See download stats for:    Bioconductor software packages    Bioconductor annotation packages    Bioconductor experiment packages

Download stats for Bioconductor workflow packages

This page was generated on 2023-11-26 22:26:31 -0500 (Sun, 26 Nov 2023).

The number reported next to each package name is the download score, that is, the average number of distinct IPs that “hit” the package each month for the last 12 months (not counting the current month).

All workflow package stats in one file: workflows_pkg_stats.tab

All workflow package download scores in one file: workflows_pkg_scores.tab

See Download stats for Bioconductor workflow repository (all packages combined)

ABAData (1)
abc (1)
abind (1)
acepack (1)
ade4 (2)
adegraphics (1)
adephylo (1)
admiral (1)
admiral.test (1)
admiraldev (1)
admisc (20)
affy (1)
affyio (1)
AGHmatrix (1)
airr (0)
akima (1)
alakazam (0)
ALDEx2 (1)
alembic (1)
AlgDesign (0)
alkahest.generic (1)
ALL (1)
almanac (1)
alphashape3d (1)
AMARETTO (1)
amgen.okta.client (0)
amgsafetyvis (0)
amlogger (0)
ANCOMBC (1)
animation (1)
anndata (1)
annotate (2)
annotation (67)
AnnotationDbi (11)
AnnotationFilter (1)
AnnotationForge (1)
AnnotationHub (1)
annotatr (1)
anRichment (1)
anticlust (1)
AnVIL (1)
apcluster (1)
ape (6)
apeglm (1)
apexcharter (1)
aplot (10)
appgen (0)
archive (1)
argparse (1)
argus.DS.Credentials (1)
argusDS.apc.utils (1)
argusDS.backtesting.engine (1)
argusDS.data (1)
argusDS.data.preparation (1)
argusDS.data.preparation2 (1)
argusDS.DB.manager.utilities (1)
argusDS.driver.importance (1)
argusDS.FCUtilities (1)
argusDS.FZ.SourceData (1)
argusDS.gamlss.forecast (1)
argusDS.gamlss.modelling (1)
argusDS.gamlss.testing (1)
argusDS.gamlss.utils (1)
argusDS.model.tools (1)
argusDS.PossibilityCurves.utils (0)
argusDS.shiny.utils (1)
argusDS.spread.trading.utils (1)
argusDS.Studio.APC (1)
argusDS.Studio.FC (1)
argusDS.Studio.MyStudio (1)
argusDS.Studio.permissions (1)
argusDS.Studio.utils (1)
argusDS.tabulator (0)
argusDS.trading.performance (1)
argusDS.TradingSignals (0)
argusDS.utilities (1)
arm (1)
arrayop (1)
arrays (35)
arrow (4)
arsenal (1)
arules (21)
ArvadosR (1)
asciicast (1)
ash (1)
ashr (1)
AsioHeaders (3)
askpass (30)
assertive.code (1)
assertive.properties (2)
assertive.types (2)
assertr (1)
assertthat (1)
ATACseqQC (1)
attachment (1)
AUCell (1)
audio (0)
av (1)
aws (1)
aws.s3 (1)
aws.signature (1)
azcore (1)
AzureGraph (1)
AzureRMR (1)
babelgene (1)
babelmixr2 (1)
babelwhale (1)
backbone (1)
backports (11)
badger (1)
bambu (1)
base64 (1)
base64enc (1)
BASiCS (1)
basilisk (1)
batchelor (1)
BatchJobs (1)
batchtools (1)
BayesFactor (1)
bayesm (3)
bayesplot (1)
bayestestR (1)
baySeq (4)
BBmisc (1)
bbmle (1)
bbr (1)
bbr.bayes (1)
bdsmatrix (1)
beachmat (2)
beadarray (1)
beanplot (1)
beeswarm (1)
bench (1)
benchmarkme (0)
berryFunctions (1)
bestNormalize (1)
betareg (1)
BgeeCall (1)
BgeeDB (0)
BH (30)
BiasedUrn (2)
bibtex (1)
biclust (1)
bigassertr (1)
bigD (1)
bigreadr (1)
bigrquery (3)
billboarder (2)
binr (0)
biobank (1)
Biobase (3)
bioc::GenomeInfoDbData (1)
BiocBaseUtils (1)
BiocCheck (1)
BiocFileCache (1)
BiocGenerics (15)
BiocInstaller (0)
BiocIO (1)
BiocManager (91)
BiocMetaWorkflow (21)
biocmetaworkflow (1)
BiocNeighbors (1)
Bioconductor (1)
BiocParallel (6)
BiocSingular (1)
BiocVersion (25)
biocViews (1)
BioGenerics (1)
Biogenerics (1)
biomaRt (2)
