See download stats for:    Bioconductor annotation packages    Bioconductor experiment packages    Bioconductor workflow packages

Download stats for Bioconductor software packages

This page was generated on 2023-03-22 18:54:24 -0400 (Wed, 22 Mar 2023).

The number reported next to each package name is the download score, that is, the average number of distinct IPs that “hit” the package each month for the last 12 months (not counting the current month).


Top 75

1BiocGenerics (53658)
2S4Vectors (51036)
3BiocVersion (50730)
4GenomeInfoDb (49516)
5IRanges (48405)
6Biobase (45843)
7zlibbioc (45262)
8XVector (43914)
9Biostrings (40681)
10BiocParallel (40322)
11GenomicRanges (37033)
12DelayedArray (36609)
13SummarizedExperiment (34473)
14MatrixGenerics (34447)
15limma (34032)
16AnnotationDbi (32407)
17KEGGREST (31509)
18annotate (21601)
19BiocFileCache (20144)
20Rhtslib (19728)
21Rsamtools (19546)
22edgeR (19503)
23GenomicAlignments (19425)
24genefilter (19039)
25biomaRt (18703)
26Rhdf5lib (17851)
27rtracklayer (17784)
28graph (17300)
29DESeq2 (17201)
30geneplotter (16151)
31rhdf5 (16008)
32GenomicFeatures (15982)
33ggtree (15273)
34rhdf5filters (14654)
35treeio (14635)
36BiocIO (14550)
37qvalue (13478)
38preprocessCore (13265)
39enrichplot (13046)
40fgsea (12591)
41DelayedMatrixStats (12493)
42DOSE (12262)
43clusterProfiler (11908)
44GOSemSim (11499)
45sparseMatrixStats (11444)
46SingleCellExperiment (11215)
47ComplexHeatmap (10878)
48beachmat (10699)
49BSgenome (9911)
50HDF5Array (9822)
51multtest (9710)
52BiocSingular (9375)
53ScaledMatrix (9233)
54ProtGenerics (9145)
55Rgraphviz (9093)
56RBGL (9088)
57GEOquery (9020)
58impute (9014)
59AnnotationHub (8410)
60ensembldb (8163)
61affyio (7889)
62affy (7759)
63interactiveDisplayBase (7669)
64AnnotationFilter (7574)
65GSEABase (7054)
66scuttle (7053)
67BiocNeighbors (7046)
68VariantAnnotation (6810)
69BiocStyle (6234)
70sva (5894)
71ShortRead (5336)
72ExperimentHub (5040)
73scater (4891)
74vsn (4749)
75KEGGgraph (4689)

All software packages

All software package stats in one file: bioc_pkg_stats.tab

All software package download scores in one file: bioc_pkg_scores.tab

See Download stats for Bioconductor software repository (all packages combined)

A

a4 (59)
a4Base (79)
a4Classif (57)
a4Core (89)
a4Preproc (100)
a4Reporting (61)
a4reporting (0)
ABAEnrichment (15)
abaenrichment (1)
ABarray (52)
abc (1)
abc.data (1)
abe (1)
abind (1)
abseqR (48)
ABSOLUTE (1)
ABSSeq (76)
acde (61)
ACE (64)
acepack (1)
aCGH (121)
ACME (65)
adabag (1)
ADaCGH2 (45)
ADAM (48)
ADAMgui (45)
adaptest (2)
adductomicsR (44)
adegenet (1)
ADGofTest (1)
ADImpute (57)
admiral (1)
admiral.test (1)
admiraldev (1)
admisc (3)
admixtools (1)
adSplit (50)
AER (1)
afex (1)
affio (0)
AffiXcan (42)
affxparser (1410)
affy (7759)
affycomp (60)
AffyCompatible (60)
affyContam (50)
affycoretools (345)
affydata (1)
AffyExpress (6)
affyILM (43)
affyio (7889)
affylmGUI (56)
affyPara (8)
affypdnn (5)
affyPLM (1300)
affyQCReport (16)
affyqcreport (0)
AffyRNADegradation (48)
AffyTiling (3)
AGDEX (45)
aggregateBioVar (47)
aggregation (1)
Agi4x44PreProcess (5)
agilp (102)
AgiMicroRna (135)
agimicrorna (0)
agricolae (2)
AIMS (331)
airpart (38)
airway (0)
akima (1)
alabaster (0)
alabaster.base (0)
alabaster.bumpy (0)
alabaster.mae (0)
alabaster.matrix (0)
alabaster.ranges (0)
alabaster.sce (0)
alabaster.schemas (0)
alabaster.se (0)
alabaster.spatial (0)
alabaster.string (0)
alabaster.vcf (0)
ALDEx2 (693)
aldvmm (1)
alevinQC (69)
AlgDesign (1)
ALL (3)
AllelicImbalance (59)
AlphaBeta (41)
alphashape3d (1)
alpine (77)
ALPS (5)
AlpsNMR (61)
alsace (17)
altcdfenvs (52)
AMARETTO (46)
Amelia (1)
amgen.okta.client (1)
AMOUNTAIN (56)
amplican (59)
ampliQueso (2)
AnalysisPageServer (3)
anamiR (3)
Anaquin (47)
ANCOMBC (705)
AneuFinder (70)
AneuFinderData (1)
ANF (46)
animalcules (85)
animation (1)
annaffy (208)
AnnBuilder (3)
annmap (40)
annotate (21601)
AnnotationDbi (32407)
annotationdbi (0)
AnnotationFilter (7574)
AnnotationForge (2260)
AnnotationFuncs (8)
AnnotationHub (8410)
AnnotationHubData (197)
annotationTools (72)
annotatr (393)
anota (53)
anota2seq (51)
antiProfiles (46)
AnVIL (599)
AnVILBilling (38)
AnVILPublish (40)
AnVILWorkflow (0)
aod (1)
APAlyzer (53)
apcluster (1)
apComplex (48)
apcomplex (0)
ape (1)
apeglm (2973)
apexcharter (1)
APL (38)
aplot (3)
applera (2)
appreci8R (41)
aqp (1)
argparse (2)
arm (1)
aroma.affymetrix (2)
aroma.apd (2)
aroma.core (2)
aroma.light (1692)
ArrayExpress (502)
ArrayExpressHTS (35)
arrayhelpers (1)
arrayMagic (2)
arrayMvout (42)
arraymvout (0)
arrayQCplot (2)
arrayQuality (97)
arrayQualityMetrics (494)
arrayqualitymetrics (0)
ArrayTools (12)
ArrayTV (4)
ARRmNormalization (42)
arrow (3)
arsenal (1)
artMS (62)
ASAFE (40)
ASCAT (1)
ascii (1)
asciicast (1)
ASEB (46)
ASExtras4 (1)
ASGSCA (46)
ash (2)
asht (1)
ASICS (58)
AsioHeaders (1)
askpass (1)
asmn (1)
asnipe (1)
ASpediaFI (38)
ASpli (69)
asremlPlus (1)
assert (1)
assertive.properties (1)
assertr (1)
assertthat (1)
AssessORF (42)
ASSET (66)
ASSIGN (65)
ASURAT (42)
ATACCoGAPS (11)
ATACseqQC (297)
ATACseqTFEA (16)
ATE (1)
atena (45)
AtlasRDF (1)
atSNP (49)
attract (44)
AUC (1)
AUCell (1541)
audio (1)
autonomics (43)
Autotuner (5)
av (1)
AWFisher (45)
aws.s3 (2)
aws.signature (2)
awst (39)

B

BaalChIP (45)
babelgene (1)
babelmixr2 (1)
BAC (45)
backports (8)
bacon (83)
bacr (1)
BADER (53)
badger (1)
BadRegionFinder (44)
BAGS (44)
baguette (1)
ballgown (513)
bambu (200)
bamsignals (884)
BANDITS (53)
bandle (31)
banocc (37)
barcodetrackR (38)
BART (1)
bartMachine (1)
bartMachineJARs (1)
base (1)
base64 (1)
base64enc (1)
base64url (1)
basecallQC (48)
BaseSpaceR (47)
Basic4Cseq (46)
BASiCS (105)
BASiCStan (15)
BasicSTARRseq (45)
basilisk (1266)
basilisk.utils (1223)
batchelor (2834)
BatchJobs (1)
BatchQC (101)
batchtools (1)
BayesFactor (1)
BayesianTools (1)
BayesKnockdown (35)
bayesm (1)
bayesmeta (1)
BayesPeak (10)
bayespeak (0)
BayesPen (1)
bayesplot (2)
BayesSpace (149)
bayestestR (1)
bayNorm (68)
baySeq (516)
bayseq (1)
BB (1)
BBCAnalyzer (39)
BBmisc (1)
bbmle (1)
bbr (1)
BCEE (1)
BCRANK (54)
bcSeq (43)
BDgraph (1)
BDMMAcorrect (46)
bdsmatrix (1)
beachmat (10699)
beadarray (616)
beadarraySNP (51)
BeadDataPackR (622)
beaddatapackr (0)
BeadExplorer (1)
beanplot (1)
BEARscc (37)
BEAT (41)
BEclear (62)
bedr (1)
beer (33)
beeswarm (1)
bench (1)
benchdamic (37)
BentoBox (0)
betr (3)
BeviMed (1)
bezier (1)
BG2 (1)
bgafun (4)
BgeeCall (44)
BgeeDB (81)
BGmix (40)
bgx (48)
BH (12)
BHC (99)
BiasedUrn (2)
bibtex (1)
BicARE (87)
BiFET (41)
biganalytics (1)
bigassertr (1)
bigD (1)
BiGGR (44)
biglm (1)
BigMatrix (0)
bigmelon (50)
bigmemory (1)
bigmemory.sri (1)
bigmemoryExtras (6)
bigparallelr (1)
bigPint (69)
bigreadr (1)
bigrquery (2)
bigsnpr (1)
bigsparser (1)
bigstatsr (1)
bigutilsr (1)
bim (2)
BindingSiteFinder (39)
bindr (1)
bindrcpp (1)
binom (1)
binr (1)
bio3d (1)
bioassayR (55)
Biobase (45843)
biobase (1)
biobroom (161)
biobtreeR (43)
bioc::GenomeInfoDbData (1)
bioCancer (51)
BiocBaseUtils (793)
BiocCaseStudies (5)
BiocCheck (1568)
biocDatasets (1)
BiocDockerManager (39)
BiocFHIR (12)
BiocFileCache (20144)
BiocGenerics (53658)
BioCGenerics (1)
biocGraph (78)
BiocHubsShiny (0)
BiocInstaller (872)
Biocinstaller (0)
biocinstaller (1)
BiocInstallerf (1)
BiocIO (14550)
biocLite (0)
BiocManager (8)
BiocNeighbors (7046)
BiocOncoTK (52)
Bioconductor (1)
bioconductor-geomxtools (1)
BioCor (52)
BiocParallel (40322)
BiocPkgTools (88)
BiocSet (173)
BiocSingular (9375)
BiocSklearn (59)
BiocStyle (6234)
biocthis (137)
BiocVersion (50730)
biocViews (3716)
BiocWorkflowTools (147)
biodb (87)
biodbChebi (37)
biodbExpasy (26)
biodbHmdb (36)
biodbKegg (49)
biodbLipidmaps (31)
biodbMirbase (27)
biodbNcbi (30)
biodbNci (26)
biodbUniprot (37)
bioDist (188)
biom (1)
biomaRt (18703)
biomart (1)
biomartr (1)
BioMedR (1)
biomformat (4355)
BioMM (40)
BioMVCClass (43)
biomvRCNS (39)
BioNAR (13)
BioNERO (79)
BioNet (224)
bionet (0)
BioNetStat (54)
BioPlex (28)
BioQC (98)
BioSeqClass (8)
biosigner (64)
biostatUtil (1)
Biostrings (40681)
biostrings (1)
BiostringsCinterfaceDemo (0)
biosvd (2)
BioTIP (42)
biotmle (41)
BioVersion (1)
biovizBase (4453)
BiRewire (75)
birta (6)
birte (2)
biscuiteer (48)
BiSeq (63)
bit (4)
bit64 (2)
bitops (1)
BitSeq (50)
bizdays (0)
blacksheepr (44)
BlakerCI (1)
blastula (1)
blavaan (1)
blima (43)
BLMA (44)
blme (2)
blob (4)
blockcluster (1)
blogdown (1)
BloodGen3Module (49)
bluster (3258)
BMA (1)
BMix (1)
bmp (1)
bnbc (43)
bnem (36)
bnlearn (1)
BOBaFIT (28)
BOIN (1)
bold (1)
bookdown (5)
boot (2)
bootstrap (1)
borealis (26)
Boruta (1)
bpcp (1)
BPRMeth (47)
BRAIN (95)
brainflowprobes (40)
brainImageR (1)
BrainSABER (36)
BrainStars (4)
branchpointer (55)
brave (1)
breakpointR (43)
brendaDb (43)
brew (10)
BRGenomics (127)
brglm (1)
brglm2 (0)
bridge (37)
BridgeDbR (55)
bridgedist (1)
bridgesampling (1)
brio (1)
brms (1)
Brobdingnag (1)
broman (1)
broom (4)
broom.helpers (1)
broom.mixed (1)
BrowserViz (111)
BrowserVizDemo (1)
bs4Dash (1)
BSgenome (9911)
BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam3 (2)
BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5 (1)
BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (2)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 (3)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 (2)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9 (1)
bslib (5)
bsplus (1)
bsseq (1152)
bst (1)
BubbleTree (44)
BufferedMatrix (51)
BufferedMatrixMethods (43)
bugsigdbr (74)
BUMHMM (34)
bumphunter (2170)
BumpyMatrix (266)
BUS (44)
BUScorrect (38)
BUSpaRse (195)
BUSseq (35)
butcher (1)
BuxcoR (0)
bvls (1)
BWStest (1)

