See download stats for:    Bioconductor software packages    Bioconductor annotation packages    Bioconductor workflow packages

Download stats for Bioconductor experiment packages

This page was generated on 2023-11-25 17:17:20 -0500 (Sat, 25 Nov 2023).

The number reported next to each package name is the download score, that is, the average number of distinct IPs that “hit” the package each month for the last 12 months (not counting the current month).


Top 15

1ALL (3138)
2TCGAbiolinksGUI.data (2763)
3celldex (2604)
4HSMMSingleCell (2523)
5airway (1833)
6scRNAseq (1504)
7geneLenDataBase (1372)
8pasilla (863)
9tximportData (744)
10bladderbatch (600)
11ChAMPdata (581)
12sesameData (539)
13Illumina450ProbeVariants.db (505)
14GSVAdata (488)
15TENxPBMCData (486)

All experiment packages

All experiment package stats in one file: experiment_pkg_stats.tab

All experiment package download scores in one file: experiment_pkg_scores.tab

See Download stats for Bioconductor experiment repository (all packages combined)

A

a4Core (0)
a4Reporting (0)
ABAData (11)
abc (1)
abind (1)
acepack (1)
actuar (1)
adabag (1)
adductData (43)
ade4 (2)
adegenet (1)
adegraphics (1)
adephylo (1)
ADGofTest (1)
admiral (1)
admiral.test (1)
admiraldev (1)
admisc (24)
ADMM (1)
AER (1)
afex (1)
affxparser (1)
affy (1)
affycompData (36)
affycoretools (1)
affydata (359)
Affyhgu133A2Expr (34)
Affyhgu133aExpr (39)
Affyhgu133Plus2Expr (50)
affyio (1)
AffymetrixDataTestFiles (82)
Affymoe4302Expr (36)
Affymoe430Expr (1)
affyPLM (1)
AGHmatrix (1)
AgiMicroRna (0)
agricolae (4)
AICcmodavg (1)
AIMS (0)
AIPW (1)
airr (0)
airway (1833)
akima (1)
alabama (1)
alakazam (0)
ald (1)
ALDEx2 (1)
aldvmm (1)
alembic (1)
AlgDesign (1)
alkahest.generic (1)
ALL (3138)
all (0)
allenpvc (1)
ALLMLL (119)
alluvial (1)
almanac (1)
alphahull (1)
alphashape3d (1)
alpineData (31)
alr4 (1)
amap (1)
AMARETTO (1)
ambient (1)
Amelia (1)
AmesHousing (1)
amgen.okta.client (0)
amgsafetyvis (0)
amlogger (0)
AmpAffyExample (28)
ANCOMBC (1)
AneuFinderData (73)
animation (1)
annaffy (0)
anndata (1)
annotate (2)
AnnotationDbi (12)
AnnotationFilter (1)
AnnotationForge (1)
AnnotationHub (2)
annotatr (1)
anRichment (1)
anticlust (1)
antiProfilesData (70)
AnVIL (1)
anytime (3)
aod (1)
apcluster (1)
ape (12)
apeglm (1)
apexcharter (1)
aplot (17)
appgen (0)
aqp (1)
aracne.networks (49)
archive (1)
ArchR (1)
argparse (7)
argus.DS.Credentials (1)
argusDS.apc.utils (1)
argusDS.backtesting.engine (1)
argusDS.data (1)
argusDS.data.preparation (1)
argusDS.data.preparation2 (1)
argusDS.DB.manager.utilities (1)
argusDS.driver.importance (1)
argusDS.FCUtilities (1)
argusDS.FZ.SourceData (1)
argusDS.gamlss.forecast (1)
argusDS.gamlss.modelling (1)
argusDS.gamlss.testing (1)
argusDS.gamlss.utils (1)
argusDS.model.tools (1)
argusDS.PossibilityCurves.utils (0)
argusDS.shiny.utils (1)
argusDS.spread.trading.utils (1)
argusDS.Studio.APC (1)
argusDS.Studio.FC (1)
argusDS.Studio.MyStudio (1)
argusDS.Studio.permissions (1)
argusDS.Studio.utils (1)
argusDS.tabulator (0)
argusDS.trading.performance (1)
argusDS.TradingSignals (0)
argusDS.utilities (1)
arm (1)
aroma.affymetrix (6)
aroma.apd (6)
aroma.core (7)
aroma.light (0)
arrayhelpers (1)
arrayop (1)
arrayQualityMetrics (0)
ARRmData (48)
arrow (11)
arsenal (1)
arules (21)
ArvadosR (1)
ascii (1)
asciicast (1)
ASExtras4 (1)
ash (4)
AshkenazimSonChr21 (17)
ashr (2)
asht (1)
ASICSdata (34)
AsioHeaders (3)
askpass (42)
asremlPlus (1)
assert (1)
assertive.code (1)
assertive.properties (2)
assertive.types (2)
assertr (1)
assertthat (1)
AssessORFData (29)
ASSET (1)
AssotesteR (1)
ATACseqQC (1)
ATE (0)
ATR (1)
attachment (1)
attempt (1)
AUC (1)
AUCell (1)
audio (1)
av (1)
ava2 (1)
aws (1)
aws.ec2metadata (1)
aws.s3 (4)
aws.signature (4)
azcore (1)
Azimuth (1)
AzureAuth (1)
AzureGraph (1)
AzureRMR (1)
AzureStor (1)

B

babelgene (2)
babelmixr2 (1)
babelwhale (1)
babynames (1)
backbone (1)
backports (74)
BADER (0)
badger (1)
baguette (1)
bain (1)
BalancedSampling (1)
ballgown (0)
bambu (1)
BART (1)
bartMachine (1)
bartMachineJARs (1)
base64 (1)
base64enc (1)
base64url (1)
basefun (1)
BASiCS (1)
basilisk (1)
basilisk.utils (1)
batchelor (1)
BatchJobs (1)
batchtools (1)
BayesFactor (1)
BayesFM (1)
bayesm (3)
bayesmeta (1)
bayesplot (8)
bayesQR (1)
bayestestR (1)
BayesX (1)
baySeq (4)
BB (1)
BBmisc (1)
bbmle (1)
bbotk (0)
bbr (1)
bbr.bayes (1)
bcellViper (451)
bdsmatrix (1)
beachmat (2)
beadarray (1)
beadarrayExampleData (58)
BeadArrayUseCases (26)
BeadDataPackR (0)
BeadSorted.Saliva.EPIC (17)
beanplot (1)
beepr (1)
beeswarm (1)
bench (1)
benchmarkfdrData2019 (18)
benchmarkme (1)
benchmarkmeData (1)
benchr (1)
BentoBoxData (0)
berryFunctions (1)
Bessel (1)
bestNormalize (1)
beta7 (20)
betareg (1)
bezier (1)
BgeeDB (0)
BGLR (1)
BH (84)
BiasedUrn (9)
bibtex (1)
biclust (1)
bife (1)
biganalytics (1)
bigassertr (1)
bigD (1)
bigdist (1)
biglasso (1)
biglm (1)
biglmm (1)
bigmemory (1)
bigmemory.sri (1)
bigparallelr (1)
bigreadr (1)
bigrquery (9)
bigsnpr (1)
bigsparser (1)
bigstatsr (1)
bigutils (1)
bigutilsr (1)
billboarder (2)
bindr (1)
bindrcpp (1)
binGroup (1)
binom (1)
binr (0)
bio3d (1)
biobank (1)
Biobase (4)
bioc::GenomeInfoDbData (1)
BiocBaseUtils (1)
BiocCheck (1)
BiocFileCache (2)
BiocGenerics (16)
BiocInstaller (0)
BiocIO (1)
BiocManager (123)
BiocNeighbors (1)
Bioconductor (1)
BiocParallel (14)
BiocSingular (1)
BiocStyle (1)
BiocVersion (26)
biocViews (1)
BioGenerics (1)
Biogenerics (1)
BioImageDbs (19)
biomaRt (2)
biomartr (1)
biomformat (1)
BioPlex (24)
biostatR (1)
biostatUtil (0)
Biostrings (11)
biotmleData (41)
BioVersion (1)
biovizBase (1)
BiRewire (0)
birta (0)
biscuiteerData (45)
bit (35)
bit64 (7)
bitops (7)
bizdays (1)
bladderbatch (600)
BlakerCI (1)
blastula (1)
blavaan (1)
blimaTestingData (29)
blme (5)
blob (84)
blockcluster (1)
blockmodeling (1)
blogdown (1)
BloodCancerMultiOmics2017 (39)
bluster (1)
BMA (1)
BMisc (1)
bmp (1)
bnlearn (1)
bodymapRat (30)
BOIN (1)
bold (1)
bookdown (23)
boot (32)
bootstrap (1)
botor (1)
box (5)
bpcp (1)
BradleyTerry2 (1)
brainImageRdata (2)
brave (1)
breakpointRdata (111)
breastCancerMAINZ (93)
breastCancerMKI (1)
breastCancerNKI (77)
breastCancerTRANSBIG (68)
breastcancertransbig (0)
breastCancerUNT (55)
breastCancerUPP (72)
breastCancerVDX (118)
brew (61)
brgedata (48)
brglm (1)
brglm2 (1)
bricks (1)
brickster (1)
bridgesampling (1)
brio (2)
brms (1)
brmsmargins (1)
Brobdingnag (1)
broman (1)
bronchialIL13 (16)
broom (88)
broom.helpers (3)
broom.mixed (1)
BrowserViz (1)
bs4Dash (5)
BSgenome (1)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer11 (0)
BSgenome.Ggallus.ENSEMBL.galGal6 (1)
BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5 (1)
BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 (2)
BSgenome.Mmul10.SIVmac251 (1)
BSgenome.Mmulatta.NCBI.mmul10.tmp (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm39 (1)
BSgenome.Omela.CUSTOM.oenMel1.1 (1)
BSgenomes (1)
bsicons (1)
bslib (113)
bsplus (1)
bsseqData (70)
btergm (1)
bumphunter (0)
butcher (1)
bvls (1)
BWStest (1)