biomartr (1)
biomformat (1)
biostatR (1)
biostatUtil (0)
Biostrings (4)
BioVersion (1)
biovizBase (1)
bit (24)
bit64 (6)
bitops (6)
bizdays (1)
blastula (1)
blob (76)
blockcluster (1)
blockmodeling (1)
blogdown (1)
BMisc (1)
bnlearn (1)
bold (1)
bookdown (10)
boot (31)
box (4)
BP4RNAseq (22)
bp4rnaseq (1)
brew (5)
brglm2 (1)
brio (2)
brms (1)
Brobdingnag (1)
broom (80)
broom.helpers (2)
BrowserViz (1)
bs4Dash (5)
BSgenome (1)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer11 (0)
BSgenome.Ggallus.ENSEMBL.galGal6 (1)
BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5 (1)
BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 (1)
BSgenome.Mmul10.SIVmac251 (1)
BSgenome.Mmulatta.NCBI.mmul10.tmp (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm39 (1)
BSgenome.Omela.CUSTOM.oenMel1.1 (1)
BSgenomes (1)
bsicons (1)
bslib (94)
bsplus (1)
btergm (1)
butcher (1)
C50 (1)
cachem (102)
CAGEWorkflow (19)
cageworkflow (1)
Cairo (11)
callr (24)
CAM (1)
CAMERA (1)
campsis (1)
campsismod (1)
candisc (1)
canvasXpress (0)
capsidr (0)
car (48)
carData (2)
caret (43)
castor (1)
caTools (2)
cba (1)
CBPS (0)
ccaPP (1)
ccdrAlgorithm (1)
cdip.datastore (1)
celda (1)
celldex (0)
cellranger (1)
cem (0)
CeTF (1)
cgdsr (1)
ChAMP (1)
changepoint (1)
checkmate (17)
ChemmineOB (1)
ChemmineR (1)
chemometrics (1)
chimeraviz (1)
ChIPseeker (1)
chipseqDB (24)
chipseqdb (1)
chk (2)
chromote (2)
chron (2)
circlesize (1)
circlize (4)
Ckmeans.1d.dp (1)
class (67)
classInt (13)
cli (115)
clinfun (1)
ClinicalQc (1)
clinPK (0)
ClinViz (1)
clipr (6)
clock (21)
clue (10)
cluster (62)
clusterCrit (1)
clusterGeneration (2)
clustermq (2)
clusterprofielr (0)
clusterProfiler (2)
ClusterR (0)
clustree (1)
clValid (1)
cmdstanr (1)
CMplot (1)
cmprsk (1)
CmsAnalytics (1)
CNEr (1)
cobalt (1)
coda (1)
codetools (36)
coin (1)
collapse (1)
collections (1)
colorRamps (1)
colorspace (44)
colortools (1)
colourpicker (3)
colourvalues (1)
common (1)
commonmark (28)
compareDF (1)
compareGroups (1)
ComplexHeatmap (2)
complexheatmap (1)
compositions (2)
condiments (1)
config (6)
confintr (1)
conflicted (2)
connectwidgets (1)
conquer (2)
consort (1)
copula (1)
coro (0)
corpcor (1)
corpora (1)
corrplot (1)
corrr (1)
cosmosR (1)
countrycode (7)
coveffectsplot (1)
covr (15)
covRNA (1)
cowplot (2)
coxphf (1)
cplm (1)
cpp11 (82)
crayon (45)
credentials (5)
crew (1)
CRISPR.shinyapp (1)
crossmatch (1)
crosstalk (16)
crul (4)
csawUsersGuide (18)
csawusersguide (1)
csv (0)
cubature (1)
cubelyr (1)
Cubist (1)
curatedMetagenomicData (0)
curl (118)
cvAUC (0)
cvms (1)
CVST (0)
cxAnalysis (0)
cyclocomp (5)
cytofWorkflow (73)
cytofworkflow (1)
cytolib (1)
CytoTRACE (1)
D2C (1)
d3r (1)
dada2 (1)
dasnormalize.iomel (1)
data.table (44)
datamods (4)
DataOmnio (1)
datawizard (2)
dbaccess (0)
dbarts (1)
DBI (24)
DBItest (0)
dbplyr (71)
dbscan (1)
dcdatr (1)
ddalpha (0)
DDCompanion (1)
DECIPHER (1)
decor (1)
decoupleR (1)
Delaporte (0)
DelayedArray (2)
DelayedMatrixStats (1)
deldir (22)
dendextend (53)
densEstBayes (1)
densvis (1)
DEoptim (1)
DEoptimR (7)
DEP (1)
desc (31)
descr (1)
DescTools (2)
DESeq (1)
DESeq2 (2)
designmatch (0)
DEsingle (1)
deSolve (45)
devtools (5)
DEXSeq (1)
dfidx (0)
dfoptim (1)
DHARMa (0)
DiagrammeR (2)
dials (1)
diceR (1)
dichromat (4)
did (1)
DiffBind (1)
diffloop (1)
diffobj (8)
digest (101)
dimRed (0)
diptest (1)
directlabels (1)