C

C50 (1)
cache (1)
cachem (1)
CAEN (33)
CAFE (40)
CAGEfightR (66)
cageminer (35)
CAGEr (88)
Cairo (1)
CALIB (5)
calib (0)
calibrate (1)
callr (12)
calm (38)
CAMERA (420)
campsismod (1)
CAMTHC (2)
canceR (46)
cancerclass (54)
CancerInSilico (39)
CancerMutationAnalysis (4)
CancerSubtypes (188)
CAnD (27)
caOmicsV (23)
car (3)
carData (1)
cardelino (18)
Cardinal (104)
caret (3)
CARNIVAL (110)
casper (46)
castor (1)
CATALYST (377)
Category (1856)
category (1)
categoryCompare (43)
caTools (1)
CausalR (47)
cbaf (40)
CBEA (28)
cBioPortalData (292)
cbpManager (41)
CBPS (1)
ccaPP (1)
ccdata (3)
ccfindR (77)
ccImpute (11)
ccmap (62)
CCPROMISE (36)
ccrepe (94)
ccube (1)
CDr (0)
celaref (63)
celda (318)
CellaRepertorium (46)
CellBarcode (36)
cellbaseR (55)
CellBench (97)
cellGrowth (3)
cellHTS (3)
cellHTS2 (109)
CelliD (105)
cellity (44)
CellMapper (41)
cellmigRation (36)
CellMixS (55)
CellNOptR (78)
cellnoptr (1)
cellranger (1)
cellscape (39)
CellScore (37)
CellTrails (45)
cellTree (40)
cellxgenedp (115)
cem (1)
CEMiTool (142)
censcyt (31)
Cepo (60)
ceRNAnetsim (33)
CeTF (57)
CexoR (35)
CFAssay (49)
cfDNAPro (37)
cgdsr (1)
CGEN (56)
CGHbase (307)
CGHcall (278)
cghFLasso (1)
cghMCR (51)
CGHnormaliter (52)
CGHregions (53)
ChAMP (581)
ChAMPdata (1)
changepoint (1)
CHARGE (2)
charm (4)
checkmate (1)
ChemmineOB (194)
ChemmineR (555)
chemminer (0)
chemometrics (1)
CHETAH (54)
ChIC (39)
Chicago (73)
chihaya (0)
chimera (4)
chimeraviz (69)
ChIPanalyser (40)
ChIPComp (44)
chipenrich (85)
ChIPexoQual (42)
ChIPpeakAnno (857)
ChIPQC (328)
ChIPseeker (1641)
chipseq (491)
ChIPseqR (84)
ChIPSeqSpike (5)
ChIPsim (82)
ChIPXpress (37)
chopsticks (72)
CHORD (1)
chroGPS (2)
chromDraw (38)
ChromHeatMap (50)
ChromoViz (3)
chromPlot (72)
ChromSCape (45)
chromstaR (69)
chromswitch (40)
chromVAR (871)
chron (1)
CHRONOS (50)
cicero (173)
CIMICE (35)
CINdex (47)
cindex (0)
circlesize (0)
circlize (1)
circRNAprofiler (53)
CircSeqAlignTk (11)
circular (1)
cisPath (41)
CiteFuse (75)
Ckmeans.1d.dp (1)
class (5)
ClassifyR (60)
classInt (2)
cleanUpdTSeq (41)
cleaver (161)
clevRvis (2)
cli (5)
clinfun (0)
clinPK (1)
clippda (40)
clipper (73)
clipr (5)
cliProfiler (36)
cliqueMS (65)
clock (1)
Clomial (35)
Clonality (48)
clonotypeR (33)
clst (47)
clstutils (45)
clue (3)
CluMSID (54)
clustComp (41)
cluster (5)
clusterCrit (1)
clusterExperiment (281)
clusterGeneration (1)
ClusterJudge (41)
clustermq (1)
clusterprofielr (1)
clusterProfiler (11908)
clusterprofiler (0)
clusterRepro (1)
clusterSeq (37)
ClusterSignificance (37)
clusterStab (86)
clusthaplo (1)
clustifyr (126)
clustree (1)
clValid (1)
CMA (114)
cmapR (248)
cmdstanr (1)
cmprsk (1)
cn.farms (43)
cn.mops (172)
CNAnorm (47)
cnanorm (0)
CNAqc (1)
CNEr (1462)
CNORdt (43)
CNORfeeder (46)
CNORfuzzy (43)
cNORM (1)
CNORode (60)
CNPBayes (2)
CNTools (85)
cntools (1)
CNVfilteR (46)
CNVgears (42)
cnvGSA (39)
CNViz (38)
CNVMetrics (29)
CNVPanelizer (47)
CNVRanger (67)
CNVrd2 (38)
CNVtools (3)
cnvtools (0)
cobalt (1)
cobindR (2)
cobs (1)
CoCiteStats (38)
COCOA (43)
coda (1)
codelink (49)
codetools (4)
CODEX (67)
coexnet (18)
CoGAPS (127)
cogena (78)
cogeqc (35)
Cogito (34)
coGPS (44)
COHCAP (44)
coin (1)
cola (118)
collapse (1)
collections (1)
CollessLike (1)
coloc (3)
colorfulVennPlot (1)
colorRamps (2)
colorspace (5)
colourpicker (1)
colourvalues (1)
comapr (28)
combi (37)
coMET (61)
coMethDMR (32)
ComICS (1)
commentr (1)
CommonJavaJars (1)
commonmark (11)
compartmap (42)
COMPASS (57)
compcodeR (67)
compEpiTools (47)
CompGO (6)
compiler (1)
ComplexHeatmap (10878)
compositions (1)
CompoundDb (139)
CompQuadForm (1)
ComPrAn (36)
conclus (30)
condcomp (1)
condiments (56)
conditionz (1)
CONFESS (38)
config (1)
conflicted (2)
connectwidgets (1)
conquer (1)
consensus (37)
ConsensusClusterPlus (2666)
consensusDE (41)
consensusOV (48)
consensusSeekeR (73)
consICA (13)
consort (1)
CONSTANd (39)
contfrac (1)
contiBAIT (40)
conumee (113)
convert (112)
copa (42)
COPDSexualDimorphism (1)
copula (1)
copynumber (369)
CopyNumber450k (1)
CopyNumberPlots (85)
CopywriteR (57)
coRdon (109)
CoRegFlux (2)
CoRegNet (53)
CoreGx (168)
Cormotif (39)
CorMut (5)
coRNAi (3)
coro (1)
corpcor (1)
corral (57)
correlation (1)
CORREP (46)
corrplot (1)
corrr (1)
coseq (84)
cosmiq (41)
cosmo (3)
cosmoGUI (3)
cosmosR (53)
COSNet (42)
COTAN (35)
CountClust (11)
countsimQC (69)
covEB (37)
CoverageView (58)
covr (8)
covRNA (39)
CovSel (1)
cowplot (1)
cpp11 (4)
cpvSNP (41)
cqn (222)
crayon (6)
creatr (1)
credentials (1)
CRImage (58)
crisprBase (51)
crisprBowtie (61)
crisprBwa (28)
crisprDesign (33)
crisprScore (61)
CRISPRseek (99)
crisprseekplus (39)
CrispRVariants (77)
crisprVerse (24)
crisprViz (24)
crlmm (105)
CrossICC (2)
crossmeta (62)
crosstalk (9)
crrri (1)
crrry (1)
crul (1)
CSAR (85)
csaw (313)
csawBook (4)
csdR (37)
csSAM (1)
CSSP (43)
CSSQ (34)
csv (1)
ctc (255)
CTDquerier (39)
ctgGEM (23)
ctmle (1)
cTRAP (46)
ctree (1)
ctsGE (44)
CTSV (19)
cubature (1)
cubelyr (1)
Cubist (1)
cummeRbund (225)
cummerbund (1)
curatedMetagenomicData (1)
curl (10)
customCMPdb (39)
customProDB (61)
cvAUC (1)
CVE (2)
CVST (1)
CVXR (1)
cxAnalysis (1)
cyanoFilter (35)
cycle (37)
cyclocomp (1)
cydar (77)
CytoDx (42)
cytofast (3)
cytofkit (16)
CyTOFpower (29)
CytoGLMM (46)
cytoKernel (37)
cytolib (2194)
cytomapper (161)
cytoMEM (31)
CytoML (914)
CytoPipeline (1)
CytoTree (61)

D

D0.db (1)
d3Network (1)
d3r (0)
dada2 (2097)
dae (1)
dagLogo (51)
daMA (45)
DAMEfinder (39)
DaMiRseq (61)
DAPAR (100)
DART (48)
DASC (1)
DASiR (1)
dasper (42)
data.table (9)
data.tree (1)
datamods (1)
datapipeline (1)
datasets (1)
datawizard (1)
DAVIDQuery (2)
dbarts (1)
DBChIP (9)
DBI (4)
DBItest (1)
dbplyr (3)
dbscan (1)
dcanr (62)
dce (42)
dcGSA (38)
DChIPRep (2)
ddalpha (1)
ddCt (80)
ddgraph (2)
DDiGGER (0)
ddPCRclust (36)
deal (1)
dearseq (70)
debCAM (49)
debrowser (117)
debugme (1)
DECIPHER (1820)
deco (38)
DEComplexDisease (37)
decompTumor2Sig (67)
DeconRNASeq (161)
decontam (817)
deconvR (41)
decoupleR (294)
DEDS (6)
DeepBlueR (46)
DeepPINCS (37)
deepSNV (87)
DEFormats (197)
DegNorm (43)
DEGraph (42)
degraph (1)
DEGreport (461)
DEGseq (179)
degseq (0)
DelayedArray (36609)
DelayedDataFrame (46)
DelayedMatrixStats (12493)
DelayedRandomArray (43)
DelayedTensor (34)
deldir (1)
deltaCaptureC (33)
deltaGseg (35)
DeMAND (40)
DeMixT (56)
demuxmix (29)
dendextend (2)
dendsort (1)
densityClust (1)
densvis (181)
DEoptim (1)
DEoptimR (1)
DEP (412)
DepecheR (412)
DepInfeR (26)
DEqMS (182)
derfinder (438)
derfinderHelper (433)
derfinderPlot (78)
Deriv (1)
desc (10)
DEScan2 (40)
DescTools (1)
DESeq (436)
deseq (1)
DESeq2 (17201)
deseq2 (1)
DEsingle (260)
deSolve (1)
destiny (627)
DEsubs (43)
devtools (10)
DEWSeq (46)
DEXICA (0)
DExMA (41)
DEXSeq (1071)
dexus (4)
dfidx (1)
DFP (39)
DHARMa (1)
diagram (1)
DiagrammeR (1)
DIAlignR (43)
dials (2)
DiceDesign (1)
DiceKriging (1)
diceR (1)
dichromat (1)
DiffBind (1023)
diffcoexp (65)
diffcyt (219)
DifferentialRegulation (31)
diffGeneAnalysis (36)
diffgeneanalysis (0)
diffHic (89)
DiffLogo (56)
diffloop (90)
diffobj (1)
diffuStats (54)
diffUTR (37)
digest (12)
diggit (45)
dimRed (1)
Dino (38)
dir.expiry (1189)
directlabels (1)
Director (34)
DirichletMultinomial (2108)
discordant (83)
DiscoRhythm (60)
DiscriMiner (1)
disk.frame (0)
distill (1)
distillery (1)
distinct (99)
distr (1)
distrEx (1)
distributional (2)
DistributionUtils (1)
dittodb (1)
dittoSeq (630)
divergence (34)
diveRsity (1)
dks (32)
dlstats (1)
dm (1)
DMCFB (36)
DMCHMM (37)
DMRcaller (64)
DMRcate (784)
DMRcatedata (1)
DMRforPairs (38)
DMRScan (34)
dmrseq (122)
DMwR (1)
DNABarcodeCompatibility (35)
DNABarcodes (120)
DNAcopy (3767)
dnacopy (1)
DNAfusion (13)
DNaseR (1)
DNAshapeR (67)
dndscv (1)
DO.db (1)
doBy (1)
dockerfiler (1)
docopt (2)
domainsignatures (3)
doMC (1)
DominoEffect (35)
doParallel (5)
doppelgangR (47)
DOQTL (3)
doRNG (1)
Doscheda (34)
DOSE (12262)
DoseFinding (1)
doseR (38)
doSNOW (1)
dotCall64 (1)
doubletrouble (4)
downlit (1)
downloader (1)
dparser (1)
DPClust (1)
dpclust3p (1)
dpeak (38)
dplyr (9)
dqrng (2)
dr (1)
drake (1)
drawProteins (130)
drc (1)
dream (0)
DRIMSeq (337)
DriverNet (45)
DropletUtils (1966)
DRR (1)
drugTargetInteractions (45)
DrugVsDisease (39)
dSimer (2)
DSS (959)
dStruct (30)
DT (13)
DTA (41)
dtangle (1)
dtplyr (3)
DTRreg (1)
dtw (1)
dtwclust (1)
dualKS (5)
duckdb (1)
dummies (1)
Dune (35)
DupChecker (2)
dupRadar (86)
dyebias (41)
dygraphs (1)
dynamicTreeCut (1)
DynDoc (955)
dyndoc (0)