C

C50 (1)
ca (3)
cache (1)
cachem (112)
cAIC4 (1)
Cairo (12)
callr (77)
callthat (1)
CAM (1)
CAMERA (0)
campsis (1)
campsismod (1)
cancerdata (35)
candisc (1)
canvasXpress (0)
capsidr (0)
car (56)
carData (2)
CardinalWorkflows (45)
caret (50)
carrier (1)
casebase (1)
castor (1)
CATALYST (1)
catdata (1)
Category (1)
caTools (2)
CATT (1)
causaldata (1)
cba (1)
CBPS (1)
ccaPP (1)
ccdata (69)
ccdrAlgorithm (1)
CCl4 (42)
ccTutorial (18)
cdip.datastore (1)
celarefData (24)
celda (1)
celldex (2604)
CellMapperData (28)
cellranger (1)
cem (0)
censReg (1)
CeTF (1)
ceu1kg (2)
ceu1kgv (2)
ceuhm3 (2)
cfToolsData (3)
cgam (1)
cgdsr (1)
cgdv17 (3)
CGHbase (0)
cghMCR (0)
ChAMP (1)
ChAMPdata (581)
champdata (1)
changepoint (1)
charmData (2)
checkmate (24)
ChemmineOB (1)
ChemmineR (1)
chemometrics (1)
cheung2010 (2)
ChIC.data (33)
chimera (0)
chimeraviz (1)
ChimpHumanBrainData (18)
ChIPComp (0)
chipenrich (0)
chipenrich.data (83)
ChIPexoQualExample (30)
ChIPQC (0)
ChIPseeker (1)
chipseq (0)
chipseqDBData (31)
ChIPseqR (0)
ChIPsim (0)
ChIPXpressData (47)
chk (2)
chopsticks (0)
chroGPS (0)
chromDraw (0)
ChromHeatMap (0)
chromote (2)
chromstaRData (77)
chromVAR (1)
chron (2)
cicero (1)
circlesize (1)
circlize (4)
cisPath (0)
CiteFuse (1)
Ckmeans.1d.dp (1)
class (72)
ClassDiscovery (1)
classInt (20)
cleanrmd (1)
cleanUpdTSeq (0)
cleaver (0)
cli (130)
clinfun (1)
ClinicalQc (1)
clinPK (0)
ClinViz (1)
clippda (0)
clipper (0)
clipr (39)
clisymbols (1)
CLL (202)
CLLmethylation (15)
clock (21)
Clomial (0)
Clonality (0)
clonotypeR (0)
clst (0)
clstutils (0)
clubSandwich (1)
clue (17)
CluMSIDdata (36)
cluster (64)
clusterCrit (1)
clusterGeneration (2)
clustermq (2)
clusterprofielr (0)
clusterProfiler (2)
ClusterR (1)
clusterSim (1)
clusterStab (0)
clusthaplo (1)
clustifyrdatahub (30)
clustMixType (1)
clustree (1)
clv (1)
clValid (1)
CMA (0)
cMap2data (49)
cmdstanr (1)
CMplot (1)
cmprsk (1)
CmsAnalytics (1)
cn.farms (0)
cn.mops (0)
CNAnorm (0)
CNEr (1)
CNORdt (0)
CNORfeeder (0)
CNORfuzzy (0)
CNORode (0)
CNPBayes (0)
CNTools (0)
cnvGSA (0)
cnvGSAdata (24)
cnvgsadata (1)
CNVPanelizer (0)
CNVrd2 (0)
CNVtools (0)
cobalt (1)
cobindR (0)
cobs (1)
CoCiteStats (0)
coda (2)
codelink (0)
codetools (41)
CODEX (0)
CoGAPS (0)
cogena (0)
cogeqc (1)
coGPS (0)
COHCAP (0)
COHCAPanno (57)
coin (1)
collapse (1)
collections (1)
coloc (9)
colonCA (46)
colorfulVennPlot (1)
colorRamps (6)
colorspace (51)
colortools (1)
colourpicker (3)
colourvalues (1)
combinat (1)
coMET (0)
commentr (1)
common (1)
CommonJavaJars (1)
commonmark (105)
compareDF (1)
compareGroups (1)
COMPASS (0)
compcodeR (0)
CompGO (0)
ComplexHeatmap (9)
complexheatmap (1)
compositions (2)
CompQuadForm (1)
compute.es (1)
concaveman (1)
condiments (1)
conditionz (1)
condMVNorm (1)
coneproj (1)
conf.design (1)
CONFESSdata (26)
config (8)
confintr (1)
conflicted (8)
ConnectivityMap (26)
connectwidgets (1)
conquer (2)
ConsensusClusterPlus (0)
consort (1)
ConsRank (1)
contfrac (1)
conumee (0)
convert (0)
coop (1)
copa (0)
COPDSexualDimorphism.data (45)
copula (1)
CopyhelpeR (52)
CopyNeutralIMA (17)
copynumber (0)
CopyNumber450k (0)
CopyNumber450kData (2)
CopywriteR (0)
CoRegNet (0)
Cormotif (0)
CorMut (0)
coRNAi (0)
coro (1)
corpcor (1)
corpora (1)
correlation (1)
CORREP (0)
corrplot (2)
corrr (1)
CoSIAdata (15)
COSMIC.67 (55)
cosmiq (0)
cosmosR (1)
COSNet (0)
countrycode (7)
coveffectsplot (1)
covr (61)
covRNA (1)
cowplot (2)
coxme (1)
coxphf (1)
cplm (1)
cpm (1)
cpp11 (97)
cpvSNP (0)
cqn (0)
cranlogs (1)
crayon (93)
crch (1)
CRCL18 (14)
creatr (1)
credentials (14)
crew (1)
crew.cluster (1)
CRImage (0)
CRISPR.shinyapp (1)
crisprScoreData (94)
crlmm (0)
crop (1)
crossdes (1)
crossmatch (1)
crosstalk (63)
crrri (0)
crrry (0)
crul (4)
csaw (0)
CSSP (0)
csv (1)
ctc (0)
cubature (1)
cubelyr (1)
Cubist (1)
cummeRbund (0)
curatedAdipoArray (16)
curatedAdipoChIP (16)
curatedAdipoRNA (17)
curatedBladderData (31)
curatedBreastData (33)
curatedCRCData (24)
curatedMetagenomicData (299)
curatedOvarianData (60)
curatedTBData (21)
curatedTCGAData (279)
curl (166)
customProDB (0)
cvar (1)
cvAUC (1)
cvms (1)
CVST (1)
CVXR (1)
cxAnalysis (0)
cycle (0)
cyclocomp (6)
cytofkit (0)
cytolib (1)
CytoML (1)
CytoTRACE (1)

D

D2C (1)
d3r (1)
dada2 (1)
dae (1)
dagitty (1)
dagLogo (0)
daMA (0)
DAPAR (0)
DAPARdata (106)
DART (0)
DASiR (0)
dasnormalize.iomel (1)
data.table (83)
data.tree (1)
DataEditR (1)
datamods (4)
DataOmnio (1)
datapipeline (1)
datawizard (2)
DAVIDQuery (0)
davidTiling (18)
dbaccess (0)
dbarts (1)
DBChIP (0)
DBI (26)
DBItest (1)
dbplyr (78)
dbscan (2)
DCchoice (1)
dcdatr (1)
ddalpha (1)
DDCompanion (1)
ddCt (0)
ddgraph (0)
debugme (1)
DECIPHER (1)
DeconRNASeq (0)
decontam (1)
decor (1)
decoupleR (1)
DEDS (0)
Deducer (1)
deepSNV (0)
DEGraph (0)
DEGseq (0)
Delaporte (0)
DelayedArray (3)
DelayedMatrixStats (8)
deldir (26)
dendextend (53)
DendSer (1)
dendsort (1)
densEstBayes (3)
densityClust (0)
densvis (1)
DEoptim (1)
DEoptimR (11)
DEP (1)
depmap (434)
derfinder (0)
derfinderData (50)
derfinderHelper (0)
Deriv (1)
desc (83)
descr (1)
descsuppR (0)
DescTools (2)
DESeq (1)
DESeq2 (2)
designmatch (1)
DEsingle (1)
deSolve (45)
DeSousa2013 (16)
destiny (0)
devEMF (1)
devtools (56)
DExMAdata (42)
DEXSeq (1)
dexus (0)
dfidx (1)
dfoptim (1)
DFP (0)
DHARMa (1)
diagram (1)
DiagrammeR (3)
DiagrammeRsvg (1)
dials (8)
DiceDesign (1)
DiceKriging (1)
diceR (1)
dichromat (4)
did (1)
DiffBind (1)
diffdf (1)
diffGeneAnalysis (0)
diffHic (0)
DiffLogo (0)
diffloop (1)
diffloopdata (23)
diffobj (9)
diffviewer (1)
digest (173)
diggit (0)
diggitdata (28)
dimRed (1)
diptest (1)
directlabels (1)
DirichletMultinomial (1)
disk.frame (1)
distances (1)
distill (1)
distr (1)
distr6 (0)
distributional (8)
DistributionUtils (1)
distro (1)
dittodb (1)
dittoSeq (1)
dks (0)
DLBCL (96)
dlookr (1)
dlstats (1)
dm (1)
DmelSGI (31)
DMRcaller (0)
DMRcate (0)
DMRcatedata (202)
DMRforPairs (0)
DNABarcodes (0)
DNAcopy (1)
DNAZooData (19)
DO.db (1)
doBy (1)
dockerfiler (1)
docopt (4)
DoE.base (1)
DoEstRare (1)
doFuture (1)
domainsignatures (0)
doMC (1)
doMPI (1)
DonaPLLP2013 (15)
donapllp2013 (0)
doParallel (29)
DOQTL (0)
doRedis (1)
doRNG (1)
dorothea (396)
DOSE (2)
Dose (1)
DoseFinding (1)
doSNOW (1)
dotCall64 (2)
dotwhisker (1)
DoubletFinder (1)
downlit (18)
downloader (1)
downloadthis (1)
dparser (1)
dplyr (180)
dqrng (11)
drake (2)
drat (1)
drc (1)
DRDID (1)
dream (1)
DREAM4 (4)
dreamerr (1)
dressCheck (18)
drgee (1)
DriverNet (0)
DropletTestFiles (212)
DropletUtils (1)
DRR (1)
DrugVsDisease (0)
DrugVsDiseasedata (46)
dspNgs (1)
dsQTL (2)
DSS (0)
DT (114)
DTA (0)
dtplyr (47)
dtw (1)
dtwclust (1)
dualKS (0)
duckdb (1)
DuoClustering2018 (72)
DupChecker (0)
dupRadar (0)
DvDdata (15)
dyebias (0)
dyebiasexamples (27)
dygraphs (1)
dynamicTreeCut (1)
DynDoc (1)
dynfeature (1)
dynlm (1)
dynplot (1)
dynpred (1)
dynwrap (1)

