Download stats for Bioconductor annotation packagesDownload stats for Bioconductor experiment packages

Download stats for Bioconductor Software packages

This page was generated on 2014-08-27 09:48:15 -0700 (Wed, 27 Aug 2014).

This page monitors Bioconductor Software package downloads from http://bioconductor.org/ over the last 12 months. The number reported next to each package name is the number of distinct IPs that “hit” the package over the last 12 months. Core packages (i.e. the BiocInstaller package + packages that get installed the first time biocLite() is called with no arguments) are reported in bold.


Top 50

1BiocInstaller (127760)
2BiocGenerics (97585)
3IRanges (95273)
4Biobase (93585)
5AnnotationDbi (80255)
6limma (59842)
7zlibbioc (58972)
8Biostrings (54570)
9GenomicRanges (51570)
10annotate (47286)
11genefilter (42647)
12Rsamtools (41931)
13XVector (41751)
14biomaRt (40852)
15rtracklayer (38762)
16affy (38030)
17graph (37095)
18GenomicFeatures (36828)
19preprocessCore (36798)
20BSgenome (34368)
21affyio (33884)
22geneplotter (27121)
23GenomeInfoDb (26876)
24multtest (26548)
25edgeR (26010)
26DESeq (22910)
27RBGL (22316)
28flowCore (20826)
29Rgraphviz (20361)
30impute (20313)
31mzR (18610)
32xcms (18488)
33GEOquery (18431)
34biovizBase (18344)
35gcrma (17444)
36VariantAnnotation (17149)
37DESeq2 (15622)
38ShortRead (15530)
39vsn (14683)
40BiocParallel (14405)
41qvalue (14358)
42GenomicAlignments (14279)
43Gviz (13703)
44AnnotationForge (13679)
45affyPLM (13289)
46GSEABase (13190)
47cummeRbund (12577)
48Category (12003)
49simpleaffy (11889)
50GOstats (11335)

All Software packages

MonthNb of distinct IPsNb of downloads
Sep/2013242021083196
Oct/2013312871041153
Nov/201329406853692
Dec/201328510807082
Jan/201429690725608
Feb/201428993573612
Mar/201434634886794
Apr/201439965777391
May/201438374830827
Jun/201436391728039
Jul/201436900655894
Aug/201430933538848
All months2532739502136

A

a4 (2305)
a4Base (2388)
a4Classif (2255)
a4Core (2397)
a4Preproc (2399)
a4Reporting (2201)
ABarray (2174)
ABSSeq (738)
aCGH (2966)
ACME (2139)
ADaCGH2 (2014)
adSplit (2003)
AdvancedR (1)
AdvancedR2011 (3)
AdvancedR2011Data (5)
affxparser (10245)
affy (38030)
affycomp (3105)
AffyCompatible (2284)
affyContam (2048)
affycoretools (5147)
affydata (1)
AffyExpress (2310)
affyILM (1972)
affyio (33884)
affylmGUI (3270)
affyPara (1999)
affypdnn (2360)
affyPLM (13289)
affyQCReport (6428)
affyqcreport (3)
AffyRNADegradation (1998)
AffyTiling (2147)
AGDEX (1873)
Agi4x44PreProcess (1780)
agilp (2234)
agimicrorna (1)
AgiMicroRna (2425)
AIMS (1)
AllelicImbalance (1514)
alsace (716)
altcdfenvs (2075)
ampliQueso (1483)
annaffy (9833)
AnnBuilder (28)
annmap (930)
annotate (47286)
annotation (297)
AnnotationDbi (80255)
AnnotationForge (13679)
AnnotationFuncs (2087)
AnnotationHub (3021)
annotationTools (2416)
anota (1996)
antiProfiles (1791)
apcluster (1)
apComplex (2129)
aroma.light (5301)
ArrayExpress (4602)
ArrayExpressHTS (1110)
arrayMagic (6)
arrayMvout (1941)
arraymvout (1)
arrayQCplot (3)
arrayQuality (2588)
arrayQualityMetrics (4938)
arrays (488)
ArrayTools (2342)
ArrayTV (1543)
ARRmNormalization (1683)
ASEB (1779)
asmn (763)
ASSET (1356)
ASSIGN (713)
AtlasRDF (733)
attract (1894)