E

e1071 (3)
earth (1)
easier (65)
EasyABC (1)
EasyCellType (15)
easypar (1)
EasyqpcR (5)
easyreporting (37)
easyRNASeq (58)
easyrnaseq (0)
EBarrays (122)
EBcoexpress (54)
EBImage (2155)
ebimage (0)
EBSEA (36)
EBSeq (320)
EBSeqHMM (55)
echarts4r (1)
ecolitk (40)
ECOSolveR (1)
EDASeq (1532)
edd (3)
EDDA (3)
edge (98)
edgeR (19503)
edger (1)
eds (39)
eegc (39)
EGAD (55)
egg (2)
EGSEA (155)
eha (1)
eiR (38)
eisa (6)
eisaR (82)
ELBOW (4)
ellipse (1)
ellipsis (3)
elliptic (1)
ELMER (223)
emayili (1)
embed (1)
emdbook (1)
EMDomics (53)
emmeans (3)
EMMREML (1)
EmpiricalBrownsMethod (63)
emulator (1)
enc (1)
ENCODExplorer (5)
EnhancedVolcano (3219)
enhancedvolcano (1)
enhancerHomologSearch (41)
EnMCB (32)
ENmix (152)
EnrichedHeatmap (384)
EnrichmentBrowser (256)
enrichplot (13046)
enrichTF (60)
EnsDb.Hsapiens.v75 (2)
EnsDb.Hsapiens.v79 (1)
EnsDb.Hsapiens.v86 (2)
ensembldb (8163)
ensemblVEP (112)
ENVISIONQuery (3)
Epi (1)
epialleleR (37)
EpiCluster (0)
EpiCompare (38)
epidecodeR (32)
EpiDISH (231)
epigenomix (40)
epigraHMM (39)
epihet (34)
EpiMix (12)
epimutacions (31)
epiNEM (62)
epiR (1)
epistack (37)
epistasisGA (13)
epitools (1)
EpiTxDb (44)
epivizr (53)
epivizrChart (39)
epivizrData (55)
epivizrServer (65)
epivizrStandalone (46)
erccdashboard (55)
ergm (1)
ergm.count (1)
erma (64)
ERSSA (35)
esATAC (79)
escape (199)
esetVis (60)
esquisse (1)
estimability (3)
eudysbiome (35)
evaluate (12)
evaluomeR (37)
evd (1)
EventPointer (49)
EWCE (89)
Exact (1)
exactRankTests (1)
ExCluster (35)
ExiMiR (42)
exomeCopy (208)
exomecopy (0)
ExomeDepth (1)
exomePeak (10)
exomePeak2 (91)
exonfindR (0)
exonmap (5)
ExperimentHub (5040)
ExperimentHubData (162)
ExperimentSubset (41)
explorase (5)
ExploreModelMatrix (94)
expm (1)
ExpressionAtlas (90)
ExpressionView (4)
exprExternal (1)
expsmooth (1)
expss (1)
externalVector (2)
extraChIPs (31)
extraDistr (2)
extrafont (1)
extrafontdb (1)
extraTrees (1)
extRemes (1)

F

fabia (121)
facets (1)
facopy (2)
factDesign (41)
FactoMineR (1)
factR (15)
fail (1)
FamAgg (64)
famat (35)
fansi (8)
farms (59)
farver (2)
fastcluster (1)
fastDummies (1)
fastGHQuad (1)
fastICA (1)
fastLiquidAssociation (39)
fastmap (1)
fastmatch (1)
FastqCleaner (77)
fastreeR (35)
fastseg (617)
fasttime (0)
fBasics (1)
fbat (2)
FCBF (68)
fCCAC (39)
fCI (41)
fcoex (56)
fcScan (37)
fda (3)
FDb.InfiniumMethylation.hg19 (2)
fdrame (43)
fdrtool (1)
fds (2)
FEAST (74)
feather (1)
fedup (34)
FELLA (103)
FEM (37)
ff (7)
ffbase (1)
FField (1)
ffpe (57)
fftw (1)
fftwtools (1)
fgga (39)
FGNet (63)
fgsea (12591)
fields (1)
filehash (1)
filelock (2)
filesstrings (0)
FilterFFPE (35)
finalfit (1)
FindIT2 (38)
FindMyFriends (7)
findpython (1)
FISHalyseR (39)
fishHook (1)
fishMod (1)
fishpond (340)
fit.models (1)
fitdistrplus (1)
FitHiC (49)
fixest (1)
flagme (39)
FLAMES (41)
flashClust (1)
flexclust (1)
flexdashboard (1)
flexmix (1)
flexsurv (1)
flextable (3)
flipflop (2)
flowAI (445)
flowBeads (38)
flowBin (41)
flowcatchR (39)
flowCHIC (37)
flowCL (37)
flowClean (188)
flowClust (1020)
flowCore (2137)
flowcore (1)
flowCut (65)
flowCyBar (36)
flowDensity (174)
flowFit (4)
flowFlowJo (2)
flowFP (69)
flowGraph (34)
flowMap (39)
flowMatch (40)
flowMeans (97)
flowMerge (53)
flowPeaks (99)
flowPhyto (1)
flowPloidy (42)
flowPlots (41)
flowQ (4)
flowq (0)
flowQB (2)
FlowRepositoryR (8)
FlowSOM (871)
FlowSorted.Blood.EPIC (3)
FlowSorted.CordBloodCombined.450k (3)
flowSpecs (45)
flowSpy (3)
flowStats (992)
flowTime (41)
flowTrans (54)
flowType (4)
flowUtils (114)
flowViz (1228)
flowVS (75)
flowWorkspace (1343)
flowworkspace (1)
flowWorkspaceData (1)
fma (1)
fmcsR (183)
FME (1)
fmrs (49)
fmsb (1)
FNN (1)
fobitools (38)
focalCall (2)
foghorn (1)
FoldGO (41)
fontawesome (3)
forcats (4)
foreach (3)
forecast (1)
foreign (2)
forestplot (1)
fork (1)
formatR (4)
formatters (1)
Formula (1)
formula.tools (1)
forrester.metadata (1)
fossil (1)
FourCSeq (6)
fpc (1)
fpp (1)
fracdiff (1)
FRASER (103)
frenchFISH (31)
fresh (2)
FRGEpistasis (37)
frma (89)
frmaTools (43)
fs (11)
FScanR (35)
fstcore (1)
FunChIP (37)
FunciSNP (5)
funtooNorm (36)
furrr (3)
FuseSOM (15)
future (4)
future.apply (3)
future.callr (1)
fuzzyjoin (1)

G

g3viz (0)
GA (1)
GA4GHclient (43)
ga4ghclient (0)
GA4GHshiny (35)
gada (1)
gaga (52)
gage (923)
gaggle (36)
gaia (77)
gam (1)
gamlss (1)
gamlss.data (1)
gamlss.dist (1)
gamlss.tr (1)
gamm4 (1)
gap (1)
gap.datasets (1)
gapfill (1)
GAPGOM (24)
GAprediction (41)
garfield (45)
gargle (3)
GARS (38)
gaston (1)
GateFinder (42)
gaucho (1)
gbm (1)
gbRd (1)
GBScleanR (35)
gcapc (44)
gcatest (46)
gclus (1)
gCMAP (5)
gCMAPWeb (2)
gCrisprTools (45)
gcrma (1405)
GCS (1)
GCSConnection (14)
GCSFilesystem (26)
GCSscore (43)
gdata (1)
GDCRNATools (274)
gdistance (1)
GDSArray (73)
gdsfmt (1716)
gdtools (2)
gee (1)
geecc (2)
geepack (1)
geigen (1)
geiger (1)
GEM (42)
gemini (38)
gemma.R (18)
gemtc (1)
GenABEL (2)
GenABEL.data (2)
genArise (40)
genbankr (165)
GENE.E (3)
gene2pathway (2)
GeneAccord (32)
GeneAnswers (33)
geneAttribution (37)
GeneBreak (47)
geneClassifiers (37)
GeneExpressionSignature (46)
genefilter (19039)
genefu (326)
GeneGA (35)
GeneGeneInteR (40)
GeneGroupAnalysis (1)
geneLenDataBase (3)
GeneMeta (58)
GeneNet (1)
GeneNetworkBuilder (50)
GeneOverlap (244)
geneplast (55)
geneplotter (16151)
GeneR (3)
geneRecommender (41)
GeneRegionScan (40)
GeneRfold (2)
generics (3)
geneRxCluster (41)
GeneSelectMMD (45)
GeneSelector (4)
GENESIS (281)
genesis (1)
GeneSpring (3)
GeneStructureTools (56)
geNetClassifier (84)
genetics (0)
GeneticsBase (2)
GeneticsDesign (5)
GeneticsPed (84)
GeneTonic (102)
GeneTraffic (3)
GeneTS (3)
geneXtendeR (40)
GENIE3 (822)
genoCN (41)
GenoGAM (4)
genomation (521)
GenomAutomorphism (16)
GenomeBase (1)
GenomeGraphs (11)
GenomeInfoDb (49516)
genomeinfodb (0)
GenomeInfoDB (1)
GenomeInfoDbData (6)
genomeIntervals (120)
genomeintervals (0)
GenomelnfoDb (1)
genomes (45)
GenomicAlignments (19425)
genomicalignments (0)
GenomicDataCommons (1026)
GenomicDistributions (73)
GenomicFeatures (15982)
genomicfeatures (1)
GenomicFiles (835)
genomicInstability (34)
GenomicInteractionNodes (28)
GenomicInteractions (192)
GenomicOZone (36)
GenomicRanges (37033)
GenomicScores (414)
GenomicSuperSignature (44)
GenomicTuples (39)
Genominator (3)
genoset (17)
genotypeeval (39)
GenoView (1)
genphen (24)
GenProSeq (26)
GenRank (2)
GenSA (1)
GenVisR (388)
GeoDiff (60)
GEOexplorer (53)
GEOfastq (40)
GEOmetadb (176)
geometadb (1)
geometries (0)
geometry (1)
GeomxTools (201)
GEOquery (9020)
geoquery (0)
geoR (1)
GEOsearch (1)
geosphere (2)
GEOsubmission (39)
gep2pep (39)
gert (3)
gespeR (58)
getDEE2 (46)
GetoptLong (1)
getSVCNVperGene0.94 (1)
gettz (1)
geva (35)
GEWIST (36)
gff3Plotter (2)
gfonts (1)
ggalluvial (1)
GGally (1)
gganimate (1)
GGBase (11)
ggbeeswarm (1)
ggbio (1818)
ggbreak (0)
ggcorrplot (1)
ggcyto (1129)
ggdag (1)
ggdendro (2)
ggdist (1)
ggeasy (0)
ggeffects (1)
ggExtra (1)
ggforce (1)
ggforestplot (1)
ggfortify (1)
ggfun (3)
gghalves (1)
gghighlight (1)
ggm (1)
ggmanh (40)
ggmsa (293)
ggnewscale (2)
GGPA (43)
ggplot2 (5)
ggplotify (1)
ggPMX (1)
ggpointdensity (2)
ggpubr (2)
ggRandomForests (1)
ggraph (1)
ggrastr (1)
ggrepel (2)
ggridges (2)
ggsci (1)
ggseqlogo (2)
ggsignif (1)
ggspavis (59)
ggstance (1)
ggstatsplot (1)
ggtext (1)
ggthemes (2)
GGtools (10)
ggtree (15273)
ggtreeDendro (17)
ggtreeExtra (694)
ggVennDiagram (0)
ggvis (1)
gh (9)
ghql (1)
GIGSEA (36)
GillespieSSA (1)
girafe (85)
GISPA (41)
git2r (8)
gitcreds (2)
GLAD (223)
GladiaTOX (35)
glasso (1)
gld (1)
Glimma (1160)
gllvm (1)
glmGamPoi (1481)
glmmADMB (1)
glmmML (1)
glmmTMB (1)
glmnet (2)
glmnetUtils (1)
glmSparseNet (82)
GlobalAncova (593)
GlobalOptions (1)
globals (4)
globalSeq (41)
globaltest (1276)
glpgStyle (1)
glpgTesteR (1)
glpkAPI (1)
glue (4)
gmapR (67)
gMCP (1)
GmicR (44)
gmm (1)
gmodels (1)
gmoviz (36)
gmp (3)
GMRP (36)
GNET2 (39)
gnm (1)
GO.db (4)
goCluster (1)
GOexpress (84)
goftest (1)
GOfuncR (181)
GOFunction (4)
golem (1)
gomms (1)
googledrive (1)
GoogleGenomics (1)
googlesheets4 (3)
GOplot (1)
GOpro (44)
goProfiles (71)
goprofiles (0)
GOSemSim (11499)
gosemsim (0)
goseq (1151)
GOSim (107)
goSorensen (15)
goSTAG (44)
GOstats (1692)
gostats (1)
GOsummaries (57)
GOTHiC (46)
goTools (53)
gotools (0)
gower (2)
GPA (35)
GPArotation (1)
gpart (41)
GPfit (1)
gplots (1)
gpls (88)
gprege (29)
gpuMagic (42)
gQTLBase (7)
gQTLstats (7)
gramm4R (3)
GRaNIE (40)
granulator (90)
graper (40)
graph (17300)
GraphAlignment (47)
GraphAT (39)
graphat (1)
graphics (1)
graphite (2140)
graphlayouts (1)
GraphPAC (40)
graphql (1)
grDevices (1)
GRENITS (41)
GreyListChIP (750)
grf (1)
grid (1)
gridExtra (1)
gridGraphics (1)
gridtext (1)
GRmetrics (71)
groHMM (53)
grpreg (1)
grr (1)
GRridge (43)
GSA (1)
gsalib (1)
GSALightning (47)
GSAR (99)
GSCA (42)
gscounts (1)
gscreend (43)
gsDesign (1)
GSEABase (7054)
gseabase (0)
GSEABenchmarkeR (54)
GSEAlm (63)
GSEAmining (45)
gsean (41)
GSgalgoR (35)
gsl (1)
gsmoothr (2)
gsrc (1)
GSReg (39)
GSRI (42)
gss (1)
GSVA (4365)
gsw (1)
gt (1)
gtable (3)
gtools (3)
gtrellis (107)
gtsummary (1)
gtx (1)
GUIDEseq (52)
Guitar (99)
gUtils (1)
GUTS (1)
Gviz (2998)
GWAS.BAYES (38)
gwascat (383)
GWASExactHW (2)
gwasrapidd (1)
GWASTools (551)
gwasurvivr (68)
GWENA (85)
gWidgets2tcltk (1)

