See download stats for:    Bioconductor annotation packages    Bioconductor experiment packages    Bioconductor workflow packages

Download stats for Bioconductor software packages

This page was generated on 2023-12-06 14:10:33 -0500 (Wed, 06 Dec 2023).

The number reported next to each package name is the download score, that is, the average number of distinct IPs that “hit” the package each month for the last 12 months (not counting the current month).


Top 75

1BiocVersion (52568)
2S4Vectors (50328)
3BiocGenerics (50192)
4GenomeInfoDb (49817)
5IRanges (46161)
6Biobase (43631)
7zlibbioc (43304)
8XVector (42387)
9BiocParallel (41860)
10DelayedArray (41050)
11Biostrings (39597)
12GenomicRanges (37586)
13AnnotationDbi (35667)
14MatrixGenerics (35451)
15SummarizedExperiment (34261)
16KEGGREST (32663)
17limma (31104)
18BiocFileCache (23002)
19biomaRt (21266)
20GenomicAlignments (20977)
21Rhtslib (20707)
22Rsamtools (20501)
23edgeR (19755)
24Rhdf5lib (19527)
25DESeq2 (19432)
26annotate (19224)
27rtracklayer (18777)
28S4Arrays (18449)
29treeio (17715)
30rhdf5 (17601)
31ggtree (17480)
32rhdf5filters (17329)
33GenomicFeatures (17251)
34graph (17197)
35BiocIO (16620)
36enrichplot (16087)
37clusterProfiler (15513)
38qvalue (15314)
39DOSE (14866)
40fgsea (14795)
41DelayedMatrixStats (14567)
42GOSemSim (14300)
43preprocessCore (14023)
44sparseMatrixStats (13727)
45genefilter (13593)
46SingleCellExperiment (13315)
47beachmat (13223)
48ComplexHeatmap (12027)
49BSgenome (11646)
50geneplotter (11505)
51multtest (11065)
52BiocSingular (10707)
53ScaledMatrix (10664)
54HDF5Array (10428)
55ProtGenerics (10366)
56impute (9816)
57AnnotationHub (9564)
58interactiveDisplayBase (9331)
59Rgraphviz (9214)
60scuttle (9104)
61RBGL (8893)
62ensembldb (8840)
63AnnotationFilter (8839)
64BiocNeighbors (8579)
65VariantAnnotation (8269)
66GEOquery (8237)
67affy (7882)
68GSEABase (7799)
69affyio (7772)
70sva (6465)
71ExperimentHub (6375)
72scater (5874)
73ShortRead (5755)
74BiocStyle (5615)
75KEGGgraph (5227)

All software packages

All software package stats in one file: bioc_pkg_stats.tab

All software package download scores in one file: bioc_pkg_scores.tab

See Download stats for Bioconductor software repository (all packages combined)

1

1imma (0)

A

a4 (53)
a4Base (77)
a4Classif (54)
a4Core (89)
a4Preproc (105)
a4Reporting (70)
a4reporting (0)
ABAData (1)
ABAEnrichment (5)
abaenrichment (0)
ABarray (52)
abc (1)
abc.data (0)
abe (0)
abind (1)
abseqR (44)
ABSOLUTE (0)
ABSSeq (78)
acde (66)
ACE (71)
acepack (1)
aCGH (114)
ACME (66)
actuar (1)
ada (1)
adabag (1)
ADaCGH2 (47)
ADAM (55)
ADAMgui (49)
adaptest (2)
adductomicsR (45)
ade4 (2)
adegenet (1)
adegraphics (1)
adephylo (1)
ADGofTest (1)
ADImpute (60)
admiral (1)
admiral.test (1)
admiraldev (1)
admisc (24)
admixtools (0)
ADMM (1)
adSplit (45)
adverSCarial (8)
AER (1)
afex (1)
affio (0)
AffiXcan (44)
affxparser (1471)
affy (7882)
affycomp (67)
AffyCompatible (30)
affyContam (44)
affycoretools (328)
affydata (1)
AffyExpress (3)
affyILM (42)
affyio (7772)
affylmGUI (49)
affyPara (3)
affypdnn (3)
affyPLM (1371)
affyQCReport (9)
affyqcreport (0)
AffyRNADegradation (43)
AffyTiling (2)
AGDEX (45)
aggregateBioVar (54)
aggregation (0)
AGHmatrix (1)
Agi4x44PreProcess (3)
agilp (96)
AgiMicroRna (121)
agimicrorna (0)
agricolae (5)
AHMassBank (21)
AICcmodavg (1)
AIMS (346)
AIPW (1)
airpart (40)
airr (1)
airway (1)
akima (1)
alabama (1)
alabaster (27)
alabaster.base (32)
alabaster.bumpy (26)
alabaster.files (7)
alabaster.mae (28)
alabaster.matrix (26)
alabaster.ranges (24)
alabaster.sce (23)
alabaster.schemas (31)
alabaster.se (24)
alabaster.spatial (25)
alabaster.string (25)
alabaster.vcf (22)
alakazam (1)
ald (1)
ALDEx2 (1009)
aldvmm (1)
alembic (1)
alevinQC (74)
AlgDesign (1)
alkahest.generic (1)
ALL (9)
AllelicImbalance (63)
alluvial (1)
almanac (1)
AlphaBeta (44)
alphahull (1)
alphashape3d (1)
alpine (62)
ALPS (3)
AlpsNMR (55)
alr4 (1)
alsace (6)
altcdfenvs (47)
amap (1)
AMARETTO (64)
ambient (1)
Amelia (1)
AmesHousing (1)
amgen.okta.client (0)
amgsafetyvis (1)
amlogger (1)
AMOUNTAIN (65)
amplican (59)
ampliQueso (2)
AnalysisPageServer (2)
anamiR (3)
Anaquin (48)
ANCOMBC (1048)
AneuFinder (73)
AneuFinderData (0)
ANF (40)
animalcules (100)
animation (2)
annaffy (203)
AnnBuilder (1)
anndata (1)
annmap (53)
annotate (19224)
annotation (1)
AnnotationDbi (35667)
annotationdbi (1)
AnnotationFilter (8839)
AnnotationForge (2460)
AnnotationFuncs (6)
AnnotationHub (9564)
AnnotationHubData (245)
annotationTools (75)
annotatr (404)
anota (49)
anota2seq (56)
anRichment (1)
anticlust (1)
antiProfiles (58)
AnVIL (554)
AnVILBilling (51)
AnVILPublish (41)
AnVILWorkflow (21)
anytime (3)
aod (1)
APAlyzer (52)
apcluster (1)
apComplex (43)
apcomplex (0)
ape (10)
apeglm (3127)
apexcharter (1)
APL (56)
aplot (18)
appgen (1)
applera (1)
appreci8R (58)
aqp (1)
archive (1)
ArchR (1)
argparse (8)
argus.DS.Credentials (1)
argusDS.apc.utils (1)
argusDS.backtesting.engine (1)
argusDS.data (1)
argusDS.data.preparation (1)
argusDS.data.preparation2 (2)
argusDS.DB.manager.utilities (1)
argusDS.driver.importance (1)
argusDS.FCUtilities (1)
argusDS.FZ.SourceData (1)
argusDS.gamlss.forecast (1)
argusDS.gamlss.modelling (2)
argusDS.gamlss.testing (1)
argusDS.gamlss.utils (1)
argusDS.model.tools (1)
argusDS.PossibilityCurves.db.utils (1)
argusDS.PossibilityCurves.utils (1)
argusDS.shiny.utils (1)
argusDS.spread.trading.utils (1)
argusDS.Studio.APC (1)
argusDS.Studio.FC (1)
argusDS.Studio.MyStudio (1)
argusDS.Studio.permissions (1)
argusDS.Studio.utils (1)
argusDS.tabulator (1)
argusDS.trading.performance (1)
argusDS.TradingSignals (1)
argusDS.utilities (1)
arm (1)
aroma.affymetrix (7)
aroma.apd (7)
aroma.core (7)
aroma.light (1749)
ArrayExpress (378)
arrayexpress (1)
ArrayExpressHTS (14)
arrayhelpers (1)
arrayMagic (1)
arrayMvout (40)
arraymvout (0)
arrayop (1)
arrayQCplot (2)
arrayQuality (94)
arrayQualityMetrics (525)
arrayqualitymetrics (0)
ArrayTools (7)
ArrayTV (4)
ARRmNormalization (49)
arrow (12)
arsenal (1)
artMS (57)
arules (21)
ArvadosR (1)
ASAFE (52)
ASCAT (0)
ascii (1)
asciicast (1)
ASEB (54)
ASExtras4 (0)
ASGSCA (57)
ash (5)
ashr (1)
asht (1)
ASICS (62)
AsioHeaders (2)
askpass (61)
asmn (1)
asnipe (0)
ASpediaFI (16)
ASpli (75)
asremlPlus (1)
assert (1)
assertive.properties (4)
assertive.types (4)
assertr (1)
assertthat (1)
AssessORF (42)
ASSET (84)
ASSIGN (62)
AssotesteR (1)
ASURAT (50)
ATACCoGAPS (35)
ATACseqQC (298)
ATACseqTFEA (41)
ATE (0)
atena (60)
AtlasRDF (1)
ATR (1)
atSNP (45)
attachment (2)
attempt (1)
attract (42)
AUC (1)
AUCell (1892)
audio (1)
autonomics (46)
Autotuner (3)
av (1)
ava2 (1)
AWFisher (46)
aws (1)
aws.ec2metadata (1)
aws.s3 (5)
aws.signature (5)
awst (45)
azcore (1)
Azimuth (1)
AzureAuth (1)
AzureGraph (1)
AzureRMR (1)
AzureStor (1)

B

BaalChIP (49)
babelgene (1)
babelmixr2 (1)
babelwhale (1)
babynames (1)
BAC (33)
backports (70)
bacon (87)
bacr (0)
BADER (64)
badger (1)
BadRegionFinder (39)
BAGS (41)
baguette (1)
bain (1)
BalancedSampling (1)
ballgown (561)
bambu (218)
bamsignals (1023)
BANDITS (62)
bandle (45)
banocc (56)
barcodetrackR (42)
BART (1)
bartMachine (1)
bartMachineJARs (1)
base (0)
base64 (1)
base64enc (1)
base64url (1)
basecallQC (49)
basefun (1)
BaseSpaceR (58)
Basic4Cseq (43)
BASiCS (109)
BASiCStan (35)
BasicSTARRseq (47)
basilisk (3667)
basilisk.utils (3443)
batchelor (3395)
BatchJobs (1)
BatchQC (96)
batchtools (1)
BayesFactor (1)
BayesFM (1)
BayesianTools (0)
BayesKnockdown (40)
bayesm (3)
bayesmeta (1)
BayesPeak (6)
bayespeak (0)
BayesPen (0)
bayesplot (8)
bayesQR (1)
BayesSpace (183)
bayestestR (1)
BayesX (1)
bayNorm (71)
baySeq (369)
bayseq (0)
BB (1)
BBCAnalyzer (38)
BBmisc (1)
bbmle (1)
bbotk (1)
bbr (1)
bbr.bayes (1)
BCEE (0)
bcellViper (1)
BCRANK (50)
bcSeq (44)
BDgraph (0)
BDMMAcorrect (42)
bdsmatrix (1)
beachmat (13223)
beachmat.hdf5 (6)
beadarray (656)
beadarraySNP (48)
BeadDataPackR (666)
beaddatapackr (0)
BeadExplorer (1)
beanplot (1)
BEARscc (37)
BEAT (37)
BEclear (54)
bedr (0)
beepr (1)
beer (46)
beeswarm (1)
bench (1)
benchdamic (54)
benchmarkme (1)
benchmarkmeData (1)
benchr (1)
BentoBox (0)
BERT (1)
Bessel (1)
bestNormalize (1)
betareg (1)
betr (3)
BeviMed (0)
bezier (1)
BG2 (25)
bgafun (2)
BgeeCall (43)
BgeeDB (73)
BGLR (1)
BGmix (44)
bgx (41)
BH (79)
BHC (93)
BiasedUrn (9)
bibtex (1)
BicARE (87)
biclust (1)
bife (1)
BiFET (41)
biganalytics (1)
bigassertr (1)
bigD (1)
bigdist (1)
BiGGR (43)
biglasso (1)
biglm (1)
biglmm (1)
BigMatrix (0)
bigmelon (48)
bigmemory (1)
bigmemory.sri (1)
bigmemoryExtras (4)
bigparallelr (1)
bigPint (54)
bigreadr (1)
bigrquery (10)
bigsnpr (1)
bigsparser (1)
bigstatsr (1)
bigutils (1)
bigutilsr (1)
billboarder (4)
bim (1)
BiMax (1)
BindingSiteFinder (48)
bindr (1)
bindrcpp (1)
binGroup (1)
binom (1)
binr (0)
bio3d (1)
bioassayR (48)
biobank (1)
Biobase (43631)
biobase (1)
biobroom (155)
biobtreeR (53)
bioc::GenomeInfoDbData (1)
bioCancer (52)
BioCartaImage (4)
BiocBaseUtils (3591)
BiocBook (7)
BiocBookDemo (1)
BiocCaseStudies (3)
BiocCheck (1382)
biocDatasets (1)
BiocDockerManager (45)
BiocFHIR (36)
BiocFileCache (23002)
BiocGenerics (50192)
BioCGenerics (0)
biocGraph (93)
BiocHail (20)
BiocHubsShiny (43)
BiocInstaller (594)
Biocinstaller (0)
biocinstaller (1)
BiocInstallerf (0)
BiocIO (16620)
biocLite (0)
BiocManager (128)
BiocNeighbors (8579)
biocneighbors (1)
BiocOncoTK (58)
Bioconductor (1)
bioconductor (1)
bioconductor-geomxtools (0)
BioCor (64)
BiocParallel (41860)
BiocPkgTools (149)
BiocSet (188)
BiocSingular (10707)
BiocSklearn (49)
BiocStyle (5615)
biocthis (182)
BiocVersion (52568)
Biocversion (1)
biocversion (1)
biocViews (4064)
BiocWorkflowTools (161)
biodb (111)
biodbChebi (44)
biodbExpasy (37)
biodbHmdb (47)
biodbKegg (59)
biodbLipidmaps (37)
biodbMirbase (36)
biodbNcbi (40)
biodbNci (35)
biodbUniprot (40)
bioDist (192)
BioGenerics (1)
Biogenerics (1)
biom (0)
biomanager (1)
biomaRt (21266)
biomart (0)
biomartr (1)
BioMedR (1)
biomformat (4879)
BioMM (38)
BioMVCClass (40)
biomvRCNS (18)
BioNAR (43)
BioNERO (123)
BioNet (203)
bionet (0)
BioNetStat (56)
BioPlex (3)
BioQC (102)
BioSeqClass (5)
biosigner (66)
biostatR (1)
biostatUtil (0)
Biostrings (39597)
biostrings (0)
BiostringsCinterfaceDemo (0)
biosvd (2)
BioTIP (47)
biotmle (50)
BioVersion (1)
biovizBase (5070)
BiRewire (105)
birta (5)
birte (2)
biscuiteer (45)
BiSeq (68)
bit (38)
bit64 (8)
bitops (4)
BitSeq (24)
bizdays (1)
blacksheepr (43)
BlakerCI (1)
blastula (1)
blavaan (1)
blima (38)
BLMA (46)
blme (5)
blob (86)
blockcluster (1)
blockForest (1)
blockmodeling (1)
blogdown (1)
BloodGen3Module (65)
bluster (3960)
BMA (1)
BMisc (1)
BMix (0)
bmp (1)
bnbc (47)
bnem (37)
bnlearn (1)
BOBaFIT (38)
BOIN (1)
bold (1)
bookdown (24)
boot (25)
bootstrap (1)
borealis (30)
Boruta (0)
botor (1)
box (5)
bpcp (1)
BPRMeth (47)
BradleyTerry2 (1)
BRAIN (87)
brainflowprobes (37)
brainImageR (1)
BrainSABER (14)
BrainStars (2)
branchpointer (58)
brave (1)
breakpointR (51)
brendaDb (40)
brew (64)
BRGenomics (136)
brglm (1)
brglm2 (1)
bricks (1)
brickster (1)
bridge (15)
BridgeDbR (78)
bridgedist (0)
bridgesampling (1)
brio (3)
brms (1)
brmsmargins (1)
Brobdingnag (1)
broman (1)
broom (90)
broom.helpers (3)
broom.mixed (1)
BrowserViz (131)
BrowserVizDemo (1)
bs4Dash (5)
BSgenome (11646)
BSGenome (1)
BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 (1)
BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam3 (5)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer11 (1)
BSgenome.Ggallus.ENSEMBL.galGal6 (1)
BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5 (1)
BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (6)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 (8)
BSgenome.Mmul10.SIVmac251 (1)
BSgenome.Mmulatta.NCBI.mmul10.tmp (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 (6)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm39 (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9 (0)
BSgenome.Omela.CUSTOM.oenMel1.1 (1)
BSgenomeForge (34)
BSgenomes (1)
bsicons (1)
bslib (120)
bsplus (1)
bsseq (1189)
bst (0)
btergm (1)
BubbleTree (43)
BufferedMatrix (57)
BufferedMatrixMethods (42)
bugsigdbr (168)
BUMHMM (36)
bumphunter (2344)
BumpyMatrix (324)
BUS (39)
BUScorrect (38)
BUSpaRse (184)
BUSseq (38)
butcher (1)
BuxcoR (0)
bvls (1)
BWStest (1)