DirichletMultinomial (1)
disk.frame (1)
distill (1)
distr (1)
distributional (1)
DistributionUtils (1)
dittodb (1)
dittoSeq (1)
dlookr (1)
dlstats (1)
dm (1)
DMRcate (0)
DNAcopy (1)
DO.db (1)
doBy (1)
dockerfiler (1)
DoE.base (1)
doFuture (1)
doMC (1)
doParallel (3)
doRNG (1)
dorothea (1)
DOSE (2)
Dose (1)
DoseFinding (1)
doSNOW (1)
dotCall64 (2)
DoubletFinder (1)
downlit (7)
downloadthis (1)
dparser (1)
dplyr (122)
dqrng (5)
drake (2)
drat (1)
DRDID (1)
dreamerr (1)
DropletUtils (1)
DRR (0)
dspNgs (1)
DT (57)
dtplyr (40)
dtw (0)
dtwclust (1)
duckdb (1)
dynfeature (1)
dynplot (1)
dynwrap (1)
e1071 (10)
earth (1)
ebal (0)
echarts4r (7)
ecodist (1)
edgeR (2)
effectsize (2)
EGSEA123 (19)
egsea123 (1)
eha (1)
elasticsearchr (1)
ellipse (48)
ellipsis (7)
emayili (1)
embed (1)
EMD (1)
emdbook (1)
emdist (1)
emmeans (49)
engitomixmk2 (1)
english (1)
EnhancedVolcano (1)
enrichplot (2)
enrichR (1)
EnsDb.Hsapiens.v75 (1)
ensembldb (1)
entropy (1)
EnvStats (1)
Epi (1)
epiR (2)
EpiStats (1)
eQTL (2)
ergm (1)
escape (1)
esquisse (0)
estimability (1)
eulerr (1)
europepmc (1)
evaluate (93)
EValue (0)
evd (0)
Exact (1)
exactRankTests (1)
ExpHunterSuite (22)
exphuntersuite (1)
ExploreModelMatrix (1)
ExplorOMICS (0)
expm (2)
ExpressionNormalizationWorkflow (28)
expressionnormalizationworkflow (1)
expss (5)
extrafont (2)
fabletools (1)
factoextra (1)
FactoMineR (44)
fansi (58)
farver (23)
fastcluster (1)
fastDummies (11)
fastICA (1)
fastmap (45)
fastmatch (10)
fastshap (1)
fauxpas (1)
fBasics (1)
FD (1)
fda (1)
fdrtool (2)
ff (2)
fftwtools (0)
fgsea (1)
fields (2)
filehash (1)
filelock (1)
filesstrings (1)
finalfit (1)
findpython (1)
fitdistrplus (16)
fixest (1)
flair (1)
flexclust (0)
flexdashboard (2)
flexmix (1)
flexsurv (1)
flextable (3)
flowAI (1)
flowClust (1)
FlowCore (1)
flowWorkspace (1)
flowWorkspaceData (0)
fluentGenomics (20)
fluentgenomics (1)
flux (1)
FME (1)
fmtr (1)
FNN (15)
foghorn (1)
fontawesome (57)
forcats (7)
foreach (5)
forecast (2)
foreign (19)
forestplot (1)
fork (1)
formatR (32)
formatters (1)
Formula (5)
forrester.metadata (1)
fpc (1)
fracdiff (1)
fresh (1)
FrF2 (1)
fs (114)
fstcore (1)
furrr (8)
futile.logger (1)
futile.options (1)
future (71)
future.apply (33)
future.batchtools (1)
future.callr (2)
g3viz (1)
GA (0)
gam (1)
gamboostLSS (1)
gamlss (1)
gamlss.dist (1)
gamm4 (1)
gap (1)
gap.datasets (1)
gapminder (1)
gargle (57)
gbm (0)
gbRd (1)
gdata (4)
gdtools (2)
gee (0)
geepack (0)
genefilter (1)
genefu (0)
generegulation (24)
generics (27)
GenomeInfoDb (6)
GenomeInfoDbData (2)
GenomicAlignments (1)
GenomicFeatures (1)
GenomicRanges (2)
GenomicTools (1)
GenSA (1)
geodiv (1)
geohashTools (0)
geojson (1)
geojsonio (1)
geojsonsf (1)
geometries (3)
geometry (1)
geomorph (1)
GeomxTools (1)
GeoMxWorkflows (130)
geomxworkflows (1)
GEOquery (1)
geosphere (1)
gert (11)
getopt (1)
GetoptLong (1)
gettz (1)
gfonts (1)
ggalluvial (1)
GGally (1)
gganimate (0)
ggbeeswarm (15)
ggbreak (1)
ggcorrplot (1)
ggdag (1)
ggdendro (1)
ggdist (1)
ggeasy (1)
ggeffects (2)
ggExtra (1)
ggfittext (1)
ggforce (4)
ggformula (1)
ggfortify (1)
ggfun (11)
gggenes (1)
ggh4x (1)
gghalves (1)
gghighlight (0)
gginnards (0)
ggiraph (1)
ggmap (41)
ggnetwork (1)
ggnewscale (8)
ggnewscales (1)
ggplot (1)
ggplot2 (110)
ggplotify (10)
ggpmisc (1)
ggPMX (0)
ggpp (1)
ggprism (0)
ggpubr (4)
ggRandomForests (0)
ggraph (3)
ggrastr (5)
ggrepel (30)