H

h2o (1)
h5vc (59)
HandTill2001 (1)
hapFabia (37)
hardhat (1)
Harman (124)
Harshlight (39)
harshlight (0)
haven (4)
hca (54)
HCABrowser (2)
HCAExplorer (2)
HCAMatrixBrowser (2)
HCsnip (1)
HDF5Array (9822)
hdf5r (1)
HDInterval (2)
hdm (1)
hdrcde (2)
HDTD (42)
heatmap.plus (1)
heatmap3 (1)
heatmaply (4)
heatmaps (224)
Heatplus (332)
heemod (0)
HelloRanges (80)
HELP (39)
helperMut (1)
HEM (43)
here (1)
hermes (46)
Herper (64)
hexbin (6)
HGC (46)
hgu133a.db (1)
hgu133plus2.db (2)
hgug4112a.db (1)
hiAnnotator (60)
HIBAG (81)
HiCBricks (48)
hicbricks (0)
HiCcompare (140)
HiCDCPlus (61)
HiCDOC (16)
HiCExperiment (0)
HiContacts (18)
HiCool (0)
hicrep (9)
hierfstat (1)
hierGWAS (41)
hierinf (32)
highlight (1)
highr (10)
HilbertCurve (65)
HilbertVis (140)
HilbertVisGUI (22)
HiLDA (37)
hipathia (55)
HIPPO (37)
hiReadsProcessor (46)
HIREewas (38)
HiTC (109)
hmdbQuery (61)
Hmisc (1)
HMMcopy (222)
hms (4)
Homo.sapiens (2)
hopach (189)
HPAanalyze (80)
hpar (216)
HPAStainR (36)
HPiP (34)
htmlTable (1)
htmltools (11)
htmlwidgets (10)
HTqPCR (138)
HTSanalyzeR (6)
HTSeqGenie (25)
htSeqTools (5)
htseqtools (0)
HTSFilter (162)
httpcode (1)
httpgd (1)
httptest (1)
httpuv (5)
httr (12)
httr2 (1)
HubPub (75)
huge (1)
HumanTranscriptomeCompendium (39)
hummingbird (34)
hunspell (1)
huxtable (1)
hwriter (1)
HWxtest (1)
HybridMTest (69)
hypeR (88)
hyperdraw (54)
hypergeo (1)
hypergraph (75)

I

iASeq (36)
iasva (38)
iBBiG (78)
ibh (39)
iBMQ (27)
ica (1)
iCARE (87)
Icens (248)
icetea (36)
iCheck (33)
iChip (36)
ichorCNA (0)
iClusterPlus (278)
iCNV (40)
iCOBRA (124)
ideal (76)
ideogram (0)
IdeoViz (55)
idiogram (43)
IdMappingAnalysis (2)
IdMappingRetrieval (2)
IDPmisc (1)
idpr (46)
idr (1)
idr2d (44)
ids (1)
ieugwasr (1)
IFAA (3)
iFlow (1)
iGC (38)
IgGeneUsage (34)
igraph (3)
igvR (82)
IHW (558)
Illumina450ProbeVariants.db (1)
IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 (2)
IlluminaHumanMethylation450kmanifest (2)
IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19 (2)
IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b4.hg19 (2)
IlluminaHumanMethylationEPICmanifest (2)
illuminaio (2433)
ILoReg (39)
imageHTS (42)
imager (1)
imagerExtra (1)
IMAS (40)
imcRtools (97)
Imetagene (2)
iml (1)
IMMAN (45)
ImmuneSpaceR (54)
immunoClust (41)
immunotation (36)
IMPCdata (36)
ImpulseDE (3)
ImpulseDE2 (13)
impute (9014)
INDEED (33)
ineq (1)
infer (3)
infercnv (789)
infinityFlow (41)
influenceR (1)
Informeasure (36)
ini (1)
INLA (1)
inline (1)
InPAS (40)
INPower (38)
insight (1)
inSilicoDb (5)
inSilicoMerging (7)
insilicomerging (0)
INSPEcT (45)
INTACT (1)
InTAD (37)
intansv (46)
interacCircos (49)
InteractionSet (1179)
InteractiveComplexHeatmap (211)
interactiveDisplay (71)
interactiveDisplayBase (7669)
InterCellar (63)
IntEREst (43)
InterMineR (49)
interp (1)
interpretR (1)
intervals (1)
IntOMICS (2)
IntramiRExploreR (41)
inum (1)
inveRsion (23)
inversion (0)
IONiseR (53)
iontree (2)
iPAC (43)
ipaddress (1)
iPath (33)
ipdDb (36)
ipmisc (1)
IPO (116)
IPPD (6)
ipred (1)
irace (1)
IRanges (48405)
iranges (0)
IRdisplay (1)
IRISFGM (39)
IrisSpatialFeatures (1)
IRkernel (1)
irlba (2)
irr (1)
ISAnalytics (45)
iSEE (253)
iSEEhex (32)
iSEEhub (12)
iSEEu (69)
iSeq (39)
ISLET (13)
iSNetwork (2)
Iso (1)
isoband (4)
isobar (77)
ISOcodes (1)
IsoCorrectoR (47)
IsoCorrectoRGUI (34)
IsoformSwitchAnalyzeR (212)
IsoGeneGUI (23)
ISoLDE (38)
isomiRs (49)
iSPlot (2)
isva (2)
ISwR (1)
ITALICS (41)
iterativeBMA (45)
iterativebma (0)
iterativeBMAsurv (37)
iterativebmasurv (1)
iterators (3)
iterClust (42)
iteremoval (18)
itertools (1)
IVAS (49)
ivpack (1)
ivygapSE (35)
IWTomics (35)

J

JADE (1)
janeaustenr (1)
janitor (1)
JASPAR2018 (1)
JASPAR2020 (2)
JavaGD (1)
JBTools (1)
jiebaR (1)
jiebaRD (1)
JM (1)
jmosaics (1)
joda (3)
joineRML (1)
jomo (1)
jpeg (1)
jquerylib (1)
jsonlite (12)
jsTreeR (1)
jtools (1)
juicyjuice (1)
JuliaCall (1)
JunctionSeq (10)

K

kableExtra (1)
karyoploteR (715)
KaryoploteR (0)
katdetectr (20)
KBoost (35)
KCsmart (39)
kebabs (106)
kedd (1)
KEGG.db (1)
KEGGgraph (4689)
kegggraph (1)
KEGGlincs (45)
keggorth (2)
keggorthology (73)
KEGGprofile (16)
KEGGREST (31509)
KEGGSOAP (4)
keras (1)
kernlab (1)
KernSmooth (1)
keyring (1)
kimod (2)
KinSwingR (41)
kissDE (37)
kknn (1)
klaR (1)
km.ci (1)
kmknn (0)
KMsurv (1)
knitr (12)
knockoff (1)
KnowSeq (46)
KODAMA (1)
kohonen (1)
kpmt (1)
ks (1)
kSamples (1)

L

labdsv (1)
labeling (1)
labelled (1)
LACE (36)
Lahman (1)
lambda.r (1)
lambdr (1)
languageserver (1)
LaplacesDemon (1)
lapmix (38)
later (8)
latex2exp (1)
lattice (3)
latticeExtra (2)
lava (2)
lavaan (2)
lazy (1)
lazyeval (4)
LBE (262)
lbfgs (1)
lbfgsb3c (1)
lda (1)
ldblock (45)
LEA (401)
leafcutter (1)
leaflet (0)
leaps (1)
LearnBayes (1)
learnr (1)
LedPred (33)
lefser (186)
leiden (2)
leidenAlg (1)
leidenbase (2)
lemon (1)
les (42)
levi (30)
lfa (332)
lfe (0)
lgr (1)
lhs (2)
liana (1)
libcoin (1)
LiblineaR (2)
lifecycle (5)
lightgbm (1)
limma (34032)
limmaGUI (51)
LINC (2)
LineagePulse (38)
lineagespot (30)
LinkHD (32)
Linnorm (137)
LinTInd (31)
lintr (2)
lionessR (45)
lipidr (100)
LiquidAssociation (41)
liquidSVM (1)
lisaClust (70)
listenv (2)
lixoftConnectors (1)
lixoftConnectors.1 (1)
lixoftConnectors.2 (1)
lle (1)
lm.beta (1)
lmdme (44)
lme4 (3)
lmerTest (1)
LMGene (6)
lmom (1)
lmomco (1)
Lmoments (1)
lmtest (1)
LOBSTAHS (49)
lobstr (1)
locfdr (1)
locfit (4)
loci2path (33)
log4r (1)
logcondens (1)
logicFS (66)
logistf (1)
logitT (40)
logitt (1)
Logolas (4)
logolas (1)
logspline (1)
lol (2)
LOLA (151)
longitudinal (1)
longmemo (1)
loo (1)
LoomExperiment (303)
lotri (1)
LowMACA (32)
LPE (48)
LPEadj (36)
lpNet (34)
lpSolve (1)
lpSolveAPI (1)
lpsymphony (1010)
lqa (1)
LRBaseDbi (44)
LRcell (37)
lsa (2)
LSAF (1)
lsei (1)
lubridate (3)
lumi (1046)
LVSmiRNA (3)
LymphoSeq (58)

