See download stats for:    Bioconductor software packages    Bioconductor annotation packages    Bioconductor experiment packages

Download stats for Bioconductor workflow packages

This page was generated on 2023-01-28 12:42:17 -0500 (Sat, 28 Jan 2023).

The number reported next to each package name is the download score, that is, the average number of distinct IPs that “hit” the package each month for the last 12 months (not counting the current month).

All workflow package stats in one file: workflows_pkg_stats.tab

All workflow package download scores in one file: workflows_pkg_scores.tab

See Download stats for Bioconductor workflow repository (all packages combined)

ade4 (1)
admiral (1)
admiral.test (1)
admiraldev (1)
amgen.okta.client (1)
annotate (1)
annotation (68)
AnnotationDbi (2)
AnVIL (1)
apcluster (1)
ape (1)
aplot (1)
arm (1)
arrays (31)
arrow (1)
asciicast (1)
AsioHeaders (1)
assertive.properties (1)
assertr (1)
assertthat (1)
AUCell (1)
av (1)
aws.s3 (1)
aws.signature (1)
babelgene (1)
babelmixr2 (1)
backports (1)
badger (1)
base64enc (1)
batchelor (1)
bayestestR (1)
BBmisc (1)
bbmle (1)
bbr (1)
bdsmatrix (1)
benchmarkme (1)
BgeeCall (1)
BH (2)
BiasedUrn (1)
bibtex (1)
bigD (1)
bigreadr (1)
binr (1)
Biobase (1)
BiocFileCache (1)
BiocGenerics (1)
BiocInstaller (1)
BiocIO (1)
BiocManager (3)
BiocMetaWorkflow (16)
Bioconductor (1)
BiocParallel (1)
BiocVersion (3)
biomaRt (1)
biostatUtil (1)
Biostrings (1)
bit (1)
bit64 (1)
bitops (1)
blob (2)
blockcluster (1)
blogdown (1)
bookdown (1)
boot (1)
BP4RNAseq (19)
brew (1)
brio (1)
brms (1)
Brobdingnag (1)
broom (2)
broom.helpers (1)
bs4Dash (1)
BSgenome (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 (1)
bslib (2)
bsplus (1)
cachem (1)
CAGEWorkflow (15)
Cairo (1)
callr (3)
campsismod (1)
car (1)
carData (1)
caret (1)
castor (1)
caTools (1)
ccaPP (1)
cem (1)
changepoint (1)
checkmate (1)
chipseqDB (19)
chron (1)
circlize (1)
class (1)
classInt (1)
cli (3)
clinPK (1)
clipr (2)
clock (1)
clue (1)
cluster (3)
clusterCrit (1)
clusterprofielr (1)
clusterProfiler (1)
ClusterR (1)
cmdstanr (1)
cmprsk (1)
cobalt (1)
codetools (1)
coin (1)
collapse (1)
collections (1)
colorspace (3)
colourpicker (1)
commonmark (2)
ComplexHeatmap (1)
config (1)
conquer (1)
coro (1)
corrr (1)
covr (1)
cowplot (1)
cpp11 (2)
crayon (3)
credentials (1)
crosstalk (2)
crul (1)
csawUsersGuide (15)
csv (1)
cubature (1)
cubelyr (1)
Cubist (1)
curatedMetagenomicData (1)
curl (1)
CVST (1)
cxAnalysis (1)