E

e1071 (17)
earth (1)
easierData (95)
easyENTIM (1)
EasyqpcR (0)
easystats (1)
EatonEtAlChIPseq (18)
eatonetalchipseq (0)
ebal (1)
EBarrays (0)
EBcoexpress (0)
EBImage (0)
EBSeq (0)
EBSeqHMM (0)
Ecdat (1)
Ecfun (1)
echarts4r (7)
ecodist (1)
ecoliLeucine (35)
ecolitk (0)
ECOSolveR (1)
EDASeq (0)
EDDA (0)
edge (0)
edgeR (9)
effects (1)
effectsize (2)
egg (4)
EGSEAdata (151)
eha (1)
eisa (0)
elasticsearchr (1)
ELBOW (0)
ellipse (48)
ellipsis (10)
elliptic (1)
ELMER (0)
ELMER.data (191)
emayili (1)
embed (1)
EMD (1)
emdbook (4)
emdist (1)
EMDomics (0)
emmeans (55)
EMMREML (1)
emtdata (20)
emulator (1)
enc (0)
encode (1)
ENCODEFig4Band4D (1)
encoDnaseI (2)
encodnasei (0)
encryptr (1)
energy (1)
engitomixmk2 (1)
english (1)
EnhancedVolcano (1)
enhancedvolcano (1)
EnrichedHeatmap (1)
enrichplot (2)
enrichR (1)
enrichwith (1)
EnsDb.Hsapiens.v75 (1)
EnsDb.Hsapiens.v86 (1)
ensembldb (1)
ensemblVEP (0)
entropy (1)
ENVISIONQuery (0)
EnvStats (1)
Epi (1)
epigenomix (0)
EpiMix.data (34)
epimutacionsData (45)
epiR (2)
EpiStats (1)
epitools (1)
equatags (1)
equate (1)
equivalence (1)
erccdashboard (0)
ergm (1)
erify (1)
erma (0)
escape (1)
ESNSTCC (0)
esquisse (1)
estimability (6)
estimatr (1)
estmeansd (1)
estrogen (75)
etec16s (22)
etm (1)
eudysbiome (0)
eulerr (1)
europepmc (1)
evaluate (161)
EValue (1)
evd (1)
eventTrack (1)
ewceData (128)
Exact (1)
exact2x2 (1)
exactci (1)
exactRankTests (1)
ExiMiR (0)
exomeCopy (0)
ExomeDepth (1)
ExperimentHub (1)
expint (1)
explorase (0)
explore (1)
ExploreModelMatrix (1)
ExplorOMICS (0)
expm (2)
ExpressionView (0)
expss (5)
extraDistr (4)
extrafont (2)
extrafontdb (1)
extraInserts (1)
extraoperators (1)
extraTrees (0)

F

faahKO (214)
fabia (0)
fabiaData (17)
fabletools (1)
facopy.annot (2)
facsDorit (3)
factDesign (0)
factoextra (1)
FactoInvestigate (1)
FactoMineR (45)
Factoshiny (1)
fansi (107)
FANTOM3and4CAGE (35)
faraway (1)
farms (0)
farver (24)
fastcluster (1)
fastDummies (11)
fastGHQuad (1)
fastICA (1)
fastmap (53)
fastmatch (10)
fastreeR (1)
fastseg (0)
fastshap (1)
fasttime (1)
fastverse (1)
fauxpas (1)
fBasics (1)
fCI (0)
FD (1)
fda (6)
FDb.InfiniumMethylation.hg19 (0)
fdrame (0)
fdrtool (2)
fds (4)
feather (1)
feature (3)
FedData (1)
feisr (1)
FEM (0)
ff (52)
ffpe (0)
ffpeExampleData (27)
fftwtools (0)
fGarch (1)
FGNet (0)
fgsea (2)
fibroEset (71)
FieldEffectCrc (16)
fields (2)
filehash (1)
filelock (4)
filesstrings (1)
finalfit (1)
FindMyFriends (0)
findpython (5)
finetune (1)
fingerprint (1)
FIs (55)
FISHalyseR (0)
fission (240)
fit.models (1)
fitdistrplus (21)
fixest (1)
flagme (0)
flair (1)
flashClust (1)
Fletcher2013a (57)
Fletcher2013b (46)
flexclust (1)
flexdashboard (2)
flexmix (1)
flexsurv (1)
flexsurvcure (1)
flextable (10)
flipflop (0)
float (1)
flock (1)
flowAI (1)
flowBeads (0)
flowBin (0)
flowcatchR (0)
flowCHIC (0)
flowCL (0)
flowClean (0)
flowClust (1)
flowCore (0)
FlowCore (1)
flowCyBar (0)
flowDensity (0)
flower (1)
flowFit (0)
flowFitExampleData (2)
flowFP (0)
flowMap (0)
flowMatch (0)
flowMeans (0)
flowMerge (0)
flowPeaks (0)
flowPloidyData (35)
flowPlots (0)
flowQB (0)
flowQBData (2)
FlowRepositoryR (0)
FlowSOM (1)
FlowSorted.Blood.450k (244)
FlowSorted.Blood.EPIC (157)
FlowSorted.CordBlood.450k (36)
FlowSorted.CordBloodCombined.450k (43)
FlowSorted.CordBloodNorway.450k (23)
FlowSorted.DLPFC.450k (160)
flowStats (1)
flowTrans (0)
flowType (0)
flowUtils (0)
flowViz (0)
flowVS (0)
flowWorkspace (1)
flowWorkspaceData (129)
flux (1)
fmcsR (0)
FME (1)
fmsb (1)
FMStable (1)
fmtr (1)
FNN (20)
focalCall (0)
foghorn (1)
fontawesome (87)
fontBitstreamVera (1)
fontcm (1)
fontLiberation (1)
fontquiver (1)
forcats (16)
foreach (7)
forecast (2)
foreign (21)
forestplot (1)
fork (1)
formatR (40)
formattable (1)
formatters (1)
Formula (6)
formula.tools (1)
forrester.metadata (1)
fortunes (1)
FourCSeq (0)
fourDNData (19)
fpc (1)
fracdiff (1)
FRASER (0)
fresh (4)
FrF2 (1)
FRGEpistasis (0)
frma (0)
frmaExampleData (35)
frmaTools (0)
fs (182)
fst (1)
fstcore (1)
fTrading (1)
fucci (0)
FunciSNP (0)
FunciSNP.data (3)
fungible (1)
furrowSeg (15)
furrr (15)
futile.logger (1)
futile.options (1)
future (78)
future.apply (41)
future.batchtools (1)
future.callr (3)
fuzzyjoin (1)
fwb (1)

G

g3viz (1)
GA (1)
gaga (0)
gage (0)
gageData (310)
gaggle (0)
gaia (0)
gam (1)
gamboostLSS (1)
gamlss (1)
gamlss.data (1)
gamlss.dist (1)
gamm4 (1)
gap (1)
gap.datasets (1)
gapminder (1)
gargle (66)
gaschYHS (15)
gaston (1)
gatingMLData (10)
gaucho (0)
gbm (1)
gbRd (1)
gbutils (1)
gcatest (0)
gclus (1)
gCMAP (0)
gCMAPWeb (0)
gcrma (0)
gcspikelite (58)
gdata (8)
gDNAinRNAseqData (11)
gDRtestData (4)
gdsfmt (1)
gdtools (9)
gee (1)
geecc (0)
geepack (1)
geigen (1)
gemma.R (0)
gemtc (1)
GenABEL (3)
GenABEL.data (3)
genArise (0)
GENE.E (0)
GeneAnswers (0)
GeneBreak (0)
GeneExpressionSignature (0)
genefilter (1)
genefu (0)
geneLenDataBase (1372)
genelendatabase (0)
GeneMeta (0)
GeneNetworkBuilder (0)
GeneOverlap (0)
geneplotter (1)
GeneralizedHyperbolic (1)
geneRecommender (0)
GeneRegionScan (0)
generics (29)
geneRxCluster (0)
GeneSelectMMD (0)
GeneSelector (0)
GENESIS (0)
geNetClassifier (0)
GeneticsDesign (0)
GeneticsPed (0)
GENIE3 (0)
genoCN (0)
genomationData (64)
GenomeGraphs (0)
GenomeInfoDb (13)
GenomeInfoDbData (3)
genomeIntervals (0)
GenomicAlignments (2)
GenomicDistributionsData (51)
GenomicFeatures (9)
GenomicFeatures.Hsapiens.UCSC.hg18 (1)
GenomicFeatures.Mmusculus.UCSC.mm9 (1)
GenomicFiles (1)
GenomicRanges (3)
GenomicTools (1)
GenomicTuples (0)
Genominator (0)
genoset (0)
genotypeeval (0)
GenoView (0)
GenSA (1)
geodiv (1)
geohashTools (0)
geojson (1)
geojsonio (1)
geojsonsf (1)
GEOmap (3)
GEOmetadb (0)
geometries (3)
geometry (1)
geomorph (1)
geomtextpath (1)
GeomxTools (1)
GEOquery (1)
geoR (1)
geos (1)
geosphere (8)
GEOsubmission (0)
gert (26)
gespeR (0)
gestate (1)
getip (1)
getopt (11)
GetoptLong (2)
getPass (1)
gettz (1)
GeuvadisTranscriptExpr (30)
geuvPack (2)
geuvStore (1)
geuvStore2 (2)
GEWIST (0)
gfonts (1)
ggalluvial (1)
GGally (1)
gganimate (1)
GGBase (0)
ggbeeswarm (15)
ggbio (0)
ggbreak (1)
ggcorrplot (1)
ggdag (1)
GGdata (3)
ggdendro (5)
ggdist (1)
gge (1)
ggeasy (1)
ggeffects (2)
ggExtra (1)
ggfittext (1)
ggforce (4)
ggformula (1)
ggfortify (2)
ggfun (19)
gggenes (1)
ggh4x (1)
gghalves (1)
gghighlight (1)
ggimage (1)
gginnards (0)
ggiraph (1)
ggm (1)
ggmap (41)
ggmosaic (1)
ggnetwork (1)
ggnewscale (14)
ggnewscales (1)
ggokabeito (1)
ggpattern (1)
ggplot (1)
ggplot2 (120)
ggplot2movies (1)
ggplotify (14)
ggpmisc (1)
ggPMX (1)
ggpointdensity (4)
ggpp (2)
ggprism (0)
ggpubr (12)
ggRandomForests (0)
ggraph (4)
ggrastr (7)
ggrepel (38)
ggridges (23)
ggsci (51)
ggseqlogo (4)
ggside (1)
ggsignif (4)
ggstance (1)
ggstatsplot (1)
ggsurvfir (1)
ggsurvfit (1)
ggtext (1)
ggthemes (4)
ggtree (10)
ggtreeDendro (1)
ggtreeExtra (1)
ggtut (2)
ggvenn (1)
ggVennDiagram (1)
gh (56)
ghql (1)
gifski (1)
GIGSEAdata (14)
Giotto (1)
git2r (46)
gitcreds (11)
gitlabr (1)
GLAD (1)
glassoFast (1)
glca (1)
gld (1)
glmGamPoi (1)
GLMMadaptive (1)
glmmADMB (1)
glmmML (1)
glmmTMB (1)
glmnet (12)
glmnetUtils (2)
glmx (1)
GlobalAncova (0)
GlobalOptions (1)
globals (23)
globals, (1)
globaltest (0)
glpkAPI (1)
glue (16)
gmailr (1)
gMCP (1)
GMD (0)
Gmisc (1)
gmm (1)
gmnl (1)
gmodels (1)
gmp (9)
gnm (1)
GO.db (3)
goftest (13)
GOFunction (0)
golem (2)
golubEsets (223)
gongs (1)
googleAuthR (1)
googleCloudStorageR (1)
googledrive (59)
googlesheets4 (62)
googleVis (1)
GOSemSim (2)
goseq (0)
goshawk (1)
GOstats (1)
gower (8)
gpaExample (38)
GPArotation (42)
GPfit (1)
gplots (16)
gprofiler2 (1)
gRain (1)
granny (1)
graph (1)
graphite (0)
graphlayouts (13)
graphql (1)
gRbase (1)
Greg (1)
grf (1)
gridBase (1)
gridExtra (1)
gridGraphics (1)
gridpattern (1)
gridSVG (1)
gridtext (1)
grImport2 (1)
grndata (37)
groupdata2 (1)
grpreg (1)
grr (1)
gsbDesign (1)
GSBenchMark (28)
gscounts (1)
gsDesign (1)
GSE103322 (32)
GSE13015 (29)
GSE159526 (15)
GSE62944 (54)
GSEABase (1)
gsignal (1)
gskb (4)
gsl (2)
gsmoothr (4)
gson (4)
gsrc (1)
gss (1)
gstat (1)
gsubfn (1)
GSVA (1)
GSVAdata (488)
gsvadata (0)
gt (2)
gtable (120)
gto (1)
gtools (26)
gtsummary (3)
gtx (0)
gubraqsar (1)
GUniFrac (1)
gupio (1)
Gviz (1)
GWASdata (75)
GWASExactHW (4)
gwasrapidd (1)
GWASTools (0)
GWENA (1)
gWidgets2tcltk (1)