ggridges (15)
ggsci (45)
ggsignif (4)
ggstance (1)
ggstatsplot (1)
ggtext (1)
ggtree (3)
ggvenn (1)
ggVennDiagram (0)
gh (6)
gifski (1)
git2r (2)
gitcreds (4)
gitlabr (1)
GLAD (1)
glassoFast (1)
glca (1)
gld (1)
glmGamPoi (1)
glmmADMB (1)
glmmTMB (1)
glmnet (4)
glmnetUtils (1)
GlobalOptions (0)
globals (15)
glue (11)
gmailr (1)
GMD (0)
gmm (1)
gmodels (1)
gmp (2)
gnm (1)
GO.db (2)
goftest (12)
golem (2)
gongs (1)
googleAuthR (0)
googleCloudStorageR (0)
googledrive (53)
googlesheets4 (53)
googleVis (1)
GOSemSim (1)
goshawk (1)
gower (1)
GPArotation (42)
gplots (16)
gprofiler2 (1)
gRain (1)
graph (1)
graphlayouts (1)
graphql (0)
gRbase (1)
gridExtra (0)
gridGraphics (0)
gridSVG (0)
gridtext (0)
grImport2 (1)
groupdata2 (0)
gsDesign (0)
GSEABase (1)
gsl (0)
gson (0)
gss (0)
GSVA (1)
GSVAdata (1)
gt (1)
gtable (1)
gtools (1)
gtsummary (1)
gubraqsar (0)
GUniFrac (1)
gupio (0)
Gviz (0)
gwasrapidd (0)
GWENA (1)
gWidgets2tcltk (1)
h2o (1)
HandTill2001 (1)
hardhat (0)
HardyWeinberg (1)
harmony (0)
hash (0)
haven (1)
HDF5Array (1)
hdf5r (0)
HDInterval (1)
HDO.db (1)
heatmaply (1)
heemod (0)
here (0)
Herper (1)
hexbin (1)
hgu95a.db (0)
HiClimR (1)
highlight (0)
highr (1)
highthroughputassays (4)
Hmisc (12)
hms (1)
Homo.sapiens (0)
Hoover (1)
HSAUR2 (1)
hsm (0)
htmlTable (1)
htmltools (1)
htmlwidgets (1)
HTqPCR (1)
httpcode (0)
httpgd (0)
httptest (0)
httpuv (1)
httr (1)
httr2 (0)
hunspell (0)
huxtable (1)
hwriter (1)
IAPWS95 (1)
iatlas.app (0)
ica (0)
idr (0)
ids (0)
igraph (1)
igvShiny (0)
iheatmapr (0)
IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 (1)
imager (0)
imcRtools (1)
iml (0)
import (0)
ImpulseDE2 (1)
impute (0)
imputeLCMD (0)
imputeTS (0)
infer (1)
influenceR (0)
infotheo (0)
InkblotAnalytics (19)
INLA (1)
inline (0)
insight (1)
intergraph (0)
interp (0)
intervals (0)
inum (0)
ipaddress (1)
ipred (0)
IRanges (4)
IRkernel (1)
irlba (0)
irr (0)
isoband (1)
iterators (1)
JADE (1)
janeaustenr (0)
janitor (0)
jcolors (0)
JM (0)
jnjtemplates (0)
joineRML (0)
jomo (0)
jose (1)
jpeg (1)
jqr (0)
jquerylib (0)
jsonify (0)
jsonlite (2)
jsTreeR (1)
jtools (0)
juicyjuice (1)
JuliaCall (0)
kableExtra (0)
KEGG.db (1)
KEGGREST (3)
keggsvg (0)
keras (1)
kernlab (0)
KernSmooth (30)
keyring (1)
khroma (0)
klaR (0)
km.ci (0)
kmed (0)
knitr (2)
kohonen (0)
ks (1)
labeling (1)
labelled (0)
Lahman (1)
lambda.r (0)
lambdr (0)
LambertW (1)
lamW (0)
landscapemetrics (0)
languageserver (0)
lares (1)
lasso2 (0)
later (1)
latex2exp (1)
lattice (1)
latticeExtra (1)
lava (1)
lavaan (0)
lazyeval (0)
lbfgs (0)
ldap (0)
LDlinkR (1)
leafem (0)
leaflet (0)
leaflet.providers (0)
leaps (0)
learnr (1)
leiden (0)
leidenAlg (0)
leidenbase (0)
lemon (0)
lfe (0)
lgr (0)
lhs (1)
liana (0)
libcoin (0)
lifecycle (2)
liftOver (36)
liftover (0)
limma (0)
limmia (0)
limSolve (0)
linprog (0)
lintr (0)
listenv (1)
listviewer (0)
littler (0)
lm.beta (0)
lme4 (1)
lmom (0)
lmomco (0)
lmtest (1)
lobstr (0)
locfit (1)
log4r (1)
logger (0)
logistf (0)
logitnorm (0)
logr (0)
lokern (0)
loo (0)
LoomExperiment (1)
lotri (0)
lpSolve (0)
lpSolveAPI (0)
lsa (0)
lsei (0)
lubridate (1)
Luminescence (1)
lvec (0)
lwgeom (0)
m03modeldevelopment (0)
M3Drop (1)
maboost (0)
MACSr (1)
madness (0)
maEndToEnd (13)
MafDb.gnomAD.r2.1.hs37d5 (1)
magic (1)
magick (0)
magrittr (1)
maketools (0)
MALDIquant (1)
mapbayr (0)
mapdata (1)
mapplots (0)
mapproj (1)
