Download stats for Bioconductor Software packagesDownload stats for Bioconductor experiment packages

Download stats for Bioconductor annotation packages

This page was generated on 2014-07-21 15:35:03 -0700 (Mon, 21 Jul 2014).

This page monitors Bioconductor annotation package downloads from http://bioconductor.org/ over the last 12 months. The number reported next to each package name is the number of distinct IPs that “hit” the package over the last 12 months.


Top 30

1org.Hs.eg.db (31652)
2GO.db (23942)
3KEGG.db (13279)
4org.Mm.eg.db (12254)
5hgu95av2.db (10776)
6hgu133plus2.db (8393)
7BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (8076)
8hgu133plus2cdf (6599)
9hgu133a.db (6353)
10TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene (6299)
11org.Sc.sgd.db (5372)
12hgu95av2cdf (4943)
13PFAM.db (4803)
14BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3 (4614)
15BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 (4584)
16hgu133acdf (4399)
17BSgenome.Ecoli.NCBI.20080805 (3610)
18org.Rn.eg.db (3564)
19IlluminaHumanMethylation450k.db (3517)
20reactome.db (3228)
21IlluminaHumanMethylation450kmanifest (3162)
22DO.db (3035)
23mouse4302cdf (2779)
24org.Dm.eg.db (2738)
25HuExExonProbesetLocation (2730)
26hgu133plus2probe (2527)
27hgu133a2.db (2526)
28org.At.tair.db (2477)
29lumiHumanAll.db (2472)
30BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9 (2398)

All annotation packages

MonthNb of distinct IPsNb of downloads
Aug/2013767595025
Sep/2013843380614
Oct/2013888782465
Nov/2013848987905
Dec/2013860188378
Jan/2014949380965
Feb/20141093377672
Mar/201412589102703
Apr/201414232109004
May/201412281111122
Jun/201413928117232
Jul/2014959587817
All months856761120902

A

adme16cod (8)
adme16cod.db (831)
ag (5)
ag.db (847)
agahomology (5)
agcdf (819)
agprobe (805)
anopheles.db0 (767)
arabidopsis.db0 (845)
atgenomeatrefseq (1)
atgenomeatrefseqcdf (1)
atgenomeatrefseqprobe (1)
atgenomeattair (1)
atgenomeattaircdf (1)
atgenomeattairprobe (1)
ath1121501 (13)
ath1121501.db (1617)
ath1121501cdf (1938)
ath1121501probe (1191)
ath1atrefseq (1)
ath1attair (1)
athhomology (6)