B

BAC (1826)
BADER (1615)
BAGS (1431)
ballgown (30)
BaseSpaceR (1722)
Basic4Cseq (754)
BayesPeak (2845)
baySeq (4179)
bcellViper (3)
BCRANK (2183)
beadarray (6447)
beadarraySNP (2109)
BeadDataPackR (5866)
beaddatapackr (1)
BeadExplorer (3)
BEAT (741)
betr (2036)
bgafun (1954)
BGmix (990)
bgx (1893)
BHC (2329)
BicARE (1912)
BiGGR (1482)
bigmemoryExtras (1018)
bioassayR (1658)
Biobase (93585)
biobase (1)
BiocCaseStudies (1970)
BiocCheck (861)
biocDatasets (29)
BiocGenerics (97585)
biocGraph (2111)
BiocInstaller (127760)
biocinstaller (2)
BiocParallel (14405)
BiocStyle (3121)
biocViews (2462)
bioDist (4498)
biomaRt (40852)
BioMVCClass (2093)
biomvRCNS (1534)
BioNet (3112)
BioSeqClass (1973)
Biostrings (54570)
biostrings (1)
biosvd (721)
biovizbase (1)
biovizBase (18344)
BiRewire (1412)
birta (1822)
BiSeq (2126)
BitSeq (2349)
blima (85)
blimaTestingData (3)
BRAIN (2084)
BrainStars (1799)
bridge (1897)
BSgenome (34368)
bsseq (2250)
BufferedMatrix (1793)
bufferedmatrix (1)
BufferedMatrixMethods (1738)
bumphunter (7050)
BUS (1706)

C

CAFE (665)
CAGEr (1768)
CALIB (1688)
CAMERA (2987)
cancerclass (1657)
CancerMutationAnalysis (1728)
casper (1628)
Category (12003)
categoryCompare (1721)
ccrepe (729)
cellGrowth (1626)
cellhts (1)
cellHTS (1778)
cellHTS2 (2633)
CellNOptR (1975)
CexoR (1312)
CGEN (1824)
CGHbase (2287)
CGHcall (2138)
cghcall (1)
cghMCR (1789)
CGHnormaliter (1697)
CGHregions (1764)
ChAMP (2219)
ChAMPdata (3)
charm (1966)
ChemmineOB (1742)
ChemmineR (3166)
chemminer (3)
chimera (2393)
chipenrich (1342)
chipenrich.data (3)
ChIPpeakAnno (4567)
ChIPQC (801)
ChIPseeker (905)
chipseq (3698)
ChIPseqR (1931)
ChIPsim (1854)
ChIPXpress (836)
chopsticks (2078)
chroGPS (1600)
ChromHeatMap (1829)
cisPath (1599)
cleanUpdTSeq (1310)
cleaver (1607)
clippda (1653)
clipper (1759)
Clomial (660)
Clonality (1686)
clonotypeR (1293)
clst (1652)
clstutils (1612)
clusterProfiler (3105)
clusterprofiler (2)
clusterStab (1954)
CMA (2432)
cn.farms (1674)
cn.mops (2759)
cnanorm (1)
CNAnorm (1824)
CNEr (798)
CNORdt (1557)
CNORfeeder (1517)
CNORfuzzy (1580)
CNORode (1585)
CNTools (1965)
cnvGSA (1630)
CNVrd2 (1243)
CNVtools (1870)
cnvtools (1)
cobindR (1311)
CoCiteStats (1791)
codelink (1768)
CoGAPS (460)
coGPS (1562)
COHCAP (791)
COHCAPanno (3)
COMPASS (690)
compcodeR (786)
compEpiTools (4)
CompGO (687)
ConsensusClusterPlus (2796)
convert (2920)
copa (1842)
COPDSexualDimorphism (648)
COPDSexualDimorphism.data (1)
copynumber (1752)
CopyNumber450k (685)
CopyNumber450kData (3)
Cormotif (1586)
CorMut (1637)
coRNAi (1622)
CORREP (1688)
cosmiq (54)
cosmo (176)
cosmoGUI (216)
CoverageView (415)
cqn (2368)
CRImage (1932)
CRISPRseek (776)
crlmm (3318)
CSAR (2079)
CSSP (1308)
ctc (4075)
cummeRbund (12577)
CummeRbund (1)
customProDB (1394)
cycle (1787)