M

M3C (1049)
M3D (4)
M3Drop (384)
m6Aboost (30)
maanova (55)
Maaslin2 (415)
Macarron (25)
macat (40)
maCorrPlot (39)
MACPET (23)
MACSQuantifyR (31)
MACSr (62)
maDB (5)
madb (0)
made4 (220)
MADSEQ (36)
maftools (2431)
MAGAR (37)
MAGeCKFlute (281)
magic (1)
magick (1)
magrene (13)
magrittr (6)
MAI (38)
maic (1)
maigesPack (45)
mailR (1)
MAIT (58)
makecdfenv (103)
makePlatformDesign (2)
MALDIquant (1)
manipulateWidget (1)
MANOR (41)
manta (3)
MantelCorr (36)
mantelcorr (0)
maotai (1)
mapbayr (1)
mapdata (1)
mAPKL (38)
mapproj (1)
maPredictDSC (39)
maps (1)
mapscape (33)
maptools (3)
maptree (1)
Markdown (1)
markdown (10)
marr (32)
marray (1612)
martini (43)
maser (92)
maSigPro (242)
maskBAD (38)
MASS (11)
MassArray (42)
massarray (0)
massiR (42)
MassSpecWavelet (1380)
MAST (1515)
matchBox (34)
Matching (1)
MatchIt (1)
matchprobes (3)
mathjaxr (2)
Matrix (6)
Matrix.utils (1)
matrixcalc (1)
MatrixGenerics (34447)
MatrixModels (3)
MatrixQCvis (49)
MatrixRider (34)
matrixStats (4)
matter (105)
MaxContrastProjection (2)
MBAmethyl (33)
MBASED (42)
MBCB (40)
MBECS (28)
mbkmeans (355)
mbOmic (26)
mboost (1)
mBPCR (37)
MBQN (39)
mbQTL (0)
MBttest (32)
mc2d (1)
mcaGUI (4)
MCbiclust (39)
mclogit (1)
mclust (1)
mcmc (1)
MCMCglmm (1)
MCMCpack (1)
MCPcounter (1)
MCRestimate (3)
mCSEA (59)
mda (1)
mdgsa (8)
mdp (40)
mdqc (43)
MDTS (36)
MEAL (59)
MeasurementError.cor (36)
MEAT (37)
MEB (32)
medflex (1)
mediation (1)
MEDIPS (96)
MEDME (39)
megadepth (88)
MEIGOR (55)
Melissa (36)
memes (139)
memisc (1)
memoise (6)
MergeMaid (9)
mergemaid (0)
Mergeomics (47)
MeSHDbi (181)
meshes (111)
meshr (75)
MeSHSim (1)
MesKit (61)
messina (37)
meta (1)
metaArray (5)
metaarray (0)
Metab (43)
metabCombiner (38)
metabinR (10)
metaBMA (1)
MetaboAnnotation (129)
MetaboCoreUtils (171)
metabolomicsWorkbenchR (52)
metabomxtr (39)
MetaboSignal (85)
metaCCA (52)
MetaCyto (47)
metadat (1)
metafor (1)
metagene (55)
metagene2 (52)
metagenomeFeatures (3)
metagenomeSeq (943)
MetaGxOvarian (1)
metahdep (38)
metaMA (2)
metaMS (90)
MetaNeighbor (59)
metap (3)
MetaPhOR (12)
metaplus (1)
metapod (3133)
metapone (44)
metaR (0)
metaSeq (52)
metaseqR (12)
metaseqR2 (54)
MetaSKAT (1)
metavizr (31)
MetaVolcanoR (65)
metaX (3)
MetCirc (39)
MethCP (15)
methimpute (50)
methInheritSim (40)
methods (1)
MethPed (34)
MethReg (51)
methrix (58)
MethTargetedNGS (34)
methVisual (4)
methyAnalysis (12)
MethylAid (49)
methylCC (53)
methylclock (93)
methylGSA (97)
methylInheritance (44)
methylKit (497)
MethylMix (107)
methylMnM (38)
methylPipe (49)
methylscaper (31)
MethylSeekR (123)
methylSig (54)
methylumi (1279)
methyvim (3)
MetID (40)
MetNet (46)
mets (1)
mfa (72)
Mfuzz (783)
mfuzz (1)
mg14 (1)
mgcv (5)
MGFM (40)
MGFR (43)
mgsa (85)
mi (1)
mia (616)
miaSim (41)
miaViz (132)
mice (3)
MiChip (33)
microbenchmark (1)
microbiome (1475)
microbiomeDASim (37)
microbiomeExplorer (56)
microbiomeMarker (208)
MicrobiomeProfiler (59)
MicrobiotaProcess (293)
microRNA (113)
microSTASIS (3)
midasHLA (40)
MIGSA (36)
MIIVsem (1)
miloR (143)
mimager (37)
mime (10)
MIMOSA (43)
mina (34)
MineICA (50)
minerva (1)
minet (530)
minfi (1878)
MinimumDistance (38)
miniUI (1)
minpack.lm (1)
minqa (3)
MiPP (39)
miQC (84)
MIRA (52)
MiRaGE (39)
miRBaseConverter (121)
miRcomp (33)
mirIntegrator (37)
miRLAB (44)
miRmine (33)
miRNAmeConverter (46)
miRNApath (45)
miRNAtap (104)
miRSM (38)
miRsponge (1)
miRspongeR (49)
Mirsynergy (2)
mirTarRnaSeq (39)
misc3d (1)
missMethyl (842)
missRows (35)
mistyR (49)
mitch (49)
mitml (1)
mitoClone2 (33)
mitoODE (2)
mitools (1)
mixOmics (2411)
mixsqp (3)
mixtools (1)
mlbench (1)
mlegp (1)
MLInterfaces (264)
mlm4omics (1)
mlmm.gwas (1)
mlogit (1)
MLP (62)
mlr (1)
mlr3 (1)
mlr3measures (1)
mlr3misc (1)
MLSeq (117)
mltools (1)
MMAPPR2 (24)
MMDiff (1)
MMDiff2 (38)
mmgmos (2)
mmnet (1)
MmPalateMiRNA (2)
mmrm (1)
MMUPHin (78)
mnem (67)
mnormt (2)
MNP (1)
moanin (49)
MobilityTransformR (27)
mobster (1)
mockery (1)
mockr (0)
MODA (45)
ModCon (28)
modeldata (3)
modelenv (1)
ModelMetrics (1)
modelr (3)
modeltools (1)
Modstrings (91)
MOFA (11)
MOFA2 (289)
MOGAMUN (38)
mogsa (104)
MOMA (48)
monaLisa (69)
monocle (2357)
MoonlightR (46)
MoPS (2)
morpheus (1)
mosaics (93)
mosbi (37)
MOSim (37)
Motif2Site (28)
motifbreakR (83)
motifcounter (40)
MotifDb (465)
motifmatchr (945)
motifRG (6)
motifStack (551)
MotIV (42)
mouse4302.db (1)
MouseFM (32)
mpath (1)
MPFE (33)
mpra (40)
MPRAnalyze (43)
MQmetrics (30)
mQTL.NMR (1)
mrgda (1)
mrggsave (0)
mrgmisc (1)
mrgsolve (1)
mrgvalidate (1)
mrgvalprep (1)
msa (1145)
MSA2dist (42)
MsBackendMassbank (59)
MsBackendMgf (195)
MsBackendMsp (47)
MsBackendRawFileReader (35)
MsBackendSql (2)
msbase (0)
mscalib (0)
MsCoreUtils (2428)
MSEADbi (1)
MsExperiment (22)
MsFeatures (1056)
msgbsR (38)
MSGFgui (10)
MSGFplus (26)
msigdbr (1)
msImpute (50)
mslp (16)
msm (1)
msmsEDA (151)
msmsTests (143)
MSnbase (2723)
msnbase (1)
MSnID (132)
MSPrep (44)
msPurity (59)
msQC (0)
msqrob2 (79)
MsQuality (3)
MSstats (359)
MSstatsConvert (300)
MSstatsLiP (34)
MSstatsLOBD (31)
MSstatsPTM (77)
MSstatsQC (41)
MSstatsQCgui (37)
MSstatsSampleSize (37)
MSstatsShiny (20)
MSstatsTMT (174)
MSstatsTMTPTM (2)
mstate (1)
mtbls2 (0)
MTseeker (1)
MuData (30)
muhaz (1)
Mulcom (76)
mulcom (0)
multcomp (1)
multcompView (1)
MultiAssayExperiment (2607)
MultiBaC (46)
multiClust (56)
multicrispr (38)
MultiDataSet (692)
multidplyr (1)
multiGSEA (72)
multiHiCcompare (70)
MultiMed (40)
multiMiR (198)
multinma (1)
multiOmicsViz (48)
multiscan (36)
multiSight (31)
multtest (9710)
mumosa (47)
MungeSumstats (199)
munsell (1)
muscat (195)
muscle (178)
musicatk (47)
MutationalPatterns (361)
MutationTimeR (1)
mutoss (2)
mutSigExtractor (1)
mvabund (1)
MVCClass (44)
mvGST (1)
mvnfast (1)
mvtnorm (1)
MWASTools (85)
mygene (321)
myvariant (62)
mzID (2347)
mzR (2532)

N

n1qn1 (1)
N2R (1)
nabor (1)
NADA (2)
NADfinder (37)
naniar (0)
NanoMethViz (55)
NanoStringDiff (83)
NanoStringNCTools (209)
NanoStringQCPro (72)
nanostringr (1)
nanotatoR (39)
nanotime (1)
NanoTube (48)
narray (1)
NarrowPeaks (3)
nasapower (1)
natserv (1)
naturalsort (1)
NBAMSeq (35)
NBSplice (36)
ncbit (1)
ncdf4 (1)
ncdf4.1 (1)
ncdfFlow (1356)
ncGTW (35)
NCIgraph (44)
ncRNAtools (39)
ndexr (59)
ndjson (1)
neaGUI (1)
nearBynding (34)
Nebulosa (609)
NeighborNet (33)
nem (10)
NEMO (1)
nempi (35)
NetActivity (13)
netbenchmark (2)
netbiov (55)
netboost (31)
netboxr (31)
NetCRG (0)
netDx (38)
nethet (43)
netOmics (37)
NetPathMiner (50)
netprioR (34)
netReg (2)
netresponse (52)
NetSAM (40)
netSmooth (42)
network (1)
networkBMA (34)
networkDynamic (1)
netZooR (37)
NeuCA (33)
NeuralNetTools (1)
neuRosim (1)
NewWave (42)
NGScopy (1)
ngsReports (67)
nhanesA (1)
nleqslv (1)
nlme (10)
nlmixr2 (1)
nlmixr2data (1)
nlmixr2est (1)
nlmixr2extra (1)
nlmixr2lib (1)
nlmixr2plot (1)
nloptr (1)
NLP (1)
NMcalc (1)
NMdata (1)
NMF (2)
NMproject (1)
nnet (3)
NNLM (1)
nnls (1)
nnNorm (38)
nnSVG (39)
NoiseFiltersR (1)
NOISeq (503)
NonCompart (1)
nondetects (67)
nonmemica (1)
nonnest2 (1)
nor1mix (1)
NoRCE (43)
normalize450K (34)
NormalyzerDE (99)
NormqPCR (191)
normr (120)
np (1)
NPARC (40)
npde (1)
npGSEA (41)
npsurv (1)
NTW (33)
nucleoSim (38)
nucleR (52)
nucler (0)
nuCpos (37)
nudge (4)
nullranges (46)
numDeriv (1)
NuPoP (43)
NxtIRFcore (38)

