Download stats for Bioconductor annotation packagesDownload stats for Bioconductor experiment packages

Download stats for Bioconductor Software packages

This page was generated on 2014-07-25 09:49:02 -0700 (Fri, 25 Jul 2014).

This page monitors Bioconductor Software package downloads from http://bioconductor.org/ over the last 12 months. The number reported next to each package name is the number of distinct IPs that “hit” the package over the last 12 months. Core packages (i.e. the BiocInstaller package + packages that get installed the first time biocLite() is called with no arguments) are reported in bold.


Top 50

1BiocInstaller (123715)
2BiocGenerics (94568)
3IRanges (92496)
4Biobase (91617)
5AnnotationDbi (78260)
6limma (58793)
7zlibbioc (56090)
8Biostrings (52610)
9GenomicRanges (49352)
10annotate (45381)
11genefilter (41175)
12Rsamtools (40335)
13biomaRt (39345)
14XVector (37955)
15rtracklayer (37318)
16affy (37072)
17graph (36193)
18preprocessCore (35915)
19GenomicFeatures (35373)
20affyio (33218)
21BSgenome (32891)
22geneplotter (26073)
23multtest (25747)
24edgeR (24796)
25DESeq (22243)
26GenomeInfoDb (21462)
27RBGL (21315)
28flowCore (20641)
29Rgraphviz (19571)
30impute (19450)
31mzR (18298)
32xcms (18281)
33GEOquery (17750)
34biovizBase (17464)
35gcrma (17232)
36VariantAnnotation (16057)
37ShortRead (15028)
38vsn (14377)
39DESeq2 (14036)
40qvalue (13791)
41AnnotationForge (13447)
42affyPLM (13136)
43Gviz (12952)
44GSEABase (12685)
45cummeRbund (11946)
46BiocParallel (11838)
47simpleaffy (11767)
48Category (11513)
49GOstats (10876)
50GenomicAlignments (10787)

All Software packages

MonthNb of distinct IPsNb of downloads
Aug/201318067688596
Sep/2013242021083196
Oct/2013312871041153
Nov/201329406853692
Dec/201328510807082
Jan/201429690725608
Feb/201428993573612
Mar/201434634886794
Apr/201439965777391
May/201438374830827
Jun/201436391728039
Jul/201429498501714
All months2403999497704

A

a4 (2252)
a4Base (2318)
a4Classif (2197)
a4Core (2342)
a4Preproc (2318)
a4Reporting (2121)
ABarray (2103)
ABSSeq (582)
aCGH (2864)
ACME (2077)
ADaCGH2 (1940)
adSplit (1924)
AdvancedR (2)
AdvancedR2011 (8)
AdvancedR2011Data (8)
affxparser (10033)
affy (37072)
affycomp (3030)
AffyCompatible (2227)
affyContam (1982)
affycoretools (4945)
affydata (1)
AffyExpress (2267)
affyILM (1916)
affyio (33218)
affylmGUI (3214)
affyPara (1943)
affypdnn (2308)
affyPLM (13136)
affyQCReport (6418)
affyqcreport (3)
AffyRNADegradation (1931)
AffyTiling (2072)
AGDEX (1814)
Agi4x44PreProcess (1863)
agilp (2129)
agimicrorna (1)
AgiMicroRna (2379)
AllelicImbalance (1339)
alsace (549)
altcdfenvs (2011)
ampliQueso (1308)
annaffy (9759)
AnnBuilder (29)
annmap (901)
annotate (45381)
annotation (273)
AnnotationDbi (78260)
AnnotationForge (13447)
AnnotationFuncs (2009)
AnnotationHub (2889)
annotationTools (2306)
anota (1926)
antiProfiles (1707)
apcluster (1)
apComplex (2063)
aroma.light (5178)
ArrayExpress (4489)
ArrayExpressHTS (1048)
arrayMagic (7)
arrayMvout (1869)
arraymvout (1)
arrayQCplot (4)
arrayQuality (2658)
arrayQualityMetrics (4718)
arrays (437)
ArrayTools (2291)
ArrayTV (1380)
ARRmNormalization (1604)
ASEB (1711)
asmn (608)
ASSET (1191)
ASSIGN (562)
AtlasRDF (580)
attract (1838)