D

dagLogo (1245)
dama (2)
daMA (1622)
DART (1655)
DASiR (1665)
DAVIDQuery (2255)
DBChIP (1741)
ddCt (2183)
ddgraph (1653)
DECIPHER (1798)
DeconRNASeq (1622)
DEDS (1747)
deepSNV (1799)
DEGraph (1891)
DEGreport (53)
DEGseq (3688)
deltaGseg (1468)
DESeq (22910)
DESeq2 (15622)
DEXSeq (7280)
dexus (1634)
DFP (1610)
DiffBind (3659)
diffGeneAnalysis (1837)
DirichletMultinomial (1756)
dks (1578)
DMRcate (728)
DMRcatedata (3)
DMRforPairs (665)
DNAcopy (9701)
DNaseR (1353)
domainsignatures (1731)
DOQTL (48)
DOSE (3364)
DriverNet (1581)
DrugVsDisease (1590)
DSS (1846)
DTA (1592)
dualKS (1141)
DupChecker (48)
dyebias (1613)
DynDoc (8391)
dyndoc (1)

E

EasyqpcR (1757)
easyRNASeq (4362)
EBarrays (2233)
EBcoexpress (1726)
EBImage (7559)
EBSeq (2939)
ecolitk (1708)
EDASeq (2663)
edd (67)
EDDA (689)
edger (1)
edgeR (26010)
eiR (837)
eisa (2103)
ELBOW (687)
ensemblVEP (2243)
ENVISIONQuery (1645)
epigenomix (1528)
epivizr (1382)
eQTL (24)
Evomics2012 (1)
Evomics2012Data (1)
ExiMiR (1692)
exomeCopy (2200)
exomePeak (1326)
exonmap (121)
explorase (1341)
ExpressionView (1714)
expressionview (1)
externalVector (471)

F

fabia (2200)
factDesign (1920)
farms (1847)
fastLiquidAssociation (660)
fastseg (1693)
fbat (26)
fdrame (1767)
ffpe (1596)
FGNet (1434)
flagme (1734)
flipflop (1236)
flowBeads (1308)
flowBin (703)
flowCL (667)
flowClean (44)
flowClust (2644)
flowCore (20826)
flowCyBar (665)
flowDensity (58)
flowFit (1275)
flowFlowJo (1783)
flowFP (1869)
flowMap (1290)
flowMatch (677)
flowMeans (2076)
flowMerge (1932)
flowPeaks (1680)
flowPhyto (1600)
flowPlots (1690)
flowQ (1255)
flowq (1)
flowQB (1543)
flowStats (2863)
flowTrack (1)
flowTrans (1772)
flowType (1827)
flowUtils (1971)
flowViz (4940)
flowworkspace (1)
flowWorkspace (3485)
fmcsR (2074)
fOptions (1)
FRGEpistasis (653)
frma (2693)
frmaTools (1875)
FunciSNP (1807)