B

barley1cdf (760)
barley1probe (750)
bovine.db (809)
bovine.db0 (708)
bovinecdf (871)
bovineprobe (758)
BSgenome.Alyrata.JGI.v1 (684)
BSgenome.Amellifera.BeeBase.assembly4 (719)
BSgenome.Amellifera.UCSC.apiMel2 (683)
BSgenome.Amellifera.UCSC.apiMel2.masked (156)
BSgenome.Athaliana.TAIR.01222004 (17)
BSgenome.Athaliana.TAIR.04232008 (715)
BSgenome.Athaliana.TAIR.TAIR9 (1032)
BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau3 (702)
bsgenome.btaurus.ucsc.bostau3 (1)
BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau3.masked (156)
BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau4 (638)
BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau4.masked (157)
BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6 (577)
BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6.masked (146)
BSgenome.Celegans.UCSC.ce10 (709)
BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 (4584)
BSgenome.Celegans.UCSC.ce6 (605)
BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam2 (625)
BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam2.masked (126)
BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam3 (539)
BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam3.masked (146)
BSgenome.Dmelanogaster.FlyBase.r51 (4)
BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 (629)
BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2.masked (153)
BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3 (4614)
BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3.masked (175)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer5 (610)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer5.masked (148)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer6 (569)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer6.masked (156)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7 (1438)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7.masked (134)
BSgenome.Ecoli.NCBI.20080805 (3610)
BSgenome.Gaculeatus.UCSC.gasAcu1 (551)
BSgenome.Gaculeatus.UCSC.gasAcu1.masked (144)
BSgenome.Ggallus.UCSC.galGa%2520l4 (1)
BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal3 (596)
BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal3.masked (139)
BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal4 (588)
BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal4.masked (142)
BSgenome.Hsapiens.NCBI.b36v3 (3)
BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38 (265)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 (665)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17.masked (150)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 (2081)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.masked (178)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (8076)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked (254)
BSgenome.Mfuro.UCSC.musFur1 (9)
BSgenome.Mmulatta.UCSC.rheMac2 (569)
BSgenome.Mmulatta.UCSC.rheMac2.masked (143)
BSgenome.Mmulatta.UCSC.rheMac3 (322)
BSgenome.Mmulatta.UCSC.rheMac3.masked (134)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 (1357)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked (162)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm8 (624)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm8.masked (151)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9 (2398)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked (163)
BSgenome.Osativa.MSU.MSU7 (327)
BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro2 (493)
BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro2.masked (123)
BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro3 (470)
BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro3.masked (125)
BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn4 (597)
BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn4.masked (133)
BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn5 (562)
BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn5.masked (139)
BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 (617)
BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer2 (1887)
BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3 (1169)
BSgenome.Sscrofa.UCSC.susScr3 (143)
BSgenome.Sscrofa.UCSC.susScr3.masked (135)
BSgenome.Tgondii.ToxoDB.7.0 (486)
BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1 (133)
BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1.masked (133)
bsubtiliscdf (482)
bsubtilisprobe (479)
btahomology (2)
btbovinebtense (2)
btbovinebtrefseqprobe (1)

C

canine.db (498)
canine.db0 (457)
canine2 (1)
canine2.db (509)
canine2cdf (557)
canine2probe (513)
caninecdf (517)
canineprobe (472)
celegans (4)
celegans.db (625)
celeganscdf (598)
celegansprobe (512)
celhomology (1)
cfahomology (1)
cfcanine2cfense (1)
cfcanine2cfensg (1)
cfcanine2cfenst7probe (1)
cfcanine2cfentrezgcdf (1)
cfcanine2cfug (1)
chicken (1)
chicken.db (513)
chicken.db0 (481)
chickencdf (540)
chickenprobe (514)
chimp.db0 (448)
cinhomology (1)
citruscdf (458)
citrusprobe (450)
cMAP (1675)
cottoncdf (483)
cottonprobe (450)
cyp450cdf (458)

D

dmdrosophila2dmrefseq (1)
dmdrosophila2dmug (3)
dmehomology (1)
dmgenome1dmense (1)
dmgenome1dmenst (2)
DO.db (3035)
domainsignatures (1)
drehomology (1)
drosgenome1 (1)
drosgenome1.db (547)
drosgenome1cdf (580)
drosgenome1probe (475)
drosophila2 (2)
drosophila2.db (840)
drosophila2cdf (979)
drosophila2probe (1072)
drzebrafishdrugprobe (1)

E

ecoli2.db (504)
ecoli2cdf (562)
ecoli2probe (474)
ecoliasv2cdf (515)
ecoliasv2probe (464)
ecolicdf (652)
ecolik12.db0 (1)
ecoliK12.db0 (499)
ecoliprobe (427)
ecoliSakai.db0 (450)
egohomology (1)

F

FDb.FANTOM4.promoters.hg19 (421)
FDb.InfiniumMethylation.hg18 (442)
FDb.InfiniumMethylation.hg19 (1255)
FDb.UCSC.snp135common.hg19 (441)
FDb.UCSC.snp137common.hg19 (436)
FDb.UCSC.tRNAs (560)
fly.db0 (484)