H

h2o (2)
h5vcData (82)
HAC (1)
hal9001 (1)
HandTill2001 (1)
HaploSim (1)
hapmap100khind (16)
hapmap100kxba (37)
hapmap500knsp (16)
hapmap500ksty (17)
hapmapsnp5 (53)
hapmapsnp6 (58)
harbChIP (19)
hardhat (48)
HardyWeinberg (1)
HarmanData (43)
HarmonizedTCGAData (23)
harmony (3)
hash (1)
haven (45)
HCAData (79)
HCATonsilData (2)
HD2013SGI (41)
HDCytoData (140)
HDF5Array (8)
hdf5r (2)
hdi (1)
HDInterval (8)
HDO.db (1)
hdrcde (4)
healthyControlsPresenceChecker (14)
healthyFlowData (25)
heatmaply (8)
HEEBOdata (26)
heemod (1)
HelloRangesData (45)
heplots (1)
here (1)
Herper (1)
hexbin (7)
hexSticker (1)
hexView (1)
hgu133abarcodevecs (14)
hgu133afrmavecs (1)
hgu133plus2.db (0)
hgu133plus2barcodevecs (13)
hgu133plus2CellScore (25)
hgu133plus2frmavecs (1)
hgu2beta7 (13)
hgu95a.db (1)
HiBED (2)
HiCBricks (1)
HiCDataHumanIMR90 (42)
HiCDataLymphoblast (26)
HiClimR (1)
HiContactsData (103)
hierfstat (1)
highcharter (1)
highlight (1)
HighlyReplicatedRNASeq (15)
highr (68)
highs (1)
Hiiragi2013 (94)
HIVcDNAvantWout03 (14)
Hmisc (12)
HMP16SData (34)
HMP2Data (28)
hms (112)
hmyriB36 (2)
Homo.sapiens (0)
Hoover (1)
hopach (1)
hrbrthemes (1)
HSAUR2 (1)
HSAUR3 (1)
hsm (1)
HSMMSinglece11 (1)
HSMMSinglecel1 (0)
HSMMSingleCell (2523)
htmlTable (5)
htmltools (192)
htmlwidgets (165)
HTqPCR (1)
httpcode (1)
httpgd (1)
httptest (7)
httpuv (98)
httr (179)
httr2 (45)
huge (1)
HumanAffyData (26)
humanStemCell (97)
hunspell (2)
huxtable (1)
hwriter (2)
hypergeo (1)

I

IAPWS95 (1)
iatlas.app (1)
ica (14)
icenReg (1)
Icens (1)
ICS (1)
ICSOutlier (1)
IDPmisc (1)
idr (0)
ids (1)
ifnb.SeuratData (1)
iGasso (1)
igraph (54)
igraphdata (1)
igvShiny (1)
iheatmapr (3)
IHW (1)
IHWpaper (18)
Illumina450ProbeVariants.db (505)
IlluminaDataTestFiles (77)
IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 (1)
IlluminaHumanMethylation450kmanifest (1)
illuminaio (1)
imager (1)
imbalance (1)
imcdatasets (50)
imcRtools (1)
iml (0)
import (1)
ImpulseDE2 (1)
impute (1)
imputeLCMD (1)
imputeTS (1)
IncDTW (1)
ind1KG (2)
infer (8)
infercnv (1)
influenceR (3)
infotheo (1)
ini (1)
InkblotAnalytics (19)
INLA (1)
inline (1)
inlinedocs (1)
insight (3)
intansv (0)
interactiveDisplayBase (1)
intergraph (1)
interp (2)
interval (1)
intervals (2)
inum (1)
invgamma (1)
iontreeData (2)
ipaddress (1)
ipcwswitch (1)
IPDfromKM (1)
ipred (48)
IRanges (12)
IRdisplay (1)
IRkernel (1)
irlba (25)
irr (1)
ISLR (1)
Iso (1)
isoband (50)
ISOcodes (1)
isva (4)
ISwR (1)
ITALICSData (41)
iterators (7)
itertools (1)
itsadug (1)
ivpack (0)
ivprobit (1)
ivreg (1)
Iyer517 (15)

J

JADE (1)
jagsUI (1)
janeaustenr (1)
janitor (3)
JASPAR2014 (54)
JASPAR2016 (125)
JavaGD (1)
jcolors (1)
JctSeqData (3)
jctseqdata (1)
JGR (1)
JM (1)
JMbayes (1)
jnjtemplates (1)
joineRML (1)
jomo (1)
jose (1)
jpeg (6)
jqr (1)
jquerylib (1)
js (1)
jsonify (1)
jsonlite (178)
jsTreeR (1)
jtools (1)
juicyjuice (1)
JuliaCall (0)

K

kableExtra (1)
kangar00 (1)
KaryoploteR (0)
karyoploteR (0)
katex (1)
KEGG.db (1)
KEGGandMetacoreDzPathwaysGEO (49)
KEGGdzPathwaysGEO (181)
KEGGgraph (1)
keggorthology (0)
KEGGprofile (0)
KEGGREST (3)
keggsvg (0)
Kendall (1)
keras (1)
KernelKnn (1)
kernlab (2)
KernSmooth (31)
keyring (1)
KFAS (1)
khroma (1)
kidpack (16)
kit (1)
kknn (1)
klaR (1)
km.ci (1)
kmed (1)
kml (1)
kml3d (1)
KMsurv (1)
knitr (139)
knitrdata (1)
knockoff (1)
KOdata (42)
kohonen (1)
kpmt (0)
kriging (1)
ks (1)
kSamples (1)
ktplots (1)

L

labdsv (1)
labeling (30)
labelled (2)
laeken (1)
Lahman (1)
lambda.r (1)
lambdr (1)
LambertW (1)
lamW (1)
landscapemetrics (1)
languageserver (1)
LaplacesDemon (1)
lares (1)
lars (1)
lasso2 (1)
later (149)
latex2exp (1)
lattice (46)
latticeExtra (6)
lava (9)
lavaan (49)
lavaSearch2 (1)
lazyeval (33)
lbfgs (1)
lbfgsb3c (1)
lcopula (1)
ldap (0)
LDheatmap (1)
LDlinkR (1)
LEA (1)
leafem (1)
leaflet (2)
leaflet.minicharts (1)
leaflet.providers (1)
leafpop (1)
leaps (1)
LearnBayes (1)
learnr (2)
leeBamViews (50)
leiden (21)
leidenAlg (1)
leidenbase (14)
lemon (1)
leukemiasEset (104)
lfa (1)
lfda (1)
lfe (1)
lgr (1)
lhs (7)
liana (1)
libcoin (1)
libgeos (1)
LiblineaR (7)
LiebermanAidenHiC2009 (15)
lifecycle (31)
lightgbm (1)
limma (81)
limmaGUI (0)
limmia (1)
limSolve (1)
Linnorm (1)
linprog (1)
lintr (15)
listenv (23)
ListerEtAlBSseq (15)
listviewer (1)
littler (1)
lixoftConnectors (0)
lixoftConnectors.1 (0)
lixoftConnectors.2 (0)
lm.beta (1)
lme4 (82)
lmerTest (1)
lmodel2 (1)
lmom (2)
lmomco (1)
lmtest (15)
lobstr (2)
locfit (52)
log4r (1)
logcondens (1)
logger (1)
logging (1)
LogicReg (1)
logistf (4)
logitnorm (1)
logitr (1)
logr (1)
logspline (1)
lokern (1)
longitudinalData (1)
loo (5)
LoomExperiment (1)
lotri (1)
LowRankQP (1)
lpSolve (7)
lpSolveAPI (1)
lpsymphony (0)
lqmm (1)
LRcellTypeMarkers (38)
lsa (6)
lsei (1)
lsmeans (1)
lubridate (24)
lumi (0)
lumiBarnes (37)
Luminescence (1)
LungCancerACvsSCCGEO (34)
LungCancerLines (45)
lungExpression (50)
lvec (1)
lwgeom (1)
lydata (49)
lymphoma (1)