G

gaga (1755)
gage (4041)
gaggle (1635)
gaia (1614)
gaucho (645)
gCMAP (1612)
gCMAPWeb (1487)
gcrma (17444)
genArise (1604)
GENE.E (1769)
gene2pathway (267)
GeneAnswers (3602)
GeneExpressionSignature (1690)
genefilter (42647)
genefu (2151)
GeneGA (935)
GeneGroupAnalysis (437)
GeneMeta (2122)
GeneNetworkBuilder (1619)
GeneOverlap (744)
geneplotter (27121)
GeneR (83)
geneRecommender (1865)
GeneRegionScan (1624)
generegulation (113)
GeneRfold (33)
geneRxCluster (709)
GeneSelectMMD (1645)
GeneSelector (1957)
GeneSpring (26)
geNetClassifier (1515)
GeneticsBase (35)
GeneticsDesign (1725)
GeneticsPed (1903)
GeneTraffic (62)
GeneTS (3)
genoCN (1635)
genomationData (3)
GenomeGraphs (3747)
genomeinfodb (1)
GenomeInfoDb (26876)
genomeIntervals (4362)
genomes (1897)
GenomicAlignments (14279)
GenomicFeatures (36828)
genomicfeatures (1)
GenomicFiles (725)
GenomicRanges (51570)
Genominator (2167)
genoset (2508)
GEOmetadb (2737)
GEOquery (18431)
GEOsubmission (1649)
GEWIST (1542)
gff3Plotter (4)
GGBase (3265)
ggbio (10474)
GGtools (2538)
girafe (1962)
GLAD (2423)
GlobalAncova (2058)
globaltest (3948)
gmapR (1059)
GOexpress (1)
gofunction (1)
GOFunction (1940)
goProfiles (2096)
goprofiles (2)
GOSemSim (4129)
gosemsim (1)
goseq (4337)
GOSim (1809)
GOstats (11335)
GOTHiC (732)
goTools (2337)
gpls (2415)
gprege (1566)
graph (37095)
GraphAlignment (1645)
GraphAT (1648)
graphite (2723)
GraphPAC (1460)
GRENITS (1740)
GSAR (67)
GSBenchMark (4)
GSCA (631)
GSEABase (13190)
GSEAlm (2226)
GSReg (13)
GSRI (1623)
GSVA (2377)
Gviz (13703)
gwascat (1816)
GWASTools (2872)

H

h5vc (1436)
hapFabia (1584)
harshlight (1)
Harshlight (1679)
HCsnip (1410)
HDTD (63)
healthyFlowData (3)
Heatplus (5938)
HELP (1636)
HEM (1594)
hem (1)
hexbin (208)
hiAnnotator (75)
highthroughputassays (40)
HilbertVis (3023)
hilbertvis (1)
HilbertVisGUI (1509)
HiTC (1731)
HMMcopy (1750)
hopach (2892)
hpar (1694)
HSMMSingleCell (3)
HTqPCR (2654)
HTSanalyzeR (2112)
HTSandGeneCentricLabs (1)
HTSeqGenie (439)
htseqtools (2)
htSeqTools (1956)
HTSFilter (1742)
HybridMTest (1559)
hyperdraw (1774)
hypergraph (2286)

I

iASeq (1781)
iBBiG (1614)
ibh (1518)
iBMQ (1405)
Icens (3252)
iChip (1601)
iClusterPlus (740)
idiogram (1695)
IdMappingAnalysis (1536)
IdMappingRetrieval (1565)
iFlow (381)
Illumina450ProbeVariants.db (3)
illuminaio (8511)
imageHTS (1701)
impute (20313)
INPower (625)
inSilicoDb (2282)
inSilicoMerging (2107)
intansv (1390)
interactiveDisplay (1856)
interactiveDisplayBase (4)
IntermediateSequenceAnalysis2013 (59)
inveRsion (1553)
inversion (1)
iontree (1544)
iPAC (1599)
IPPD (1730)
IRanges (95273)
iranges (1)
iSeq (1611)
isobar (1973)
IsoGeneGUI (1627)
iSPlot (1)
ITALICS (1563)
iterativeBMA (1616)
iterativeBMAsurv (1610)

J

jmosaics (1448)
joda (1538)

K

KCsmart (1617)
KEGGgraph (6314)
keggorth (8)
keggorthology (1842)
KEGGprofile (1944)
KEGGREST (5857)
KEGGSOAP (859)