maps (1)
maptools (1)
mapview (0)
Markdown (0)
markdown (1)
MASS (122)
MAST (1)
Matching (1)
MatchIt (1)
MatchThem (0)
mathjaxr (1)
Matrix (141)
Matrix.utils (7)
matrixcalc (0)
MatrixGenerics (2)
MatrixModels (26)
matrixStats (1)
matrixTests (0)
maxLik (0)
mboost (0)
mc2d (1)
mclogit (1)
mclust (1)
MCPcounter (1)
mda (0)
memisc (0)
memoise (1)
MESS (0)
metabaser (0)
metabolomics (0)
MetaboReport (0)
metafor (0)
metaMA (0)
metap (0)
methylationArrayAnalysis (17)
methylationarrayanalysis (0)
mets (0)
mFilter (0)
mgcv (2)
mgm (0)
mia (0)
mice (1)
microbenchmark (0)
microseq (0)
miloR (0)
mime (1)
mimosa (0)
miniUI (0)
minpack.lm (0)
minqa (1)
mirai (0)
mirt (0)
misc3d (0)
miscTools (0)
missRanger (0)
mitml (0)
mixOmics (0)
mixsqp (0)
mixtools (0)
mlbench (0)
mlflow (0)
mlpack (0)
mlr (0)
mlr3 (1)
mlr3measures (0)
mlr3misc (0)
mlr3pipelines (0)
mlr3tuning (0)
mmrm (0)
mnormt (1)
MNP (1)
mockery (0)
mockr (0)
modeldata (0)
modelenv (1)
ModelMetrics (1)
modelr (1)
modeltools (0)
modules (0)
MOFA2 (0)
moleculaR (0)
moments (0)
Momocs (1)
morpheus (1)
Morpho (1)
mosaicCore (0)
motifmatchr (0)
MPA (1)
mpn.scorecard (0)
mrgda (1)
mrggsave (0)
mrgmisc (1)
mrgsolve (0)
mrgvalidate (1)
mrgvalprep (1)
MsCoreUtils (1)
msdata (0)
MsFeatures (1)
msigdb (0)
msigdbr (1)
msm (1)
MSnbase (1)
MSstats (1)
MSstatsTMT (1)
MSstatsTMTs (1)
multcomp (1)
multcompView (0)
MultiAssayExperiment (1)
multicross (0)
multiGSEA (0)
multipanelfigure (0)
multtest (1)
MuMIn (1)
munsell (0)
MutationalPatterns (1)
mutoss (0)
mvnfast (0)
mvtnorm (1)
myphd (0)
mzR (0)
n1qn1 (0)
naniar (0)
nanonext (0)
NanoStringNCTools (1)
nanostringr (0)
nanotime (1)
narray (0)
nat.util (0)
nat.utils (0)
natserv (0)
nbpMatching (0)
ncdf4 (0)
ncdfFlow (0)
NCmisc (1)
ndjson (0)
NEONiso (1)
neonUtilities (0)
netmeta (0)
network (0)
ngsReports (0)
nhanesA (0)
nleqslv (0)
nlme (2)
nlmixr2 (1)
nlmixr2data (1)
nlmixr2est (1)
nlmixr2extra (1)
nlmixr2lib (1)
nlmixr2plot (1)
nloptr (1)
NMcalc (1)
NMdata (1)
NMF (2)
NMproject (0)
nmrec (0)
NMsim (1)
nnet (1)
NNLM (1)
nnls (0)
NonCompart (0)
nonmem2rx (0)
nonmemica (0)
nonnest2 (0)
norm (0)
NormalizerDE (1)
npde (1)
npsurv (0)
numDeriv (0)
odbc (0)
odyproteomicsValidator (0)
officedown (0)
officer (1)
oligo (0)
omicsbase (0)
OmnipathR (1)
ompr (0)
ompr.roi (0)
ontologyIndex (0)
openssl (1)
openxlsx (1)
optimx (0)
optmatch (0)
optparse (1)
ordinal (1)
org.Dm.eg.db (0)
org.Dr.eg.db (0)
org.Hs.eg.db (1)
org.Mm.eg.db (1)
org.Pf.plasmo.db (0)
org.Rn.eg.db (0)
org.Ss.eg.db (0)
orientlib (0)
orthogene (0)
osmdata (0)
osprey (0)
osqp (1)
packrat (1)
padr (1)
pagedown (1)
pak (0)
paletteer (0)
palmerpenguins (0)
pals (0)
pammtools (0)
pamr (0)
pan (0)
pander (0)
panelr (0)
paradox (1)
parallelly (1)
parameters (1)
ParamHelpers (0)
parsedate (1)
parsnip (1)
partitions (0)
party (0)
partykit (0)
patchwork (1)
pathfindR.data (0)
pathview (0)
paws (0)
paws.analytics (0)
paws.application.integration (0)
paws.common (1)
paws.compute (0)
paws.cost.management (0)
paws.customer.engagement (0)
paws.database (0)
paws.developer.tools (0)
paws.end.user.computing (0)
paws.machine.learning (0)
paws.management (0)
paws.networking (0)
paws.security.identity (0)
paws.storage (0)
pbapply (1)
pbdZMQ (0)
pbkrest (0)
pbkrtest (0)
pcaExplorer (1)
pcalg (0)
pcaMethods (1)
pcaPP (1)
pdftools (1)
pdist (0)
pec (0)
PEIP (1)
Peptides (1)
performance (1)