B

BAC (1750)
BADER (1461)
BAGS (1281)
ballgown (4)
BaseSpaceR (1644)
Basic4Cseq (572)
BasicASE (1)
BayesPeak (2736)
baySeq (4063)
bcellViper (3)
BCRANK (2117)
beadarray (6260)
beadarraySNP (2034)
BeadDataPackR (5695)
beaddatapackr (1)
BeadExplorer (5)
BEAT (578)
betr (1960)
bgafun (1876)
BGmix (924)
bgx (1820)
BHC (2266)
BicARE (1836)
BiGGR (1317)
bigmemoryExtras (974)
bioassayR (1479)
Biobase (91617)
biobase (1)
BiocCaseStudies (1902)
BiocCheck (671)
biocDatasets (30)
BiocGenerics (94568)
biocGraph (2047)
BiocInstaller (123715)
biocinstaller (1)
BiocParallel (11838)
BiocStyle (2790)
biocViews (2336)
bioDist (4433)
biomaRt (39345)
BioMVCClass (2018)
biomvRCNS (1452)
BioNet (2993)
BioSeqClass (1912)
Biostrings (52610)
biostrings (1)
biosvd (578)
biovizbase (1)
biovizBase (17464)
BiRewire (1252)
birta (1754)
BiSeq (2043)
BitSeq (2237)
blima (82)
blimaTestingData (3)
BRAIN (2029)
BrainStars (1730)
bridge (1826)
BSgenome (32891)
bsseq (2137)
BufferedMatrix (1708)
bufferedmatrix (1)
BufferedMatrixMethods (1639)
bumphunter (6503)
BUS (1620)
BuxcoR (21)

C

CAFE (514)
CAGEr (1665)
CALIB (1600)
CAMERA (2860)
cancerclass (1564)
CancerMutationAnalysis (1632)
casper (1530)
Category (11513)
categoryCompare (1644)
ccrepe (580)
cellGrowth (1552)
cellhts (1)
cellHTS (1694)
cellHTS2 (2523)
CellNOptR (1898)
CexoR (1156)
CGEN (1752)
CGHbase (2166)
CGHcall (2015)
cghcall (1)
cghMCR (1713)
CGHnormaliter (1621)
CGHregions (1689)
ChAMP (2011)
ChAMPdata (3)
charm (1865)
ChemmineOB (1495)
ChemmineR (3014)
chemminer (3)
chimera (2240)
chipenrich (1178)
chipenrich.data (3)
ChIPpeakAnno (4316)
ChIPQC (597)
ChIPseeker (674)
chipseq (3533)
ChIPseqR (1845)
ChIPsim (1772)
ChIPXpress (769)
chopsticks (2008)
chroGPS (1513)
ChromHeatMap (1760)
cisPath (1495)
cleanUpdTSeq (1171)
cleaver (1453)
clippda (1568)
clipper (1670)
Clomial (510)
Clonality (1597)
clonotypeR (1152)
clst (1576)
clstutils (1538)
clusterProfiler (2935)
clusterprofiler (2)
clusterStab (1870)
CMA (2351)
cn.farms (1597)
cn.mops (2562)
cnanorm (1)
CNAnorm (1751)
CNEr (619)
CNORdt (1490)
CNORfeeder (1423)
CNORfuzzy (1498)
CNORode (1501)
CNTools (1858)
cnvGSA (1551)
CNVrd2 (1079)
CNVtools (1802)
cnvtools (1)
cobindR (1148)
CoCiteStats (1723)
codelink (1699)
CoGAPS (427)
coGPS (1486)
COHCAP (616)
COHCAPanno (3)
COMPASS (541)
compcodeR (617)
CompGO (533)
ConsensusClusterPlus (2687)
convert (2849)
copa (1780)
COPDSexualDimorphism (500)
COPDSexualDimorphism.data (1)
copynumber (1645)
CopyNumber450k (542)
CopyNumber450kData (3)
Cormotif (1496)
CorMut (1551)
coRNAi (1548)
CORREP (1618)
cosmiq (44)
cosmo (201)
cosmoGUI (233)
CoverageView (318)
cqn (2277)
CRImage (1845)
CRISPRseek (593)
crlmm (3123)
CSAR (1985)
CSSP (1162)
ctc (3890)
cummeRbund (11946)
CummeRbund (1)
customProDB (1244)
cycle (1719)