cytofWorkflow (61)
cytolib (1)
dada2 (0)
data.table (3)
datamods (1)
datawizard (1)
DBI (2)
DBItest (1)
dbplyr (1)
dbscan (1)
ddalpha (1)
decoupleR (1)
DelayedArray (1)
DelayedMatrixStats (1)
deldir (1)
dendextend (2)
DEoptim (1)
DEoptimR (1)
desc (2)
DescTools (1)
DESeq2 (1)
deSolve (1)
devtools (1)
dfidx (1)
DHARMa (1)
dials (1)
diceR (1)
dichromat (1)
diffobj (1)
digest (3)
dimRed (1)
distill (1)
distr (1)
distributional (1)
dittodb (1)
dittoSeq (1)
dlstats (1)
dm (1)
DMRcate (1)
doBy (1)
dockerfiler (1)
doMC (1)
doParallel (1)
doRNG (1)
dorothea (0)
DOSE (1)
dotCall64 (1)
downlit (1)
dparser (1)
dplyr (2)
drake (1)
DRR (1)
DT (3)
dtplyr (1)
dtw (1)
dtwclust (1)
duckdb (1)
e1071 (1)
edgeR (1)
EGSEA123 (17)
eha (1)
ellipse (1)
ellipsis (1)
emayili (1)
emmeans (1)
enrichR (1)
Epi (1)
epiR (1)
eQTL (2)
ergm (1)
esquisse (1)
estimability (1)
evaluate (3)
evd (1)
Exact (1)
exactRankTests (1)
ExpHunterSuite (20)
ExploreModelMatrix (1)
expm (1)
ExpressionNormalizationWorkflow (25)
expss (1)
FactoMineR (1)
fansi (3)
farver (2)
fastmap (1)
fastmatch (1)
fda (1)
fgsea (0)
fields (1)
filelock (1)
fitdistrplus (1)
fixest (1)
flexclust (1)
flexdashboard (1)
flexsurv (1)
flextable (1)
flowWorkspaceData (1)
fluentGenomics (16)
FNN (1)
foghorn (1)
fontawesome (1)
forcats (2)
foreach (2)
forecast (1)
foreign (1)
fork (1)
formatR (2)
formatters (1)
Formula (1)
forrester.metadata (1)
fracdiff (1)
fs (2)
furrr (1)
future (1)
future.apply (1)
future.callr (1)
GA (1)
gam (1)
gamlss (1)
gamlss.dist (1)
gap (1)
gargle (1)
gbm (1)
gdata (1)
gee (1)
geepack (1)
genefilter (1)
genefu (1)
generegulation (18)
generics (3)
GenomeInfoDb (1)
GenomeInfoDbData (1)
GenomicAlignments (1)
GenomicRanges (1)
geometry (1)
GeomxTools (1)
GeoMxWorkflows (71)
gert (1)
GetoptLong (1)
gettz (1)
gganimate (1)
ggbeeswarm (1)
ggcorrplot (1)
ggdag (1)
ggdist (1)
ggeffects (1)
ggforce (1)
ggfun (1)
gghighlight (1)
ggplot2 (3)
ggplotify (1)
ggPMX (1)
ggpubr (1)
ggRandomForests (1)
ggraph (1)
ggrepel (1)
ggridges (1)
ggsignif (1)
ggstatsplot (1)
ggtext (1)
ggtree (1)
gh (1)
git2r (0)
gitcreds (1)
GLAD (1)
gld (1)
glmmADMB (1)
glmmTMB (1)
glmnet (1)
GlobalOptions (1)
globals (1)
glue (2)
GMD (1)
gmm (1)
gmp (1)
gnm (1)
goftest (1)
golem (1)
googledrive (1)
googlesheets4 (1)
GOSemSim (1)
gower (1)
GPArotation (1)
gplots (1)
graph (1)
graphlayouts (1)
gridtext (1)
gsDesign (1)
gt (1)
gtable (1)
gtools (2)
gtsummary (1)
Gviz (1)
gWidgets2tcltk (1)
h2o (1)
HandTill2001 (1)