C

C50 (1)
ca (3)
cache (1)
cachem (113)
CaDrA (8)
CAEN (31)
CAFE (41)
CAGEfightR (95)
cageminer (37)
CAGEr (99)
cAIC4 (1)
Cairo (5)
CALIB (3)
calib (0)
calibrate (0)
callr (70)
callthat (1)
calm (50)
CAM (1)
CAMERA (418)
campsis (1)
campsismod (1)
CAMTHC (2)
canceR (53)
cancerclass (59)
CancerInSilico (21)
CancerMutationAnalysis (3)
CancerSubtypes (154)
CAnD (5)
candisc (1)
canvasXpress (1)
caOmicsV (3)
caper (1)
capsidr (1)
car (56)
carData (2)
cardelino (46)
Cardinal (126)
CardinalIO (12)
caret (52)
CARNIVAL (128)
carrier (1)
casebase (1)
casper (38)
castor (1)
CATALYST (377)
catboost (1)
catdata (1)
Category (1736)
category (0)
categoryCompare (40)
caTools (3)
CATT (1)
causaldata (1)
CausalR (63)
cba (1)
cbaf (40)
CBEA (44)
cBioPortalData (379)
CBNplot (50)
cbpManager (40)
CBPS (1)
ccaPP (1)
ccdata (8)
ccdrAlgorithm (1)
ccfindR (77)
ccImpute (38)
ccmap (67)
CCPlotR (5)
CCPROMISE (38)
ccrepe (86)
ccube (0)
CDI (3)
cdip.datastore (1)
CDr (1)
celaref (57)
celda (472)
CellaRepertorium (50)
CellBarcode (41)
cellbaseR (54)
CellBench (113)
celldex (1)
cellGrowth (3)
cellHTS (2)
cellHTS2 (115)
CelliD (161)
cellity (47)
CellMapper (40)
cellmigRation (48)
CellMixS (67)
CellNOptR (84)
cellnoptr (0)
cellranger (1)
cellscape (47)
CellScore (37)
CellTrails (42)
cellTree (16)
cellxgenedp (132)
cem (1)
CEMiTool (112)
censcyt (41)
censReg (1)
Cepo (86)
ceRNAnetsim (47)
CeTF (60)
CexoR (38)
CFAssay (54)
cfdnakit (7)
cfDNAPro (40)
cfTools (21)
cgam (1)
cgdsr (1)
CGEN (62)
CGHbase (340)
CGHcall (310)
cghFLasso (0)
cghMCR (48)
CGHnormaliter (39)
CGHregions (55)
ChAMP (535)
ChAMPdata (0)
changepoint (1)
CHARGE (2)
charm (4)
checkmate (30)
checkr (1)
ChemmineOB (290)
ChemmineR (845)
chemminer (0)
chemometrics (1)
CHETAH (83)
ChIC (29)
Chicago (81)
chihaya (30)
chimera (3)
chimeraviz (77)
ChIPanalyser (39)
ChIPComp (47)
chipenrich (100)
ChIPexoQual (37)
ChIPpeakAnno (800)
ChIPQC (335)
ChIPseeker (1680)
chipseq (508)
ChIPseqR (67)
ChIPSeqSpike (5)
ChIPsim (68)
ChIPXpress (55)
chk (2)
chopsticks (86)
CHORD (0)
chroGPS (2)
chromDraw (39)
ChromHeatMap (63)
chromote (2)
ChromoViz (1)
chromPlot (74)
ChromSCape (49)
chromstaR (70)
chromswitch (33)
chromVAR (1009)
chron (2)
CHRONOS (43)
cibersort (1)
cicero (206)
CIMICE (38)
CINdex (57)
cindex (0)
circlesize (1)
circlize (5)
circRNAprofiler (52)
CircSeqAlignTk (29)
circular (0)
cisPath (53)
CiteFuse (84)
Ckmeans.1d.dp (1)
class (64)
ClassDiscovery (1)
ClassifyR (132)
classInt (17)
cleanrmd (1)
cleanUpdTSeq (48)
cleaver (145)
clevRvis (28)
cli (124)
clinfun (1)
ClinicalQc (1)
clinPK (0)
ClinViz (1)
clippda (40)
clipper (77)
clipr (40)
cliProfiler (41)
cliqueMS (83)
clisymbols (1)
clock (22)
Clomial (50)
Clonality (37)
clonotypeR (7)
clst (47)
clstutils (45)
clubSandwich (1)
clue (20)
CluMSID (48)
clustComp (56)
cluster (59)
clusterCrit (1)
clusterExperiment (322)
ClusterFoldSimilarity (1)
clusterGeneration (2)
ClusterJudge (52)
clustermq (3)
clusterprofielr (0)
clusterProfiler (15513)
clusterprofiler (1)
ClusterProfiler (1)
ClusterR (1)
clusterRepro (0)
clusterSeq (24)
ClusterSignificance (52)
clusterSim (1)
clusterStab (67)
clusthaplo (0)
clustifyr (120)
ClustIRR (4)
clustMixType (1)
clustree (1)
clv (1)
clValid (1)
CMA (102)
cmapR (334)
cmdstanr (1)
CMplot (1)
cmprsk (1)
CmsAnalytics (1)
cn.farms (44)
cn.mops (182)
CNAnorm (46)
cnanorm (0)
CNAqc (0)
CNEr (2222)
CNORdt (38)
CNORfeeder (41)
CNORfuzzy (38)
cNORM (0)
CNORode (63)
CNPBayes (2)
CNTools (79)
cntools (0)
CNVfilteR (41)
CNVgears (47)
cnvGSA (39)
CNViz (36)
CNVMetrics (35)
CNVPanelizer (49)
CNVRanger (77)
CNVrd2 (36)
CNVtools (3)
cnvtools (0)
cobalt (1)
cobindR (2)
cobs (1)
CoCiteStats (34)
COCOA (41)
coda (2)
codelink (53)
codetools (22)
CODEX (65)
coexnet (16)
CoGAPS (137)
cogena (74)
cogeqc (51)
Cogito (37)
coGPS (51)
COHCAP (60)
coin (1)
cola (120)
collapse (1)
collections (1)
CollessLike (0)
coloc (11)
colorfulVennPlot (1)
colorRamps (7)
colorspace (38)
colortools (1)
colourpicker (4)
colourvalues (1)
comapr (39)
combi (41)
combinat (1)
coMET (70)
coMethDMR (38)
ComICS (0)
commentr (1)
common (1)
CommonJavaJars (1)
commonmark (96)
compareDF (1)
compareGroups (1)
compartmap (38)
COMPASS (56)
compcodeR (68)
compEpiTools (47)
CompGO (3)
compiler (0)
ComplexHeatmap (12027)
complexheatmap (1)
compositions (2)
CompoundDb (333)
CompQuadForm (1)
ComPrAn (46)
compSPOT (4)
compute.es (1)
concaveman (1)
conclus (13)
concordexR (41)
condcomp (1)
condiments (55)
conditionz (1)
condMVNorm (1)
coneproj (1)
conf.design (1)
CONFESS (39)
config (9)
confintr (1)
conflicted (9)
connectwidgets (1)
conquer (2)
consensus (52)
ConsensusClusterPlus (2674)
consensusDE (41)
consensusOV (59)
consensusSeekeR (73)
consICA (47)
consort (1)
ConsRank (1)
CONSTANd (51)
contfrac (1)
contiBAIT (37)
conumee (129)
convert (113)
coop (1)
copa (42)
COPDSexualDimorphism (1)
copula (1)
copynumber (230)
CopyNumber450k (1)
CopyNumberPlots (85)
CopywriteR (26)
coRdon (121)
CoRegFlux (2)
CoRegNet (59)
CoreGx (177)
Cormotif (36)
CorMut (3)
coRNAi (3)
coro (1)
corpcor (1)
corpora (1)
corral (64)
correlation (1)
CORREP (54)
corrplot (2)
corrr (1)
coseq (95)
CoSIA (29)
cosmiq (37)
cosmo (2)
cosmoGUI (2)
cosmosR (58)
COSNet (57)
COTAN (55)
CountClust (5)
countrycode (8)
countsimQC (86)
covEB (36)
coveffectsplot (1)
CoverageView (52)
covr (62)
covRNA (37)
CovSel (0)
cowplot (3)
coxme (1)
coxphf (1)
cplm (1)
cpm (1)
cpp11 (97)
cpvSNP (39)
cqn (210)
cranlogs (1)
crayon (80)
crch (1)
creatr (1)
credentials (18)
crew (1)
crew.cluster (1)
CRImage (52)
CRISPR.shinyapp (1)
crisprBase (81)
crisprBowtie (77)
crisprBwa (46)
crisprDesign (64)
crisprScore (85)
CRISPRseek (90)
crisprseekplus (30)
CrispRVariants (80)
crisprVerse (51)
crisprViz (58)
crlmm (123)
crop (1)
crossdes (1)
CrossICC (1)
crossmatch (1)
crossmeta (78)
crosstable (1)
crosstalk (58)
crrri (0)
crrry (0)
crul (5)
CSAR (67)
csaw (397)
csawBook (5)
csdR (39)
csSAM (0)
CSSP (51)
CSSQ (37)
csv (1)
ctc (241)
CTdata (27)
CTDquerier (40)
CTexploreR (1)
ctgGEM (3)
ctmle (0)
cTRAP (44)
ctree (0)
ctsGE (41)
CTSV (36)
cubature (1)
cubelyr (1)
Cubist (1)
cummeRbund (215)
cummerbund (1)
CuratedAtlasQueryR (8)
curatedMetagenomicData (0)
curl (172)
customCMPdb (38)
customProDB (57)
cvar (1)
cvAUC (1)
CVE (2)
cvms (1)
CVST (1)
CVXR (1)
cxAnalysis (0)
cyanoFilter (32)
cycle (36)
cyclocomp (8)
cydar (63)
CytoDx (40)
cytofast (3)
cytofkit (19)
CyTOFpower (36)
cytofQC (21)
CytoGLMM (47)
cytoKernel (34)
cytolib (2328)
cytomapper (212)
cytoMEM (60)
CytoML (499)
CytoPipeline (29)
CytoPipelineGUI (5)
CytoTRACE (1)
CytoTree (20)
cytoviewer (43)

D

D0.db (1)
D2C (1)
d3Network (0)
d3r (1)
dada2 (2108)
dae (1)
dagitty (1)
dagLogo (49)
daMA (53)
DAMEfinder (40)
DaMiRseq (56)
DAPAR (90)
DART (58)
DASC (1)
DASiR (2)
dasnormalize.iomel (1)
dasper (31)
data.table (77)
data.tree (2)
DataEditR (1)
datamods (5)
DataOmnio (1)
datapasta (1)
datapipeline (1)
datasets (0)
datawizard (2)
DAVIDQuery (3)
dbaccess (1)
dbarts (1)
DBChIP (5)
DBI (29)
DBItest (1)
dbplyr (81)
dbscan (2)
dcanr (84)
DCATS (9)
DCchoice (1)
dcdatr (1)
dce (45)
dcGSA (39)
DChIPRep (2)
ddalpha (1)
DDCompanion (1)
ddCt (76)
ddgraph (1)
DDiGGER (0)
ddPCRclust (44)
deal (0)
dearseq (120)
debCAM (50)
debrowser (118)
debugme (1)
DECIPHER (2384)
deco (15)
DEComplexDisease (15)
decompTumor2Sig (70)
DeconRNASeq (194)
decontam (1388)
decontX (13)
deconvR (47)
decor (1)
decoupleR (753)
DEDS (3)
Deducer (1)
DeepBlueR (46)
DeepPINCS (37)
deepSNV (95)
DEFormats (215)
DegNorm (48)
DEGraph (41)
degraph (0)
DEGreport (468)
DEGseq (155)
degseq (0)
Delaporte (1)
DelayedArray (41050)
DelayedDataFrame (42)
DelayedMatrixStats (14567)
DelayedRandomArray (45)
DelayedTensor (35)
deldir (21)
DELocal (25)
deltaCaptureC (38)
deltaGseg (47)
DeMAND (53)
DeMixT (72)
demuxmix (134)
demuxSNP (11)
dendextend (49)
DendSer (1)
dendsort (0)
densEstBayes (3)
densityClust (0)
densvis (2682)
DEoptim (1)
DEoptimR (12)
DEP (437)
DepecheR (215)
DepInfeR (36)
DEqMS (197)
derfinder (463)
derfinderHelper (460)
derfinderPlot (85)
Deriv (1)
desc (75)
DEScan2 (40)
descr (1)
descsuppR (1)
DescTools (5)
DESeq (275)
deseq (0)
DESeq2 (19432)
deseq2 (1)
designmatch (1)
DEsingle (253)
deSolve (45)
DESpace (24)
destiny (659)
DEsubs (44)
devEMF (1)
devtools (59)
DEWSeq (46)
DEXICA (0)
DExMA (50)
DEXSeq (1322)
dexus (4)
dfidx (1)
dfoptim (1)
DFP (36)
DHARMa (1)
diagram (1)
DiagrammeR (3)
DiagrammeRsvg (1)
DIAlignR (44)
dials (8)
DiceDesign (1)
DiceKriging (1)
diceR (1)
dichromat (1)
did (1)
DiffBind (999)
diffcoexp (75)
diffcyt (233)
diffdf (1)
DifferentialRegulation (40)
diffGeneAnalysis (45)
diffgeneanalysis (0)
diffHic (90)
DiffLogo (64)
diffloop (34)
diffobj (2)
diffuStats (57)
diffUTR (33)
diffviewer (1)
digest (166)
diggit (40)
dimRed (1)
Dino (39)
diptest (1)
dir.expiry (3347)
directlabels (1)
Director (46)
DirichletMultinomial (3368)
discordant (66)
DiscoRhythm (52)
DiscriMiner (0)
disk.frame (1)
distances (1)
distill (1)
distillery (0)
distinct (112)
distr (0)
distr6 (1)
distrEx (0)
distributional (9)
DistributionUtils (1)
distro (1)
dittodb (1)
dittoSeq (1015)
divergence (34)
diveRsity (0)
djvdj (1)
dks (45)
dlookr (1)
dlstats (1)
dm (1)
DMCFB (33)
DMCHMM (37)
DMRcaller (65)
DMRcate (751)
DMRcatedata (0)
DMRforPairs (34)
DMRScan (35)
dmrseq (124)
DMwR (0)
DNABarcodeCompatibility (36)
DNABarcodes (139)
DNAcopy (4791)
dnacopy (1)
DNAfusion (36)
DNaseR (1)
DNAshapeR (63)
dndscv (0)
do (1)
DO.db (6)
doBy (1)
dockerfiler (1)
docopt (4)
DoE.base (1)
DoEstRare (1)
doFuture (1)
domainsignatures (2)
doMC (1)
DominoEffect (38)
doMPI (1)
doParallel (29)
doppelgangR (55)
DOQTL (3)
doRedis (1)
doRNG (2)
dorothea (1)
Doscheda (37)
DOSE (14866)
Dose (1)
DoseFinding (1)
doseR (37)
doSNOW (1)
dotCall64 (3)
dotwhisker (1)
DoubletFinder (1)
doubletrouble (32)
downlit (21)
downloader (1)
downloadthis (1)
dparser (1)
DPClust (0)
dpclust3p (0)
dpeak (32)
dplyr (183)
dplyrb (1)
dqrng (13)
dr (0)
drake (3)
drat (1)
drawProteins (142)
drc (1)
DRDID (1)
dream (1)
dreamerr (1)
dreamlet (7)
drgee (1)
DRIMSeq (301)
DriverNet (55)
DropletUtils (2516)
drosophila2probe (1)
DRR (1)
drugTargetInteractions (48)
DrugVsDisease (44)
dSimer (2)
DSS (989)
dStruct (33)
DT (125)
DTA (64)
dtangle (0)
dtplyr (48)
DTRreg (0)
dttr2 (1)
dtw (1)
dtwclust (1)
dualKS (3)
duckdb (2)
duct.tape (1)
dummies (0)
Dune (36)
DupChecker (2)
dupRadar (87)
dyebias (38)
dygraphs (1)
dynamicTreeCut (1)
DynDoc (1127)
dyndoc (0)
dynfeature (1)
dynlm (1)
dynplot (1)
dynpred (1)
dynwrap (1)