D

dagLogo (1091)
dama (2)
daMA (1538)
DART (1589)
DASiR (1579)
DAVIDQuery (2178)
DBChIP (1571)
ddCt (2072)
ddgraph (1568)
DECIPHER (1725)
DeconRNASeq (1551)
DEDS (1679)
deepSNV (1718)
DEGraph (1805)
DEGreport (41)
DEGseq (3533)
deltaGseg (1393)
DESeq (22243)
DESeq2 (14036)
DEXSeq (6971)
dexus (1538)
DFP (1543)
DiffBind (3452)
diffGeneAnalysis (1757)
DirichletMultinomial (1624)
dks (1499)
DMRcate (578)
DMRcatedata (3)
DMRforPairs (516)
DNAcopy (9335)
DNaseR (1203)
domainsignatures (1657)
DOQTL (34)
DOSE (3159)
DriverNet (1460)
DrugVsDisease (1493)
DSS (1729)
DTA (1515)
dualKS (1091)
DupChecker (41)
dyebias (1540)
DynDoc (8373)
dyndoc (1)

E

EasyqpcR (1649)
easyRNASeq (4171)
EBarrays (2128)
EBcoexpress (1656)
EBImage (7259)
EBSeq (2712)
ecolitk (1623)
EDASeq (2528)
edd (68)
EDDA (533)
edger (1)
edgeR (24796)
eiR (755)
eisa (2006)
ELBOW (531)
ensemblVEP (2097)
ENVISIONQuery (1564)
epigenomix (1431)
epivizr (1168)
eQTL (19)
Evomics2012 (1)
Evomics2012Data (1)
ExiMiR (1615)
exomeCopy (2103)
exomePeak (1176)
exonmap (127)
explorase (1315)
ExpressionView (1649)
expressionview (1)
externalVector (565)

F

fabia (2107)
factDesign (1842)
farms (1771)
fastLiquidAssociation (515)
fastseg (1614)
fbat (25)
fdrame (1682)
ffpe (1530)
FGNet (1267)
flagme (1658)
Fletcher2013a (3)
flipflop (1099)
flowBeads (1163)
flowBin (558)
flowCL (515)
flowClean (33)
flowClust (2500)
flowCore (20641)
flowCyBar (522)
flowDensity (44)
flowFit (1136)
flowFlowJo (1697)
flowFP (1778)
flowMap (1138)
flowMatch (527)
flowMeans (1979)
flowMerge (1829)
flowPeaks (1564)
flowPhyto (1520)
flowPlots (1608)
flowQ (1179)
flowq (1)
flowQB (1454)
flowStats (2513)
flowTrack (1)
flowTrans (1679)
flowType (1726)
flowUtils (1877)
flowViz (4563)
flowworkspace (1)
flowWorkspace (2976)
fmcsR (1941)
fOptions (1)
FRGEpistasis (504)
frma (2613)
frmaTools (1788)
FunciSNP (1703)