O

occugene (32)
OceanView (1)
OCplus (84)
octad (13)
odbc (1)
oddsratio (1)
ODER (28)
odseq (53)
officedown (1)
officer (3)
OGRE (27)
OGSA (2)
oligo (1420)
oligoClasses (1486)
OLIN (44)
OLINgui (38)
omada (11)
OmaDB (74)
omicade4 (94)
OmicCircos (189)
omiccircos (0)
omicplotR (40)
omicRexposome (38)
OmicsLonDA (37)
OmicsMarkeR (3)
omicsmarker (0)
OMICsPCA (37)
omicsPrint (39)
omicsViewer (29)
Omixer (34)
OmnipathR (312)
ompBAM (45)
Onassis (5)
onbrand (1)
OncoBayes2 (1)
oncomix (35)
oncoscanR (14)
OncoScore (40)
OncoSimulR (49)
oneChannelGUI (5)
onechannelgui (1)
oneSENSE (31)
onlineFDR (38)
ontoCAT (3)
ontologyIndex (4)
ontoProc (97)
ontoTools (3)
oompaBase (1)
oompaData (1)
openCyto (1012)
openPrimeR (81)
openPrimeRui (45)
openssl (12)
OpenStats (38)
openxlsx (3)
OperaMate (1)
operator.tools (1)
oposSOM (57)
oppar (38)
oppti (33)
optextras (1)
optimalFlow (31)
optimx (1)
optmatch (1)
optparse (4)
OPWeight (34)
OrderedList (82)
ordinal (1)
ORFhunteR (37)
ORFik (139)
org.At.tair.db (1)
org.Bt.eg.db (1)
org.Ce.eg.db (1)
org.Cf.eg.db (1)
org.Dm.eg.db (1)
org.Dr.eg.db (1)
org.Gg.eg.db (1)
org.Hs.eg.db (4)
org.Hs.eg.db.html (0)
org.Mm.eg.db (3)
org.Rn.eg.db (3)
org.Sc.sgd.db (1)
org.Ss.eg.db (1)
Organism.dplyr (341)
OrganismDbi (2691)
orientlib (1)
orthogene (153)
OSAT (46)
OSCA (5)
OSCA.advanced (12)
OSCA.basic (14)
OSCA.intro (49)
OSCA.multisample (10)
OSCA.workflows (23)
Oscope (49)
osqp (1)
OTUbase (36)
OutlierD (5)
OUTRIDER (146)
overlapping (1)
OVESEG (32)

P

PAA (47)
packFinder (37)
packrat (2)
padma (34)
PADOG (168)
padr (1)
pagedown (1)
pageRank (37)
PAIRADISE (65)
paircompviz (40)
pairkat (30)
pairseqsim (1)
pairwiseComparisons (1)
pak (1)
paletteer (1)
Palimpsest (1)
palmerpenguins (1)
pamr (6)
PAN (0)
pan (1)
pandaR (91)
pander (1)
panelcn.mops (58)
PAnnBuilder (3)
PanomiR (30)
panp (41)
PANR (37)
PanViz (14)
PanVizGenerator (10)
PAPi (4)
paradox (1)
parallel (1)
parallelly (3)
parameters (1)
ParamHelpers (1)
pareg (26)
parglms (35)
parody (46)
parsedate (1)
parsnip (3)
partitions (1)
party (1)
partykit (1)
PAST (37)
pastecs (1)
patchwork (3)
Path2PPI (42)
pathifier (145)
PathNet (43)
PathoStat (41)
pathprint (2)
pathRender (42)
pathVar (30)
pathview (4093)
pathwayPCA (82)
PathwaySplice (3)
PatientGeneSets (1)
paws (1)
paws.analytics (1)
paws.application.integration (2)
paws.common (3)
paws.compute (2)
paws.cost.management (1)
paws.customer.engagement (1)
paws.database (1)
paws.developer.tools (1)
paws.end.user.computing (1)
paws.machine.learning (1)
paws.management (1)
paws.networking (1)
paws.security.identity (1)
paws.storage (1)
paxtoolsr (91)
pbapply (2)
Pbase (2)
pbcmc (2)
pbdZMQ (1)
PBIR (1)
pbivnorm (1)
pbkrest (1)
pbkrtest (2)
pbmcapply (1)
pcaExplorer (372)
pcaGoPromoter (5)
pcaMethods (4320)
PCAN (44)
pcaPP (2)
PCAtools (954)
pcot2 (9)
PCpheno (4)
pctGCdata (1)
pcxn (34)
pd.atdschip.tiling (1)
pd.hg.u133.plus.2 (1)
pd.mouse430.2 (1)
PDATK (34)
pdftools (1)
pdInfoBuilder (91)
pdmclass (3)
pdp (1)
PeacoQC (93)
peakPantheR (46)
peakPick (1)
PECA (47)
peco (33)
pegas (1)
penalized (1)
pengls (30)
peperr (1)
PepsNMR (60)
pepStat (38)
pepXMLTab (41)
PERFect (51)
performance (1)
PerformanceAnalytics (1)
periodicDNA (37)
perm (2)
perturbatr (3)
PFAM.db (3)
PFIM (0)
PFP (34)
PGA (4)
pga (0)
pgca (35)
PGSEA (26)
pgUtils (3)
phangorn (1)
phantasus (63)
PharmacoGx (148)
pheatmap (1)
phemd (15)
phenoDist (2)
PhenoGeneRanker (31)
phenomis (14)
phenopath (79)
phenoTest (66)
PhenStat (41)
PheWAS (1)
philentropy (1)
philr (172)
PhIPData (43)
phosphonormalizer (29)
PhosR (73)
phyclust (1)
phylobase (1)
PhyloProfile (52)
phyloseq (4307)
phytools (1)
Pi (69)
piano (323)
pickgene (35)
PICS (79)
Pigengene (64)
pillar (9)
pim (1)
PING (37)
pingr (1)
pins (1)
pint (4)
pio (1)
pipeComp (39)
pipeFrame (112)
pkgbuild (10)
pkgcache (1)
pkgconfig (2)
pkgdepends (1)
pkgDepTools (48)
pkgdown (2)
pkgKitten (0)
pkgload (10)
pkgmaker (1)
PKI (1)
PKNCA (1)
planet (89)
planttfhunter (3)
plateCore (2)
plethy (39)
plgem (57)
plier (120)
plm (1)
PloGO2 (51)
plogr (1)
plot3D (1)
plot3Drgl (1)
plotgardener (131)
plotGrouper (38)
plotly (4)
plotmo (1)
plotrix (1)
PLPE (38)
plrs (2)
pls (1)
plumber (1)
plw (3)
plyr (4)
plyranges (824)
PMCMRplus (1)
pmforest (1)
pmm (33)
pmp (82)
pmplots (1)
pmtables (1)
pmxTools (1)
png (2)
PoDCall (29)
podkat (44)
pogos (34)
pointblank (1)
PoissonSeq (1)
polspline (1)
polyclip (2)
polyester (105)
Polyfit (3)
polynom (1)
PolynomF (1)
polysat (1)
POMA (54)
pool (0)
poppr (1)
POST (2)
posterior (3)
PoTRA (26)
PowerExplorer (2)
poweRlaw (2)
powerTCR (281)
POWSC (36)
ppcseq (32)
PPInfer (61)
ppiStats (23)
pqsfinder (60)
pracma (2)
prada (23)
praise (1)
pram (35)
prebs (35)
PreciseSums (1)
preciseTAD (33)
PrecisionTrialDrawer (20)
precommit (1)
PREDA (66)
predictionet (8)
preprocessCore (13265)
preprocesscore (1)
PresenceAbsence (1)
preseqR (1)
prettydoc (1)
prettyunits (2)
primirTSS (35)
PrInCE (40)
prismatic (1)
Prize (2)
proActiv (45)
proBAMr (36)
proBatch (80)
pROC (1)
PROcess (79)
processCore (1)
processx (12)
procoil (36)
ProCoNA (1)
proDA (141)
prodlim (1)
proffer (0)
proFIA (38)
profile (1)
profileModel (1)
profileplyr (149)
profileScoreDist (32)
progeny (307)
progress (1)
progressr (3)
PROJ (0)
proj (0)
proj4 (1)
projectR (54)
projpred (1)
pRoloc (209)
pRolocdata (3)
pRolocGUI (63)
PROMISE (37)
promises (8)
PROPER (73)
PROPS (35)
Prostar (66)
prostar (0)
prot2D (3)
proteasy (16)
proteinProfiles (32)
ProteoDisco (36)
ProteomicsAnnotationHubData (7)
ProteoMM (54)
proteoQC (2)
protGear (28)
ProtGenerics (9145)
proto (1)
protolite (1)
protr (0)
proxy (1)
PRROC (2)
pryr (2)
ps (12)
PSCBS (2)
pscl (1)
PSEA (38)
psichomics (66)
PSICQUIC (34)
PSMatch (61)
PsNR (1)
pspline (1)
psych (1)
psygenet2r (42)
ptairMS (39)
Publish (1)
PubScore (22)
pulsar (1)
pulsedSilac (20)
puma (88)
PureCN (145)
purr (1)
purrr (10)
pvac (38)
pvca (215)
Pviz (46)
PWMEnrich (81)
pwOmics (43)
pwr (1)
pwrEWAS (48)
pxr (0)

Q

qap (3)
qckitfastq (51)
qcmetrics (47)
qcNvs (1)
QDNAseq (263)
QFeatures (337)
qgam (1)
qgraph (1)
qlcMatrix (2)
qmtools (29)
qpcR (1)
qpcrNorm (42)
qpdf (1)
qpgraph (110)
qPLEXanalyzer (46)
qqconf (1)
qrnn (1)
qrqc (93)
qs (1)
qsea (53)
qsmooth (50)
QSutils (39)
qsvaR (28)
qtbase (0)
qtl (1)
qtl2 (1)
Qtlizer (37)
qtpaint (0)
quadprog (1)
QUALIFIER (2)
qualifier (1)
quantiseqr (150)
quantmod (0)
quantreg (1)
quantro (176)
quantsmooth (573)
quarto (1)
QuartPAC (43)
QuasR (301)
QuaternaryProd (53)
QUBIC (90)
questionr (1)
qusage (328)
qvalue (13478)
qvcalc (1)