M

m03modeldevelopment (1)
M3DExampleData (53)
M3Drop (1)
Maaslin2 (1)
maboost (1)
macrophage (160)
MACSdata (33)
MACSr (1)
madness (1)
MafDb.ALL.wgs.phase1.release.v3.20101123 (1)
MafDb.ESP6500SI.V2.SSA137.dbSNP138 (1)
MafDb.gnomAD.r2.1.hs37d5 (1)
magic (1)
magick (6)
magrittr (31)
maic (1)
maicChecks (1)
mailR (1)
MAIT (0)
makecdfenv (0)
maketools (13)
MALDIquant (2)
mammaPrintData (21)
manipulate (1)
manipulateWidget (1)
maotai (1)
mapbayr (1)
mapdata (1)
mAPKLData (22)
mapplots (1)
mapproj (1)
maps (2)
maptools (13)
maptree (1)
mapview (1)
maqcExpression4plex (38)
MAQCsubset (27)
MAQCsubsetAFX (2)
MAQCsubsetILM (13)
marginaleffects (1)
margins (1)
marinerData (27)
Markdown (0)
markdown (85)
marqLevAlg (1)
marray (0)
maSigPro (0)
MASS (137)
MassSpecWavelet (0)
MAST (1)
Matching (1)
MatchIt (1)
MatchThem (0)
mathjaxr (3)
matlib (1)
Matrix (147)
Matrix.utils (7)
matrixcalc (1)
MatrixEQTL (1)
MatrixGenerics (3)
MatrixModels (33)
matrixStats (81)
matrixTests (1)
maxLik (1)
maxstat (1)
MBA (3)
mbend (1)
mboost (1)
mc2d (1)
MCAData (1)
mclogit (1)
mclust (2)
mclustcomp (1)
mcmc (1)
MCMCglmm (1)
MCMCpack (1)
MCPcounter (1)
mCSEAdata (72)
mcsurvdata (14)
mda (1)
MEALData (1)
measurements (1)
measures (1)
mediation (1)
MEDIPSData (42)
MEEBOdata (28)
memisc (1)
memoise (15)
MEMSS (1)
memuse (1)
merDeriv (1)
MerfishData (25)
merTools (1)
MeSHDbi (1)
MESS (0)
meta (1)
Metab (0)
metabaser (1)
metaBLUE (1)
metaBMA (1)
metabolomics (1)
MetaboReport (0)
metacore (1)
metadat (1)
metafor (1)
metagenomeSeq (0)
MetaGxBreast (24)
MetaGxOvarian (22)
MetaGxPancreas (19)
metaMA (6)
metaMS (0)
metaMSdata (52)
metap (6)
metaplot (1)
metaplus (1)
MetaScope (12)
metatools (1)
MetaUtility (1)
methyAnalysis (0)
MethylAidData (29)
methylclockData (109)
MethylMix (0)
MethylSeqData (14)
methylumi (0)
methyvimData (2)
metR (1)
mets (1)
mev (1)
mFilter (1)
Mfuzz (0)
mfx (1)
mgcv (120)
mgm (1)
mhurdle (1)
mia (1)
miaViz (1)
mice (10)
miceadds (1)
microbenchmark (1)
MicrobiomeBenchmarkData (18)
microbiomeDataSets (115)
micromap (1)
microRNAome (17)
microseq (1)
Microsoft365R (1)
MIGSAdata (24)
miloR (1)
mime (52)
mimosa (1)
minet (0)
minfi (0)
minfiData (378)
minfiDataEPIC (77)
minionSummaryData (36)
miniUI (1)
minpack.lm (1)
minqa (27)
mirai (1)
miRcompData (33)
miRNATarget (26)
mirt (13)
misc3d (1)
miscTools (1)
missForest (1)
missMDA (1)
missRanger (1)
mitml (1)
mitoODEdata (2)
mitools (1)
mixOmics (1)
mixsqp (11)
mixtools (1)
mlbench (5)
MLEcens (1)
mlegp (1)
mlflow (1)
MLmetrics (1)
mlmm.gwas (1)
mlmRev (1)
mlogit (1)
mlpack (1)
mlr (0)
mlr3 (1)
mlr3cluster (0)
mlr3data (1)
mlr3filters (0)
mlr3fselect (0)
mlr3hyperband (0)
mlr3learners (0)
mlr3measures (1)
mlr3misc (1)
mlr3pipelines (1)
mlr3proba (0)
mlr3tuning (1)
mlr3tuningspaces (0)
mlt (1)
MMAPPR2data (42)
MMDiffBamSubset (27)
mmrm (1)
mnormt (10)
MNP (1)
mockery (1)
mockr (1)
modelbased (1)
modeldata (8)
modelenv (1)
ModelMetrics (1)
modelr (47)
modelsummary (1)
modeltests (1)
modeltools (1)
modules (4)
MOFA2 (0)
MOFAdata (109)
moleculaR (1)
moments (1)
Momocs (1)
mondate (1)
monocle (1)
morpheus (1)
Morpho (1)
mosaicCore (1)
mosaicsExample (82)
motifmatchr (1)
mouse4302barcodevecs (12)
mouse4302frmavecs (1)
MouseGastrulationData (135)
MouseThymusAgeing (58)
MPA (1)
MplusAutomation (1)
mpn.scorecard (1)
mppR (1)
MPV (1)
mratios (1)
mrgda (1)
mrggsave (1)
mrgmisc (1)
mrgsolve (1)
mrgvalidate (1)
mrgvalprep (1)
msa (1)
MSBdata (1)
MsCoreUtils (1)
msd16s (33)
msdata (443)
MsFeatures (1)
msigdb (345)
msigdbr (1)
msm (1)
MSMB (64)
MSnbase (1)
msPurityData (38)
msqc1 (14)
MSstats (1)
MSstatsBioData (2)
MSstatsLiP (1)
MSstatsQC (0)
MSstatsTMT (1)
MSstatsTMTs (1)
mstate (1)
MSwM (1)
mtbls2 (60)
MTseekerData (1)
MUGAExampleData (15)
muhaz (1)
Mulder2012 (2)
multcomp (2)
multcompView (42)
multgee (1)
MultiAssayExperiment (1)
multicool (1)
multicross (1)
multidplyr (1)
multiGSEA (1)
multimode (1)
multinichenetr (1)
multinma (1)
multipanelfigure (1)
multiwayvcov (1)
multiWGCNAdata (0)
multtest (1)
MuMIn (1)
munsell (1)
muscat (1)
muscData (140)
muscle (1)
MutationalPatterns (1)
mutoss (7)
mvabund (1)
mvna (1)
mvnfast (1)
mvnormtest (1)
mvoutData (26)
mvtnorm (32)
mygene (0)
myphd (1)
mzID (0)
mzR (1)

N

n1qn1 (1)
nabor (1)
NADA (4)
naniar (1)
nanonext (1)
NanoporeRNASeq (60)
NanoStringNCTools (1)
nanostringr (1)
nanotime (1)
nanotubes (27)
narray (1)
nasapower (1)
nat.util (1)
nat.utils (1)
natserv (1)
naturalsort (1)
NbClust (1)
nbpMatching (1)
ncappc (1)
ncar (1)
ncdf4 (2)
ncdf4.1 (0)
ncdfFlow (1)
NCIgraphData (14)
NCmisc (1)
ncvreg (1)
ndexr (0)
ndjson (0)
Nebulosa (1)
NEONiso (1)
neonUtilities (0)
nestedLogit (1)
nestedmodels (1)
NestLink (17)
NetActivityData (32)
netDx.examples (1)
netmeta (1)
netrankr (1)
NetSwan (1)
network (1)
networkD3 (1)
neuralnet (1)
NeuralNetTools (1)
Neve2006 (16)
neve2006 (0)
nFactors (1)
NGScopyData (32)
ngsReports (1)
NHANES (1)
nhanesA (1)
nimble (1)
nipals (1)
NISTunits (1)
NlcOptim (1)
nleqslv (1)
nlme (118)
nlmixr2 (1)
nlmixr2data (1)
nlmixr2est (1)
nlmixr2extra (1)
nlmixr2lib (1)
nlmixr2plot (1)
nlmixr2rpt (1)
nloptr (54)
NMcalc (1)
NMdata (1)
NMF (7)
NMproject (0)
nmrec (1)
NMsim (1)
nnet (68)
NNLM (1)
nnls (1)
NOISeq (0)
NonCompart (1)
nonmem2R (1)
nonmem2rx (1)
nonmemica (1)
nonnest2 (1)
nor1mix (1)
norm (2)
NormalizerDE (1)
nortest (1)
Nozzle.R1 (1)
npde (1)
nphRCT (1)
npsurv (1)
nullrangesData (69)
numbat (4)
numbers (1)
numDeriv (1)
NxtIRFdata (72)
nycflights13 (1)

O

oaqc (1)
ObMiTi (14)
oct4 (23)
octad.db (29)
odbc (9)
odyproteomicsValidator (1)
officedown (1)
officer (9)
oligo (1)
oligoClasses (0)
OmicCircos (0)
omicsbase (1)
OMICsPCAdata (35)
OmnipathR (1)
ompr (1)
ompr.roi (1)
OnassisJavaLibs (18)
onbrand (1)
OncoBayes2 (1)
oneChannelGUI (0)
ontologyIndex (12)
ontoProc (1)
oompaBase (2)
oompaData (2)
opdisDownsampling (1)
openCyto (1)
OpenMx (1)
openssl (191)
openxlsx (19)
openxlsx2 (1)
operator.tools (1)
optextras (1)
optimalFlowData (31)
optimParallel (1)
optimr (1)
optimx (9)
optmatch (1)
optparse (51)
optpart (1)
optweight (1)
OrderedList (0)
ordinal (1)
org.Ag.eg.db (1)
org.Dm.eg.db (1)
org.Dr.eg.db (1)
org.Hs.eg.db (4)
org.Mm.eg.db (2)
org.Pf.plasmo.db (1)
org.Rn.eg.db (0)
org.Sc.sgd.db (1)
org.Ss.eg.db (1)
OrganismDbi (0)
orientlib (1)
origami (1)
orthogene (1)
orthopolynom (1)
orthosData (6)
oskeyring (1)
osmdata (31)
osprey (1)
osqp (1)
overlapping (1)