PerformanceAnalytics (0)
permute (0)
PFIM (1)
phangorn (0)
pharmaversesdtm (0)
pheatmap (0)
philentropy (0)
phosphoricons (0)
PhosR (0)
phyclust (0)
phyloseq (0)
phylosignal (0)
phytools (0)
picante (0)
pillar (2)
pingr (1)
pins (0)
pixmap (0)
PK (1)
pkgbuild (1)
pkgcache (1)
pkgconfig (1)
pkgdepends (1)
pkgdown (1)
pkgKitten (0)
pkgload (1)
pkgmaker (0)
PKI (1)
PKNCA (1)
PKPDmodels (1)
plantecophys (0)
plm (0)
plogr (0)
plot3D (0)
plotgardener (0)
plotly (1)
plotmm (0)
plotrix (0)
plotROC (0)
pls (0)
plumber (0)
plyr (1)
pmartR (0)
PMCMRplus (1)
pmforest (1)
pmparams (0)
pmplots (0)
pmtables (1)
pmxTools (0)
png (1)
pointblank (0)
PoissonBinomial (1)
poLCA (0)
polspline (1)
polyclip (1)
polycor (0)
polynom (1)
pool (1)
poolfstat (0)
poorman (0)
PossibilityCurves (1)
posterior (0)
prabclus (0)
pracma (0)
praise (0)
preAnomalyDetectionCredLife (0)
PreciseSums (1)
precommit (0)
preprocessCore (0)
prettydoc (0)
prettyunits (1)
prismatic (0)
pROC (0)
processCore (0)
processx (2)
prodlim (0)
proffer (0)
profile (0)
profvis (0)
progress (0)
progressr (1)
proj4 (1)
projpred (1)
promises (1)
prompt (0)
propr (0)
proteomics (2)
ProtGenerics (1)
protolite (1)
proxy (0)
proxyC (0)
pryr (0)
ps (2)
pscl (0)
psych (0)
psychometric (0)
Publish (1)
PullReadAnalysisData (1)
purrr (1)
pvca (0)
qap (1)
qdapRegex (0)
qdapTools (0)
qgraph (0)
qpdf (1)
qqconf (1)
qqman (0)
qqplotr (0)
qrnn (0)
qs (0)
qtl2 (0)
quadprog (0)
qualpalr (0)
quantable (0)
quantmod (0)
quantreg (1)
quarto (1)
questionr (0)
QuickJSR (1)
qvalue (1)
qvcalc (0)
R.cache (1)
R.devices (1)
R.methodsS3 (10)
R.oo (10)
R.rsp (1)
R.utils (18)
r2rtf (0)
R6 (9)
rAccess (0)
ragg (1)
rainbow (0)
rAmCharts (0)
randomForest (1)
randomForestSRC (0)
randomizr (0)
randtoolbox (1)
ranger (0)
RankAggreg (1)
RApiDatetime (1)
RApiSerialize (1)
rappdirs (0)
rapportools (1)
raster (1)
RBesT (1)
rbibutils (1)
rbioapi (0)
rBLAST (0)
rcartocolor (0)
Rcgmin (1)
Rchoice (1)
RCircos (0)
RClickhouse (1)
rclipboard (0)
rcmdcheck (0)
RcmdrMisc (1)
RColorBrewer (8)
rcompanion (0)
Rcpp (96)
RcppAnnoy (20)
RcppArmadillo (104)
RcppCCTZ (1)
RcppDate (1)
RcppDE (1)
RcppEigen (19)
RcppGSL (1)
RcppHNSW (17)
RcppNumerical (1)
RcppParallel (3)
RcppProgress (1)
RcppSimdJson (1)
RcppSpdlog (1)
RcppThread (1)
RcppTOML (14)
Rcsdp (1)
RCurl (48)
RCy3 (0)
Rd2roxygen (0)
Rdpack (2)
reactable (1)
reactlog (0)
reactome.db (0)
ReactomeGSA (1)
ReactomePA (1)
reactR (0)
readODS (0)
readr (1)
readstata13 (0)
readxl (1)
REBayes (1)
recipes (1)
reclin (0)
recommenderlab (0)
recosystem (0)
recountWorkflow (4)
recountworkflow (0)
reda (0)
REddyProc (0)
RefManageR (1)
registry (0)
reldist (0)
remaCor (0)
rematch (0)
rematch2 (1)
remotes (0)
rentrez (0)
renv (1)
reporter (0)
repr (0)
reprex (1)
repurrrsive (1)
reshape (0)
reshape2 (1)
ResidualMatrix (1)
restfulr (1)
RestRserve (7)
reticulate (0)
revealgenomics (0)
RevGadgets (1)
review (0)
rex (0)
Rfast (2)
Rfit (1)
rgbif (0)
RGCCA (1)
rgdal (0)
rgeos (1)
rgexf (0)
rgl (0)
Rglpk (1)
RgoogleMaps (0)
Rgraphviz (1)
rhandsontable (0)
rhdf5 (1)
rhdf5filters (0)
Rhdf5lib (3)
rhino (0)
RhpcBLASctl (7)
Rhtslib (1)
rhub (0)
rice (0)
rintrojs (0)
rio (0)
RIPSeeker (0)
riskmetric (0)
riskRegression (1)
ritis (0)
RItools (1)
rjags (0)
rJava (0)
RJDBC (1)
rjson (0)
RJSONIO (13)
rlang (2)
rlecuyer (0)
rlemon (0)
Rmagic (1)
RMariaDB (1)
rmarkdown (1)
rmdformats (1)