G

gahgu133a (2)
gahgu133a.db (514)
gahgu133acdf (423)
gahgu133aprobe (482)
gahgu133b (2)
gahgu133b.db (416)
gahgu133bcdf (391)
gahgu133bprobe (443)
gahgu133plus2 (2)
gahgu133plus2.db (546)
gahgu133plus2cdf (569)
gahgu133plus2probe (514)
gahgu95av2 (2)
gahgu95av2.db (498)
gahgu95av2cdf (431)
gahgu95av2probe (460)
gahgu95b (2)
gahgu95b.db (431)
gahgu95bcdf (395)
gahgu95bprobe (479)
gahgu95c (3)
gahgu95c.db (434)
gahgu95ccdf (371)
gahgu95cprobe (454)
gahgu95d (2)
gahgu95d.db (441)
gahgu95dcdf (407)
gahgu95dprobe (477)
gahgu95e (2)
gahgu95e.db (446)
gahgu95ecdf (393)
gahgu95eprobe (461)
genomewidesnp5Crlmm (609)
genomewidesnp5crlmm (1)
genomewidesnp6Crlmm (895)
ggahomology (1)
GGHumanMethCancerPanelv1.db (483)
gmahomology (2)
GO (23)
GO.db (23942)
gp53cdf (438)

H

h10kcod (1)
h10kcod.db (470)
h20kcod (1)
h20kcod.db (470)
hapmap370k (489)
hcg110 (2)
hcg110.db (452)
hcg110cdf (468)
hcg110probe (461)
hgfocus (2)
hgfocus.db (1053)
hgfocuscdf (855)
hgfocusprobe (535)
hgu133a (26)
hgu133a.db (6353)
hgu133a2 (2)
hgu133a2.db (2526)
hgu133a2cdf (1617)
hgu133a2frmavecs (358)
hgu133a2probe (889)
hgu133acdf (4399)
hgu133afrmavecs (723)
hgu133aprobe (1574)
hgu133atagcdf (877)
hgu133atagprobe (518)
hgu133b (7)
hgu133b.db (1083)
hgu133bcdf (1606)
hgu133bprobe (631)
hgu133plus2 (24)
hgu133plus2.db (8393)
hgu133plus2cdf (6599)
hgu133plus2frmavecs (945)
hgu133plus2probe (2527)
hgu219.db (647)
hgu219cdf (601)
hgu219probe (531)
hgu95a (2)
hgu95a.db (1019)
hgu95acdf (1913)
hgu95aprobe (599)
hgu95av2 (1901)
hgu95av2.db (10776)
hgu95av2cdf (4943)
hgu95av2probe (2059)
hgu95b (1)
hgu95b.db (544)
hgu95bcdf (545)
hgu95bprobe (478)
hgu95c (1)
hgu95c.db (523)
hgu95ccdf (508)
hgu95cprobe (474)
hgu95d (1)
hgu95d.db (513)
hgu95dcdf (500)
hgu95dprobe (478)
hgu95e (1)
hgu95e.db (522)
hgu95ecdf (478)
hgu95eprobe (465)
hguatlas13k (1)
hguatlas13k.db (449)
hgubeta7 (2)
hgubeta7.db (448)
hguDKFZ31 (1)
hguDKFZ31.db (464)
hgug4100a (1)
hgug4100a.db (519)
hgug4101a (1)
hgug4101a.db (477)
hgug4110b (2)
hgug4110b.db (487)
hgug4111a (1)
hgug4111a.db (487)
hgug4112a (1)
hgug4112a.db (1290)
hgug4845a.db (465)
hguqiagenv3 (1)
hguqiagenv3.db (453)
hi16cod (1)
hi16cod.db (425)
hivprtplus2cdf (434)
hom.At.inp.db (429)
hom.Ce.inp.db (437)
hom.Dm.inp.db (471)
hom.Dr.inp.db (432)
hom.Hs.inp.db (1388)
hom.Mm.inp.db (595)
hom.Rn.inp.db (498)
hom.Sc.inp.db (472)
Homo.sapiens (1364)
hs133ahsensecdf (1)
hs133ahsensgcdf (6)
hs133ahsentrezg (2)
hs133ahsentrezgcdf (1)