P

PAA (0)
packer (1)
packrat (28)
pacman (1)
padr (1)
pagedown (1)
pagoda2 (1)
PAIRADISE (0)
PairedData (1)
pak (1)
paletteer (1)
palmerpenguins (1)
pals (1)
pammtools (1)
pamr (1)
pan (1)
pander (2)
panelr (1)
paradox (1)
parallelly (76)
parallelMap (1)
param6 (0)
parameters (2)
ParamHelpers (0)
parathyroid (2)
parathyroidSE (209)
parsedate (2)
parsnip (8)
partitions (1)
party (1)
partykit (2)
pasilla (863)
pasillaBamSubset (279)
PasillaTranscriptExpr (35)
PASWR (1)
patchwork (33)
pathfindR.data (1)
pathifier (0)
PathNetData (42)
pathprintGEOData (2)
pathview (1)
patrick (1)
paws (13)
paws.analytics (13)
paws.application.integration (14)
paws.common (15)
paws.compute (14)
paws.cost.management (13)
paws.customer.engagement (13)
paws.database (13)
paws.developer.tools (7)
paws.end.user.computing (7)
paws.machine.learning (13)
paws.management (13)
paws.networking (13)
paws.security.identity (13)
paws.storage (13)
pbapply (38)
pbdZMQ (1)
PBIR (1)
pbivnorm (1)
pbkrest (1)
pbkrtest (65)
pbmcapply (1)
PBSmapping (1)
pcaExplorer (1)
pcaGoPromoter.Hs.hg19 (3)
pcaGoPromoter.Mm.mm9 (3)
pcaGoPromoter.Rn.rn4 (2)
pcalg (1)
pcaMethods (1)
pcaPP (8)
PCAtools (1)
PCDimension (1)
pch (1)
PCHiCdata (47)
PCICt (1)
pcse (1)
pcxnData (38)
pd.atdschip.tiling (21)
pdfCluster (1)
pdftools (2)
pdist (0)
pdp (1)
pec (1)
pedigree (1)
pegas (1)
pegboard (1)
PEIP (1)
penalized (1)
pepDat (32)
PepsNMRData (52)
Peptides (1)
performance (2)
PerformanceAnalytics (1)
perm (6)
permimp (1)
permute (2)
PFAM.db (0)
PFIM (1)
pgirmess (1)
PGPC (1)
PGSEA (0)
phangorn (2)
pharmaRTF (1)
pharmaversesdtm (1)
phastCons100way.UCSC.hg19 (1)
pheatmap (1)
philentropy (2)
phosphoricons (4)
PhosR (0)
phyclust (2)
phylobase (1)
phylocanvas (1)
phylogram (1)
phylolm (1)
PhyloProfileData (15)
phyloseq (1)
phylosignal (1)
phylotools (1)
phyr (1)
phytools (2)
picante (1)
pillar (163)
pimeta (1)
pingr (2)
pins (31)
pipeR (1)
pixmap (1)
PK (1)
pkgbuild (73)
pkgcache (1)
pkgconfig (3)
pkgdepends (1)
pkgdown (9)
pkgKitten (1)
pkgload (107)
pkgmaker (1)
pkgsearch (1)
PKI (1)
PKNCA (1)
PKPDmodels (1)
plantecophys (1)
plasFIA (9)
plier (0)
plm (1)
plogr (1)
plot3D (1)
plotfunctions (1)
plotgardener (1)
plotgardenerData (66)
plotly (60)
plotlyGeoAssets (1)
plotmm (1)
plotmo (1)
plotrix (2)
plotROC (1)
pls (1)
plumber (1)
plyr (53)
plyranges (1)
PMA (1)
pmartR (1)
PMCMRplus (1)
pmforest (1)
pmml (1)
pmparams (1)
pmplots (1)
pmtables (1)
pmxTools (1)
png (32)
pointblank (1)
PoissonBinomial (1)
poLCA (1)
polspline (1)
Polychrome (1)
polyclip (27)
polycor (1)
polyester (0)
polynom (2)
PolynomF (1)
polysat (1)
pool (1)
poolfstat (1)
poorman (1)
PopED (1)
poppr (1)
PossibilityCurves (1)
posterior (8)
poweRlaw (4)
powerTCR (1)
PowerTOST (1)
ppcor (1)
ppiData (4)
prabclus (1)
pracma (9)
praise (1)
preAnomalyDetectionCredLife (1)
prebsdata (33)
PreciseSums (1)
preciseTADhub (14)
precommit (0)
PREDAsampledata (51)
prediction (1)
predint (1)
PReMiuM (1)
preprocessCore (1)
presto (1)
prettycode (1)
prettydoc (1)
prettyunits (40)
princurve (1)
printr (1)
prismatic (1)
pROC (29)
processCore (1)
processx (181)
ProData (17)
prodlim (50)
productplots (1)
proffer (1)
profile (0)
profileModel (1)
profmem (1)
profvis (24)
progress (1)
progressr (33)
PROJ (1)
proj (1)
proj4 (8)
ProjecTILs (1)
projpred (1)
pRolocdata (178)
promises (92)
prompt (1)
propr (1)
PROreg (1)
prostateCancerCamcap (17)
prostateCancerGrasso (16)
prostateCancerStockholm (14)
prostateCancerTaylor (16)
prostateCancerVarambally (15)
ProtGenerics (1)
proto (1)
protolite (1)
protr (5)
proxy (2)
proxyC (0)
PRROC (4)
pryr (8)
ps (180)
PSCBS (5)
pscl (1)
PsNR (1)
pspline (1)
psych (47)
psychometric (0)
psychotools (1)
psychotree (1)
psychTools (1)
ptairData (33)
PtH2O2lipids (31)
Publish (1)
PullReadAnalysisData (1)
pumadata (25)
PureCN (0)
purrr (123)
purrrlyr (1)
pvca (1)
pvclust (1)
PWMEnrich.Dmelanogaster.background (27)
PWMEnrich.Hsapiens.background (31)
PWMEnrich.Mmusculus.background (24)
pwr (1)
pwrEWAS.data (41)
pyinit (1)
pzfx (1)

Q

qap (5)
qcc (1)
qcNvs (0)
qdapRegex (1)
qdapTools (1)
QDNAseq.hg19 (127)
QDNAseq.mm10 (54)
qgam (1)
qgraph (1)
qlcMatrix (4)
qpcR (1)
qpdf (2)
qPLEXdata (29)
qqconf (4)
qqman (1)
qqplotr (1)
qreport (1)
qrng (1)
qrnn (1)
qs (2)
QSARdata (1)
qtl (1)
qtl2 (1)
quadprog (2)
qualpalr (1)
quantable (1)
quantmod (6)
quantreg (62)
quantsmooth (0)
quarto (3)
QUBICdata (53)
questionr (1)
QuickJSR (1)
qvalue (1)
qvcalc (1)