L

lapmix (1738)
LBE (1919)
les (1611)
limma (59842)
limmaGUI (3006)
LiquidAssociation (1606)
liquidassociation (1)
lmdme (1539)
LMGene (1928)
logicFS (2113)
logitt (1)
logitT (1641)
lol (1617)
LPE (2076)
LPEadj (1555)
lpNet (1509)
lumi (8769)
LVSmiRNA (1699)

M

maanova (2344)
macat (1613)
maCorrPlot (1571)
maDB (596)
madb (1)
made4 (3914)
maigesPack (1612)
makecdfenv (3189)
makePlatformDesign (31)
MANOR (1606)
manta (1606)
MantelCorr (1582)
maPredictDSC (1251)
marray (10639)
maSigPro (2615)
maskBAD (1506)
MassArray (1757)
massiR (648)
MassSpecWavelet (3075)
matchBox (1532)
matchprobes (130)
MBCB (1619)
mBPCR (1574)
mcaGUI (1609)
MCRestimate (1816)
mdqc (1786)
MeasurementError.cor (1518)
MEDIPS (2376)
MEDME (1605)
MEIGOR (10)
MergeMaid (2336)
MeSH.AOR.db (3)
MeSH.db (3)
MeSH.PCR.db (3)
MeSHDbi (684)
meshr (650)
messina (661)
metaArray (2249)
metabomxtr (3)
metagene (2)
metagenomeSeq (2191)
metahdep (1554)
metaMS (685)
metaMSdata (3)
metaR (41)
metaSeq (1252)
metaseqR (659)
methVisual (1707)
methyAnalysis (2215)
MethylAid (56)
methylMnM (1291)
methylPipe (4)
MethylSeekR (1667)
methylumi (7875)
Mfuzz (3487)
mfuzz (1)
mgsa (1772)
MiChip (1556)
microRNA (2449)
MIMOSA (675)
MineICA (1484)
minet (3515)
minfi (8742)
MinimumDistance (1546)
MiPP (1625)
MiRaGE (1552)
miRNApath (1881)
miRNAtap (1)
Mirsynergy (676)
missMethyl (11)
mitoODE (1187)
MLInterfaces (2803)
MLP (1648)
MLSeq (683)
MMDiff (1520)
mmnet (757)
MmPalateMiRNA (1670)
monocle (128)
MoPS (54)
mosaics (1883)
MotifDb (2819)
motifRG (1659)
motifStack (2526)
MotIV (2865)
mQTL.NMR (17)
MSIseqData (7)
msmsEDA (1258)
msmsTests (1239)
MSnbase (3024)
msQC (55)
MSstats (1546)
MUGAExampleData (3)
Mulcom (1623)
MultiMed (13)
multiscan (1528)
multtest (26548)
MVCClass (1624)
mzID (1646)
mzR (18610)

N

NarrowPeaks (1597)
ncdfFlow (3064)
NCIgraph (1932)
neaGUI (1323)
nem (1672)
netbiov (16)
NetPathMiner (681)
netresponse (1594)
NetSAM (1358)
networkBMA (1505)
NGScopyData (4)
nnNorm (1550)
NOISeq (2847)
nondetects (667)
NormqPCR (1902)
npGSEA (672)
NTW (1558)
nucleR (1674)
nucler (1)
nudge (1552)
NuPoP (1601)

O

occugene (1660)
OCplus (1781)
oligo (9204)
oligoClasses (10101)
OLIN (1691)
OLINgui (1571)
omicade4 (1389)
OmicCircos (1721)
OncoSimulR (4)
oneChannelGUI (2425)
ontoCAT (1739)
ontoTools (49)
openCyto (1254)
oposSOM (31)
OrderedList (2417)
org.MeSH.Aca.db (3)
org.MeSH.Atu.K84.db (3)
org.MeSH.Bsu.168.db (3)
org.MeSH.Hsa.db (3)
org.MeSH.Syn.db (3)
OrganismDbi (2847)
OSAT (1487)
OTUbase (1686)
OutlierD (1754)