R

R.cache (1)
R.devices (2)
R.filesets (2)
R.huge (2)
R.matlab (1)
R.methodsS3 (1)
R.oo (1)
R.rsp (1)
R.utils (3)
r2d3 (1)
R3CPET (38)
r3Cseq (85)
R453Plus1Toolbox (44)
R4RNA (470)
R6 (5)
RadioGx (34)
ragg (2)
RaggedExperiment (798)
rain (68)
rainbow (2)
rama (39)
RamiGO (6)
ramigo (0)
ramr (42)
ramwas (62)
randomcoloR (2)
RandomFields (1)
RandomFieldsUtils (1)
randomForest (1)
randomForestSRC (1)
RandomWalkRestartMH (79)
randPack (42)
randRotation (34)
randtoolbox (1)
ranger (1)
RankProd (237)
RANN (1)
RApiDatetime (1)
rapidjsonr (1)
RApiSerialize (1)
rappdirs (1)
RAREsim (24)
RareVariantVis (38)
Rariant (2)
rARPACK (2)
raster (1)
ratelimitr (1)
RAthena (2)
rawrr (136)
RbcBook1 (82)
Rbec (36)
RBesT (1)
RBGL (9088)
rbgl (1)
rbibutils (1)
RBioFormats (1)
RBioinf (50)
rbioinf (0)
rBiopaxParser (134)
RBM (44)
Rbowtie (389)
Rbowtie2 (254)
rbsurv (50)
Rbwa (48)
Rcade (52)
RCAS (55)
RCASPAR (33)
rcdk (2)
rcdklibs (2)
rcellminer (61)
rCGH (63)
Rcgmin (1)
Rchemcpp (2)
Rchoice (0)
RchyOptimyx (4)
RCircos (1)
RcisTarget (825)
rclipboard (1)
RCM (41)
rcmdcheck (8)
RColorBrewer (3)
RConferoMapping (0)
Rcpi (106)
Rcpp (7)
RcppAnnoy (4)
RcppArmadillo (5)
RcppCCTZ (1)
RcppDE (1)
RcppDist (1)
RcppEigen (2)
RcppGSL (1)
RcppHNSW (2)
RcppNumerical (0)
RcppParallel (3)
RcppProgress (1)
RcppRoll (1)
RcppSpdlog (1)
RcppTOML (2)
RcppZiggurat (2)
Rcsdp (1)
RCSL (36)
RCurl (5)
RCurl.back (1)
Rcwl (41)
RcwlPipelines (35)
RCX (51)
RCy3 (655)
RCyjs (44)
RCytoscape (6)
Rd2roxygen (1)
rda (1)
RDAVIDWebService (42)
Rdbi (3)
RdbiPgSQL (2)
rDGIdb (57)
Rdisop (408)
Rdpack (1)
RDRToolbox (80)
Rdsdp (1)
reactable (1)
reactlog (1)
reactome.db (1)
ReactomeContentService4R (61)
ReactomeGraph4R (32)
ReactomeGSA (178)
ReactomePA (1760)
readat (4)
readbitmap (1)
readODS (0)
ReadqPCR (206)
readr (8)
readxl (3)
reb (4)
REBET (34)
rebook (91)
receptLoss (31)
recipes (3)
reconsi (33)
recount (350)
recount3 (245)
recountmethylation (40)
recoup (39)
reda (1)
RedeR (200)
RedisParam (14)
REDseq (78)
RefManageR (1)
RefNet (2)
RefPlus (62)
RegEnrich (52)
regioneR (1740)
regioneReloaded (12)
regionReport (92)
registry (1)
regsplice (32)
regutools (38)
reldist (2)
rematch (1)
rematch2 (1)
remotes (8)
REMP (50)
rentrez (1)
renv (3)
Repitools (614)
ReportingTools (708)
reposTools (1)
repr (1)
reprex (3)
repurrrsive (1)
RepViz (36)
ReQON (37)
resample (1)
reshape (1)
reshape2 (1)
ResidualMatrix (2675)
RESOLVE (11)
Resourcerer (3)
restfulr (2)
restfulSE (40)
reticulate (4)
ReUseData (0)
review (0)
rex (8)
rexposome (60)
rfaRm (37)
Rfast (3)
Rfastp (98)
rfcdmin (1)
rflowcyt (3)
rfPred (37)
rGADEM (356)
RGalaxy (11)
RGCCA (1)
rGenomeTracks (28)
rgeos (2)
rgexf (1)
Rgin (34)
rgl (1)
Rglpk (1)
RGMQL (23)
RgnTX (13)
rgoslin (33)
RGraph2js (36)
Rgraphviz (9093)
rgraphviz (1)
rGREAT (433)
RGSEA (61)
rgsepd (38)
rhdf5 (16008)
rhdf5client (47)
rhdf5filters (14654)
Rhdf5lib (17851)
Rhisat2 (168)
RhpcBLASctl (1)
Rhtslib (19728)
rhub (1)
rHVDM (3)
RiboCrypt (32)
RiboDiPA (39)
RiboProfiling (53)
ribor (38)
riboSeq (0)
riboSeqR (48)
ribosomeProfilingQC (54)
RIdeogram (1)
rifi (21)
rifiComparative (1)
RImmPort (35)
Ringo (627)
RInside (1)
Rintact (2)
rio (1)
RIPAT (32)
RIPSeeker (18)
Risa (45)
riskRegression (1)
RITAN (43)
ritis (1)
RItools (1)
RIVER (33)
rj (1)
rj.gd (1)
rjags (1)
rJava (1)
RJMCMCNucleosomes (35)
rjson (1)
RJSONIO (2)
rlang (7)
RLassoCox (41)
rle (1)
rlecuyer (1)
rlemon (1)
RLMM (38)
RLSeq (35)
rly (1)
RMAGEML (1)
Rmagpie (39)
RMAPPER (3)
RMariaDB (1)
rmarkdown (5)
RMassBank (67)
rMAT (5)
rmelting (49)
rmeta (1)
rmio (1)
RmiR (5)
rmir (0)
Rmmquant (35)
Rmpfr (2)
Rmpi (1)
rms (1)
rmspc (38)
RMTstat (1)
rmutil (1)
RMySQL (1)
RNAAgeCalc (58)
RNAdecay (32)
rnaEditr (32)
RNAinteract (41)
RNAither (4)
rnaither (0)
RNAmodR (57)
RNAmodR.AlkAnilineSeq (40)
RNAmodR.ML (34)
RNAmodR.RiboMethSeq (37)
RNAprobR (3)
RNAsense (31)
rnaseqcomp (44)
RnaSeqGeneEdgeRQL (1)
rnaSeqMap (4)
RNASeqPower (120)
RNASeqR (25)
RnaSeqSampleSize (83)
rnaturalearth (1)
RnBeads (183)
rncl (1)
RNeXML (1)
rngtools (1)
rngWELL (1)
Rnits (26)
roar (46)
robust (1)
robustbase (1)
ROC (1043)
ROCpAI (31)
ROCR (1)
RODBC (1)
ROI (1)
RolDE (27)
Roleswitch (4)
Rolexa (2)
rols (277)
roma (0)
ROntoTools (78)
Rook (1)
rootSolve (1)
ropls (698)
ROSeq (34)
rotl (1)
ROTS (148)
roxygen2 (10)
RPA (38)
rpact (1)
rpart (3)
RPostgres (2)
RPostgreSQL (1)
rprimer (38)
rprojroot (8)
RProtoBufLib (2056)
RpsiXML (31)
RPushbullet (1)
rpx (254)
Rqc (188)
rqt (36)
rqubic (54)
rrBLUP (1)
rrcov (2)
rRDP (41)
Rredland (2)
rredlist (1)
RRHO (72)
rrvgo (256)
rsample (3)
Rsamtools (19546)
rsamtools (1)
rsbml (74)
rsconnect (3)
rScudo (35)
RSEIS (1)
rsemmed (31)
RSeqAn (53)
Rserve (1)
rSFFreader (2)
RSiena (1)
Rsmlx (1)
Rsmlx.1 (1)
Rsmlx.2 (1)
RSNNS (1)
RSNPper (3)
Rsolnp (2)
RSpectra (3)
RSQLite (7)
Rssa (1)
RsSimulx (1)
RsSimulx.1 (1)
rstan (2)
rstanarm (1)
rstantools (1)
rstatix (2)
rstpm2 (1)
rstudio (0)
rstudioapi (10)
Rsubread (2110)
rsvd (2)
rsvg (1)
RSVSim (44)
rSWeeP (33)
rtables (1)
rTANDEM (8)
RTCA (38)
RTCGA (497)
RTCGAToolbox (503)
rticles (1)
rtkore (1)
RTN (104)
RTNduals (45)
RTNsurvival (49)
RTools4TB (1)
RTopper (38)
Rtpca (33)
rtracklayer (17784)
Rtreemix (43)
rTRM (48)
rTRMui (33)
Rtsne (1)
Rttf2pt1 (1)
runibic (53)
RUnit (1)
Runuran (1)
Ruuid (4)
ruv (1)
RUVcorr (45)
RUVnormalize (44)
RUVSeq (805)
RUVseq (1)
rvcheck (1)
RVenn (0)
rversions (9)
rvest (3)
rvg (1)
Rvmmin (1)
RVS (36)
Rwave (1)
RWebServices (2)
RWiener (1)
rWikiPathways (268)
rxode2 (1)
rxode2et (1)
rxode2ll (1)
rxode2parse (1)
rxode2random (1)
rzmq (1)

S

s2 (2)
S4Vectors (51036)
saemix (1)
safe (384)
safetyexploreR (1)
safetyMarginCalculation (1)
SAGElyzer (2)
sagenhaft (33)
SAGx (16)
SAIGEgds (50)
samExploreR (2)
sampleClassifier (37)
sampling (1)
samr (2)
SamSPECTRAL (89)
sandwich (1)
sangeranalyseR (129)
sangerseqR (336)
SANTA (39)
sapFinder (2)
saps (1)
sarks (31)
sass (5)
satuRn (67)
savR (49)
SBGNview (68)
SBGNview.data (1)
sbgr (1)
SBMLR (46)
SC3 (382)
sc3 (1)
Scale4C (33)
ScaledMatrix (9233)
scales (5)
scAlign (37)
scam (1)
SCAN.UPC (67)
scanMiR (37)
scanMiRApp (31)
scAnnotatR (59)
SCANVIS (47)
SCArray (35)
SCATE (35)
scater (4891)
scatterHatch (26)
scattermore (2)
scatterpie (1)
scatterplot3d (1)
scBFA (34)
SCBN (45)
scBubbletree (13)
scCB2 (41)
scClassifR (8)
scClassify (59)
sccomp (29)
sccore (1)
scDataviz (55)
scDblFinder (780)
scDD (128)
scDDboost (15)
scde (295)
scds (477)
SCFA (33)
scFeatureFilter (33)
scFeatures (1)
scfind (2)
scGPS (39)
schex (118)
scHOT (53)
scico (1)
scidb (1)
scifer (11)
ScISI (7)
scMAGeCK (35)
scmap (384)
scMerge (290)
scMET (14)
scmeth (48)
SCnorm (87)
scone (90)
Sconify (32)
SCOPE (41)
scoreInvHap (35)
scp (61)
scPCA (61)
scPipe (70)
scran (3705)
scReClassify (32)
scRecover (41)
ScreenR (15)
scRepertoire (239)
scrime (2)
scRNAseq (1)
scRNAseqApp (0)
scruff (47)
scry (92)
scs (1)
scShapes (30)
scsR (2)
scTensor (46)
scTGIF (39)
scTHI (34)
sctransform (4)
scTreeViz (33)
scuttle (7053)
SDAMS (37)
SDMTools (1)
sechm (78)
seewave (1)
segmented (1)
segmenter (32)
segmentSeq (76)
selectKSigs (31)
selectr (1)
SELEX (37)
sem (1)
SemDist (35)
semisup (32)
SemSim (2)
semsim (0)
sendmailR (1)
sensitivity (1)
sensobol (1)
SEPA (1)
SEPIRA (31)
seq2pathway (40)
seqArchR (34)
seqArchRplus (2)
SeqArray (751)
seqbias (47)
seqCAT (38)
seqCNA (54)
seqcombo (37)
SeqGate (30)
SeqGSEA (55)
seqLogo (2009)
seqminer (2)
Seqnames (0)
seqPattern (522)
seqplots (11)
seqsetvis (49)
SeqSQC (41)
seqTools (97)
SeqVarTools (414)
seriation (4)
servr (1)
sesame (408)
sessioninfo (8)
SEtools (72)
sets (0)
Seurat (5)
seurat (1)
SeuratObject (4)
sevenbridges (56)
sevenC (37)
sf (1)
sfsmisc (1)
SGCP (2)
SGSeq (245)
shadowtext (1)
shape (1)
shapefiles (1)
shapes (1)
shapr (0)
SharedObject (54)
ShatterSeek (1)
shiny (5)
shiny.react (1)
shiny.router (1)
shinyBS (3)
shinybusy (1)
shinycssloaders (1)
shinydashboard (2)
shinydashboardPlus (2)
shinyepico (46)
shinyFeedback (0)
shinyfeedback (0)
shinyFiles (3)
shinyglide (0)
shinyhelper (2)
shinyjqui (1)
shinyjs (1)
shinyMethyl (72)
shinyMobile (1)
shinypanel (2)
shinySelect (1)
shinystan (1)
shinyTANDEM (3)
shinythemes (1)
shinyWidgets (5)
ShortRead (5336)
shortread (0)
SIAMCAT (106)
SICtools (30)
sidap (0)
sigaR (4)
SigCheck (37)
sigFeature (139)
SigFuge (35)
siggenes (2436)
sights (44)
Signac (3)
signal (1)
signature.tools.lib (1)
signature.tools.lib.back (1)
signature.tools.lib.v2.1 (1)
signature.tools.lib.v2.1.2 (1)
signatureSearch (73)
signeR (60)
signet (2)
signifinder (12)
SignifReg (1)
sigPathway (104)
sigpathway (1)
SigsPack (35)
sigsquared (36)
SIM (41)
SIMAT (35)
SimBindProfiles (35)
SimBu (14)
SIMD (33)
SimFFPE (33)
similaRpeak (45)
SIMLR (179)
simpar (0)
simpleaffy (161)
simpleSeg (19)
simpleSingleCell (0)
simplifyEnrichment (282)
SimSeq (1)
simulatorAPMS (3)
simulatorZ (3)
sincell (42)
single (25)
SingleCellExperiment (11215)
SingleCelLExperiment (1)
SingleCellSignalR (123)
singleCellTK (153)
SingleMoleculeFootprinting (37)
SingleR (2645)
SingleRBook (4)
singscore (792)
SISPA (38)
sitadela (33)
sitePath (36)
sitmo (3)
sizepower (45)
SJava (2)
sjPlot (1)
sjstats (1)
SKAT (2)
skewr (35)
skimr (1)
slackr (0)
slalom (40)
slam (1)
SLGI (10)
slickR (1)
slider (2)
slingshot (1053)
slinky (10)
SLqPCR (43)
sm (1)
SMAD (31)
SMAP (37)
smartdata (1)
SMITE (42)
smoother (1)
smoothHR (1)
SMVar (2)
sn (2)
sna (1)
SNAData (1)
SNAGEE (38)
snakecase (1)
snapCGH (51)
snapcount (47)
snifter (97)
snm (127)
snow (2)
SnowballC (1)
snowfall (1)
snpAssoc (0)
SNPchip (17)
SNPediaR (35)
SNPhood (35)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38 (1)
snpMatrix (4)
snpmatrix (1)
snpMatrix2 (0)
SNPRelate (1258)
snpStats (1660)
SOAR (1)
soGGi (236)
soilDB (1)
sojourner (31)
solrium (1)
som (1)
SomaDataIO (1)
SomatiCA (1)
SomaticSignatures (132)
sommer (1)
SOMNiBUS (31)
sortable (1)
soundecology (1)
sourcetools (2)
sp (3)
SpacePAC (38)
spacetime (1)
SPACox (1)
spade (5)
spam (1)
spaMM (1)
Spaniel (69)
sparklyr (2)
SPARQL (1)
sparrow (72)
sparseDOSSA (37)
SparseM (1)
sparseMatrixStats (11444)
sparsenetgls (31)
SparseSignatures (45)
sparsesvd (4)
spaSim (14)
spatial (1)
SpatialCPie (64)
spatialDE (52)
SpatialDecon (115)
SpatialExperiment (663)
SpatialFeatureExperiment (31)
spatialHeatmap (41)
spatialreg (1)
spatstat (1)
spatstat.core (2)
spatstat.data (2)
spatstat.explore (0)
spatstat.geom (2)
spatstat.linnet (1)
spatstat.random (2)
spatstat.sparse (2)
spatstat.utils (2)
spatzie (32)
spData (1)
speckle (3)
specL (42)
SpeCond (74)
Spectra (367)
SpectralTAD (53)
speedglm (1)
SPEI (1)
spelling (1)
SPEM (51)
spgs (1)
SPIA (417)
SPIAT (21)
spicyR (77)
SpidermiR (55)
spikeLI (32)
spiky (37)
spkTools (36)
splancs (1)
splatter (348)
splicegear (5)
spliceR (8)
spliceSites (3)
SpliceWiz (18)
SplicingFactory (32)
SplicingGraphs (76)
splines (1)
splines2 (1)
splineTCDiffExpr (1)
splineTimeR (51)
SPLINTER (33)
splots (118)
spls (1)
SPONGE (65)
SpotClean (25)
SPOTlight (86)
spotSegmentation (4)
spqn (35)
SPsimSeq (63)
SQLDataFrame (38)
SQUADD (31)
SQUAREM (1)
sRACIPE (40)
SRAdb (330)
sRAP (4)
SRGnet (2)
srnadiff (36)
sROC (1)
sscore (42)
sscu (36)
sSeq (129)
ssh.utils (1)
ssize (62)
sSNAPPY (30)
SSPA (92)
ssPATHS (31)
ssrch (39)
ssviz (40)
stabledist (1)
stabs (1)
stageR (156)
stam (2)
STAN (40)
standR (37)
StanHeaders (1)
staRank (34)
StarBioTrek (36)
Starr (3)
startupmsg (1)
STATegRa (44)
Statial (11)
statmod (1)
statnet (1)
statnet.common (1)
stats (1)
stats4 (1)
statsExpressions (1)
statTarget (83)
STdeconvolve (45)
stepNorm (38)
stepwiseCM (2)
sticky (1)
stinepack (1)
stJoincount (11)
stopwords (1)
storr (1)
strandCheckR (38)
Streamer (44)
strex (0)
string (0)
STRINGdb (786)
stringdist (2)
stringfish (1)
stringi (8)
stringr (7)
STROMA4 (34)
strucchange (1)
struct (83)
Structstrings (76)
structToolbox (60)
StructuralVariantAnnotation (126)
styler (1)
SubCellBarCode (40)
subplex (1)
subselect (1)
subSeq (53)
SUITOR (14)
SummarizedBenchmark (39)
SummarizedExperiment (34473)
Summix (28)
superheat (1)
SuperLearner (1)
superpc (1)
supersigs (37)
SuppDists (1)
supraHex (314)
surfaltr (32)
survcomp (746)
survey (1)
survival (5)
survivalROC (1)
survminer (1)
survMisc (1)
survtype (45)
Sushi (182)
susieR (3)
sva (5894)
svaNUMT (28)
SVAPLSseq (2)
svaRetro (29)
svd (1)
svglite (2)
SVM2CRM (1)
svUnit (1)
SWATH2stats (44)
SwathXtend (44)
swfdr (38)
SwimR (4)
switchBox (78)
switchde (40)
sybil (1)
sybilGUROBI (1)
sybilSBML (1)
synapsis (31)
synapter (37)
synergyfinder (159)
SynExtend (43)
synlet (41)
SynMut (35)
syntenet (31)
sys (10)
systemfit (1)
systemfonts (1)
systemPipeR (1110)
systemPipeRdata (0)
systemPipeShiny (46)
systemPipeTools (35)