R

R.cache (1)
R.devices (6)
R.filesets (6)
R.huge (4)
R.methodsS3 (11)
R.oo (11)
R.rsp (1)
R.utils (27)
r2d2 (1)
r2d3 (1)
R2HTML (1)
R2jags (1)
R2OpenBUGS (1)
r2rtf (1)
R2wd (1)
R2WinBUGS (1)
R6 (63)
rAccess (1)
radarchart (1)
radiator (1)
raerdata (3)
ragg (25)
rainbow (5)
rAmCharts (1)
RamiGO (0)
randomcoloR (4)
RandomFields (0)
RandomFieldsUtils (0)
randomForest (1)
randomForestSRC (1)
randomizr (1)
randomNames (1)
randtoolbox (1)
ranger (1)
RankAggreg (1)
RankProd (0)
RANN (1)
RApiDatetime (1)
rapidjsonr (1)
rapidoc (1)
RApiSerialize (2)
rappdirs (6)
rapportools (1)
rARPACK (4)
raster (53)
ratelimitr (1)
RAthena (7)
rbenchmark (1)
RBesT (1)
RBGL (1)
rbibutils (2)
rbioapi (2)
rBLAST (1)
rbmi (1)
rcartocolor (1)
rcdk (7)
rcdklibs (7)
rcellminerData (53)
Rcgmin (1)
Rchoice (1)
RCircos (0)
RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp (50)
RClickhouse (1)
rclipboard (0)
rcmdcheck (47)
RcmdrMisc (1)
RColorBrewer (10)
rcompanion (1)
rcorpora (1)
Rcpp (129)
RcppAnnoy (34)
RcppArmadillo (113)
RcppCCTZ (1)
RcppClassic (1)
RcppDate (1)
RcppDE (1)
RcppDist (1)
RcppEigen (26)
RcppGSL (2)
RcppHNSW (23)
RcppML (3)
RcppNumerical (1)
RcppParallel (12)
RcppProgress (1)
RcppRoll (1)
RcppSimdJson (1)
RcppSpdlog (1)
RcppThread (1)
RcppTOML (22)
RcppZiggurat (5)
Rcsdp (1)
RCurl (57)
RCy3 (0)
Rd2roxygen (0)
RDAVIDWebService (0)
rdd (1)
Rdimtools (1)
Rdpack (2)
Rdsdp (1)
reactable (2)
reactlog (1)
reactome.db (1)
ReactomeGSA (1)
ReactomeGSA.data (73)
ReactomePA (1)
reactR (2)
readbitmap (1)
readODS (1)
readr (57)
readstata13 (1)
readxl (46)
REBayes (1)
recipes (44)
reclin (1)
recommenderlab (7)
recosystem (12)
reda (1)
REddyProc (0)
redoc (1)
redux (1)
RefManageR (1)
registry (1)
RegParallel (64)
relaimpo (1)
relations (1)
reldist (5)
relimp (1)
remaCor (3)
rematch (16)
rematch2 (1)
remotes (74)
rentrez (1)
renv (119)
report (1)
reporter (1)
reporting (0)
ReportingTools (0)
repr (1)
reprex (10)
repurrrsive (1)
reReg (1)
reshape (2)
reshape2 (8)
ResidualMatrix (1)
restfulr (13)
restfulSEData (32)
RestRserve (7)
reticulate (25)
revealgenomics (1)
RevGadgets (1)
review (1)
rex (54)
Rfast (8)
rfcdmin (2)
Rfit (1)
RFOC (3)
RforProteomics (123)
rgbif (1)
RGCCA (1)
rgdal (2)
rgenoud (1)
rgeos (19)
rgexf (1)
rgl (2)
Rglpk (2)
RGMQLlib (30)
RgoogleMaps (1)
Rgraphviz (1)
rhandsontable (2)
rhdf5 (2)
rhdf5filters (1)
Rhdf5lib (3)
rheumaticConditionWOLLBOLD (17)
rhino (5)
RhpcBLASctl (8)
Rhtslib (1)
rhub (1)
rice (1)
RICGA.clinical (1)
RIdeogram (1)
rintrojs (2)
rio (5)
RIPSeeker (0)
RIPSeekerData (4)
riskmetric (1)
riskRegression (1)
RITANdata (32)
ritis (1)
RItools (1)
rj (1)
rj.gd (1)
rjags (1)
rJava (1)
RJDBC (1)
rjson (15)
RJSONIO (20)
Rlab (1)
rlang (133)
rlecuyer (1)
rlemon (1)
RLHub (33)
rlist (1)
RLRsim (1)
rly (0)
Rmagic (1)
RMariaDB (1)
rmarkdown (148)
RMassBankData (35)
rmatio (1)
rmcorr (1)
rmdformats (1)
rmeta (1)
rminer (1)
rmio (1)
Rmisc (1)
Rmpfr (8)
Rmpi (1)
rms (1)
rmsb (1)
RMTstat (1)
rmutil (1)
rMVP (1)
RMySQL (2)
RNAi (1)
RNAinteractMAPK (21)
rnainteractmapk (0)
RNAmodR.Data (46)
RNAseqData.HeLa.bam.chr14 (1)
RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14 (298)
RNASeqDataSubset (1)
RNASeqPower (0)
RNASeqRData (12)
RnaSeqSampleSizeData (78)
RnaSeqTutorial (2)
rnaturalearth (1)
RnBeads (1)
RnBeads.hg19 (123)
RnBeads.hg38 (92)
RnBeads.mm10 (69)
rnbeads.mm10 (1)
RnBeads.mm9 (68)
RnBeads.rn5 (16)
rncl (1)
RNeXML (1)
rngtools (1)
rngWELL (1)
robfilter (1)
RobinCar (1)
RobStatTM (1)
robumeta (1)
robust (3)
robustbase (8)
robustlmm (1)
RobustRankAggreg (1)
ROC (1)
ROCR (1)
RODBC (1)
ROI (1)
ROI.plugin.lpsolve (1)
roll (1)
rols (1)
Rook (1)
rootSolve (2)
roptim (1)
ROracle (1)
rosettR (1)
rotl (1)
round (1)
roxygen2 (56)
rpact (1)
rpart (64)
rpart.plot (1)
RPEGLMEN (1)
RPEIF (1)
RPESE (1)
rpf (1)
RPMG (3)
RPostgres (8)
RPostgreSQL (1)
rprintf (1)
rprojroot (69)
RProtoBufLib (0)
rpsftm (1)
RPtests (1)
RPushbullet (1)
Rqc (1)
rr2 (1)
rrapply (1)
rrBLUP (1)
RRBSdata (14)
rrcov (7)
rRDPData (30)
rredlist (1)
RRPP (1)
rsample (16)
Rsamtools (2)
rsbml (0)
rsconnect (62)
RSEIS (3)
RSelenium (1)
Rserve (7)
RSiena (1)
rslurm (1)
rsm (1)
Rsmlx (1)
Rsmlx.1 (0)
Rsmlx.2 (0)
RSNNS (0)
rsnps (1)
Rsolnp (3)
RSpectra (17)
RSQLite (95)
RsSimulx (1)
RsSimulx.1 (0)
rstan (8)
rstanarm (1)
rstantools (6)
rstatix (12)
rstpm2 (1)
rstudioapi (113)
Rsubread (1)
rsvd (7)
rsvg (1)
Rsymphony (1)
rtables (1)
RTCGA.clinical (305)
RTCGA.CNV (63)
RTCGA.methylation (65)
RTCGA.miRNASeq (102)
RTCGA.mRNA (156)
RTCGA.mutations (85)
RTCGA.PANCAN12 (46)
RTCGA.rnaseq (143)
RTCGA.RPPA (59)
RTCGAToolbox (0)
rtdists (1)
rtf (1)
rticles (1)
rtkore (1)
rtracklayer (1)
Rtsne (9)
Rttf2pt1 (2)
Ruchardet (1)
rugarch (1)
RUnit (1)
runjags (1)
runonce (1)
Runuran (1)
ruv (0)
RUVnormalizeData (43)
RUVseq (1)
Rvcg (1)
rvcheck (1)
RVenn (1)
rversions (55)
rvest (12)
rvg (1)
Rvmmin (1)
RVtests (1)
Rwave (3)
RWiener (1)
rworldmap (1)
RxODE (1)
rxode2 (1)
rxode2et (1)
rxode2ll (1)
rxode2parse (1)
rxode2random (1)
Ryacas (1)
rzmq (2)

S

s2 (46)
S4Arrays (1)
S4Vectors (7)
saemix (1)
safetyData (1)
safetyexploreR (1)
SAIGEgds (1)
sampleClassifierData (28)
sampleSelection (1)
sampling (1)
samr (4)
sandwich (3)
sas7bdat (1)
SASmixed (1)
sass (136)
satellite (1)
SBGNview.data (89)
SC3 (0)
scagnostics (1)
ScaledMatrix (1)
scales (31)
scalreg (1)
scam (1)
scanMiRData (38)
scATAC.Explorer (18)
SCATE (0)
SCATEData (42)
scater (1)
scatterD3 (1)
scattermore (26)
scatterpie (11)
scatterplot3d (47)
scClassify (1)
scclusteval (1)
sccore (1)
sccs (1)
scda (1)
scda.2021 (1)
scda.2022 (1)
ScDblFinder (1)
scDblFinder (1)
scDC (1)
scGate (1)
scHOT (1)
scico (1)
scidb (1)
Scillus (1)
scistreer (4)
SCLCBam (29)
scLinear (1)
scMerge (1)
scMultiome (12)
scoringRules (1)
SCP (1)
scpdata (34)
scPipe (0)
scran (1)
scRepertoire (1)
scrime (4)
scRNAseq (1504)
scRNASeq.spatial (1)
scrypt (1)
scs (1)
scTHI.data (31)
sctransform (24)
scuttle (8)
scviewer (1)
sda (1)
SDMTools (1)
secrets (0)
see (1)
segmented (2)
selectr (1)
semEff (1)
semTools (1)
sen2r (1)
sendmailR (2)
sensitivity (1)
sensobol (1)
seq2pathway (0)
seq2pathway.data (43)
SeqArray (1)
seqc (25)
seqCNA.annot (42)
seqinr (1)
seqLogo (1)
seqmagick (1)
seqminer (7)
SeqVarTools (0)
seriation (14)
serumStimulation (12)
servr (1)
sesame (1)
sesameData (539)
sessioninfo (47)
set6 (0)
setRNG (1)
sets (1)
settings (1)
Seurat (35)
seurat (1)
SeuratObject (27)
SeuratWrappers (1)
seventyGeneData (17)
sf (55)
SFEData (83)
sfheaders (3)
sfsmisc (2)
sftime (1)
sgeostat (1)
SGP (1)
shadowtext (2)
shape (2)
shapefiles (1)
shapes (1)
shapr (1)
SHELF (1)
shiny (89)
shiny.react (1)
shiny.router (1)
shinyAce (1)
shinyalert (0)
shinyauth (0)
shinyBS (8)
shinybusy (1)
shinycssloaders (1)
shinydashboard (2)
shinydashboardPlus (5)
shinydisconnect (1)
shinyEffects (1)
shinyFeedback (1)
shinyfeedback (1)
shinyFiles (9)
shinyglide (1)
shinyhelper (4)
ShinyItemAnalysis (22)
shinyjqui (1)
shinyjs (4)
shinyloadtest (1)
shinyLP (0)
shinymanager (1)
shinyMatrix (1)
shinyMethyl (1)
shinyMethylData (35)
shinyMobile (1)
shinypanel (5)
shinyscreenshot (1)
shinySelect (1)
shinystan (1)
shinytest (2)
shinytest2 (1)
shinythemes (1)
shinytoastr (1)
shinyTree (1)
shinyvalidate (1)
shinyWidgets (20)
ShortRead (1)
showimage (1)
showtext (1)
showtextdb (1)
SIAMCAT (1)
SID (1)
sigaR (0)
sigclust (1)
Sigfried (1)
siggenes (0)
Signac (7)
signal (0)
signatureSearchData (70)
sigPathway (0)
SimBenchData (19)
SimComp (1)
simex (1)
simpar (1)
simpIntLists (65)
simpleaffy (0)
simplermarkdown (1)
simplifyEnrichment (1)
simputation (1)
simsurv (1)
Single.mTEC.Transcriptomes (16)
SingleCelLExperiment (0)
SingleCellExperiment (8)
SingleCellMultiModal (68)
singleCellTK (1)
SingleMoleculeFootprintingData (30)
SingleR (1)
singscore (1)
sirnakit (1)
SIS (1)
siscreener (1)
sitmo (13)
sjlabelled (1)
sjmisc (1)
sjPlot (1)
sjstats (1)
SKAT (7)
SkewHyperbolic (1)
skewt (1)
skimr (1)
skmeans (1)
slackr (1)
slam (2)
slickR (1)
slider (14)
sloop (1)
sm (0)
smacof (1)
smcfcs (1)
sme (1)
smfishHmrf (1)
smldesign (1)
smokingMouse (2)
smoothHR (0)
smotefamily (1)
SMVar (6)
sn (8)
sna (1)
SNAData (15)
snadata (0)
SNAGEEdata (46)
snakecase (6)
SnapATAC (1)
snow (10)
SnowballC (1)
snowfall (1)
SNPhoodData (26)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38 (1)
SNPRelate (1)
snpStats (0)
sodium (1)
softImpute (1)
soilDB (1)
solrium (1)
som (1)
SomatiCAData (12)
SomaticCancerAlterations (59)
SomaVarDB (1)
SOMbrero (1)
sommer (1)
sortable (1)
sos (1)
SoupX (1)
sourcetools (46)
sp (50)
spacefillr (1)
spacetime (1)
spade (0)
spam (2)
spam64 (1)
spaMM (1)
sparkline (1)
sparklyr (8)
SPARQL (1)
SparseArray (1)
sparsebn (1)
SparseGrid (1)
SparseM (1)
sparseMatrixStats (1)
sparsepca (1)
sparsesvd (12)
spatial (20)
SpatialCPie (1)
SpatialDatasets (1)
spatialDmelxsim (13)
SpatialExperiment (1)
spatialLIBD (160)
spatialreg (1)
spatstat (1)
spatstat.core (20)
spatstat.data (20)
spatstat.explore (8)
spatstat.geom (28)
spatstat.linnet (1)
spatstat.model (1)
spatstat.random (15)
spatstat.sparse (25)
spatstat.utils (25)
spd (1)
spData (10)
spdep (8)
spec (1)
spectacles (1)
speedglm (1)
SPEI (1)
spelling (1)
spgs (1)
SPIA (0)
SpidermiR (1)
SpikeIn (33)
SpikeInSubset (115)
splancs (3)
splatter (1)
spliceR (0)
splines2 (1)
spls (1)
splus2R (1)
spqnData (32)
spsComps (1)
sqldf (1)
SQUAREM (1)
ssanv (1)
ssh (1)
SSPA (0)
stabledist (1)
stabs (1)
StanHeaders (5)
stargazer (1)
stars (1)
starter (1)
statmod (13)
statnet (1)
statnet.common (1)
statsExpressions (1)
statTarget (1)
STdeconvolve (1)
stdReg (1)
stemHypoxia (40)
stevedore (1)
STexampleData (107)
sticky (1)
stinepack (1)
stjudem (34)
stopwords (1)
storr (1)
strex (1)
stringdist (8)
stringfish (2)
stringi (51)
stringr (58)
striprtf (1)
strucchange (1)
styler (16)
subplex (1)
subselect (1)
SummarizedExperiment (2)
summarytools (1)
sunburstR (1)
superheat (1)
SuperLearner (1)
superpc (1)
SuppDists (1)
supraHex (0)
survcomp (1)
survey (1)
survival (95)
survivalROC (1)
survminer (1)
survMisc (1)
survPen (1)
survPresmooth (1)
susieR (12)
sva (1)
svd (1)
svDialogs (1)
svglite (11)
svGUI (1)
SVM2CRMdata (15)
svMisc (0)
svUnit (1)
swagger (1)
Swiffer (1)
swirl (1)
sybil (1)
sybilGUROBI (1)
sybilSBML (1)
sylly (1)
sylly.en (1)
symengine (1)
symphony (1)
synapterdata (32)
syntenet (1)
sys (151)
sysfonts (1)
systemfit (1)
systemfonts (14)
systemPipeRdata (207)
syuzhet (1)