hs133ahsug (1)
hs133ahsugcdf (2)
hs133ahsugprobe (2)
hs133aptentrezgcdf (1)
hs133aptentrezgprobe (3)
hs133bptense (1)
hs133bptenstprobe (2)
hs133bptrefseqprobe (1)
hs133phsentrezg (2)
hs133phsentrezgcdf (3)
hs133phsugcdf (1)
hs133pptrefseq (1)
hs25kresogen.db (457)
Hs6UG171.db (466)
hs95av2hsenstcdf (1)
hs95av2hsentrezgcdf (1)
hs95av2ptenst (5)
HsAgilentDesign026652.db (516)
hsahomology (8)
hsfocushsentrezgcdf (3)
hsfocusptense (3)
hsfocusptensg (1)
hthgu133a.db (883)
hthgu133acdf (1180)
hthgu133afrmavecs (470)
hthgu133aprobe (545)
hthgu133b.db (510)
hthgu133bcdf (495)
hthgu133bprobe (452)
hthgu133pluspmcdf (710)
hthgu133pluspmprobe (540)
htmg430acdf (512)
htmg430aprobe (454)
htmg430bcdf (457)
htmg430bprobe (421)
htmg430pmcdf (558)
htmg430pmprobe (486)
htrat230pmcdf (467)
htrat230pmprobe (435)
htratfocuscdf (464)
htratfocusprobe (441)
hu35ksuba (1)
hu35ksuba.db (477)
hu35ksubacdf (431)
hu35ksubaprobe (458)
hu35ksubb (1)
hu35ksubb.db (460)
hu35ksubbcdf (453)
hu35ksubbprobe (459)
hu35ksubc (1)
hu35ksubc.db (473)
hu35ksubccdf (439)
hu35ksubcprobe (450)
hu35ksubd (1)
hu35ksubd.db (475)
hu35ksubdcdf (467)
hu35ksubdprobe (434)
hu6800 (3)
hu6800.db (1505)
hu6800cdf (822)
hu6800probe (680)
hu6800subacdf (434)
hu6800subbcdf (415)
hu6800subccdf (428)
hu6800subdcdf (431)
huex.1.0.st.v2frmavecs (434)
huex10stprobeset.db (124)
huex10sttranscriptcluster.db (142)
HuExExonProbesetLocation (2730)
HuExExonProbesetLocationHg18 (453)
huexexonprobesetlocationhg19 (1)
HuExExonProbesetLocationHg19 (550)
hugene.1.0.st.v1frmavecs (469)
hugene10st.db (3)
hugene10stprobeset.db (1044)
hugene10sttranscriptcluster.db (1789)
hugene10stv1.r3cdf (10)
hugene10stv1cdf (1936)
hugene10stv1probe (967)
hugene11stprobeset.db (544)
hugene11sttranscriptcluster.db (637)
hugene20stprobeset.db (481)
hugene20sttranscriptcluster.db (609)
hugene21stprobeset.db (434)
hugene21sttranscriptcluster.db (473)
human.db0 (1178)
human1mduov3bCrlmm (382)
human1mv1cCrlmm (396)
human370quadv3cCrlmm (367)
human370v1ccrlmm (1)
human370v1cCrlmm (518)
human550v3bCrlmm (370)
human610quadv1bCrlmm (463)
human650v3aCrlmm (349)
human660quadv1aCrlmm (341)
humanCHRLOC (685)
humancytosnp12v2p1hCrlmm (346)
humanLLMappings (5)
humanomni1quadv1bCrlmm (375)
humanomni258v1aCrlmm (37)
humanomni258v1p1bCrlmm (45)
humanomni25quadv1bCrlmm (354)
humanomni5quadv1bCrlmm (277)
humanomniexpress12v1bCrlmm (359)
HuO22 (1)
HuO22.db (461)
hvuhomology (1)
hwgcod (2)
hwgcod.db (463)