G

gaga (1675)
gage (3739)
gaggle (1565)
gaia (1544)
gaucho (501)
gCMAP (1493)
gCMAPWeb (1374)
gcrma (17232)
genArise (1540)
GENE.E (1637)
gene2pathway (286)
GeneAnswers (3474)
GeneExpressionSignature (1634)
genefilter (41175)
genefu (2045)
GeneGA (878)
GeneGroupAnalysis (535)
GeneMeta (2045)
GeneNetworkBuilder (1523)
GeneOverlap (597)
geneplotter (26073)
GeneR (84)
geneRecommender (1786)
GeneRegionScan (1551)
generegulation (108)
GeneRfold (34)
geneRxCluster (565)
GeneSelectMMD (1580)
GeneSelector (1871)
GeneSpring (22)
geNetClassifier (1420)
GeneticsBase (37)
GeneticsDesign (1664)
GeneticsPed (1803)
GeneTraffic (61)
GeneTS (2)
genoCN (1575)
genomationData (3)
GenomeGraphs (3645)
genomeinfodb (1)
GenomeInfoDb (21462)
genomeIntervals (4202)
genomes (1805)
GenomicAlignments (10787)
GenomicFeatures (35373)
genomicfeatures (1)
GenomicFiles (560)
GenomicRanges (49352)
Genominator (2059)
genoset (2409)
GEOmetadb (2653)
GEOquery (17750)
GEOsubmission (1559)
GEWIST (1468)
gff3Plotter (4)
GGBase (3102)
ggbio (10069)
GGtools (2423)
girafe (1903)
GLAD (2327)
GlobalAncova (1972)
globaltest (3827)
gmapR (985)
GOexpress (1)
gofunction (1)
GOFunction (1865)
goProfiles (2021)
goprofiles (2)
GOSemSim (3912)
gosemsim (1)
goseq (4113)
GOSim (1623)
GOstats (10876)
GOTHiC (604)
goTools (2248)
gpls (2316)
gprege (1496)
graph (36193)
GraphAlignment (1561)
GraphAT (1575)
graphite (2558)
GraphPAC (1393)
GRENITS (1618)
GSAR (58)
GSBenchMark (4)
GSCA (490)
GSEABase (12685)
GSEAlm (2145)
GSReg (1)
GSRI (1540)
GSVA (2274)
Gviz (12952)
gwascat (1714)
GWASTools (2763)

H

h5vc (1261)
hapFabia (1485)
harshlight (1)
Harshlight (1598)
HCsnip (1335)
HDTD (56)
healthyFlowData (3)
Heatplus (5726)
HELP (1579)
HEM (1515)
hem (1)
hexbin (202)
hiAnnotator (58)
highthroughputassays (36)
HilbertVis (2934)
hilbertvis (1)
HilbertVisGUI (1455)
HiTC (1663)
HMMcopy (1645)
hopach (2815)
hpar (1583)
HSMMSingleCell (3)
HTqPCR (2507)
HTSanalyzeR (2016)
HTSandGeneCentricLabs (1)
HTSeqGenie (432)
htseqtools (2)
htSeqTools (1879)
HTSFilter (1644)
HybridMTest (1484)
hyperdraw (1684)
hypergraph (2190)

I

iASeq (1714)
iBBiG (1553)
ibh (1436)
iBMQ (1268)
Icens (3175)
iChip (1528)
iClusterPlus (588)
idiogram (1617)
IdMappingAnalysis (1456)
IdMappingRetrieval (1475)
iFlow (437)
Illumina450ProbeVariants.db (3)
illuminaio (8032)
imageHTS (1625)
impute (19450)
INPower (493)
inSilicoDb (2158)
inSilicoMerging (2008)
intansv (1234)
interactiveDisplay (1608)
IntermediateSequenceAnalysis2013 (78)
inveRsion (1476)
inversion (1)
iontree (1476)
iPAC (1527)
IPPD (1655)
IRanges (92496)
iranges (1)
iSeq (1538)
isobar (1868)
IsoGeneGUI (1551)
iSPlot (1)
ITALICS (1498)
iterativeBMA (1540)
iterativeBMAsurv (1535)

J

jmosaics (1373)
joda (1450)

K

KCsmart (1536)
KEGGgraph (5983)
keggorth (8)
keggorthology (1775)
KEGGprofile (1840)
KEGGREST (5274)
KEGGSOAP (1003)