T

table1 (1)
tableHTML (1)
tableone (1)
tables (2)
TabulaMurisData (61)
TabulaMurisSenisData (63)
TailRank (2)
tanggle (1)
tarchetypes (2)
targets (3)
TargetScoreData (41)
TargetSearchData (49)
tartare (48)
taxize (1)
TBX20BamSubset (51)
TCC (4)
TCGAbiolinks (1)
TCGAbiolinksGUI.data (2763)
TCGAcrcmiRNA (14)
TCGAcrcmRNA (16)
TCGAMethylation450k (45)
tcgaWGBSData.hg19 (2)
TCGAWorkflowData (80)
tcltk2 (1)
tclust (1)
TeachingDemos (1)
teal (1)
teal.modules.clinical (0)
teal.modules.general (0)
teal.widgets (1)
templater (0)
tensor (1)
tensorA (1)
tensorflow (8)
TENxBrainData (90)
TENxBUSData (34)
TENxPBMCData (486)
TENxVisiumData (64)
tergm (1)
tern (1)
terra (55)
tesseract (1)
testit (1)
testthat (169)
texreg (1)
textshaping (10)
tfautograph (1)
TFBSTools (1)
tfdatasets (1)
TFisher (1)
TFMPvalue (6)
tfrmt (1)
tfruns (7)
tgp (1)
TH.data (2)
thematic (1)
themis (1)
this.path (1)
threejs (1)
tibble (162)
tictoc (8)
tidybayes (1)
tidycensus (13)
tidyclust (1)
tidycmprsk (1)
tidygraph (5)
tidylog (1)
tidymodels (5)
tidyposterior (1)
tidyr (46)
tidyrules (1)
tidyselect (36)
tidySEM (1)
tidyseurat (1)
tidySummarizedExperiment (1)
tidytext (1)
tidytlg (1)
tidytree (20)
tidyTree (1)
tidyverse (12)
tidyvpc (1)
tidyxl (0)
tiff (1)
tigris (13)
tikzDevice (1)
timechange (3)
timecoursedata (49)
timeDate (9)
timereg (1)
TimerQuant (13)
timeSeries (1)
timetk (1)
tinesath1cdf (14)
tinesath1probe (12)
tinkr (1)
tinysnapshot (1)
tinytest (1)
tinytex (115)
tippy (1)
tis (1)
tissueTreg (32)
TitanCNA (0)
titanic (1)
tkrplot (1)
tkWidgets (1)
tm (1)
tmap (1)
TMB (2)
TMExplorer (28)
tmle (1)
tmvnsim (1)
tmvtnorm (1)
toastui (1)
tofsimsData (13)
tokenizers (1)
tokupika (1)
tolerance (1)
toOrdinal (1)
topdownrdata (30)
topGO (1)
torch (1)
Tplyr (1)
tracee (1)
tradeSeq (1)
TrajectoryUtils (1)
tram (1)
transformr (1)
transport (1)
tree (1)
treeio (8)
treemap (1)
treespace (1)
TreeSummarizedExperiment (1)
Trendy (0)
triangle (1)
triebeard (2)
trimcluster (0)
tripack (1)
trtf (1)
truncdist (1)
truncnorm (5)
truncreg (1)
TSCAN (1)
tseries (2)
tsfeatures (1)
tsModel (1)
tsne (1)
TSP (17)
TSSi (0)
ttdo (1)
TTR (1)
ttservice (1)
tuberculosis (14)
tufte (1)
TumourMethData (2)
tune (8)
twang (0)
twangContinuous (1)
tweeDEseqCountData (123)
tweedie (1)
tweenr (4)
twilight (0)
twosamples (1)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene (0)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene (1)
tximeta (1)
tximport (1)
tximportDat (1)
tximportData (744)
txtq (1)
tzdb (57)

U

uatools (1)
UCell (1)
uchardet (0)
ucminf (1)
udunits2 (1)
umap (8)
unitizer (1)
units (46)
unmarked (1)
UpSetR (1)
urca (1)
urlchecker (1)
urltools (1)
usethis (68)
utf8 (100)
utilsRmd (1)
uuid (33)
uwot (34)

V

V8 (8)
validate (1)
valr (1)
VAM (0)
vaplot (1)
variables (1)
variancePartition (1)
VariantAnnotation (1)
VariantToolsData (15)
varImp (1)
vars (1)
vaultr (0)
VBsparsePCA (1)
vcd (1)
vcr (1)
vctrs (167)
vdbR (1)
vdiffr (1)
VectraPolarisData (18)
vegan (2)
vegawidget (1)
vembedr (1)
vendormetadatahelpers (1)
venn (6)
VennDiagram (1)
venneuler (1)
VGAM (6)
vhydeg (1)
VIM (1)
VineCopula (1)
vioplot (1)
vip (1)
vipor (1)
viridis (70)
viridisLite (100)
viridislite (1)
visdat (1)
visNetwork (3)
visR (1)
vistime (0)
vpc (1)
vroom (70)
vscDebugger (1)
vsn (1)
vulcandata (33)

W

waiter (5)
wakefield (1)
waldo (80)
warp (1)
wateRmelon (0)
waveTilingData (2)
wdm (1)
wdman (1)
weaver (0)
webchem (1)
webdriver (1)
WeberDivechaLCdata (32)
webfakes (1)
WebGestaltR (1)
webmockr (1)
webp (1)
webshot (19)
webshot2 (1)
websocket (1)
webutils (1)
WeightIt (1)
weights (2)
WES.1KG.WUGSC (42)
wesanderson (1)
WGCNA (6)
WGScan (1)
WGSmapp (33)
whereami (1)
whisker (73)
whitening (1)
whoami (1)
widgetTools (1)
WikidataQueryServiceR (1)
WikidataR (1)
WikipediR (1)
wikitaxa (1)
wildmeta (1)
winboxr (1)
withr (57)
wk (60)
wordcloud (1)
wordcloud2 (1)
workflowr (1)
workflows (7)
workflowsets (4)
worrms (1)
wrapr (1)
Wrench (1)
writexl (2)
WriteXLS (1)
WRS2 (1)

X

xaringan (1)
xaringanExtra (1)
xaringanthemer (1)
xbioc (1)
xcms (1)
xcoredata (30)
xfun (179)
xgboost (12)
xgxr (1)
XhybCasneuf (13)
XLConnect (1)
xlsx (1)
xlsxjars (1)
XML (35)
xml2 (135)
xmlparsedata (1)
xopen (1)
xpose (1)
xpose.nlmixr2 (1)
xpose4 (1)
xrf (1)
xslt (1)
xtable (2)
xts (4)
XVector (1)

Y

yaImpute (1)
yaml (100)
yardstick (7)
yeastCC (52)
yeastExpData (77)
yeastGSData (12)
yeastNagalakshmi (67)
yeastRNASeq (61)
ymlthis (0)
yri1kgv (2)
yriMulti (2)
yspec (1)
yulab.utils (19)

Z

zCompositions (6)
zeallot (1)
zebrafishRNASeq (152)
zinbwave (1)
zip (93)
Ziploc (1)
zlibbioc (1)
zoo (31)