Rmisc (1)
Rmpfr (1)
Rmpi (1)
rms (0)
RMTstat (1)
rmutil (1)
rMVP (0)
RMySQL (2)
RNAi (1)
RNAseq123 (119)
rnaseq123 (0)
rnaseqDTU (7)
rnaseqdtu (0)
rnaseqGene (29)
rnaseqgene (0)
RnaSeqGeneEdgeRQL (122)
rnaseqgeneedgerql (0)
rnaturalearth (0)
rncl (0)
RNeXML (1)
rngtools (0)
rngWELL (1)
robfilter (0)
robust (0)
robustbase (1)
RobustRankAggreg (1)
ROC (1)
ROCR (1)
RODBC (1)
ROI (1)
ROI.plugin.lpsolve (1)
rols (0)
Rook (1)
rootSolve (0)
rotl (0)
roxygen2 (1)
rpart (1)
rpart.plot (1)
RPMG (1)
RPostgres (1)
RPostgreSQL (1)
rprojroot (1)
RProtoBufLib (0)
rrapply (0)
rrcov (1)
rredlist (0)
RRPP (1)
rsample (1)
Rsamtools (2)
rsconnect (1)
RSEIS (1)
RSelenium (1)
Rserve (7)
RSiena (1)
Rsmlx (1)
rsnps (0)
RSpectra (14)
RSQLite (85)
RsSimulx (1)
rstan (0)
rstanarm (0)
rstantools (0)
rstatix (1)
rstpm2 (0)
rstudioapi (1)
rsvd (0)
rsvg (1)
rtables (0)
rticles (0)
rtkore (0)
rtracklayer (0)
Rtsne (8)
Rttf2pt1 (2)
rugarch (0)
runjags (0)
Runuran (1)
RUVseq (1)
Rvcg (1)
rvcheck (0)
rversions (1)
rvest (1)
rvg (1)
Rvmmin (1)
Rwave (1)
rworldmap (0)
rxode2 (1)
rxode2et (1)
rxode2ll (1)
rxode2parse (1)
rxode2random (1)
rzmq (0)
s2 (1)
S4Arrays (1)
S4Vectors (7)
saemix (0)
SAIGEgds (1)
sandwich (1)
sas7bdat (0)
sass (1)
SBGNview.data (1)
ScaledMatrix (1)
scales (2)
scam (0)
scater (0)
scatterD3 (0)
scattermore (0)
scatterpie (1)
scatterplot3d (1)
sccore (0)
sccs (0)
scda (0)
scda.2021 (0)
scda.2022 (0)
ScDblFinder (1)
scDblFinder (0)
scico (0)
scidb (0)
scLinear (0)
scMerge (0)
SCP (1)
scPipe (0)
scran (0)
scRNAseq (0)
scRNASeq.spatial (0)
scrypt (0)
sctransform (0)
scuttle (0)
scviewer (0)
sda (0)
SDMTools (1)
secrets (0)
segmented (1)
selectr (0)
sen2r (0)
sendmailR (0)
sensitivity (0)
sensobol (1)
SeqArray (1)
seqinr (1)
seqLogo (0)
seqmagick (0)
seqminer (0)
seqpac (1)
sequencing (6)
seriation (1)
servr (1)
sesame (0)
sessioninfo (0)
setRNG (0)
sets (0)
Seurat (21)
seurat (0)
SeuratObject (15)
sf (0)
sfheaders (0)
sfsmisc (1)
shadowtext (1)
shape (0)
shapr (0)
shiny (1)
shiny.react (0)
shiny.router (0)
shinyAce (0)
shinyalert (0)
shinyauth (0)
shinyBS (1)
shinybusy (1)
shinycssloaders (1)
shinydashboard (1)
shinydashboardPlus (0)
shinydisconnect (0)
shinyFeedback (0)
shinyFiles (1)
shinyglide (0)
ShinyItemAnalysis (22)
shinyjqui (0)
shinyjs (1)
shinyLP (0)
shinymanager (0)
shinyMethyl (0)
shinyMobile (1)
shinyscreenshot (0)
shinySelect (1)
shinytest (1)
shinytest2 (0)
shinythemes (1)
shinytoastr (0)
shinyTree (0)
shinyvalidate (0)
shinyWidgets (1)
ShortRead (1)
showtext (0)
SIAMCAT (1)
SID (1)
sigclust (0)
Sigfried (1)
Signac (1)
signal (0)
simpar (0)
simpleSingleCell (8)
simplesinglecell (0)
SingleCelLExperiment (0)
SingleCellExperiment (1)
singleCellTK (0)
SingleR (1)
SingscoreAMLMutations (19)
singscoreamlmutations (0)
sirnakit (0)
siscreener (0)
sitmo (0)
sjlabelled (0)
sjmisc (0)
sjPlot (1)
sjstats (1)
skimr (0)
skmeans (0)
slackr (0)
slam (0)
slickR (1)
slider (1)
sm (0)
smacof (0)
sme (0)
smldesign (0)
smoothHR (0)
SMVar (1)
sn (1)
sna (0)
snakecase (0)
snow (1)
SnowballC (1)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38 (1)
sodium (0)
solrium (0)
SomaVarDB (1)
sommer (0)
sortable (0)
sos (0)
SoupX (1)
sourcetools (0)
sp (1)
spacetime (0)
spam (0)
spaMM (1)
sparklyr (1)
SPARQL (1)
sparsebn (0)
SparseM (1)
sparseMatrixStats (0)
sparsesvd (0)
spatial (0)
spatialreg (0)
spatstat (0)
spatstat.core (0)