L

lapmix (1664)
LBE (1846)
les (1529)
limma (58793)
limmaGUI (2938)
LiquidAssociation (1532)
liquidassociation (1)
lmdme (1465)
LMGene (1851)
logicFS (1967)
logitt (1)
logitT (1572)
lol (1533)
LPE (2016)
LPEadj (1482)
lpNet (1419)
lumi (8399)
LVSmiRNA (1612)

M

maanova (2277)
macat (1529)
maCorrPlot (1476)
maDB (624)
madb (1)
made4 (3774)
maigesPack (1534)
makecdfenv (3099)
makePlatformDesign (30)
MANOR (1534)
manta (1537)
MantelCorr (1490)
maPredictDSC (1119)
marray (10694)
maSigPro (2515)
maskBAD (1427)
MassArray (1655)
massiR (507)
MassSpecWavelet (2980)
matchBox (1456)
matchprobes (127)
MBCB (1544)
mBPCR (1512)
mcaGUI (1528)
MCRestimate (1741)
mdqc (1720)
MeasurementError.cor (1444)
MEDIPS (2278)
MEDME (1523)
MergeMaid (2246)
MeSH.AOR.db (3)
MeSH.db (3)
MeSH.PCR.db (3)
MeSHDbi (532)
meshr (500)
messina (506)
metaArray (2155)
metagenomeSeq (2030)
metahdep (1486)
metaMS (524)
metaMSdata (3)
metaR (53)
metaSeq (1104)
metaseqR (507)
methVisual (1635)
methyAnalysis (2088)
MethylAid (41)
methylMnM (1144)
methylPipe (4)
MethylSeekR (1567)
methylumi (7592)
Mfuzz (3354)
mfuzz (1)
mgsa (1705)
MiChip (1482)
microRNA (2346)
MIMOSA (534)
MineICA (1390)
minet (3388)
minfi (8300)
MinimumDistance (1471)
MiPP (1553)
MiRaGE (1469)
miRNApath (1794)
Mirsynergy (513)
mitoODE (1059)
MLInterfaces (2727)
MLP (1579)
MLSeq (534)
MMDiff (1422)
mmnet (588)
MmPalateMiRNA (1592)
monocle (111)
MoPS (45)
mosaics (1791)
MotifDb (2720)
motifRG (1589)
motifStack (2394)
MotIV (2777)
mQTL.NMR (1)
MSIseqData (3)
msmsEDA (1104)
msmsTests (1080)
MSnbase (2823)
msQC (50)
MSstats (1361)
MUGAExampleData (3)
Mulcom (1515)
multiscan (1452)
multtest (25747)
MVCClass (1524)
mzID (1382)
mzR (18298)

N

NarrowPeaks (1527)
ncdfFlow (2634)
NCIgraph (1836)
neaGUI (1168)
nem (1596)
netbiov (1)
NetPathMiner (514)
netresponse (1509)
NetSAM (1216)
networkBMA (1421)
nnNorm (1473)
NOISeq (2719)
nondetects (514)
NormqPCR (1803)
npGSEA (524)
NTW (1482)
nucleR (1598)
nudge (1479)
NuPoP (1520)

O

occugene (1595)
OCplus (1708)
oligo (9025)
oligoClasses (9814)
OLIN (1619)
OLINgui (1507)
omicade4 (1214)
OmicCircos (1540)
oneChannelGUI (2319)
ontoCAT (1652)
ontoTools (49)
openCyto (1077)
oposSOM (21)
OrderedList (2323)
org.MeSH.Aca.db (3)
org.MeSH.Atu.K84.db (3)
org.MeSH.Bsu.168.db (3)
org.MeSH.Hsa.db (3)
org.MeSH.Syn.db (3)
OrganismDbi (2626)
OSAT (1412)
OTUbase (1617)
OutlierD (1683)