hardhat (1)
haven (2)
hdf5r (1)
HDInterval (1)
heatmaply (1)
hexbin (1)
highr (1)
highthroughputassays (19)
Hmisc (1)
hms (2)
Homo.sapiens (1)
htmlTable (1)
htmltools (2)
htmlwidgets (1)
httpuv (2)
httr (3)
httr2 (1)
hunspell (1)
huxtable (1)
hwriter (1)
ica (1)
idr (1)
igraph (1)
imcRtools (1)
iml (1)
infer (1)
INLA (1)
insight (1)
interp (1)
inum (1)
ipaddress (1)
ipred (1)
IRanges (1)
IRkernel (1)
irlba (1)
irr (1)
isoband (2)
iterators (2)
JM (1)
jomo (1)
jose (1)
jpeg (1)
jsonlite (3)
jsTreeR (1)
juicyjuice (1)
JuliaCall (1)
KEGGREST (1)
keras (1)
kernlab (1)
KernSmooth (1)
keyring (1)
klaR (1)
km.ci (1)
knitr (3)
kohonen (1)
ks (1)
labeling (1)
labelled (1)
lambdr (1)
languageserver (1)
lares (1)
later (1)
latex2exp (1)
lattice (2)
latticeExtra (2)
lava (1)
lavaan (1)
lazyeval (1)
lbfgs (1)
learnr (1)
leiden (1)
lgr (1)
lhs (1)
libcoin (1)
lifecycle (3)
liftOver (210)
limma (1)
lintr (1)
listenv (1)
lme4 (1)
lmtest (1)
lobstr (1)
locfit (2)
log4r (1)
lotri (1)
lpSolve (1)
lpSolveAPI (1)
lsa (1)
lubridate (1)
MACSr (0)
maEndToEnd (74)
magic (1)
magick (1)
magrittr (2)
mapbayr (1)
mapdata (1)
mapproj (1)
maps (1)
maptools (1)
Markdown (1)
markdown (1)
MASS (3)
Matching (1)
MatchIt (1)
mathjaxr (1)
Matrix (3)
matrixcalc (1)
MatrixGenerics (1)
MatrixModels (1)
matrixStats (2)
mc2d (1)
mclogit (1)
mclust (1)
MCPcounter (1)
memisc (1)
memoise (2)
metafor (1)
metap (1)
methylationArrayAnalysis (109)
mets (1)
mgcv (3)
mice (1)
mime (2)
minpack.lm (1)
minqa (1)
mixOmics (1)
mlr (1)
mlr3 (1)
mlr3measures (1)
mlr3misc (1)
mnormt (1)
modeldata (1)
modelenv (1)
ModelMetrics (1)
modelr (1)
modeltools (1)
MOFA2 (1)
morpheus (1)
motifmatchr (1)
mrgda (1)
mrgmisc (1)
mrgsolve (1)
mrgvalidate (1)
mrgvalprep (1)
MsCoreUtils (0)
MsFeatures (0)
msigdbr (1)
msm (1)
MSnbase (0)
multcomp (1)
multtest (1)
MutationalPatterns (1)
mvtnorm (1)
mzR (0)
n1qn1 (1)
nanostringr (1)
nanotime (1)
narray (1)
ndjson (1)
network (1)
nhanesA (1)
nleqslv (1)
nlme (3)
nlmixr2 (1)
nlmixr2data (1)
nlmixr2est (1)
nlmixr2extra (1)
nlmixr2lib (1)
nlmixr2plot (1)
nloptr (1)
NMcalc (1)
NMdata (1)
NMF (1)
NMproject (1)
nnet (1)
NonCompart (1)
nonmemica (1)
npde (1)
numDeriv (1)
officer (1)
oligo (1)
openssl (3)
openxlsx (1)
optmatch (1)
optparse (1)
ordinal (1)
org.Hs.eg.db (1)
org.Mm.eg.db (1)
org.Rn.eg.db (1)
osqp (1)
packrat (1)
padr (1)
pagedown (1)
pak (1)
paletteer (1)
palmerpenguins (1)
pamr (1)
paradox (1)
parallelly (1)
parameters (1)
ParamHelpers (1)
parsedate (1)