T

table1 (1)
tables (1)
TADCompare (50)
TailRank (1)
tanggle (43)
TAPseq (45)
tarchetypes (1)
target (36)
TargetDecoy (37)
targets (1)
TargetScore (41)
TargetSearch (45)
targetsearch (0)
TarSeqQC (34)
taxize (1)
TBSignatureProfiler (44)
TCC (253)
TCGAbiolinks (2861)
TCGAbiolinksGUI (94)
TCGAbiolinksGUI.data (1)
TCGAutils (667)
tcltk (1)
tclust (1)
TCseq (110)
TDARACNE (32)
tdaracne (0)
TDbasedUFE (1)
TeachingDemos (1)
TEKRABber (29)
templater (1)
tensor (1)
tensorA (1)
tensorflow (2)
TENxIO (13)
tenXplore (31)
TEQC (50)
tergm (1)
ternarynet (35)
terra (1)
terraTCGAdata (26)
testthat (10)
TFARM (30)
tfautograph (1)
TFBSTools (1469)
tfbstools (1)
TFEA.ChIP (51)
TFHAZ (32)
TFisher (1)
TFMPvalue (2)
tfrmt (1)
tfruns (2)
TFutils (37)
tgp (1)
TH.data (1)
threejs (1)
tibble (7)
tictoc (1)
tidybayes (0)
tidybulk (114)
tidygraph (1)
tidyjson (1)
tidymodels (1)
tidyposterior (1)
tidyr (7)
tidyselect (5)
tidySingleCellExperiment (94)
tidySummarizedExperiment (113)
tidytext (1)
tidytree (3)
tidyverse (2)
tidyvpc (1)
tiff (1)
tiger (0)
tigre (39)
tikzDevice (0)
TileDBArray (37)
tilingArray (67)
timechange (1)
timecourse (52)
timeDate (3)
timeOmics (51)
timereg (1)
TimerQuant (0)
timescape (58)
timeSeries (1)
TimeSeriesExperiment (32)
TimiRGeN (41)
TIN (37)
TINC (1)
tinytest (0)
tinytex (5)
TissueEnrich (82)
TitanCNA (58)
tkrgl (1)
tkrplot (1)
tkWidgets (945)
tkwidgets (1)
tLOH (34)
tm (1)
TMB (1)
TMixClust (52)
tmle (1)
tmvnsim (1)
tmvtnorm (1)
TNBC.CMS (43)
TnT (38)
TOAST (150)
tofsims (12)
tokenizers (1)
tomoda (29)
tomoseqr (24)
tools (1)
ToPASeq (4)
topconfects (123)
topdownr (42)
topGO (2699)
topicmodels (1)
torch (0)
ToxicoGx (33)
Tplyr (1)
TPP (64)
TPP2D (40)
tracee (1)
tracktables (117)
trackViewer (273)
tradeSeq (332)
TrajectoryGeometry (27)
TrajectoryUtils (1124)
TraMineR (1)
transcriptogramer (45)
transcriptR (43)
transformGamPoi (35)
transformr (1)
transite (41)
tRanslatome (37)
transomics2cytoscape (32)
TransView (38)
TraRe (28)
traseR (36)
Travel (22)
traviz (32)
tree (1)
TreeAndLeaf (87)
treeio (14635)
treekoR (34)
TreeSummarizedExperiment (641)
TREG (26)
TReNA (1)
trena (37)
Trendy (44)
TRESS (34)
tricycle (82)
triebeard (1)
triform (3)
trigger (37)
trimcluster (1)
trio (72)
tripack (1)
triplex (39)
tripr (33)
tRNA (72)
tRNAdbImport (43)
tRNAscanImport (50)
TRONCO (63)
truncdist (1)
truncnorm (2)
trust (1)
TSCAN (337)
tscR (47)
tseries (1)
tseriesChaos (1)
tsna (1)
tsne (1)
TSP (4)
tspair (26)
TSRchitect (8)
TSSi (2)
ttdo (0)
ttgsea (40)
TTMap (32)
tune (2)
tuneR (1)
TurboNorm (36)
TVTB (36)
tweeDEseq (83)
tweedie (1)
tweenr (1)
twilight (89)
twoddpcr (39)
TwoSampleMR (1)
txcutr (31)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene (2)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene (1)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.ensGene (1)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene (2)
tximeta (980)
tximport (2941)
tximportData (1)
TxRegInfra (2)
TypeInfo (37)
tzdb (1)

U

uatools (0)
UCell (408)
ucminf (1)
Ularcirc (37)
umap (2)
UMI4Cats (37)
unbalanced (1)
uncoverappLib (31)
UNDO (39)
unifiedWMWqPCR (37)
UniProt.ws (276)
uniqueAtomMat (1)
Uniquorn (36)
units (2)
universalmotif (378)
updateObject (28)
urca (1)
urltools (1)
uroot (1)
usethis (8)
uSORT (38)
UTAR (0)
utf8 (6)
utils (1)
uuid (1)
uwot (4)

V

V8 (1)
VAExprs (35)
VanillaICE (54)
vaplot (1)
vapour (1)
VarCon (34)
variancePartition (474)
VariantAnnotation (6810)
VariantExperiment (40)
VariantFiltering (44)
VariantTools (92)
vasp (2)
VaSP (35)
vaultr (1)
vbmp (49)
vcd (0)
VCFArray (37)
vcfR (0)
vcr (1)
vctrs (11)
vdiffr (1)
VDJdive (13)
Vega (3)
VegaMC (36)
vegan (1)
vegawidget (1)
velociraptor (87)
veloviz (39)
venn (2)
VennDetail (155)
VennDiagram (1)
VERSO (30)
VGAM (1)
vhydeg (1)
VIBER (1)
vidger (84)
vioplot (1)
viper (582)
viridis (3)
viridisLite (4)
viridislite (1)
virtualArray (3)
visdat (0)
ViSEAGO (116)
visNetwork (1)
vissE (54)
Voyager (18)
vpc (1)
VplotR (41)
vroom (3)
vsclust (12)
vsn (4749)
vtpnet (36)
vulcan (35)

W

waddR (44)
waiter (2)
waldo (1)
warp (1)
wateRmelon (701)
wavClusteR (41)
waveslim (1)
waveTiling (3)
weaver (42)
webbioc (42)
webfakes (1)
webmockr (1)
webshot (4)
WeightIt (1)
weights (1)
WeightSVM (1)
weitrix (34)
WGCNA (2)
WGSmapp (1)
whereami (1)
whisker (9)
widgetInvoke (2)
widgetTools (955)
widgettools (1)
wiggleplotr (111)
WikidataQueryServiceR (1)
WikidataR (1)
WikipediR (1)
wikitaxa (1)
withr (6)
wk (2)
workflows (3)
workflowsets (1)
worrms (1)
wpm (43)
wppi (36)
Wrench (946)
writexl (1)
WriteXLS (1)
WRS2 (1)

X

xaringan (1)
xaringanExtra (1)
xaringanthemer (1)
XBSeq (3)
XCIR (3)
xcms (1263)
xcore (28)
XDE (43)
xdg-utils (1)
Xeva (39)
xfun (13)
xgboost (2)
xgxr (1)
XINA (39)
XLConnect (1)
xlsx (1)
xlsxjars (1)
xmapbridge (35)
xmapcore (1)
XML (5)
xml2 (8)
xmlparsedata (1)
XNAString (38)
xopen (1)
xpose (1)
xps (7)
xslt (0)
xtable (1)
xts (1)
XVector (43914)
xvector (0)
XVectorb (1)

Y

y2hStat (1)
yaImpute (1)
yaml (11)
yamss (41)
YAPSA (69)
yaqcaffy (6)
yardstick (2)
yarn (90)
ymlthis (1)
yulab.utils (3)

Z

zCompositions (2)
zeallot (1)
zellkonverter (527)
zenith (13)
zFPKM (89)
zinbwave (599)
zip (3)
zlibbioc (45262)
zoo (3)