E

e1071 (11)
earth (1)
easier (98)
EasyABC (0)
EasyCellType (47)
easyENTIM (1)
easylift (5)
easypar (0)
EasyqpcR (4)
easyreporting (49)
easyRNASeq (69)
easyrnaseq (0)
easystats (1)
ebal (1)
EBarrays (128)
EBcoexpress (54)
EBImage (2425)
ebimage (0)
EBSEA (39)
EBSeq (348)
EBSeqHMM (55)
Ecdat (1)
Ecfun (1)
echarts4r (8)
ecodist (1)
ecolitk (38)
ECOSolveR (1)
EDASeq (1578)
edd (2)
EDDA (2)
edge (82)
edgeR (19755)
edger (1)
EDIRquery (21)
eds (240)
eegc (39)
effects (1)
effectsize (2)
EGAD (51)
egg (5)
EGSEA (131)
eha (1)
eiR (41)
eisa (4)
eisaR (83)
elasticsearchr (1)
ELBOW (2)
ellipse (48)
ellipsis (10)
elliptic (1)
ELMER (167)
emayili (1)
embed (1)
EMD (1)
emdbook (4)
emdist (1)
EMDomics (56)
emmeans (66)
EMMREML (1)
EmpiricalBrownsMethod (82)
emulator (1)
enc (0)
encode (1)
ENCODExplorer (3)
encryptr (1)
energy (1)
engitix.singlecell.db (1)
engitomixmk2 (1)
english (1)
EnhancedVolcano (3762)
enhancedvolcano (1)
enhancerHomologSearch (38)
EnMCB (34)
ENmix (173)
EnrichedHeatmap (506)
EnrichmentBrowser (408)
enrichplot (16087)
enrichR (1)
enrichTF (61)
enrichViewNet (4)
enrichwith (1)
EnsDb.Hsapiens.v75 (4)
EnsDb.Hsapiens.v79 (4)
EnsDb.Hsapiens.v86 (6)
EnsDb.Mmusculus.v79 (1)
ensembldb (8840)
ensemblVEP (116)
entropy (1)
ENVISIONQuery (2)
EnvStats (1)
Epi (1)
epialleleR (42)
EpiCluster (0)
EpiCompare (42)
epidecodeR (34)
EpiDISH (402)
epigenomix (39)
epigraHMM (41)
epihet (15)
EpiMix (32)
epimutacions (41)
epiNEM (55)
EpiNow2 (1)
epiR (2)
epistack (39)
epistasisGA (33)
EpiStats (1)
epitools (1)
EpiTxDb (46)
epivizr (48)
epivizrChart (41)
epivizrData (67)
epivizrServer (88)
epivizrStandalone (51)
equatags (1)
equate (1)
equivalence (1)
erccdashboard (50)
ergm (1)
ergm.count (0)
erify (1)
erma (62)
ERSSA (39)
esATAC (78)
escape (227)
escheR (32)
esetVis (55)
esquisse (1)
estimability (7)
estimatr (1)
estmeansd (1)
etm (1)
eudysbiome (33)
europepmc (1)
evaluate (173)
EValue (1)
evaluomeR (41)
evd (1)
EventPointer (46)
eventTrack (1)
EWCE (124)
Exact (1)
exact2x2 (1)
exactci (1)
exactextractr (1)
exactRankTests (2)
ExCluster (35)
ExiMiR (41)
exomeCopy (204)
exomecopy (0)
ExomeDepth (1)
exomePeak (7)
exomePeak2 (88)
exonfindR (0)
exonmap (3)
ExperimentHub (6375)
ExperimentHubData (211)
ExperimentSubset (37)
expint (1)
explorase (4)
explore (1)
ExploreModelMatrix (127)
ExplorOMICS (1)
expm (3)
ExpressionAtlas (105)
ExpressionView (3)
exprExternal (1)
expsmooth (0)
expss (5)
externalVector (1)
extraChIPs (40)
extraDistr (4)
extrafont (1)
extrafontdb (1)
extraInserts (1)
extraoperators (1)
extraTrees (0)
extRemes (0)

F

fabia (128)
fabletools (1)
facets (0)
facopy (1)
factDesign (40)
factoextra (1)
FactoInvestigate (1)
FactoMineR (46)
Factoshiny (1)
factR (39)
fail (0)
FamAgg (56)
famat (38)
fansi (113)
faraway (1)
farms (52)
farver (12)
fastcluster (1)
fastDummies (12)
fasterize (1)
fastGHQuad (1)
fastICA (2)
fastLiquidAssociation (40)
fastmap (50)
fastmatch (12)
FastqCleaner (77)
fastreeR (65)
fastseg (651)
fastshap (1)
fasttime (1)
fastverse (1)
fauxpas (1)
fBasics (2)
fbat (2)
FCBF (63)
fCCAC (35)
fCI (49)
fcoex (50)
fcScan (36)
FD (1)
fda (7)
FDb.InfiniumMethylation.hg19 (5)
fdrame (51)
fdrtool (1)
fds (5)
FEAST (89)
feather (1)
FeatSeekR (27)
feature (4)
FedData (1)
fedup (37)
feisr (1)
FELLA (121)
FEM (21)
fenr (5)
ff (53)
ffbase (0)
FField (0)
ffpe (50)
fftw (0)
fftwtools (1)
fGarch (1)
fgga (35)
FGNet (74)
fgsea (14795)
fields (3)
filehash (1)
filelock (5)
filesstrings (1)
FilterFFPE (36)
finalfit (1)
FindIT2 (45)
FindMyFriends (4)
findpython (6)
finetune (1)
fingerprint (1)
FISHalyseR (37)
fishHook (0)
fishMod (0)
fishpond (311)
fit.models (1)
fitdistrplus (9)
FitHiC (61)
fixest (1)
flagme (40)
flair (1)
FLAMES (50)
flashClust (1)
flexclust (1)
flexdashboard (2)
flexmix (1)
flexsurv (1)
flexsurvcure (1)
flextable (13)
flipflop (2)
float (1)
flock (1)
flowAI (469)
flowBeads (37)
flowBin (36)
flowcatchR (39)
flowCHIC (36)
flowCL (14)
flowClean (203)
flowClust (748)
flowclust (1)
flowCore (2253)
FlowCore (1)
flowcore (1)
flowCut (75)
flowCyBar (50)
flowDensity (173)
flower (1)
flowFit (4)
flowFlowJo (3)
flowFP (70)
flowGate (33)
flowGraph (51)
flowMap (49)
flowMatch (41)
flowMeans (87)
flowMerge (62)
flowPeaks (125)
flowPhyto (1)
flowPloidy (43)
flowPlots (40)
flowQ (2)
flowq (0)
flowQB (2)
FlowRepositoryR (4)
FlowSOM (928)
FlowSorted.Blood.EPIC (8)
FlowSorted.CordBloodCombined.450k (8)
flowSpecs (47)
flowSpy (2)
flowStats (501)
flowTime (43)
flowTrans (53)
flowType (4)
flowUtils (37)
flowViz (922)
flowVS (83)
flowWorkspace (1109)
flowworkspace (0)
flowWorkspaceData (0)
flux (1)
fma (0)
fmcsR (202)
FME (1)
fmrs (90)
fmsb (1)
FMStable (1)
fmtr (1)
FNN (9)
fobitools (36)
focalCall (2)
foghorn (1)
FoldGO (35)
fontawesome (91)
fontBitstreamVera (1)
fontcm (1)
fontLiberation (1)
fontquiver (1)
forcats (16)
foreach (6)
forecast (3)
foreign (23)
forestplot (1)
forestploter (1)
fork (1)
formatR (19)
formattable (1)
formatters (1)
Formula (6)
formula.tools (1)
forrester.metadata (0)
fortunes (1)
fossil (0)
FourCSeq (4)
fpc (1)
fpp (0)
fracdiff (1)
FRASER (94)
frenchFISH (44)
fresh (5)
FrF2 (1)
FRGEpistasis (49)
frma (94)
frmaTools (44)
fs (175)
FScanR (41)
fst (1)
fstcore (1)
fTrading (1)
FunChIP (47)
FunciSNP (3)
fungible (1)
funtooNorm (34)
furrr (9)
FuseSOM (41)
futile.logger (1)
futile.options (1)
future (71)
future.apply (30)
future.batchtools (1)
future.callr (3)
fuzzyjoin (1)
fwb (1)

G

g3viz (1)
GA (1)
GA4GHclient (42)
ga4ghclient (0)
GA4GHshiny (35)
gada (0)
gaga (47)
gage (828)
gaggle (35)
gaia (25)
gam (2)
gamboostLSS (1)
gamlss (2)
gamlss.data (1)
gamlss.dist (2)
gamlss.tr (0)
gamm4 (1)
gap (1)
gap.datasets (1)
gapfill (0)
GAPGOM (4)
gapminder (1)
GAprediction (51)
garfield (55)
gargle (69)
GARS (37)
gaston (0)
GateFinder (36)
gatom (4)
gaucho (2)
gbm (1)
gbRd (1)
GBScleanR (35)
gbutils (1)
gcapc (46)
gcatest (38)
gclus (1)
gCMAP (4)
gCMAPWeb (3)
gCrisprTools (43)
gcrma (1294)
GCS (1)
GCSConnection (2)
GCSFilesystem (5)
GCSscore (33)
gdata (9)
GDCRNATools (224)
gdistance (0)
gDNAx (6)
gDR (8)
gDRcore (8)
gDRimport (9)
gDRstyle (10)
gDRutils (9)
GDSArray (72)
gdsfmt (1975)
gdtools (13)
gee (1)
geecc (2)
geepack (1)
geigen (1)
geiger (0)
GEM (54)
gemini (52)
gemma.R (46)
gemtc (1)
GenABEL (3)
GenABEL.data (3)
genArise (47)
genbankr (167)
GENE.E (2)
gene2pathway (2)
GeneAccord (14)
GeneAnswers (17)
geneAttribution (38)
GeneBreak (47)
geneClassifiers (38)
GeneExpressionSignature (46)
genefilter (13593)
genefu (336)
GeneGA (39)
GeneGeneInteR (40)
GeneGroupAnalysis (2)
geneLenDataBase (8)
GeneMeta (62)
GeneNet (0)
GeneNetworkBuilder (51)
GeneOverlap (291)
geneplast (72)
geneplotter (11505)
GeneR (2)
GeneralizedHyperbolic (1)
geneRecommender (39)
GeneRegionScan (42)
GeneRfold (1)
generics (13)
geneRxCluster (39)
GeneSelectMMD (53)
GeneSelector (3)
GENESIS (296)
genesis (1)
GeneSpring (2)
GeneStructureTools (58)
geNetClassifier (78)
genetics (0)
GeneticsBase (2)
GeneticsDesign (3)
GeneticsPed (100)
GeneTonic (135)
GeneTraffic (1)
GeneTS (1)
geneXtendeR (49)
GENIE3 (1024)
genoCN (51)
GenoGAM (3)
genomation (549)
GenomAutomorphism (35)
GenomeBase (1)
GenomeGraphs (7)
GenomeInfoDb (49817)
genomeinfodb (0)
GenomeInfoDB (1)
GenomeInfoDbData (18)
genomeIntervals (107)
genomeintervals (0)
GenomelnfoDb (0)
genomes (61)
GenomicAlignments (20977)
genomicalignments (0)
GenomicDataCommons (1120)
GenomicDistributions (75)
GenomicDistributionsData (1)
GenomicFeatures (17251)
genomicfeatures (0)
GenomicFiles (1012)
genomicInstability (37)
GenomicInteractionNodes (34)
GenomicInteractions (260)
GenomicOZone (37)
GenomicPlot (4)
GenomicRanges (37586)
GenomicScores (458)
GenomicSuperSignature (43)
GenomicTools (1)
GenomicTuples (37)
Genominator (3)
genoset (10)
genotypeeval (20)
GenoView (1)
genphen (3)
GenProSeq (31)
GenRank (2)
GenSA (1)
GenVisR (339)
geodata (1)
GeoDiff (68)
geodiv (1)
GEOexplorer (52)
GEOfastq (59)
geohashTools (1)
geojson (1)
geojsonio (1)
geojsonsf (1)
GEOmap (4)
GEOmetadb (181)
geometadb (0)
geometries (4)
geometry (1)
geomorph (1)
geomtextpath (1)
GeomxTools (279)
GEOquery (8237)
geoquery (1)
GEoquery (1)
geoR (1)
geos (1)
GEOsearch (2)
geosphere (8)
GEOsubmission (38)
GeoTcgaData (41)
gep2pep (42)
gert (29)
gespeR (50)
gestalt (2)
gestate (1)
getDEE2 (47)
getip (1)
getopt (15)
GetoptLong (2)
getPass (1)
getSVCNVperGene0.94 (0)
gettz (1)
geva (46)
GEWIST (45)
gff3Plotter (1)
gfonts (1)
gg4way (4)
ggalluvial (1)
GGally (2)
gganimate (1)
GGBase (6)
ggbeeswarm (3)
ggbio (1936)
ggbreak (1)
ggcorrplot (1)
ggcyto (837)
ggdag (1)
ggdendro (6)
ggdist (2)
gge (1)
ggeasy (1)
ggeffects (2)
ggExtra (1)
ggfittext (1)
ggforce (3)
ggforestplot (0)
ggformula (7)
ggfortify (2)
ggfun (19)
gggenes (1)
ggh4x (1)
gghalves (1)
gghighlight (1)
ggimage (1)
gginnards (1)
ggiraph (1)
ggkegg (25)
ggm (1)
ggmanh (80)
ggmap (42)
ggmosaic (1)
ggmsa (410)
ggnetwork (1)
ggnewscale (13)
ggnewscales (1)
ggokabeito (1)
GGPA (38)
ggpattern (1)
ggplot (1)
ggplot2 (120)
ggplot2movies (1)
ggplotify (15)
ggpmisc (3)
ggPMX (1)
ggpointdensity (4)
ggpp (3)
ggprism (1)
ggpubr (13)
ggRandomForests (0)
ggraph (3)
ggrastr (6)
ggrepel (41)
ggridges (10)
ggsc (9)
ggsci (52)
ggseqlogo (5)
ggside (1)
ggsignif (4)
ggspavis (82)
ggstance (1)
ggstatsplot (1)
ggsurvfir (1)
ggsurvfit (1)
ggtext (1)
ggthemes (5)
GGtools (6)
ggtree (17480)
ggtreeDendro (48)
ggtreeExtra (858)
ggvenn (1)
ggVennDiagram (1)
ggvis (0)
gh (58)
ghql (1)
gifski (1)
GIGSEA (52)
GillespieSSA (0)
Giotto (1)
girafe (72)
GISPA (42)
git2r (48)
gitcreds (12)
gitlabr (1)
GLAD (190)
GladiaTOX (37)
glasso (0)
glassoFast (1)
glca (1)
gld (1)
Glimma (1157)
gllvm (0)
glmGamPoi (2571)
GLMMadaptive (1)
glmmADMB (0)
glmmML (1)
glmmTMB (1)
glmnet (13)
glmnetUtils (2)
glmSparseNet (84)
glmx (1)
GlobalAncova (834)
GlobalOptions (1)
globals (12)
globals, (1)
globalSeq (52)
globaltest (1582)
GloScope (4)
glpgStyle (1)
glpgTesteR (1)
glpkAPI (1)
glue (16)
gmailr (1)
gmapR (75)
gMCP (1)
GmicR (48)
Gmisc (1)
gmm (1)
gmnl (1)
gmodels (1)
gmoviz (39)
gmp (9)
GMRP (36)
GNET2 (41)
gnm (1)
gnomAD (1)
GNOSIS (4)
GO.db (14)
goCluster (1)
GOexpress (81)
goftest (1)
GOfuncR (230)
GOFunction (3)
golem (3)
golubEsets (1)
gomms (0)
gongs (1)
googleAuthR (1)
googleCloudStorageR (1)
googledrive (61)
GoogleGenomics (2)
googlesheets4 (65)
googleVis (1)
GOplot (0)
GOpro (57)
goProfiles (67)
goprofiles (0)
GOSemSim (14300)
gosemsim (0)
goseq (1147)
goshawk (1)
GOSim (117)
goSorensen (32)
goSTAG (44)
GOstats (1595)
gostats (1)
GOsummaries (54)
GOTHiC (60)
goTools (49)
gotools (0)
gower (9)
GPA (52)
GPArotation (43)
gpart (11)
GPfit (1)
gplots (3)
gpls (110)
gprege (4)
gprofiler2 (1)
gpuMagic (40)
gQTLBase (4)
gQTLstats (4)
gRain (1)
gramm4R (2)
GRaNIE (71)
granny (1)
granulator (128)
graper (52)
grapg (1)
graph (17197)
GraphAlignment (55)
GraphAT (37)
graphat (0)
graphics (0)
graphite (2597)
graphlayouts (12)
GraphPAC (39)
graphql (1)
gRbase (1)
grDevices (0)
Greg (1)
GRENITS (53)
GreyListChIP (861)
grf (1)
grid (0)
gridBase (1)
gridExtra (1)
gridGraphics (1)
gridpattern (1)
gridSVG (1)
gridtext (1)
GRmetrics (71)
groHMM (53)
groupdata2 (1)
grpreg (1)
grr (1)
GRridge (24)
GSA (0)
gsalib (0)
GSALightning (55)
GSAR (96)
gsbDesign (1)
GSCA (44)
gscounts (1)
gscreend (38)
gsDesign (1)
GSEABase (7799)
gseabase (0)
GSEABenchmarkeR (60)
GSEAlm (59)
GSEAmining (65)
gsean (43)
GSgalgoR (50)
gsignal (1)
gsl (2)
gsmoothr (5)
gson (3)
gsrc (0)
GSReg (42)
GSRI (40)
gss (2)
gstat (1)
gsubfn (1)
GSVA (4881)
GSVAdata (1)
gsw (0)
gt (3)
gtable (108)
gto (1)
gtools (16)
gtrellis (96)
gtsummary (3)
gtx (0)
gubraqsar (1)
GUIDEseq (49)
Guitar (120)
GUniFrac (1)
gupio (1)
gUtils (0)
GUTS (0)
Gviz (3543)
GWAS.BAYES (50)
gwascat (466)
GWASExactHW (5)
gwasrapidd (1)
GWASTools (587)
gwasurvivr (72)
GWENA (116)
gWidgets (1)
gWidgets2tcltk (0)
gWidgetstcltk (1)