P

PADOG (1541)
paircompviz (1251)
pairseqsim (7)
pamr (53)
PAnnBuilder (1774)
panp (1819)
PANR (1550)
PAPi (1478)
parody (1972)
pathifier (1282)
PathNet (1459)
pathRender (1728)
pathview (4708)
PatientGeneSets (85)
Pbase (24)
pcaGoPromoter (1878)
pcaMethods (6174)
pcot2 (1573)
PCpheno (1579)
pdInfoBuilder (2438)
pdmclass (1711)
PECA (767)
pepDat (4)
pepStat (4)
PGSEA (2241)
pgUtils (724)
phenoDist (1403)
phenoTest (1719)
PhenStat (711)
phyloseq (4151)
piano (2287)
pickgene (1562)
PICS (2340)
PING (1667)
pint (1647)
pkgDepTools (1873)
pkgdeptools (2)
plateCore (1595)
plethy (1226)
plgem (1610)
plier (2965)
PLPE (1685)
plrs (1430)
plw (1544)
Polyfit (23)
ppiStats (1704)
prada (3282)
prebs (1455)
PREDA (1617)
predictionet (894)
preprocessCore (36798)
PROcess (2218)
procoil (1512)
ProCoNA (1264)
pRoloc (1529)
pRolocGUI (35)
PROMISE (1585)
prot2D (1262)
proteinProfiles (1373)
proteoQC (6)
PSICQUIC (1378)
puma (1891)
pvac (1581)
pvca (1650)
Pviz (32)
pvxmlrpclibs (4)
PWMEnrich (1852)
pxr (3)

Q

qcmetrics (1172)
QDNAseq (746)
qpcrNorm (1741)
qpgraph (2704)
qrqc (2031)
QUALIFIER (1197)
quantro (2)
quantsmooth (3314)
QuasR (3702)
qusage (1299)
qvalue (14358)

R

r3Cseq (1645)
R453Plus1Toolbox (1707)
rama (1717)
RamiGO (2109)
ramigo (1)
randpack (1)
randPack (1500)
RankProd (4080)
Rariant (649)
RbcBook1 (1731)
RBGL (22316)
rbioinf (1)
RBioinf (1770)
rBiopaxParser (1633)
Rbowtie (3532)
rbsurv (1707)
Rcade (1529)
RCASPAR (1543)
Rchemcpp (1332)
RchyOptimyx (1628)
Rcpi (1159)
RCytoscape (3785)
RDAVIDWebService (1831)
Rdbi (42)
RdbiPgSQL (35)
Rdisop (1945)
RDRToolbox (1957)
ReactomePA (2424)
ReadqPCR (2004)
reb (1556)
RedeR (2140)
REDseq (1788)
RefNet (654)
RefNet.db (3)
RefPlus (1621)
Repitools (2793)
ReportingTools (4998)
ReQON (1579)
Resourcerer (1588)
rflowcyt (35)
rfPred (1247)
rGADEM (3249)
RGalaxy (1642)
rgl (1)
Rgraphviz (20361)
RGSEA (49)
rhdf5 (11189)
rHVDM (1543)
riboSeq (33)
Ringo (3260)
Rintact (14)
RIPSeeker (1729)
Risa (1607)
RLMM (1569)
RMAGEML (25)
rmagpie (1)
Rmagpie (1559)
RMAPPER (1541)
RMassBank (1592)
rMAT (963)
RmiR (1899)
RNAinteract (1578)
RNAither (1670)
rnaither (1)
rnaSeqMap (1634)
RNASeqPower (1649)
roar (692)
ROC (4993)
Roleswitch (1268)
Rolexa (1714)
rols (1767)
ROntoTools (1539)
RPA (1773)
RpsiXML (1878)
rpx (731)
rqubic (1597)
rRDPData (4)
Rredland (7)
RRHO (1347)
rrp (1)
Rsamtools (41931)
rsbml (1981)
rSFFreader (846)
RSNPper (9)
Rsubread (2637)
RSVSim (1507)
rTANDEM (1784)
RTCA (1622)
RTN (1392)
RTools4TB (29)
RTopper (1554)
rtracklayer (38762)
Rtreemix (1612)
rTRM (1335)
rTRMui (1244)
Ruuid (58)
RUVnormalizeData (4)
RUVSeq (101)
RWebServices (385)
rxSeq (2)