P

PADOG (1469)
paircompviz (1116)
pairseqsim (6)
pamr (49)
PAnnBuilder (1710)
panp (1746)
PANR (1494)
PAPi (1387)
parody (1888)
pathifier (1159)
PathNet (1383)
pathRender (1644)
pathview (4365)
PatientGeneSets (100)
Pbase (12)
pcaGoPromoter (1790)
pcaMethods (5889)
pcot2 (1504)
PCpheno (1495)
pdInfoBuilder (2334)
pdmclass (1646)
PECA (629)
pepDat (4)
PGSEA (2161)
pgUtils (750)
phenoDist (1312)
phenoTest (1650)
PhenStat (575)
phyloseq (3797)
piano (2215)
pickgene (1490)
PICS (2238)
PING (1589)
pint (1518)
pkgDepTools (1761)
pkgdeptools (2)
plateCore (1516)
plethy (1086)
plgem (1528)
plier (2876)
PLPE (1621)
plrs (1354)
plw (1476)
Polyfit (16)
ppiStats (1627)
prada (3171)
prebs (1360)
PREDA (1533)
predictionet (832)
preprocessCore (35915)
PROcess (2155)
procoil (1441)
ProCoNA (1117)
pRoloc (1434)
pRolocGUI (22)
PROMISE (1512)
prot2D (1105)
proteinProfiles (1291)
PSICQUIC (1200)
puma (1826)
pvac (1520)
pvca (1557)
Pviz (20)
PWMEnrich (1751)
pxr (3)

Q

qcmetrics (1030)
QDNAseq (581)
qpcrNorm (1666)
qpgraph (2585)
qrqc (1946)
QUALIFIER (1092)
quantsmooth (3189)
QuasR (3545)
qusage (1150)
qvalue (13791)

R

r3Cseq (1565)
R453Plus1Toolbox (1633)
rama (1639)
RamiGO (2006)
ramigo (1)
randpack (1)
randPack (1428)
RankProd (3969)
Rariant (505)
RbcBook1 (1662)
RBGL (21315)
rbioinf (1)
RBioinf (1654)
rBiopaxParser (1520)
Rbowtie (3382)
rbsurv (1625)
Rcade (1440)
RCASPAR (1466)
Rchemcpp (1207)
RchyOptimyx (1534)
Rcpi (838)
RCytoscape (3641)
RDAVIDWebService (1617)
Rdbi (43)
RdbiPgSQL (36)
Rdisop (1848)
RDRToolbox (1882)
ReactomePA (2296)
ReadqPCR (1892)
reb (1475)
RedeR (2021)
REDseq (1709)
RefNet (513)
RefNet.db (3)
RefPlus (1550)
Repitools (2663)
ReportingTools (4755)
ReQON (1508)
Resourcerer (1506)
rflowcyt (32)
rfPred (1112)
rGADEM (3146)
RGalaxy (1556)
rgl (1)
Rgraphviz (19571)
RGSEA (41)
rhdf5 (9549)
rHVDM (1482)
riboSeq (23)
Ringo (3127)
Rintact (9)
RIPSeeker (1668)
Risa (1539)
RLMM (1501)
RMAGEML (27)
rmagpie (1)
Rmagpie (1488)
RMAPPER (1463)
RMassBank (1509)
rMAT (899)
RmiR (1819)
RNAinteract (1511)
RNAither (1582)
rnaither (1)
rnaSeqMap (1526)
RNASeqPower (1524)
roar (554)
ROC (4839)
Roleswitch (1128)
RoleswitchData (3)
Rolexa (1654)
rols (1688)
ROntoTools (1422)
RPA (1672)
RpsiXML (1811)
rpx (544)
rqubic (1523)
Rredland (7)
RRHO (1199)
rrp (1)
Rsamtools (40335)
rsbml (1895)
rSFFreader (787)
RSNPper (5)
Rsubread (2420)
RSVSim (1422)
rTANDEM (1696)
RTCA (1547)
RTN (1217)
RTools4TB (29)
RTopper (1494)
rtracklayer (37318)
Rtreemix (1538)
rTRM (1198)
rTRMui (1098)
Ruuid (56)
RUVnormalizeData (4)
RUVSeq (69)
RWebServices (373)
rxSeq (3)