H

h2o (1)
h5vc (54)
HAC (1)
hal9001 (1)
HandTill2001 (1)
hapFabia (37)
HaploSim (1)
hardhat (50)
HardyWeinberg (1)
Harman (134)
HarmonizR (6)
harmony (3)
Harshlight (39)
harshlight (0)
hash (1)
haven (48)
hca (55)
HCABrowser (2)
HCAExplorer (1)
HCAMatrixBrowser (2)
HCsnip (2)
HDCytoData (1)
HDF5Array (10428)
hdf5r (1)
hdi (1)
HDInterval (8)
hdm (0)
HDO.db (4)
hdrcde (5)
HDTD (51)
heatmap.plus (0)
heatmap3 (0)
heatmaply (9)
heatmaps (237)
Heatplus (329)
heemod (1)
HelloRanges (78)
HELP (40)
helperMut (0)
HEM (37)
heplots (1)
here (1)
hermes (83)
HERON (5)
Herper (154)
hexbin (11)
hexSticker (1)
hexView (1)
HGC (58)
hgu133a.db (1)
hgu133plus2.db (6)
hgu219.db (1)
hgu95a.db (1)
hgu95av2.db (1)
hgug4112a.db (0)
hiAnnotator (59)
HIBAG (128)
HiCBricks (86)
hicbricks (0)
HiCcompare (192)
HiCDCPlus (62)
HiCDOC (46)
HiCExperiment (55)
HiClimR (1)
HiContacts (79)
HiCool (35)
hicrep (8)
hicVennDiagram (5)
hierfstat (0)
hierGWAS (53)
hierinf (46)
highcharter (1)
highlight (1)
highr (70)
highs (1)
HilbertCurve (74)
HilbertVis (140)
HilbertVisGUI (24)
HiLDA (37)
hipathia (66)
HIPPO (37)
hiReadsProcessor (43)
HIREewas (50)
HiTC (121)
hmdbQuery (65)
Hmisc (15)
HMMcopy (276)
hms (105)
Homo.sapiens (5)
hoodscanR (5)
Hoover (1)
hopach (200)
HPAanalyze (120)
hpar (223)
HPAStainR (36)
HPiP (49)
hrbrthemes (1)
HSAUR2 (1)
HSAUR3 (1)
hsm (1)
HSMMSingleCell (1)
htmlTable (10)
htmltools (208)
htmlwidgets (169)
HTqPCR (120)
HTSanalyzeR (4)
HTSeqGenie (33)
htSeqTools (5)
htseqtools (0)
HTSFilter (172)
htslib (1)
httpcode (1)
httpgd (1)
httptest (1)
httpuv (102)
httr (173)
httr2 (50)
HubPub (96)
huge (1)
HumanTranscriptomeCompendium (44)
hummingbird (37)
hunspell (2)
huxtable (1)
hwriter (2)
HWxtest (0)
HybridMTest (70)
hypeR (76)
hyperdraw (52)
hypergeo (1)
hypergraph (69)
hyperSpec (1)

I

IAPWS95 (1)
iASeq (49)
iasva (37)
iBBiG (89)
ibh (55)
iBMQ (29)
ica (2)
iCARE (80)
icenReg (1)
Icens (323)
icetea (35)
iCheck (35)
iChip (35)
ichorCNA (0)
iClusterPlus (299)
iCNV (38)
iCOBRA (147)
ICS (1)
ICSOutlier (1)
ideal (96)
ideogram (0)
IdeoViz (56)
idiogram (40)
IdMappingAnalysis (2)
IdMappingRetrieval (2)
IDPmisc (1)
idpr (54)
idr (0)
idr2d (38)
ids (1)
ieugwasr (0)
IFAA (35)
iFlow (2)
iGasso (1)
iGC (50)
IgGeneUsage (38)
igraph (47)
igraphdata (1)
igvR (97)
igvShiny (1)
iheatmapr (3)
IHW (598)
Illumina450ProbeVariants.db (0)
IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 (6)
IlluminaHumanMethylation450kmanifest (5)
IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19 (5)
IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b4.hg19 (5)
IlluminaHumanMethylationEPICmanifest (5)
illuminaio (2614)
ILoReg (35)
imageHTS (21)
imager (1)
imagerExtra (0)
IMAS (40)
imbalance (1)
imcRtools (149)
Imetagene (2)
iml (0)
IMMAN (42)
ImmuneSpaceR (48)
immunoClust (40)
immunotation (49)
IMPCdata (48)
import (1)
ImpulseDE (2)
ImpulseDE2 (7)
impute (9816)
imputeTS (1)
IncDTW (1)
INDEED (48)
ineq (0)
iNETgrate (14)
infer (9)
infercnv (1012)
inferCNV (1)
infinityFlow (46)
influenceR (3)
Informeasure (45)
infotheo (1)
ini (1)
InkblotAnalytics (19)
INLA (0)
inline (1)
inlinedocs (1)
InPAS (39)
INPower (52)
insight (3)
inSilicoDb (5)
inSilicoMerging (7)
insilicomerging (0)
INSPEcT (49)
INTACT (26)
InTAD (38)
intamap (1)
intansv (47)
interacCircos (64)
InteractionSet (1515)
InteractiveComplexHeatmap (287)
interactiveDisplay (75)
interactiveDisplayBase (9331)
InterCellar (67)
IntEREst (42)
intergraph (1)
InterMineR (51)
interp (2)
interpretR (0)
interval (1)
intervals (2)
IntOMICS (26)
IntramiRExploreR (38)
inum (2)
inveRsion (5)
inversion (0)
invgamma (1)
IONiseR (52)
iontree (2)
iPAC (44)
ipaddress (1)
iPath (37)
ipcwswitch (1)
ipdDb (46)
IPDfromKM (1)
ipmisc (0)
IPO (115)
IPPD (4)
ipred (49)
irace (0)
IRanges (46161)
iranges (1)
IRdisplay (1)
IRISFGM (38)
IrisSpatialFeatures (1)
IRkernel (1)
irlba (12)
irr (1)
ISAnalytics (42)
iSEE (337)
iSEEde (9)
iSEEhex (77)
iSEEhub (40)
iSEEindex (9)
iSEEpathways (6)
iSEEu (81)
iSeq (49)
ISLET (38)
ISLR (1)
iSNetwork (1)
Iso (1)
isoband (37)
isobar (64)
IsoBayes (4)
ISOcodes (1)
IsoCorrectoR (62)
IsoCorrectoRGUI (42)
IsoformSwitchAnalyzeR (240)
IsoGeneGUI (3)
ISoLDE (49)
isomiRs (57)
iSPlot (1)
isva (5)
ISwR (1)
ITALICS (41)
iterativeBMA (39)
iterativebma (0)
iterativeBMAsurv (48)
iterativebmasurv (0)
iterators (6)
iterClust (41)
iteremoval (3)
itertools (1)
itsadug (1)
IVAS (47)
ivpack (0)
ivprobit (1)
ivreg (1)
ivygapSE (35)
IWTomics (37)

J

JADE (1)
jagsUI (1)
janeaustenr (1)
janitor (2)
JASPAR2016 (1)
JASPAR2018 (1)
JASPAR2020 (5)
JavaGD (1)
JBTools (0)
jcolors (1)
JGR (1)
jiebaR (0)
jiebaRD (0)
JM (1)
JMbayes (1)
jmosaics (2)
jnjtemplates (1)
joda (2)
joineRML (1)
jomo (1)
jose (1)
jpeg (7)
jqr (2)
jquerylib (1)
js (1)
jsonify (1)
jsonlite (173)
jsTreeR (1)
jtools (1)
juicyjuice (1)
JuliaCall (0)
JunctionSeq (10)

K

kableExtra (1)
kangar00 (1)
karyoploteR (826)
KaryoploteR (0)
katdetectr (43)
katex (1)
KBoost (50)
KCsmart (38)
kebabs (100)
kedd (0)
KEGG.db (2)
KEGGgraph (5227)
kegggraph (0)
KEGGlincs (46)
keggorth (1)
keggorthology (75)
KEGGprofile (12)
KEGGREST (32663)
KEGGSOAP (3)
keggsvg (1)
Kendall (1)
keras (2)
KernelKnn (1)
kernlab (2)
KernSmooth (23)
keyring (1)
KFAS (1)
khroma (1)
kimod (2)
KinSwingR (41)
kissDE (33)
kit (1)
kknn (1)
klaR (1)
km.ci (2)
kmed (1)
kmknn (0)
kml (1)
kml3d (1)
KMsurv (1)
knitr (159)
knitrdata (1)
knockoff (1)
KnowSeq (41)
KODAMA (0)
kohonen (1)
kpmt (0)
kriging (1)
ks (2)
kSamples (1)
ktplots (1)

L

labdsv (1)
labeling (44)
labelled (2)
LACE (47)
laeken (1)
Lahman (1)
lambda.r (1)
lambdr (1)
LambertW (1)
lamW (1)
landscapemetrics (1)
languageserver (1)
LaplacesDemon (1)
lapmix (34)
lars (1)
lasso2 (1)
later (139)
latex2exp (1)
lattice (53)
latticeExtra (6)
lava (13)
lavaan (50)
lavaSearch2 (1)
lazy (0)
lazyeval (34)
LBE (245)
lbfgs (1)
lbfgsb3c (1)
lcopula (1)
lda (0)
ldap (1)
ldblock (52)
LDheatmap (1)
LDlinkR (1)
LDplots (1)
LEA (482)
leafcutter (0)
leafem (1)
leaflet (3)
leaflet.minicharts (1)
leaflet.providers (1)
leafpop (1)
leaps (1)
LearnBayes (1)
learnr (2)
LedPred (46)
lefser (433)
leiden (11)
leidenAlg (1)
leidenbase (8)
lemon (1)
lemur (5)
les (54)
levi (46)
lfa (290)
lfda (1)
lfe (1)
lgr (1)
lhs (8)
liana (1)
libcoin (2)
libgeos (1)
LiblineaR (8)
lifecycle (37)
lightgbm (1)
limma (31104)
limmaGUI (50)
limmia (1)
limSolve (1)
LINC (2)
LineagePulse (38)
lineagespot (31)
LinkHD (36)
Linnorm (131)
linprog (1)
LinTInd (38)
lintr (18)
lionessR (44)
lipidr (125)
LiquidAssociation (38)
liquidSVM (0)
lisaClust (112)
listenv (11)
listviewer (1)
littler (1)
lixoftConnectors (0)
lixoftConnectors.1 (0)
lixoftConnectors.2 (0)
lle (0)
lm.beta (1)
lmdme (39)
lme4 (85)
lmerTest (1)
LMGene (3)
lmodel2 (1)
lmom (5)
lmomco (1)
Lmoments (0)
lmtest (3)
LOBSTAHS (44)
lobstr (2)
locfdr (0)
locfit (33)
loci2path (34)
log4r (1)
logcondens (1)
logger (1)
logging (1)
logicFS (78)
LogicReg (1)
logistf (5)
logitnorm (1)
logitr (1)
logitT (35)
logitt (0)
Logolas (2)
logolas (1)
logr (1)
logspline (1)
lokern (1)
lol (2)
LOLA (178)
longitudinal (0)
longitudinalData (1)
longmemo (0)
loo (6)
LoomExperiment (495)
lotri (1)
LowMACA (17)
LowRankQP (1)
LPE (61)
LPEadj (36)
lpNet (45)
lpSolve (8)
lpSolveAPI (1)
lpsymphony (1208)
lqa (0)
lqmm (1)
LRBaseDbi (53)
LRcell (45)
lsa (6)
LSAF (1)
lsei (1)
lsmeans (1)
lubridate (35)
lumi (1037)
Luminescence (1)
lute (1)
lvec (1)
LVSmiRNA (2)
lwgeom (1)
LymphoSeq (48)