S

S4Vectors (1396)
safe (1803)
SAGElyzer (1)
sagenhaft (1643)
SAGx (1964)
sagx (1)
SamSPECTRAL (1723)
sangerseqR (713)
SANTA (1392)
sapFinder (686)
savR (610)
SBMLR (1682)
SCAN.UPC (1980)
ScISI (1747)
scsR (627)
SeattleIntro2010 (3)
SeattleIntro2011 (2)
SeattleIntro2011Data (2)
SeattleIntro2012 (2)
SeattleIntro2012Data (3)
segmentSeq (1761)
SemDist (1)
SemSim (23)
SeqArray (1572)
seqbias (1767)
seqCNA (1273)
SeqGSEA (2135)
seqLogo (5708)
Seqnames (31)
SequenceAnalysis (9)
SequenceAnalysisData (95)
SeqVarTools (1314)
shinyMethyl (39)
shinyMethylData (4)
shinyTANDEM (1212)
ShortRead (15530)
sigaR (1589)
SigFuge (1263)
siggenes (10967)
sigPathway (2185)
SIM (1627)
SimBindProfiles (1195)
simpleaffy (11889)
simulatorAPMS (40)
sizepower (2004)
SJava (480)
SLGI (1578)
slgi (1)
SLqPCR (1964)
SMAP (1564)
SNAGEE (1391)
snapCGH (2088)
snm (1763)
SNPchip (3216)
snpMatrix (298)
snpStats (5616)
SomatiCA (1484)
SomaticSignatures (805)
SpacePAC (1209)
spade (2127)
SpeCond (1629)
SPEM (1366)
SPIA (2988)
spikeLI (1510)
spkTools (1529)
splicegear (1553)
spliceR (1708)
spliceSites (1233)
SplicingGraphs (1554)
splots (2627)
spotSegmentation (1557)
SQUADD (1486)
SRAdb (3407)
sRAP (1354)
sscore (1547)
sSeq (1253)
ssize (2004)
SSPA (1794)
ssviz (45)
stam (6)
STAN (9)
staRank (1480)
Starr (1784)
stepNorm (1555)
stepwiseCM (1524)
Streamer (1742)
STRINGdb (1504)
StudentGWAS (6)
supraHex (1311)
survcomp (3318)
Sushi (774)
sva (6539)
SwimR (1179)
synapter (1658)

T

targetPredictor (4)
targetPredictor.db (4)
targetPredictorTemp (4)
TargetScore (1286)
TargetSearch (1671)
TCC (1826)
TDARACNE (1678)
TEQC (1775)
ternarynet (1482)
tfbstools (1)
TFBSTools (1624)
tigre (1655)
tilingArray (2366)
timecourse (2013)
TitanCNA (686)
tkWidgets (6629)
topGO (7228)
trackViewer (712)
tRanslatome (1374)
TransView (1598)
triform (1453)
trigger (1568)
trio (1463)
triplex (1505)
tspair (1702)
TSSi (1602)
TurboNorm (1619)
tweeDEseq (1969)
twilight (2543)
typeinfo (1)
TypeInfo (1612)

U

UNDO (641)
unifiedWMWqPCR (656)
UniProt.ws (1912)

V

VanillaICE (1892)
VariantAnnotation (17149)
VariantFiltering (780)
variants (174)
VariantTools (1003)
vbmp (1956)
Vega (1561)
VegaMC (1561)
viper (655)
virtualArray (2227)
vsn (14683)
vtpnet (1246)

W

wateRmelon (2862)
wavClusteR (67)
waveTiling (1511)
weaver (2015)
webbioc (1647)
widgetTools (6594)

X

xcms (18488)
XDE (1610)
xmapbridge (1531)
xmapcore (338)
XML2R (2)
xps (2404)
xtable (1)
XVector (41751)

Y

yaqcaffy (1877)

Z

zebrafishRNASeq (6)
zlibbioc (58972)