parsnip (1)
partitions (1)
party (1)
partykit (1)
patchwork (1)
paws.application.integration (1)
paws.common (1)
paws.compute (1)
pbapply (1)
pcaExplorer (1)
pcaMethods (1)
pcaPP (1)
pdftools (1)
pdist (1)
Peptides (1)
performance (1)
PerformanceAnalytics (1)
permute (1)
pheatmap (1)
PhosR (1)
pillar (3)
pingr (1)
pins (1)
pkgbuild (2)
pkgcache (1)
pkgconfig (1)
pkgdepends (1)
pkgdown (1)
pkgload (2)
pkgmaker (1)
PKI (1)
PKNCA (1)
plm (1)
plotly (2)
plotrix (1)
pls (1)
plumber (1)
plyr (2)
pmforest (1)
pmtables (1)
png (1)
pointblank (1)
polspline (1)
polyclip (1)
polynom (1)
pool (1)
posterior (1)
pracma (1)
precommit (1)
preprocessCore (0)
prettyunits (1)
prismatic (1)
pROC (1)
processCore (0)
processx (3)
prodlim (1)
profile (1)
progress (1)
progressr (1)
proj4 (1)
projpred (1)
promises (1)
proteomics (30)
ProtGenerics (0)
protolite (1)
proxy (1)
ps (3)
psych (1)
purrr (1)
qap (1)
qpdf (1)
qqconf (1)
qs (1)
quadprog (1)
quantreg (1)
quarto (1)
questionr (1)
qvalue (1)
R.cache (1)
R.methodsS3 (1)
R.oo (1)
R.rsp (1)
R.utils (1)
R6 (1)
ragg (1)
rainbow (1)
randomForest (1)
randomForestSRC (1)
randtoolbox (1)
ranger (1)
RApiDatetime (1)
RApiSerialize (1)
rapportools (1)
raster (1)
RBesT (1)
rbibutils (1)
RCircos (1)
RClickhouse (1)
rclipboard (1)
rcmdcheck (1)
RColorBrewer (2)
Rcpp (3)
RcppAnnoy (1)
RcppArmadillo (2)
RcppCCTZ (1)
RcppDE (1)
RcppEigen (1)
RcppGSL (1)
RcppHNSW (1)
RcppTOML (0)
Rcsdp (1)
RCurl (2)
Rd2roxygen (1)
Rdpack (1)
reactable (1)
reactlog (1)
reactome.db (1)
readr (1)
readxl (1)
recipes (1)
recountWorkflow (19)
reda (1)
RefManageR (1)
registry (1)
reldist (1)
rematch2 (1)
remotes (1)
renv (2)
reprex (1)
repurrrsive (1)
reshape2 (1)
restfulr (1)
reticulate (1)
rex (1)
rgeos (1)
rgl (1)
Rgraphviz (1)
rhdf5 (1)
Rhdf5lib (1)
Rhtslib (0)
rhub (1)
riskRegression (1)
RItools (1)
rjson (1)
rlang (4)
RMariaDB (1)
rmarkdown (3)
rmdformats (1)
rms (1)
rmutil (1)
RMySQL (1)
RNAseq123 (115)
rnaseqDTU (36)
rnaseqGene (172)
RnaSeqGeneEdgeRQL (117)
rngtools (1)
rngWELL (1)
robust (1)
robustbase (1)
RobustRankAggreg (1)
RODBC (1)
rols (1)
Rook (1)
roxygen2 (1)
rpart (1)
rpart.plot (1)
RPostgres (1)
RPostgreSQL (1)
rprojroot (2)
rrcov (1)
rsample (1)
Rsamtools (0)
rsconnect (2)
RSEIS (1)
RSiena (1)
Rsmlx (1)
RSpectra (1)
RSQLite (3)
RsSimulx (1)
rstan (1)
rstatix (1)
rstpm2 (1)
rstudioapi (2)
rsvg (1)
rticles (1)
rtkore (1)
rtracklayer (1)
Rtsne (1)
Rttf2pt1 (1)
Runuran (1)
rvcheck (1)
rversions (1)
rvest (1)
rvg (1)
Rwave (1)