M

m03modeldevelopment (1)
M3C (780)
M3D (2)
M3Drop (468)
m6Aboost (33)
maanova (26)
Maaslin2 (732)
maboost (1)
Macarron (32)
macat (44)
maCorrPlot (49)
MACPET (4)
MACSQuantifyR (45)
MACSr (87)
maDB (2)
madb (0)
made4 (197)
madness (1)
MADSEQ (33)
maftools (2454)
MAGAR (51)
MAGeCKFlute (327)
magic (1)
magick (7)
magpie (23)
magrene (34)
magrittr (28)
MAI (38)
maic (1)
maicChecks (1)
maigesPack (39)
mailR (0)
MAIT (48)
makecdfenv (98)
makePlatformDesign (1)
maketools (1)
MALDIquant (2)
manipulate (1)
manipulateWidget (1)
MANOR (40)
manta (4)
MantelCorr (46)
mantelcorr (0)
maotai (1)
mapbayr (1)
mapdata (1)
mAPKL (18)
mapplots (1)
mapproj (1)
maPredictDSC (37)
maps (4)
mapscape (48)
maptools (13)
maptree (1)
mapview (1)
marginaleffects (1)
margins (1)
mariner (28)
Markdown (0)
markdown (87)
marqLevAlg (1)
marr (34)
marray (1635)
martini (42)
maser (98)
maSigPro (228)
maskBAD (37)
MASS (131)
MassArray (53)
massarray (0)
massiR (39)
MassSpecWavelet (1642)
MAST (1893)
mastR (33)
matchBox (48)
Matching (1)
MatchIt (2)
matchprobes (2)
MatchThem (1)
mathjaxr (3)
matlib (1)
Matrix (156)
Matrix.utils (1)
matrixcalc (1)
MatrixEQTL (1)
MatrixGenerics (35451)
MatrixModels (46)
MatrixQCvis (63)
MatrixRider (35)
matrixStats (64)
matrixTests (1)
matter (134)
MaxContrastProjection (2)
maxLik (1)
maxstat (1)
MBA (4)
MBAmethyl (45)
MBASED (46)
MBCB (38)
MBECS (44)
mbend (1)
mbkmeans (393)
mbOmic (28)
mboost (1)
mBPCR (41)
MBQN (38)
mbQTL (23)
MBttest (47)
mc2d (1)
mcaGUI (3)
MCbiclust (37)
mclogit (1)
mclust (4)
mclustcomp (1)
mcmc (1)
MCMCglmm (1)
MCMCpack (1)
MCPcounter (1)
mcr (2)
MCRestimate (3)
mCSEA (80)
mda (1)
mdgsa (5)
mdp (56)
mdqc (61)
MDTS (41)
MEAL (65)
MeasurementError.cor (48)
measurements (1)
measures (1)
MEAT (37)
MEB (33)
medflex (0)
mediation (1)
MEDIPS (92)
MEDME (39)
megadepth (109)
MEIGOR (49)
Melissa (38)
memes (170)
memisc (1)
memoise (15)
MEMSS (1)
memuse (1)
merDeriv (1)
MergeMaid (5)
mergemaid (0)
Mergeomics (61)
merTools (1)
MeSHDbi (174)
meshes (122)
meshr (88)
MeSHSim (1)
MesKit (55)
MESS (1)
messina (50)
meta (1)
metaArray (3)
metaarray (0)
Metab (35)
metabaser (1)
metabCombiner (39)
metabinR (44)
metaBLUE (1)
metaBMA (1)
MetaboAnalystR (1)
MetaboAnnotation (309)
MetaboCoreUtils (537)
metabolomics (1)
metabolomicsWorkbenchR (57)
metabomxtr (38)
MetaboReport (1)
MetaboSignal (85)
metaCCA (182)
metacore (1)
MetaCyto (47)
metadat (1)
metafor (1)
metagene (42)
metagene2 (54)
metagenomeFeatures (2)
metagenomeSeq (1330)
MetaGxOvarian (1)
metahdep (52)
metaMA (6)
metaMS (83)
MetaNeighbor (74)
metap (7)
MetaPhOR (34)
metaplot (1)
metaplus (1)
metapod (3881)
metapone (49)
metaR (0)
metaSeq (50)
metaseqR (5)
metaseqR2 (29)
MetaSKAT (0)
metatools (1)
MetaUtility (1)
metavizr (11)
MetaVolcanoR (67)
metaX (2)
MetCirc (41)
MethCP (14)
methimpute (49)
methInheritSim (44)
methods (0)
MethPed (37)
MethReg (57)
methrix (61)
MethTargetedNGS (39)
methVisual (3)
methyAnalysis (8)
MethylAid (54)
methylCC (57)
methylclock (123)
methylclockData (1)
methylGSA (95)
methylInheritance (47)
methylKit (544)
MethylMix (91)
methylMnM (39)
methylPipe (54)
methylscaper (35)
MethylSeekR (125)
methylSig (50)
methylumi (1300)
methyvim (3)
MetID (41)
MetNet (41)
metR (1)
mets (1)
mev (1)
mfa (69)
mFilter (1)
Mfuzz (955)
mfuzz (0)
mfx (1)
mg14 (0)
mgcv (113)
MGFM (37)
MGFR (37)
mgm (1)
mgsa (104)
mhurdle (1)
mi (0)
mia (1186)
miaSim (81)
miaViz (200)
mice (10)
miceadds (1)
MiChip (35)
microbenchmark (1)
microbiome (1516)
microbiomeDASim (37)
microbiomeExplorer (56)
microbiomeMarker (319)
MicrobiomeProfiler (78)
MicrobiotaProcess (412)
micromap (1)
microRNA (132)
microseq (1)
Microsoft365R (1)
microSTASIS (26)
MICSQTL (9)
midasHLA (49)
MIGSA (16)
MIIVsem (0)
miloR (213)
mimager (36)
mime (44)
MIMOSA (36)
mimosa (1)
mina (43)
MineICA (50)
minerva (0)
minet (543)
minfi (2038)
MinimumDistance (38)
miniUI (1)
minpack.lm (1)
minqa (32)
MiPP (36)
miQC (96)
MIRA (57)
MiRaGE (42)
mirai (1)
miRBaseConverter (152)
miRcomp (38)
mirIntegrator (38)
miRLAB (40)
miRmine (31)
miRNAmeConverter (45)
miRNApath (62)
miRNAtap (103)
miRSM (32)
miRsponge (1)
miRspongeR (48)
Mirsynergy (2)
mirt (13)
mirTarRnaSeq (60)
misc3d (1)
miscTools (1)
missForest (1)
missMDA (1)
missMethyl (942)
missRanger (1)
missRows (40)
mistyR (88)
mitch (65)
mitml (1)
mitoClone2 (31)
mitoODE (2)
mitools (1)
mixOmics (2919)
mixsqp (13)
mixtools (1)
mlbench (5)
MLEcens (1)
mlegp (1)
mlfa (1)
mlflow (1)
MLInterfaces (239)
mlm4omics (1)
MLmetrics (1)
mlmm.gwas (1)
mlmRev (1)
mlogit (1)
MLP (66)
mlpack (1)
mlr (0)
mlr3 (1)
mlr3cluster (1)
mlr3data (1)
mlr3filters (1)
mlr3fselect (1)
mlr3hyperband (1)
mlr3learners (1)
mlr3measures (1)
mlr3misc (1)
mlr3pipelines (1)
mlr3proba (1)
mlr3tuning (1)
mlr3verse (1)
MLSeq (98)
mlt (1)
mltools (0)
MMAPPR2 (24)
MMDiff (2)
MMDiff2 (37)
mmgmos (1)
mmnet (1)
MmPalateMiRNA (2)
mmrm (8)
MMUPHin (79)
mnem (62)
mnormt (10)
MNP (1)
moanin (68)
MobilityTransformR (32)
mobster (0)
mockery (1)
mockr (1)
MODA (42)
ModCon (43)
modelbased (1)
modeldata (9)
modelenv (1)
ModelMetrics (1)
modelr (48)
modelsummary (1)
modeltests (1)
modeltools (1)
MODIStsp (1)
Modstrings (89)
modules (5)
MOFA (6)
MOFA2 (369)
MOGAMUN (37)
mogsa (125)
moleculaR (1)
MoleculeExperiment (31)
MOMA (47)
moments (1)
Momocs (1)
monaLisa (88)
mondate (1)
monocle (2722)
Moonlight2R (6)
MoonlightR (47)
MoPS (2)
morpheus (1)
Morpho (1)
mosaicCore (7)
mosaics (100)
mosbi (40)
MOSim (38)
Motif2Site (36)
motifbreakR (106)
motifcounter (46)
MotifDb (547)
motifmatchr (1082)
motifRG (4)
motifStack (592)
MotIV (24)
mouse4302.db (0)
MouseFM (42)
MPA (1)
mpath (0)
MPFE (45)
MplusAutomation (1)
mpn.scorecard (1)
mppR (1)
mpra (43)
MPRAnalyze (53)
MPV (1)
MQmetrics (47)
mQTL.NMR (1)
mratios (1)
mrgda (1)
mrggsave (1)
mrgmisc (1)
mrgsolve (1)
mrgvalidate (1)
mrgvalprep (1)
msa (1376)
MSA2dist (72)
MsBackendMassbank (55)
MsBackendMgf (461)
MsBackendMsp (125)
MsBackendRawFileReader (38)
MsBackendSql (26)
msbase (0)
mscalib (0)
MsCoreUtils (2969)
msdata (1)
MsDataHub (31)
MSEADbi (1)
MsExperiment (224)
MsFeatures (1384)
msgbsR (45)
MSGFgui (4)
MSGFplus (9)
msigdb (1)
msigdbr (1)
msImpute (56)
mslp (35)
msm (1)
msmsEDA (193)
msmsTests (184)
MSnbase (2840)
msnbase (0)
MSnID (168)
MSPrep (48)
msPurity (60)
msQC (0)
msqrob2 (93)
MsQuality (32)
MSstats (406)
MSstatsBig (4)
MSstatsConvert (374)
MSstatsLiP (45)
MSstatsLOBD (47)
MSstatsPTM (120)
MSstatsQC (37)
MSstatsQCgui (31)
MSstatsSampleSize (29)
MSstatsShiny (74)
MSstatsTMT (206)
MSstatsTMTPTM (1)
MSstatsTMTs (1)
mstate (1)
MSwM (1)
mtbls2 (0)
MTseeker (2)
MuData (39)
muhaz (1)
Mulcom (62)
mulcom (0)
multcomp (2)
multcompView (42)
multgee (1)
MultiAssayExperiment (3850)
MultiBaC (48)
multiClust (53)
multicool (1)
multicrispr (41)
multicross (1)
MultiDataSet (907)
multidplyr (1)
multiGSEA (99)
multiHiCcompare (113)
MultiMed (55)
multiMiR (215)
MultimodalExperiment (23)
multimode (1)
multinichenetr (1)
multinma (1)
multiOmicsViz (42)
multipanelfigure (1)
MultiRNAflow (5)
multiscan (37)
multiSight (37)
multiwayvcov (1)
multiWGCNA (11)
multtest (11065)
MuMIn (1)
mumosa (53)
MungeSumstats (631)
munsell (1)
muscat (311)
muscData (1)
muscle (233)
musicatk (53)
MutationalPatterns (301)
MutationTimeR (0)
mutoss (7)
mutSigExtractor (0)
mvabund (1)
MVCClass (54)
mvGST (1)
mvna (1)
mvnfast (1)
mvnormtest (1)
mvtnorm (44)
MWASTools (81)
mygene (333)
myphd (1)
myvariant (60)
mzID (2634)
mzR (2890)

N

n1qn1 (1)
N2R (0)
nabor (1)
NADA (5)
NADfinder (34)
naniar (1)
NanoMethViz (59)
nanonext (1)
NanoPyx (1)
NanoStringDiff (86)
NanoStringNCTools (286)
NanoStringQCPro (61)
nanostringr (1)
nanotatoR (50)
nanotime (1)
NanoTube (70)
narray (1)
NarrowPeaks (3)
nasapower (1)
nat.util (1)
nat.utils (1)
natserv (1)
naturalsort (1)
NBAMSeq (47)
NbClust (1)
nbpMatching (1)
NBSplice (16)
ncappc (1)
ncar (1)
ncbit (0)
ncdf4 (2)
ncdf4.1 (0)
ncdfFlow (1021)
ncGTW (31)
NCIgraph (46)
ncRNAtools (39)
ncvreg (1)
ndexr (60)
ndjson (0)
neaGUI (2)
nearBynding (34)
Nebulosa (817)
NeighborNet (29)
nem (8)
NEMO (0)
nempi (34)
NEONiso (1)
neonUtilities (1)
nephro (1)
nestedLogit (1)
nestedmodels (1)
NetActivity (38)
netbenchmark (3)
netbiov (42)
netboost (32)
netboxr (16)
NetCRG (0)
netDx (38)
nethet (37)
netmeta (1)
netOmics (39)
NetPathMiner (62)
netprioR (47)
netrankr (1)
netReg (2)
netresponse (47)
NetSAM (44)
netSmooth (51)
NetSwan (1)
network (1)
networkBMA (5)
networkD3 (1)
networkDynamic (0)
netZooR (45)
NeuCA (29)
neuralnet (1)
NeuralNetTools (1)
neuRosim (0)
NewWave (61)
nFactors (1)
NGScopy (1)
ngsReports (70)
NHANES (1)
nhanesA (1)
nimble (1)
nipals (1)
nipalsMCIA (6)
NISTunits (1)
NlcOptim (1)
nleqslv (1)
nlme (120)
nlmixr2 (1)
nlmixr2data (1)
nlmixr2est (1)
nlmixr2extra (1)
nlmixr2lib (1)
nlmixr2plot (1)
nlmixr2rpt (1)
nloptr (55)
NLP (0)
NMcalc (1)
NMdata (1)
NMF (7)
NMproject (0)
nmrec (1)
NMsim (1)
nnet (70)
NNLM (1)
nnls (2)
nnNorm (39)
nnSVG (63)
NoiseFiltersR (0)
NOISeq (527)
NonCompart (1)
nondetects (51)
nonmem2R (1)
nonmem2rx (1)
nonmemica (1)
nonnest2 (1)
nor1mix (1)
NoRCE (44)
norm (1)
normalize450K (35)
NormalizerDE (1)
NormalyzerDE (114)
NormqPCR (177)
normr (123)
nortest (1)
Nozzle.R1 (1)
np (0)
NPARC (45)
npde (1)
npGSEA (45)
nphRCT (1)
npsurv (1)
NTW (48)
nucleoSim (43)
nucleR (57)
nucler (0)
nuCpos (50)
nudge (2)
nullranges (78)
numbat (4)
numbers (1)
numDeriv (1)
NuPoP (64)
NxtIRFcore (31)
nycflights13 (1)