spatstat.data (0)
spatstat.explore (0)
spatstat.geom (0)
spatstat.linnet (0)
spatstat.model (0)
spatstat.random (0)
spatstat.sparse (0)
spatstat.utils (0)
spData (1)
spdep (0)
spectacles (0)
speedglm (0)
spelling (0)
spgs (0)
spicyWorkflow (0)
spicyworkflow (0)
SpidermiR (1)
splines2 (0)
spsComps (0)
SQUAREM (1)
ssh (1)
StanHeaders (1)
stargazer (0)
stars (0)
starter (0)
statmod (0)
statnet (0)
statnet.common (0)
statsExpressions (0)
statTarget (0)
stevedore (0)
stinepack (0)
storr (0)
strex (0)
stringdist (1)
stringfish (0)
stringi (1)
stringr (1)
striprtf (0)
styler (1)
subselect (0)
SummarizedExperiment (2)
summarytools (0)
sunburstR (0)
SuperLearner (1)
SuppDists (1)
survey (0)
survival (1)
survivalROC (1)
survminer (0)
survMisc (0)
sva (0)
svd (0)
svglite (0)
svMisc (0)
svUnit (0)
Swiffer (1)
symphony (0)
sys (1)
sysfonts (0)
systemfit (0)
systemfonts (0)
syuzhet (0)
table1 (0)
tableHTML (0)
tables (0)
tarchetypes (1)
targets (1)
taxize (0)
TCC (4)
TCGAbiolinks (1)
TCGAWorkflow (53)
tcgaworkflow (0)
teal (0)
teal.modules.clinical (0)
teal.modules.general (0)
teal.widgets (0)
templater (0)
tensorflow (1)
tergm (0)
tern (0)
terra (1)
tesseract (0)
testproj (0)
testthat (1)
texreg (0)
textshaping (0)
TFBSTools (1)
TFisher (1)
TFMPvalue (1)
tfruns (0)
TH.data (2)
thematic (0)
themis (0)
this.path (0)
tibble (2)
tictoc (0)
tidybayes (0)
tidycensus (0)
tidygraph (1)
tidymodels (0)
tidyposterior (0)
tidyr (1)
tidyselect (1)
tidySummarizedExperiment (0)
tidytext (0)
tidytlg (0)
tidytree (1)
tidyTree (0)
tidyverse (1)
tidyvpc (1)
tidyxl (0)
tiff (0)
tigris (0)
tikzDevice (0)
timechange (1)
timeDate (1)
timereg (1)
timeSeries (0)
timetk (0)
tinytest (0)
tinytex (1)
tm (0)
tmap (0)
TMB (1)
tmle (0)
tmvtnorm (0)
tokenizers (0)
tokupika (0)
torch (0)
Tplyr (1)
tracee (0)
tradeSeq (0)
TrajectoryUtils (1)
transformr (0)
transport (0)
treeio (1)
treemap (0)
treespace (0)
TreeSummarizedExperiment (1)
triebeard (0)
truncnorm (0)
TSCAN (1)
tseries (0)
tsfeatures (0)
tsne (0)
TSP (11)
ttdo (0)
TTR (0)
ttservice (0)
tufte (0)
tune (0)
twang (0)
tweenr (1)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene (1)
tximeta (0)
tximport (0)
tximportDat (0)
tximportData (0)
txtq (0)
tzdb (1)
uatools (0)
UCell (1)
uchardet (0)
ucminf (0)
umap (0)
units (1)
UpSetR (1)
urca (0)
usethis (1)
utf8 (1)
utilsRmd (0)
uuid (1)
uwot (0)
V8 (8)
valr (0)
VAM (0)
variancePartition (1)
variants (5)
vars (0)
vaultr (0)
vcd (0)
vcr (1)
vctrs (2)
vdbR (0)
vdiffr (0)
vegan (0)
vegawidget (0)
vendormetadatahelpers (0)
VennDiagram (1)
VGAM (1)
vhydeg (0)
vioplot (1)
vip (0)
vipor (0)
viridis (1)
viridisLite (1)
viridislite (1)
visdat (0)
visNetwork (1)
visR (0)
vistime (0)
vroom (1)
vsn (0)
waiter (0)
waldo (1)
warp (0)
wdman (0)
webchem (0)
webdriver (1)
webfakes (1)
webmockr (0)
webp (0)
webshot (1)
webshot2 (0)
WeightIt (1)
weights (1)
WGCNA (1)
whereami (0)
whisker (1)
WikidataR (1)
wikitaxa (0)
winboxr (0)
withr (1)
wk (0)
workflowr (0)
workflows (1)
workflowsets (0)
worrms (0)
wrapr (0)
Wrench (1)
writexl (1)
WriteXLS (1)
xaringan (1)
xaringanthemer (0)
xcms (0)
xfun (2)
xgboost (1)
xgxr (0)
XLConnect (1)
xlsx (0)
XML (27)
xml2 (1)
xopen (0)
xpose (1)
xslt (0)
xtable (0)
xts (0)
XVector (1)
yaImpute (1)
yaml (1)
yardstick (0)
ymlthis (0)
yspec (0)
yulab.utils (1)
zCompositions (0)
zinbwave (0)
zip (1)
Ziploc (1)
zlibbioc (0)
zoo (1)