rxode2 (1)
rxode2et (1)
rxode2ll (1)
rxode2parse (1)
rxode2random (1)
s2 (1)
S4Vectors (1)
saemix (1)
sandwich (1)
sass (2)
SBGNview.data (1)
scales (3)
scam (1)
scater (1)
scattermore (1)
scatterpie (1)
scatterplot3d (1)
scico (1)
scidb (1)
scPipe (1)
sctransform (1)
segmented (1)
sensitivity (1)
sensobol (1)
seqinr (1)
seqpac (1)
sequencing (29)
seriation (2)
servr (1)
sessioninfo (1)
Seurat (1)
SeuratObject (1)
sf (1)
sfsmisc (1)
shadowtext (1)
shape (1)
shiny (2)
shiny.router (1)
shinyalert (1)
shinyBS (1)
shinybusy (1)
shinycssloaders (1)
shinydashboard (1)
shinyFiles (1)
shinyjqui (1)
shinyjs (1)
shinyMobile (1)
shinySelect (1)
shinytest (1)
shinythemes (1)
shinyWidgets (2)
ShortRead (0)
simpleSingleCell (47)
SingleCelLExperiment (1)
singleCellTK (1)
SingscoreAMLMutations (15)
sitmo (1)
sjPlot (1)
sjstats (1)
slickR (1)
slider (1)
sm (1)
smoothHR (1)
sn (1)
snow (2)
SnowballC (1)
sortable (1)
sp (1)
spacetime (1)
spam (1)
spaMM (1)
sparklyr (1)
SparseM (1)
spatial (1)
spatialreg (1)
spatstat.core (1)
spatstat.data (1)
spatstat.geom (1)
spatstat.sparse (1)
spatstat.utils (1)
spData (1)
splines2 (1)
ssh (1)
statmod (1)
statnet.common (1)
stringdist (1)
stringi (3)
stringr (2)
styler (1)
SummarizedExperiment (1)
survival (3)
survivalROC (1)
survminer (1)
survMisc (1)
svd (1)
svglite (1)
svMisc (1)
sys (1)
systemfit (1)
systemfonts (1)
tables (1)
tarchetypes (1)
targets (1)
TCGAWorkflow (87)
templater (1)
tensorflow (1)
terra (1)
testproj (0)
testthat (2)
textshaping (1)
tfruns (1)
TH.data (1)
tibble (3)
tictoc (1)
tidygraph (1)
tidymodels (1)
tidyposterior (1)
tidyr (3)
tidyselect (3)
tidytree (1)
tidyverse (1)
tidyvpc (1)
timechange (1)
timeDate (1)
timereg (1)
tinytex (2)
TMB (1)
Tplyr (1)
tracee (1)
transformr (1)
treeio (1)
tseries (1)
TSP (1)
tune (1)
tweenr (1)
tximport (0)
tzdb (1)
ucminf (1)
units (1)
urca (1)
usethis (1)
utf8 (1)
uuid (1)
uwot (1)
V8 (1)
VAM (1)
variancePartition (1)
variants (25)
vaultr (1)
vcr (1)
vctrs (3)
vegan (1)
vegawidget (1)
VennDiagram (1)
vioplot (1)
viridis (2)
viridisLite (2)
viridislite (1)
visNetwork (1)
vroom (1)
waldo (1)
webdriver (1)
webfakes (1)
webmockr (1)
webshot (2)
WeightIt (1)
weights (1)
WGCNA (1)
whisker (1)
withr (2)
wk (1)
workflows (1)
workflowsets (1)
writexl (1)
xaringan (1)
xaringanthemer (1)
xcms (0)
xfun (3)
xgboost (1)
XLConnect (1)
XML (2)
xml2 (1)
xpose (1)
xtable (1)
xts (1)
XVector (1)
yaImpute (1)
yaml (2)
yardstick (1)
ymlthis (1)
yulab.utils (1)
zip (2)
zoo (1)