O

oaqc (1)
occugene (44)
OceanView (0)
OCplus (69)
octad (34)
odbc (10)
oddsratio (0)
ODER (24)
odseq (59)
odyproteomicsValidator (1)
officedown (1)
officer (11)
OGRE (39)
OGSA (2)
oligo (1527)
oligoClasses (1515)
OLIN (42)
OLINgui (36)
omada (27)
OmaDB (105)
omicade4 (95)
OmicCircos (170)
omiccircos (0)
omicplotR (43)
omicRexposome (38)
omicsbase (1)
OmicsLonDA (31)
OmicsMarkeR (2)
omicsmarker (0)
OMICsPCA (39)
omicsPrint (40)
omicsViewer (42)
Omixer (49)
OmnipathR (424)
ompBAM (69)
ompr (1)
ompr.roi (1)
Onassis (2)
onbrand (1)
OncoBayes2 (1)
oncomix (35)
oncoscanR (34)
OncoScore (39)
OncoSimulR (49)
oneChannelGUI (4)
onechannelgui (0)
oneSENSE (18)
onlineFDR (50)
ontoCAT (4)
ontologyIndex (14)
ontoProc (127)
ontoTools (1)
oompaBase (2)
oompaData (2)
opdisDownsampling (1)
openCyto (645)
OpenMx (1)
openPrimeR (87)
openPrimeRui (46)
openssl (200)
OpenStats (47)
openxlsx (18)
openxlsx2 (1)
OperaMate (1)
operator.tools (1)
oposSOM (55)
oppar (35)
oppti (33)
optextras (1)
optimalFlow (35)
optimParallel (1)
optimr (1)
optimx (9)
optmatch (1)
optparse (52)
optpart (1)
optweight (1)
OPWeight (38)
OrderedList (72)
ordinal (1)
ORFhunteR (39)
ORFik (158)
org.Ag.eg.db (1)
org.At.tair.db (1)
org.Bt.eg.db (1)
org.Ce.eg.db (1)
org.Cf.eg.db (1)
org.Dm.eg.db (1)
org.Dr.eg.db (1)
org.Gg.eg.db (0)
org.Hs.eg.db (14)
org.Hs.eg.db.html (1)
org.Mm.eg.db (10)
org.Mmu.eg.db (1)
org.Pt.eg.db (1)
org.Rn.eg.db (8)
org.Sc.sgd.db (1)
org.Ss.eg.db (1)
org.Xl.eg.db (1)
Organism.dplyr (356)
OrganismDbi (2887)
orientlib (1)
origami (1)
orthogene (243)
Orthology.eg.db (1)
orthopolynom (1)
orthos (7)
OSAT (56)
OSCA (5)
OSCA.advanced (20)
OSCA.basic (22)
OSCA.intro (121)
OSCA.multisample (18)
OSCA.workflows (34)
Oscope (56)
oskeyring (1)
osmdata (31)
osprey (1)
osqp (1)
OTUbase (37)
OutlierD (3)
OUTRIDER (149)
OutSplice (20)
overlapping (1)
OVESEG (35)

P

PAA (49)
PACKAGE (1)
packer (1)
packFinder (40)
packrat (28)
pacman (1)
padma (39)
PADOG (164)
padr (1)
pagedown (1)
pageRank (36)
pagoda2 (1)
PAIRADISE (73)
paircompviz (42)
PairedData (1)
pairedGSEA (17)
pairkat (32)
pairseqsim (1)
pairwiseComparisons (0)
pak (1)
paletteer (1)
Palimpsest (0)
palmerpenguins (1)
pals (1)
pammtools (1)
pamr (3)
PAN (0)
pan (1)
pandaR (92)
pander (2)
panelcn.mops (60)
panelr (1)
PAnnBuilder (2)
PanomiR (41)
panp (38)
PANR (38)
PanViz (43)
PanVizGenerator (4)
PAPi (5)
paradox (1)
parallel (0)
parallelly (67)
parallelMap (1)
param6 (1)
parameters (3)
ParamHelpers (0)
pareg (26)
parglms (36)
parody (58)
parsedate (2)
parsnip (9)
partCNV (8)
partitions (1)
party (1)
partykit (2)
PAST (37)
pastecs (0)
PASWR (1)
patchwork (22)
Path2PPI (58)
pathfindR.data (1)
pathifier (134)
pathlinkR (1)
PathNet (60)
PathoStat (50)
pathprint (2)
pathRender (36)
pathVar (42)
pathview (4034)
pathwayPCA (85)
PathwaySplice (2)
PatientGeneSets (1)
patrick (1)
paws (8)
paws.analytics (8)
paws.application.integration (8)
paws.common (10)
paws.compute (8)
paws.cost.management (8)
paws.customer.engagement (8)
paws.database (8)
paws.developer.tools (8)
paws.end.user.computing (8)
paws.machine.learning (8)
paws.management (8)
paws.networking (8)
paws.security.identity (8)
paws.storage (8)
paxtoolsr (85)
pbapply (27)
Pbase (1)
pbcmc (1)
pbdZMQ (1)
PBIR (1)
pbivnorm (1)
pbkrest (1)
pbkrtest (66)
pbmcapply (1)
pbmcref.SeuratData (1)
PBSmapping (1)
pcaExplorer (360)
pcaGoPromoter (5)
pcalg (1)
pcaMethods (4589)
PCAN (44)
pcaPP (9)
PCAtools (1040)
PCDimension (1)
pch (1)
PCICt (1)
pcot2 (4)
PCpheno (2)
pcse (1)
pctGCdata (0)
pcxn (44)
pd.atdschip.tiling (1)
pd.clariom.s.human (1)
pd.hg.u133.plus.2 (0)
pd.mouse430.2 (0)
PDATK (40)
pdfCluster (1)
pdftools (2)
pdInfoBuilder (90)
pdmclass (3)
pdp (1)
PeacoQC (132)
peakPantheR (44)
peakPick (0)
pec (1)
PECA (43)
peco (33)
pedigree (1)
pegas (0)
pegboard (1)
PEIP (1)
penalized (1)
pengls (32)
peperr (0)
PepsNMR (77)
pepStat (39)
Peptides (1)
pepXMLTab (58)
PERFect (45)
performance (3)
PerformanceAnalytics (1)
periodicDNA (40)
perm (6)
permimp (1)
permute (2)
perturbatr (2)
PFAM.db (9)
pfamAnalyzeR (105)
PFIM (1)
PFP (28)
PGA (4)
pga (0)
pgca (48)
pgirmess (1)
PGSEA (34)
pgUtils (2)
pgxRpi (1)
phangorn (2)
phantasus (87)
phantasusLite (4)
PharmacoGx (155)
pharmaRTF (1)
pharmaversesdtm (1)
pheatmap (1)
phemd (28)
phenoDist (2)
PhenoGeneRanker (46)
phenomis (40)
phenopath (77)
phenoTest (66)
PhenStat (39)
PheWAS (0)
philentropy (2)
philr (187)
PhIPData (49)
phonTools (1)
phosphonormalizer (44)
phosphoricons (4)
PhosR (85)
phyclust (1)
phylobase (1)
phylocanvas (1)
phylogram (1)
phylolm (1)
PhyloProfile (52)
phyloseq (4848)
phylosignal (1)
phylotools (1)
phyr (1)
phytools (2)
Pi (63)
piano (299)
pickgene (46)
PICS (66)
Pigengene (68)
pillar (143)
pim (0)
pimeta (1)
PING (40)
pingr (1)
pins (32)
pint (3)
pio (0)
pipeComp (37)
pipeFrame (108)
pipeR (1)
pixmap (2)
PK (1)
pkgbuild (76)
pkgcache (1)
pkgconfig (3)
pkgdepends (1)
pkgDepTools (24)
pkgdown (10)
pkgKitten (1)
pkgload (114)
pkgmaker (1)
pkgsearch (1)
PKI (1)
PKNCA (1)
PKPDmodels (1)
planet (138)
planttfhunter (25)
plasmut (3)
plateCore (3)
plethy (18)
plgem (57)
plier (104)
plm (1)
PloGO2 (51)
plogr (1)
plot3D (1)
plot3Drgl (0)
plotfunctions (1)
plotgardener (221)
plotGrouper (49)
plotly (58)
plotlyGeoAssets (1)
plotmm (1)
plotmo (1)
plotrix (3)
plotROC (1)
PLPE (38)
plrs (2)
pls (1)
PLSDAbatch (1)
plumber (1)
plw (2)
plyinteractions (7)
plyr (59)
plyranges (1037)
PMA (1)
pmartR (1)
PMCMRplus (1)
pmforest (1)
pmm (44)
pmml (1)
pmp (111)
pmparams (1)
pmplots (1)
pmtables (1)
pmxTools (1)
png (22)
PoDCall (46)
podkat (42)
pogos (42)
pointblank (1)
PoissonSeq (0)
poLCA (1)
polspline (2)
Polychrome (1)
polyclip (24)
polycor (1)
polyester (110)
Polyfit (2)
polynom (3)
PolynomF (1)
polysat (0)
POMA (65)
pool (1)
poolfstat (1)
poorman (1)
PopED (1)
poppr (0)
PossibilityCurves (1)
POST (2)
posterior (8)
PoTRA (8)
PowerExplorer (3)
poweRlaw (5)
powerTCR (358)
PowerTOST (1)
POWSC (40)
ppcor (1)
ppcseq (38)
PPInfer (68)
ppiStats (4)
pqsfinder (67)
prabclus (1)
pracma (11)
prada (11)
praise (1)
pram (35)
preAnomalyDetectionCredLife (1)
prebs (39)
PreciseSums (1)
preciseTAD (34)
PrecisionTrialDrawer (3)
precommit (0)
PREDA (68)
prediction (1)
predictionet (3)
predint (1)
PReMiuM (1)
preprocessCore (14023)
preprocesscore (1)
PreprocessCore (1)
PresenceAbsence (0)
preseqR (0)
presto (1)
prettycode (1)
prettydoc (1)
prettyunits (60)
primirTSS (40)
PrInCE (39)
princurve (1)
printr (1)
prioritylasso (1)
prismatic (1)
Prize (2)
proActiv (52)
proBAMr (40)
proBatch (59)
pROC (33)
PROcess (74)
processCore (1)
processx (178)
procoil (39)
ProCoNA (2)
proDA (161)
prodlim (53)
productplots (1)
proffer (1)
proFIA (14)
profile (0)
profileModel (1)
profileplyr (199)
profileScoreDist (34)
profmem (1)
profvis (27)
progeny (331)
progress (1)
progressr (25)
PROJ (1)
proj (1)
proj4 (8)
ProjecTILs (1)
projectR (59)
projpred (1)
pRoloc (193)
pRolocdata (8)
pRolocGUI (69)
PROMISE (40)
promises (98)
prompt (1)
PROPER (69)
propr (1)
PROPS (33)
PROreg (1)
Prostar (61)
prostar (0)
prot2D (2)
proteasy (34)
proteinProfiles (45)
ProteoDisco (36)
ProteomicsAnnotationHubData (2)
ProteoMM (63)
proteoQC (2)
protGear (37)
ProtGenerics (10366)
proto (1)
protolite (1)
protr (6)
proxy (2)
proxyC (1)
PRROC (5)
pryr (8)
ps (169)
PSCBS (6)
pscl (1)
PSEA (40)
psichomics (53)
PSICQUIC (7)
PSMatch (104)
PsNR (1)
pspline (1)
psych (48)
psychometric (1)
psychotools (1)
psychotree (1)
psychTools (1)
psygenet2r (43)
ptairMS (32)
Publish (1)
PubScore (3)
PullReadAnalysisData (1)
pulsar (0)
pulsedSilac (3)
puma (75)
PureCN (135)
purr (0)
purrr (115)
purrrlyr (1)
pvac (35)
pvca (208)
pvclust (1)
Pviz (53)
PWMEnrich (88)
pwOmics (45)
pwr (1)
pwrEWAS (41)
pxr (0)
pyinit (1)
pzfx (1)

Q

qap (6)
qcc (1)
qckitfastq (53)
qcmetrics (41)
qcNvs (0)
qdapRegex (1)
qdapTools (1)
QDNAseq (302)
QDNAseq.hg19 (1)
QDNAseq.mm10 (1)
QFeatures (711)
qgam (1)
qgraph (1)
qlcMatrix (5)
qmtools (36)
qpcR (1)
qpcrNorm (40)
qpdf (1)
qpgraph (114)
qPLEXanalyzer (46)
qqconf (5)
qqman (1)
qqplotr (1)
qrcode (1)
qreport (1)
qrng (1)
qrnn (1)
qrqc (42)
qs (2)
QSARdata (1)
qsea (53)
qsmooth (66)
QSutils (42)
qsvaR (43)
qtbase (0)
qtl (1)
qtl2 (0)
QTLExperiment (4)
Qtlizer (36)
qtpaint (0)
quadprog (2)
QUALIFIER (2)
qualifier (0)
qualpalr (1)
quantable (1)
quantiseqr (413)
quantmod (7)
quantreg (65)
quantro (269)
quantsmooth (636)
quarto (3)
QuartPAC (33)
QuasR (300)
QuaternaryProd (70)
QUBIC (116)
questionr (1)
QuickJSR (1)
qusage (344)
qvalue (15314)
qvcalc (1)

