TargetScore (657)

TargetSearch (668)

TarSeqQC (283)

TaxSEA (398)

TBSignatureProfiler (717)

TCC (976)

TCGAbiolinks (6713)

TCGAbiolinksGUI (156)

TCGAutils (1498)

TCseq (1046)

TDARACNE (276)

TDbasedUFE (464)

TDbasedUFEadv (488)

TEKRABber (571)

TENET (444)

TENxIO (700)

tenXplore (700)

TEQC (821)

terapadog (376)

ternarynet (582)

terraTCGAdata (461)

TFARM (560)

TFBSTools (4487)

TFEA.ChIP (896)

TFHAZ (766)

TFutils (851)

TiDEomics (130)

tidybulk (940)

tidyCoverage (511)

tidyexposomics (412)

tidyFlowCore (400)

tidyomics (387)

tidyprint (293)

tidysbml (341)

tidySingleCellExperiment (865)

tidySpatialExperiment (563)

tidySummarizedExperiment (735)

tidytof (81)

tigre (821)

TileDBArray (557)

tilingArray (1018)

timecourse (918)

timeOmics (597)

timescape (435)

TimeSeriesExperiment (154)

TimiRGeN (184)

TIN (762)

TissueEnrich (800)

TitanCNA (481)

tkWidgets (2566)

tLOH (432)

TMixClust (613)

TMSig (456)

TNBC.CMS (200)

TnT (625)

TOAST (1273)

tofsims (170)

tomoda (560)

tomoseqr (485)

TOP (455)

ToPASeq (181)

topconfects (731)

topdownr (702)

topGO (3054)

toppgene (183)

ToxicoGx (734)

TPP (935)

TPP2D (616)

tpSVG (452)

tracktables (789)

trackViewer (1486)

tradeSeq (2145)

TraianProt (81)

TrajectoryGeometry (398)

TrajectoryUtils (4300)

transcriptogramer (784)

transcriptR (821)

transformGamPoi (562)

transite (489)

tRanslatome (779)

transmogR (479)

transomics2cytoscape (476)

TransView (583)

TraRe (109)

traseR (899)

Travel (42)

traviz (203)

TreeAndLeaf (661)

treeclimbR (449)

treeio (31557)

treekoR (639)

TreeSummarizedExperiment (3350)

TREG (550)

TReNA (17)

trena (308)

Trendy (670)

TRESS (581)

tricycle (999)

TrIdent (342)

triform (197)

trigger (388)

trio (715)

triplex (843)

tripr (592)

tRNA (733)

tRNAdbImport (611)

tRNAscanImport (674)

TRONCO (843)

TSAR (421)

TSCAN (1193)

tscR (139)

TSENAT (101)

tspair (295)

TSRchitect (234)

TSSi (216)

TSSr (5)

ttgsea (419)

TTMap (674)

TurboNorm (811)

TVTB (758)

tweeDEseq (715)

twilight (833)

twoddpcr (702)

txcutr (528)

txdbmaker (5694)

tximeta (2337)

tximport (5527)

TxRegInfra (99)

TypeInfo (343)

U

UCell (3539)

UCSC.utils (26272)

Ularcirc (676)

UMI4Cats (707)

uncoverappLib (628)

UNDO (734)

unifiedWMWqPCR (619)

UniProt.ws (1466)

Uniquorn (739)

universalmotif (1967)

updateObject (560)

UPDhmm (441)

uSORT (724)

V

VAExprs (485)

VanillaICE (1093)

VarCon (610)

variancePartition (2895)

VariantAnnotation (9770)

VariantExperiment (317)

VariantFiltering (976)

VariantTools (890)

VaSP (678)

vasp (49)

vbmp (787)

VCFArray (656)

VDJdive (457)

Vega (183)

VegaMC (769)

velociraptor (679)

veloviz (444)

VennDetail (664)

VERSO (467)

vidger (809)

viper (1909)

virtualArray (59)

ViSEAGO (834)

VisiumIO (620)

visiumStitched (463)

vissE (606)

VISTA (265)

vmrseq (437)

Voyager (729)

VplotR (710)

vsclust (567)

vsn (7310)

vtpnet (638)

vulcan (580)

W

waddR (307)

wateRmelon (1530)

wavClusteR (790)

waveTiling (256)

wavFeatExt (251)

weaver (580)

webbioc (809)

weitrix (844)

widgetInvoke (34)

widgetTools (2450)

wiggleplotr (726)

wpm (586)

wppi (339)

Wrench (2493)

wSIR (85)

X

XAItest (385)

XBSeq (263)

xCell2 (575)

XCIR (66)

xcms (3248)

xcore (590)

XDE (937)

XeniumIO (384)

xenLite (465)

Xeva (615)

XINA (543)

xmapbridge (607)

xmapcore (46)

XNAString (248)

xps (306)

XVector (63110)

Y

y2hStat (47)

yamss (758)

YAPSA (854)

yaqcaffy (382)

yarn (805)

Z

ZarrArray (266)

zellkonverter (4116)

zenith (674)

zFPKM (572)

zinbwave (1426)

zitools (420)

zlibbioc (21591)

ZygosityPredictor (475)