S

S4Vectors (1170)
safe (1712)
SAGElyzer (1)
sagenhaft (1574)
SAGx (1913)
sagx (1)
SamSPECTRAL (1627)
sangerseqR (561)
SANTA (1316)
sapFinder (547)
savR (480)
SBMLR (1603)
SCAN.UPC (1867)
ScISI (1676)
scsR (481)
SeattleIntro2010 (3)
SeattleIntro2011 (3)
SeattleIntro2011Data (3)
SeattleIntro2012 (3)
SeattleIntro2012Data (4)
segmentSeq (1688)
SemSim (22)
SeqArray (1463)
seqbias (1700)
seqCNA (1142)
SeqGSEA (2018)
seqLogo (5504)
Seqnames (31)
SequenceAnalysis (12)
SequenceAnalysisData (113)
SeqVarTools (1168)
shinyMethyl (16)
shinyMethylData (4)
shinyTANDEM (1075)
ShortRead (15028)
sigaR (1523)
SigFuge (1119)
siggenes (10624)
sigPathway (2062)
SIM (1563)
SimBindProfiles (1058)
simpleaffy (11767)
simulatorAPMS (39)
sizepower (1933)
SJava (444)
SLGI (1507)
slgi (1)
SLqPCR (1871)
SMAP (1478)
SNAGEE (1312)
snapCGH (1987)
snm (1686)
SNPchip (3129)
snpMatrix (296)
snpStats (5436)
SomatiCA (1400)
SomaticSignatures (645)
SpacePAC (1075)
spade (2081)
SpeCond (1547)
SPEM (1293)
SPIA (2824)
spikeLI (1442)
spkTools (1462)
splicegear (1473)
spliceR (1492)
spliceSites (1088)
SplicingGraphs (1430)
splots (2548)
spotSegmentation (1471)
SQUADD (1424)
SRAdb (3215)
sRAP (1174)
sscore (1474)
sSeq (1126)
ssize (1915)
SSPA (1714)
ssviz (30)
stam (5)
STAN (1)
staRank (1385)
Starr (1706)
stepNorm (1496)
stepwiseCM (1452)
Streamer (1666)
STRINGdb (1326)
StudentGWAS (8)
supraHex (1148)
survcomp (3126)
Sushi (576)
sva (6183)
SwimR (1049)
synapter (1560)

T

TargetScore (1167)
TargetSearch (1594)
TCC (1656)
TDARACNE (1598)
TEQC (1696)
ternarynet (1409)
TFBSTools (1446)
tigre (1587)
tilingArray (2273)
timecourse (1965)
TitanCNA (503)
tkWidgets (6539)
topGO (6946)
trackViewer (558)
tRanslatome (1238)
TransView (1526)
triform (1382)
trigger (1499)
trio (1303)
triplex (1419)
tspair (1608)
TSSi (1542)
TurboNorm (1555)
tweeDEseq (1891)
twilight (2448)
typeinfo (1)
TypeInfo (1544)

U

UNDO (502)
unifiedWMWqPCR (516)
UniProt.ws (1770)

V

VanillaICE (1800)
VariantAnnotation (16057)
VariantFiltering (600)
variants (167)
VariantTools (966)
vbmp (1845)
Vega (1489)
VegaMC (1496)
viper (519)
virtualArray (2159)
vsn (14377)
vtpnet (1089)

W

wateRmelon (2708)
wavClusteR (55)
waveTiling (1432)
weaver (1929)
webbioc (1561)
widgetTools (6500)

X

xcms (18281)
XDE (1547)
xmapbridge (1452)
xmapcore (424)
XML2R (2)
xps (2227)
xtable (1)
XVector (37955)

Y

yaqcaffy (1791)

Z

zebrafishRNASeq (6)
zlibbioc (56090)