R

R.cache (1)
R.devices (7)
R.filesets (7)
R.huge (5)
R.matlab (0)
R.methodsS3 (4)
R.oo (4)
R.rsp (1)
R.utils (31)
r2d2 (1)
r2d3 (1)
R2HTML (1)
R2jags (1)
R2OpenBUGS (1)
r2rtf (1)
R2wd (1)
R2WinBUGS (1)
R3CPET (35)
r3Cseq (75)
R453Plus1Toolbox (42)
R4RNA (546)
R6 (62)
rAccess (1)
radarchart (1)
radiator (1)
RadioGx (40)
raer (5)
ragg (31)
RaggedExperiment (822)
RAIDS (4)
rain (73)
rainbow (6)
rama (30)
rAmCharts (1)
RamiGO (5)
ramigo (0)
ramr (36)
ramwas (70)
randomcoloR (4)
RandomFields (0)
RandomFieldsUtils (0)
randomForest (2)
randomForestSRC (1)
randomizr (1)
randomNames (1)
RandomWalkRestartMH (84)
randPack (40)
randRotation (46)
randtoolbox (1)
ranger (3)
RankAggreg (1)
RankProd (222)
RANN (1)
RApiDatetime (1)
rapidjsonr (1)
rapidoc (1)
RApiSerialize (2)
rappdirs (3)
rapportools (1)
RAREsim (43)
RareVariantVis (39)
Rariant (2)
rARPACK (5)
Rarr (73)
raster (48)
ratelimitr (1)
RAthena (8)
rawrr (171)
RbcBook1 (78)
Rbec (35)
rbenchmark (1)
RBesT (1)
RBGL (8893)
rbgl (0)
rbibutils (10)
rbioapi (2)
RBioFormats (46)
RBioinf (46)
rbioinf (0)
rBiopaxParser (142)
rBLAST (1)
RBM (44)
rbmi (1)
Rbowtie (412)
Rbowtie2 (278)
rbsurv (45)
Rbwa (72)
Rcade (22)
rcartocolor (1)
RCAS (53)
RCASPAR (46)
rcdk (8)
RCdk (1)
rcdklibs (8)
rcellminer (54)
rCGH (60)
Rcgmin (1)
Rchemcpp (2)
Rchoice (1)
RchyOptimyx (3)
RCircos (0)
RcisTarget (928)
RClickhouse (1)
rclipboard (1)
RCM (40)
rcmdcheck (48)
Rcollectl (17)
RColorBrewer (10)
rcompanion (1)
RConferoMapping (0)
rcorpora (1)
Rcpi (101)
Rcpp (135)
RcppAnnoy (23)
RcppArmadillo (109)
RcppCCTZ (1)
RcppClassic (1)
RcppDate (1)
RcppDE (1)
RcppDist (1)
RcppEigen (29)
RcppGSL (2)
RcppHNSW (11)
RcppML (4)
RcppNumerical (1)
RcppParallel (12)
RcppProgress (1)
RcppRoll (1)
RcppSimdJson (1)
RcppSpdlog (1)
RcppThread (1)
RcppTOML (12)
RcppZiggurat (6)
Rcsdp (1)
RCSL (45)
RCurl (43)
RCurl.back (0)
Rcwl (45)
RcwlPipelines (42)
RCX (67)
RCy3 (707)
RCyjs (59)
RCytoscape (6)
Rd2roxygen (0)
rda (0)
RDAVIDWebService (27)
Rdbi (2)
RdbiPgSQL (1)
rdd (1)
rdflib (1)
rDGIdb (77)
Rdimtools (1)
Rdisop (424)
rdocx (1)
Rdpack (11)
RDRToolbox (101)
Rdsdp (1)
reactable (2)
reactlog (1)
reactome.db (5)
ReactomeContentService4R (79)
ReactomeGraph4R (35)
ReactomeGSA (206)
ReactomePA (2071)
reactR (4)
readat (3)
readbitmap (1)
readODS (1)
ReadqPCR (185)
readr (58)
readstata13 (1)
readxl (52)
reb (3)
REBayes (1)
REBET (37)
rebook (224)
receptLoss (30)
recipes (47)
reclin (1)
recommenderlab (7)
reconsi (33)
recosystem (12)
recount (377)
recount3 (312)
recountmethylation (41)
recoup (39)
reda (1)
REddyProc (1)
RedeR (239)
RedisParam (34)
redoc (1)
REDseq (60)
redux (1)
RefManageR (1)
RefNet (2)
RefPlus (45)
RegEnrich (55)
regionalpcs (4)
RegionalST (5)
regioneR (1873)
regioneReloaded (31)
regionReport (91)
registry (1)
RegParallel (1)
regsplice (31)
regutools (41)
relaimpo (1)
relations (1)
reldist (6)
relimp (1)
remaCor (3)
rematch (26)
rematch2 (1)
remotes (74)
REMP (47)
rentrez (1)
renv (119)
Repitools (298)
report (1)
reporter (1)
reporting (1)
ReportingTools (654)
reposTools (1)
repr (1)
reprex (11)
repurrrsive (1)
RepViz (48)
ReQON (33)
reReg (1)
resample (0)
reshape (2)
reshape2 (8)
ResidualMatrix (3037)
RESOLVE (37)
Resourcerer (2)
restfulr (6)
restfulSE (74)
reticulate (27)
retrofit (24)
ReUseData (13)
revealgenomics (1)
RevGadgets (1)
review (1)
rex (49)
rexposome (67)
rfaRm (34)
Rfast (10)
Rfastp (126)
rfcdmin (1)
Rfit (1)
rflowcyt (2)
RFOC (4)
rfPred (41)
rGADEM (292)
RGalaxy (4)
rgbif (1)
RGCCA (1)
rgdal (4)
rGenomeTracks (35)
rgenoud (1)
rgeos (10)
rgexf (1)
Rgin (4)
rgl (2)
Rglpk (2)
RGMQL (28)
RgnTX (29)
RgoogleMaps (1)
rgoslin (60)
RGraph2js (37)
Rgraphviz (9214)
rgraphviz (1)
rGREAT (622)
RGSEA (57)
rgsepd (35)
rhandsontable (2)
rhdf5 (17601)
rhdf5client (68)
rhdf5filters (17329)
Rhdf5lib (19527)
rhino (4)
Rhisat2 (158)
RhpcBLASctl (1)
Rhtslib (20707)
rhub (1)
rHVDM (2)
RiboCrypt (32)
RiboDiPA (41)
RiboProfiling (59)
ribor (38)
riboSeq (0)
riboSeqR (29)
ribosomeProfilingQC (55)
rice (1)
RIdeogram (1)
ridigbio (1)
rifi (28)
rifiComparative (19)
RImmPort (47)
Ringo (328)
RInside (0)
Rintact (1)
rintrojs (1)
rio (6)
RIPAT (31)
RIPSeeker (16)
Risa (45)
riskmetric (1)
riskRegression (1)
RITAN (44)
ritis (1)
RItools (1)
RIVER (34)
riverplot (1)
rj (0)
rj.gd (0)
rjags (1)
rJava (1)
RJDBC (1)
RJMCMCNucleosomes (34)
rjson (16)
RJSONIO (8)
Rlab (1)
rlang (156)
RLassoCox (55)
rle (0)
rlecuyer (1)
rlemon (1)
rlist (1)
RLMM (50)
RLRsim (1)
RLSeq (32)
rly (0)
RMAGEML (1)
Rmagic (1)
Rmagpie (34)
RMAPPER (3)
RMariaDB (2)
rmarkdown (159)
RMassBank (74)
rMAT (4)
rmatio (1)
rmcorr (1)
rmdformats (1)
rmelting (65)
rmeta (1)
rminer (1)
rmio (1)
RmiR (4)
rmir (0)
Rmisc (1)
Rmmquant (35)
Rmpfr (8)
Rmpi (1)
rms (2)
rmsb (1)
rmspc (41)
RMTstat (1)
rmutil (1)
rMVP (1)
RMySQL (2)
RNAAgeCalc (58)
RNAdecay (41)
rnaEditr (33)
RNAi (1)
RNAinteract (44)
RNAither (3)
rnaither (0)
RNAmodR (56)
RNAmodR.AlkAnilineSeq (38)
RNAmodR.ML (31)
RNAmodR.RiboMethSeq (34)
RNAprobR (2)
RNAsense (33)
rnaseqcomp (59)
RNAseqCovarImpute (4)
RnaSeqGeneEdgeRQL (1)
rnaSeqMap (4)
RNASeqPower (123)
RNASeqR (17)
RnaSeqSampleSize (76)
rnaturalearth (1)
RnBeads (204)
RnBeads.hg19 (2)
RnBeads.hg38 (2)
RnBeads.mm10 (2)
RnBeads.mm9 (2)
RnBeads.rn5 (2)
rncl (1)
RNeXML (1)
rngtools (1)
rngWELL (1)
Rnits (27)
roar (40)
roastgsa (5)
robfilter (1)
RobinCar (1)
RobStatTM (1)
robumeta (1)
robust (4)
robustbase (9)
robustlmm (1)
ROC (1003)
ROCpAI (35)
ROCR (1)
RODBC (1)
ROI (1)
ROI.plugin.lpsolve (1)
RolDE (35)
Roleswitch (2)
Rolexa (2)
roll (1)
rols (282)
roma (1)
ROntoTools (120)
Rook (1)
rootSolve (5)
ropls (902)
roptim (1)
ROracle (1)
ROSeq (34)
rosettR (1)
rotl (1)
ROTS (160)
round (1)
roxygen (1)
roxygen2 (58)
RPA (38)
rpact (1)
rpart (56)
rpart.plot (1)
RPEGLMEN (1)
RPEIF (1)
RPESE (1)
rpf (1)
RPMG (4)
RPostgres (10)
RPostgreSQL (1)
rprimer (55)
rprintf (1)
rprojroot (81)
RProtoBufLib (2187)
rpsftm (1)
RpsiXML (6)
RPtests (1)
RPushbullet (1)
rpx (233)
Rqc (247)
rqt (38)
rqubic (59)
rr2 (1)
rrapply (1)
rrBLUP (1)
rrcov (9)
rRDP (44)
Rredland (1)
rredlist (1)
RRHO (97)
RRPP (1)
rrvgo (330)
rsample (11)
Rsamtools (20501)
rsamtools (0)
rsbml (90)
rsconnect (60)
rScudo (38)
RSEIS (4)
RSelenium (1)
rsemmed (46)
RSeqAn (69)
Rserve (0)
rSFFreader (2)
RSiena (1)
rslurm (1)
rsm (1)
Rsmlx (1)
Rsmlx.1 (0)
Rsmlx.2 (0)
RSNNS (0)
RSNPper (1)
rsnps (1)
Rsolnp (3)
RSpectra (5)
RSQLite (102)
Rssa (0)
RsSimulx (1)
RsSimulx.1 (0)
rstan (8)
rstanarm (1)
rstantools (7)
rstatix (13)
rstpm2 (1)
rstudio (0)
rstudioapi (116)
Rsubread (2211)
rsvd (8)
rsvg (1)
RSVSim (44)
rSWeeP (45)
Rsymphony (1)
rtables (1)
rTANDEM (6)
RTCA (40)
RTCGA (497)
RTCGAToolbox (557)
rtdists (1)
rtf (1)
rticles (1)
rtkore (1)
RTN (112)
RTNduals (50)
RTNsurvival (52)
RTools4TB (1)
RTopper (36)
Rtpca (35)
rtracklayer (18777)
Rtreemix (39)
rTRM (54)
rTRMui (38)
Rtsne (2)
Rttf2pt1 (1)
rtweet (1)
Ruchardet (1)
rugarch (1)
runibic (67)
RUnit (1)
runjags (1)
runonce (1)
Runuran (1)
Ruuid (3)
ruv (0)
RUVcorr (46)
RUVnormalize (50)
RUVSeq (855)
RUVseq (1)
Rvcg (1)
rvcheck (1)
RVenn (1)
rversions (57)
rvest (12)
rvg (1)
Rvisdiff (4)
Rvmmin (1)
RVS (36)
RVtests (1)
Rwave (4)
RWebServices (2)
RWiener (1)
rWikiPathways (343)
rworldmap (1)
RxODE (1)
rxode2 (1)
rxode2et (1)
rxode2ll (1)
rxode2parse (1)
rxode2random (1)
Ryacas (1)
rzmq (2)

S

s2 (41)
S4Arrays (18449)
S4Vectors (50328)
s4vectors (1)
saemix (1)
safe (476)
safetyData (1)
safetyexploreR (1)
safetyMarginCalculation (1)
SAGElyzer (2)
sagenhaft (34)
SAGx (7)
SAIGEgds (54)
samExploreR (2)
sampleClassifier (39)
sampleSelection (1)
sampling (1)
samr (5)
SamSPECTRAL (86)
sandwich (3)
sangeranalyseR (155)
sangerseqR (656)
SANTA (57)
sapFinder (2)
saps (2)
SARC (5)
sarks (33)
sas7bdat (1)
SASmixed (1)
sass (128)
satellite (1)
satuRn (176)
savR (47)
SBGNview (93)
SBGNview.data (1)
sbgr (1)
SBMLR (58)
SC3 (400)
sc3 (0)
scagnostics (1)
Scale4C (36)
ScaledMatrix (10664)
scales (21)
scAlign (23)
scalreg (1)
scam (1)
SCAN.UPC (88)
scanMiR (40)
scanMiRApp (45)
scAnnotatR (76)
SCANVIS (53)
SCArray (44)
SCArray.sat (22)
SCATE (46)
scater (5874)
scatterD3 (1)
scatterHatch (44)
scattermore (16)
scatterpie (9)
scatterplot3d (47)
scBFA (39)
SCBN (63)
scBubbletree (37)
scCB2 (37)
scClassifR (2)
scClassify (64)
scclusteval (1)
sccomp (58)
sccore (1)
sccs (1)
scCustomize (1)
scda (1)
scda.2021 (1)
scda.2022 (1)
scDataviz (59)
scDblFinder (1116)
ScDblFinder (1)
scDC (1)
scDD (123)
scDDboost (33)
scde (315)
scDesign3 (6)
scds (464)
SCFA (35)
scFeatureFilter (48)
scFeatures (30)
scfind (2)
scGate (1)
scGPS (43)
schex (128)
scHOT (52)
scico (1)
scidb (1)
scider (4)
scifer (33)
Scillus (1)
ScISI (5)
scistreer (4)
scLinear (1)
scMAGeCK (27)
scmap (306)
scMerge (384)
scMET (38)
scmeth (47)
SCnorm (82)
scone (85)
Sconify (33)
SCOPE (46)
scoreInvHap (34)
scoringRules (1)
scp (98)
scPCA (74)
scPipe (79)
scran (4175)
scReClassify (34)
scRecover (46)
screenCounter (21)
ScreenR (31)
scRepertoire (315)
scrime (5)
scRNAseq (1)
scRNASeq.spatial (1)
scRNAseqApp (28)
scruff (48)
scry (181)
scrypt (1)
scs (1)
scShapes (34)
scsR (2)
scTensor (56)
scTGIF (55)
scTHI (33)
sctransform (14)
scTreeViz (39)
scuttle (9104)
scviewer (1)
scviR (24)
sda (1)
SDAMS (39)
SDMTools (1)
sechm (118)
secrets (1)
see (1)
seewave (0)
segmented (3)
segmenter (33)
segmentSeq (37)
selectKSigs (31)
selectr (1)
SELEX (39)
sem (0)
SemDist (39)
semEff (1)
semisup (45)
SemSim (1)
semsim (1)
semTools (1)
sen2r (1)
sendmailR (1)
sensitivity (1)
sensobol (1)
SEPA (2)
SEPIRA (28)
seq.hotSPOT (19)
seq2pathway (55)
seqArchR (49)
seqArchRplus (22)
SeqArray (739)
seqbias (43)
seqCAT (35)
seqCNA (50)
seqcombo (48)
SeqGate (32)
SeqGSEA (71)
seqinr (1)
seqLogo (2565)
seqminer (8)
Seqnames (0)
seqPattern (555)
seqplots (7)
seqsetvis (49)
SeqSQC (55)
seqTools (93)
sequenza (1)
SeqVarTools (414)
seriation (13)
servr (1)
sesame (498)
sessioninfo (48)
set6 (1)
SEtools (74)
setRNG (1)
sets (1)
settings (1)
Seurat (25)
seurat (1)
SeuratObject (19)
SeuratWrappers (1)
sevenbridges (51)
sevenC (38)
sf (49)
sfheaders (4)
sfsmisc (2)
sftime (1)
SGCP (33)
sgeostat (1)
SGP (1)
SGSeq (232)
shadowtext (1)
shape (3)
shapefiles (1)
shapes (1)
shapr (1)
SharedObject (76)
ShatterSeek (0)
SHELF (1)
shiny (94)
shiny.gosling (1)
shiny.react (1)
shiny.router (1)
shinyAce (1)
shinyalert (1)
shinyauth (1)
shinyBS (8)
shinybusy (1)
shinycssloaders (1)
shinydashboard (2)
shinydashboardPlus (6)
shinydisconnect (1)
shinyEffects (1)
shinyepico (43)
shinyFeedback (1)
shinyfeedback (1)
shinyFiles (10)
shinyglide (1)
shinyhelper (5)
ShinyItemAnalysis (22)
shinyjqui (1)
shinyjs (3)
shinyloadtest (1)
shinyLP (1)
shinymanager (1)
shinyMatrix (1)
shinyMethyl (78)
shinyMobile (1)
shinypanel (5)
shinyscreenshot (2)
shinySelect (1)
shinystan (1)
shinyTANDEM (3)
shinytest (2)
shinytest2 (2)
shinythemes (1)
shinytoastr (1)
shinyTree (2)
shinyvalidate (11)
shinyWidgets (29)
ShortRead (5755)
shortread (0)
showimage (1)
showtext (1)
showtextdb (1)
SIAMCAT (95)
SICtools (31)
SID (1)
sidap (0)
sigaR (5)
SigCheck (37)
sigclust (1)
sigFeature (156)
Sigfried (1)
SigFuge (36)
siggenes (2820)
sights (42)
Signac (8)
signal (1)
signature.tools.lib (0)
signature.tools.lib.back (0)
signature.tools.lib.v2.1 (0)
signature.tools.lib.v2.1.2 (0)
signatureSearch (100)
signeR (61)
signet (2)
signifinder (43)
SignifReg (0)
sigPathway (64)
sigpathway (0)
SigsPack (34)
sigsquared (35)
SIM (40)
SIMAT (36)
SimBindProfiles (36)
SimBu (42)
SimComp (1)
SIMD (33)
simex (1)
SimFFPE (37)
similaRpeak (56)
SIMLR (210)
simona (4)
simpar (1)
simpleaffy (102)
simplermarkdown (1)
simpleSeg (49)
simpleSingleCell (0)
simplifyEnrichment (501)
simputation (1)
SimSeq (0)
simsurv (1)
simulatorAPMS (1)
simulatorZ (2)
sincell (54)
single (36)
SingleCellExperiment (13315)
SingleCelLExperiment (0)
SingleCellSignalR (185)
singleCellTK (204)
SingleMoleculeFootprinting (35)
SingleR (3302)
singleR (1)
SingleRBook (3)
singscore (1038)
SiPSiC (22)
sirnakit (1)
SIS (1)
siscreener (1)
SISPA (37)
sitadela (35)
sitePath (41)
sitmo (7)
sizepower (57)
SJava (1)
sjlabelled (1)
sjmisc (1)
sjPlot (1)
sjstats (1)
SKAT (8)
SkewHyperbolic (1)
skewr (31)
skewt (1)
skimr (1)
skmeans (1)
slackr (1)
slalom (47)
slam (2)
SLGI (3)
slickR (1)
slider (9)
slingshot (1195)
slinky (3)
sloop (1)
SLqPCR (55)
sm (0)
smacof (1)
SMAD (46)
SMAP (50)
smartdata (0)
smcfcs (1)
smfishHmrf (1)
SMITE (43)
smldesign (1)
smoother (0)
smoothHR (0)
smotefamily (1)
SMVar (6)
sn (8)
sna (1)
SNAData (1)
SNAGEE (50)
snakecase (8)
SnapATAC (1)
snapCGH (49)
snapcount (47)
snifter (113)
snm (128)
snow (8)
SnowballC (1)
snowfall (1)
snpAssoc (0)
SNPchip (10)
SNPediaR (44)
SNPhood (37)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38 (1)
snpMatrix (5)
snpmatrix (0)
snpMatrix2 (0)
SNPRelate (1427)
snpStats (1992)
SOAR (0)
sodium (3)
softImpute (1)
soGGi (276)
soilDB (1)
sojourner (13)
solrium (1)
som (1)
SomaDataIO (0)
SomatiCA (1)
SomaticSignatures (134)
SomaVarDB (1)
SOMbrero (1)
sommer (1)
SOMNiBUS (44)
sortable (2)
sos (1)
soundecology (0)
SoupX (1)
sourcetools (35)
sp (43)
spacefillr (1)
SpacePAC (37)
spacetime (1)
SPACox (0)
spade (4)
spam (3)
spam64 (1)
spaMM (1)
Spaniel (57)
sparkline (1)
sparklyr (8)
SPARQL (1)
sparrow (112)
SparseArray (4546)
sparsebn (1)
sparseDOSSA (49)
SparseGrid (1)
SparseM (2)
sparseMatrixStats (13727)
sparsenetgls (47)
sparsepca (1)
SparseSignatures (42)
sparsesvd (13)
spaSim (36)
spatial (17)
SpatialCPie (61)
spatialDE (81)
SpatialDecon (137)
SpatialExperiment (1087)
SpatialFeatureExperiment (104)
spatialHeatmap (65)
SpatialOmicsOverlay (29)
spatialreg (1)
spatstat (1)
spatstat.core (9)
spatstat.data (10)
spatstat.explore (10)
spatstat.geom (17)
spatstat.linnet (1)
spatstat.model (1)
spatstat.random (17)
spatstat.sparse (14)
spatstat.utils (14)
spatzie (33)
spd (1)
spData (5)
spdep (1)
spec (1)
speckle (70)
specL (55)
SpeCond (56)
spectacles (1)
Spectra (844)
SpectralTAD (74)
speedglm (1)
SPEI (1)
spelling (1)
SPEM (47)
spgs (1)
SPIA (523)
SPIAT (73)
spicyR (122)
SpidermiR (56)
spikeLI (44)
spiky (38)
spkTools (35)
splancs (4)
splatter (355)
splicegear (2)
spliceR (8)
spliceSites (3)
SpliceWiz (55)
SplicingFactory (34)
SplicingGraphs (65)
splines (0)
splines2 (1)
splineTCDiffExpr (1)
splineTimeR (57)
SPLINTER (33)
splitTools (1)
splots (131)
spls (1)
splus2R (1)
SPONGE (69)
SpotClean (67)
SPOTlight (178)
spotSegmentation (2)
spqn (41)
spsComps (1)
SPsimSeq (67)
SQLDataFrame (37)
sqldf (1)
SQUADD (45)
SQUAREM (1)
sRACIPE (49)
SRAdb (323)
sRAP (4)
SRGnet (2)
srnadiff (22)
sROC (0)
ssanv (1)
sscore (33)
sscu (38)
sSeq (119)
ssh.utils (0)
ssize (82)
sSNAPPY (58)
SSPA (64)
ssPATHS (31)
ssrch (51)
ssviz (43)
stabledist (1)
stabs (1)
stageR (173)
stam (1)
STAN (20)
standR (72)
StanHeaders (6)
staRank (34)
StarBioTrek (40)
stargazer (1)
Starr (3)
stars (2)
starter (1)
startupmsg (0)
STATegRa (43)
Statial (43)
statmod (2)
statnet (1)
statnet.common (2)
stats (0)
stats4 (0)
statsExpressions (1)
statTarget (89)
STdeconvolve (87)
stdReg (1)
stepNorm (35)
stepwiseCM (2)
stevedore (1)
sticky (1)
stinepack (1)
stJoincount (43)
stopwords (1)
storr (1)
strandCheckR (38)
Streamer (39)
strex (1)
string (1)
STRINGdb (914)
stringdist (9)
stringfish (2)
stringi (55)
stringr (63)
striprtf (1)
STROMA4 (32)
strucchange (1)
struct (107)
Structstrings (67)
structToolbox (84)
StructuralVariantAnnotation (151)
styler (26)
SubCellBarCode (39)
subplex (1)
subselect (1)
subSeq (56)
SUITOR (32)
SummarizedBenchmark (40)
SummarizedExperiment (34261)
summarizedExperiment (1)
summarytools (1)
Summix (46)
sunburstR (1)
superheat (1)
SuperLearner (1)
superpc (1)
supersigs (37)
SuppDists (1)
supraHex (349)
surfaltr (39)
survcomp (890)
survey (1)
survival (90)
survivalROC (1)
survminer (1)
survMisc (2)
survPen (1)
survPresmooth (1)
survtype (44)
Sushi (69)
susieR (13)
sva (6465)
svaNUMT (35)
SVAPLSseq (2)
svaRetro (35)
svd (1)
svDialogs (1)
svglite (12)
svGUI (1)
SVM2CRM (1)
SVMDO (31)
svUnit (1)
swagger (1)
SWATH2stats (47)
SwathXtend (54)
swfdr (49)
Swiffer (1)
SwimR (2)
swirl (1)
switchBox (89)
switchde (39)
sybil (1)
sybilGUROBI (1)
sybilSBML (1)
sylly (1)
sylly.en (1)
symengine (1)
symphony (1)
synapsis (34)
synapter (57)
synergyfinder (173)
SynExtend (39)
synlet (37)
SynMut (35)
syntenet (64)
sys (142)
sysfonts (1)
systemfit (1)
systemfonts (35)
systemPipeR (1100)
systemPipeRdata (0)
systemPipeShiny (58)
systemPipeTools (41)
syuzhet (1)

T

table1 (1)
tableHTML (1)
tableone (1)
tables (2)
tadar (5)
TADCompare (64)
TailRank (2)
tanggle (52)
TAPseq (45)
tarchetypes (3)
target (36)
TargetDecoy (34)
targets (4)
TargetScore (55)
TargetSearch (62)
targetsearch (0)
TarSeqQC (18)
taxize (1)
TBSignatureProfiler (46)
TCC (175)
TCGAbiolinks (3047)
TCGAbiolinksGUI (45)
TCGAbiolinksGUI.data (1)
TCGAutils (706)
tcltk (0)
tcltk2 (1)
tclust (1)
TCseq (123)
TDARACNE (14)
tdaracne (0)
TDbasedUFE (34)
TDbasedUFEadv (33)
TeachingDemos (1)
teal (1)
teal.modules.clinical (1)
teal.modules.general (1)
teal.widgets (1)
TEKRABber (47)
templater (0)
tensor (1)
tensorA (1)
tensorflow (10)
TENxIO (39)
TENxPBMCData (1)
tenXplore (33)
TEQC (50)
tergm (1)
tern (1)
ternarynet (37)
terra (50)
terraTCGAdata (35)
tesseract (1)
testit (1)
testthat (183)
texreg (1)
textshaping (24)
TFARM (31)
tfautograph (1)
TFBSTools (2191)
tfbstools (1)
tfdatasets (1)
TFEA.ChIP (53)
TFHAZ (29)
TFisher (1)
TFMPvalue (6)
tfrmt (1)
tfruns (8)
TFutils (52)
tgp (1)
tgxWebservices (1)
TH.data (2)
thematic (1)
themis (1)
this.path (1)
threejs (1)
tibble (142)
tictoc (2)
tidybayes (1)
tidybulk (163)
tidycensus (14)
tidyclust (1)
tidycmprsk (1)
tidygraph (4)
tidyjson (0)
tidylog (1)
tidymodels (6)
tidyposterior (1)
tidyr (32)
tidyrules (1)
tidyselect (21)
tidySEM (1)
tidyseurat (1)
tidySingleCellExperiment (151)
tidySummarizedExperiment (233)
tidyterra (1)
tidytext (1)
tidytlg (1)
tidytree (19)
tidyTree (1)
tidyverse (12)
tidyvpc (1)
tidyxl (1)
tiff (1)
tiger (0)
tigre (43)
tigris (13)
tikzDevice (1)
TileDBArray (37)
tilingArray (68)
timechange (3)
timecourse (52)
timeDate (10)
timeOmics (58)
timereg (1)
TimerQuant (0)
timescape (75)
timeSeries (2)
TimeSeriesExperiment (6)
timetk (1)
TimiRGeN (49)
Timma (1)
TIN (38)
TINC (0)
tinkr (1)
tinysnapshot (1)
tinytest (1)
tinytex (134)
tippy (1)
tis (1)
TissueEnrich (97)
TitanCNA (58)
titanic (1)
tkrgl (0)
tkrplot (1)
tkWidgets (1108)
tkwidgets (0)
tLOH (32)
tm (1)
tmap (1)
TMB (7)
TMixClust (50)
tmle (1)
tmvnsim (1)
tmvtnorm (0)
TNBC.CMS (37)
TnT (38)
TOAST (291)
toastui (1)
tofsims (2)
tokenizers (1)
tokupika (1)
tolerance (1)
tomoda (31)
tomoseqr (32)
tools (0)
toOrdinal (1)
TOP (20)
ToPASeq (4)
topconfects (137)
topdownr (44)
topGO (2732)
topicmodels (0)
torch (1)
ToxicoGx (39)
Tplyr (1)
TPP (73)
TPP2D (41)
tracee (1)
tracktables (122)
trackViewer (350)
trackviewer (1)
tradeSeq (417)
TrajectoryGeometry (42)
TrajectoryUtils (1435)
tram (1)
TraMineR (0)
transcriptogramer (45)
transcriptR (41)
transformGamPoi (44)
transformr (1)
transite (40)
tRanslatome (53)
transomics2cytoscape (34)
transport (1)
TransView (37)
TraRe (12)
traseR (36)
Travel (10)
traviz (37)
tree (1)
TreeAndLeaf (103)
treeio (17715)
treekoR (36)
treemap (1)
treespace (1)
TreeSummarizedExperiment (1204)
TREG (37)
TReNA (1)
trena (41)
Trendy (47)
TRESS (46)
triangle (1)
tricycle (123)
triebeard (2)
triform (3)
trigger (35)
trimcluster (0)
trio (73)
tripack (1)
triplex (38)
tripr (51)
tRNA (60)
tRNAdbImport (45)
tRNAscanImport (52)
TRONCO (53)
trtf (1)
truncdist (1)
truncnorm (4)
truncreg (1)
trust (0)
TSAR (4)
TSCAN (464)
tscR (37)
tseries (2)
tseriesChaos (0)
tsfeatures (2)
tsModel (1)
tsna (0)
tsne (1)
TSP (13)
tspair (5)
TSRchitect (4)
TSSi (2)
ttdo (1)
ttgsea (49)
TTMap (33)
TTR (1)
ttservice (1)
tufte (1)
tune (8)
tuneR (0)
TurboNorm (36)
TVTB (37)
twang (1)
twangContinuous (1)
tweeDEseq (85)
tweedie (1)
tweenr (4)
twilight (78)
twoddpcr (39)
TwoSampleMR (0)
twosamples (1)
txcutr (33)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene (5)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene (1)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.ensGene (0)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene (5)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene (1)
tximeta (1072)
tximport (3265)
tximportDat (1)
tximportData (1)
TxRegInfra (2)
txtq (1)
TypeInfo (47)
tzdb (58)

U

uatools (1)
UCell (943)
uchardet (1)
ucminf (1)
udunits2 (1)
Ularcirc (37)
umap (8)
UMI4Cats (42)
unbalanced (0)
uncoverappLib (33)
UNDO (58)
unifiedWMWqPCR (37)
UniProt.ws (344)
uniqueAtomMat (0)
Uniquorn (35)
unitizer (1)
units (43)
universalmotif (421)
unmarked (1)
updateObject (35)
UpSetR (1)
urca (1)
urlchecker (1)
urltools (1)
uroot (0)
useful (1)
usethis (71)
usmap (1)
usmapdata (1)
uSORT (34)
UTAR (0)
utf8 (108)
utils (0)
utilsRmd (1)
uuid (28)
uwot (24)

V

V8 (9)
VAExprs (35)
validate (1)
VanillaICE (76)
vaplot (1)
vapour (0)
VarCon (35)
variables (1)
variancePartition (696)
VariantAnnotation (8269)
VariantExperiment (41)
VariantFiltering (51)
VariantTools (104)
varImp (1)
vars (1)
vasp (1)
VaSP (34)
vaultr (0)
vbmp (59)
VBsparsePCA (1)
vcd (1)
VCFArray (36)
vcfR (0)
vcr (1)
vctrs (186)
vdbR (1)
vdiffr (1)
VDJdive (36)
Vega (2)
VegaMC (38)
vegan (3)
vegawidget (1)
velociraptor (99)
veloviz (52)
vembedr (1)
vendormetadatahelpers (1)
venn (7)
VennDetail (188)
VennDiagram (1)
venneuler (1)
VERSO (45)
VGAM (7)
VGAMextra (1)
vhydeg (1)
VIBER (0)
vidger (84)
VIM (1)
VineCopula (1)
vioplot (1)
vip (1)
viper (606)
vipor (1)
viridis (59)
viridisLite (85)
viridislite (0)
virtualArray (3)
visdat (1)
ViSEAGO (110)
visNetwork (3)
visR (1)
vissE (78)
vistime (7)
Voyager (70)
vpc (1)
VplotR (47)
vroom (76)
vscDebugger (1)
vsclust (39)
vsn (4725)
vtpnet (43)
vulcan (37)

W

waddR (41)
waffle (1)
waiter (6)
wakefield (1)
waldo (89)
warp (2)
wateRmelon (694)
wavClusteR (41)
waveslim (0)
waveTiling (3)
wdm (1)
wdman (1)
weaver (55)
webbioc (39)
webchem (1)
webdriver (1)
webfakes (1)
WebGestaltR (1)
webmockr (1)
webp (1)
webshot (18)
webshot2 (1)
websocket (1)
webutils (1)
WeightIt (1)
weights (2)
WeightSVM (0)
weitrix (36)
WES.1KG.WUGSC (1)
wesanderson (1)
WGCNA (7)
WGScan (1)
WGSmapp (0)
whereami (1)
whisker (76)
whitening (1)
whoami (1)
widgetInvoke (1)
widgetTools (1124)
widgettools (0)
wiggleplotr (115)
WikidataQueryServiceR (1)
WikidataR (1)
WikipediR (1)
wikitaxa (1)
wildmeta (1)
winboxr (1)
withr (84)
wk (58)
wordcloud (1)
wordcloud2 (1)
workflowr (1)
workflows (8)
workflowsets (5)
worrms (1)
wpm (46)
wppi (38)
Wrench (1313)
writexl (2)
WriteXLS (1)
WRS2 (1)

X

xaringan (1)
xaringanExtra (1)
xaringanthemer (1)
xbioc (1)
XBSeq (2)
XCIR (2)
xcms (1480)
xcore (38)
XDE (39)
xdg-utils (1)
Xeva (38)
xfun (197)
xgboost (5)
xgxr (1)
XINA (36)
XLConnect (1)
xlsx (1)
xlsxjars (1)
xmapbridge (46)
xmapcore (2)
XML (27)
xml2 (135)
xmlparsedata (1)
XNAString (39)
xopen (1)
xpose (1)
xpose.nlmixr2 (1)
xpose4 (1)
xps (5)
xrf (1)
xslt (1)
xtable (2)
xts (3)
XVector (42387)
xvector (0)
XVectorb (0)

Y

y2hStat (1)
yaImpute (1)
yaml (90)
yamss (43)
YAPSA (59)
yaqcaffy (4)
yardstick (8)
yarn (95)
ymlthis (0)
yspec (1)
yulab.utils (20)

Z

zCompositions (6)
zeallot (1)
zellkonverter (845)
zen4R (1)
zenith (65)
zFPKM (103)
zinbwave (692)
zip (96)
Ziploc (1)
zlibbioc (43304)
zoo (19)
ZygosityPredictor (18)