I

illuminaHumanDASLBeadID.db (6)
IlluminaHumanMethylation27k.db (1114)
IlluminaHumanMethylation27kmanifest (441)
IlluminaHumanMethylation450k.db (3517)
IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 (1430)
IlluminaHumanMethylation450kannotation.ilmn.v1.2 (443)
IlluminaHumanMethylation450kmanifest (3162)
IlluminaHumanMethylation450kprobe (555)
illuminaHumanv1 (1)
illuminaHumanv1.db (1203)
illuminaHumanv1BeadID.db (9)
illuminaHumanv1ProbeID.db (2)
illuminaHumanv2 (6)
illuminaHumanv2.db (1034)
illuminaHumanv2BeadID.db (511)
illuminaHumanv2ProbeID.db (2)
illuminaHumanv3.db (1552)
illuminaHumanv3BeadID.db (18)
illuminaHumanv3ProbeID.db (4)
illuminaHumanv4.db (1301)
illuminaHumanv4BeadID.db (5)
illuminaHumanWGDASLv3.db (482)
illuminaHumanWGDASLv4.db (512)
illuminaMousev1 (1)
illuminaMousev1.db (606)
illuminaMousev1BeadID.db (8)
illuminaMousev1p1.db (468)
illuminaMousev1p1BeadID.db (6)
illuminaMousev1p1ProbeID.db (1)
illuminaMousev1ProbeID.db (1)
illuminaMousev2.db (913)
illuminaMousev2BeadID.db (14)
illuminaMousev2ProbeID.db (1)
illuminaRatv1.db (585)
illuminaratv1.db (1)
illuminaRatv1BeadID.db (10)
illuminaRatv1ProbeID.db (1)
indac (1)
indac.db (479)
IRanges (1)

J

JazaeriMetaData (1)
JazaeriMetaData.db (450)

K

KEGG (10)
KEGG.db (13279)
KEGGprofile (1)
klahomology (1)

L

LAPOINTE.db (425)
lumihumanall.db (1)
lumiHumanAll.db (2472)
lumiHumanIDMapping (1323)
lumiHumanIDMapping.db (2)
lumiHumanV1 (4)
lumiHumanV2 (4)
lumiMouseAll.db (947)
lumiMouseIDMapping (799)
lumiRatAll.db (617)
lumiRatIDMapping (611)
lumiRatV1 (1)

M

m10kcod (1)
m10kcod.db (437)
m20kcod (1)
m20kcod.db (443)
MafDb.ALL.wgs.phase1.release.v3.20101123 (83)
MafDb.ESP6500SI.V2.SSA137.dbSNP138 (82)
maizecdf (481)
maizeprobe (426)
malaria.db0 (445)
Masks.Dmelanogaster.UCSC.dm3 (4)
medicagocdf (425)
medicagoprobe (437)
MeSH.AOR.db (451)
MeSH.db (457)
MeSH.PCR.db (466)
mgrhomology (1)
mgu74a (1)
mgu74a.db (525)
mgu74acdf (529)
mgu74aprobe (456)
mgu74av2 (2)
mgu74av2.db (800)
mgu74av2cdf (785)
mgu74av2probe (516)
mgu74b (1)
mgu74b.db (475)
mgu74bcdf (445)
mgu74bprobe (444)
mgu74bv2 (1)
mgu74bv2.db (490)
mgu74bv2cdf (492)
mgu74bv2probe (460)
mgu74c (1)
mgu74c.db (478)
mgu74ccdf (457)
mgu74cprobe (438)
mgu74cv2 (1)
mgu74cv2.db (506)
mgu74cv2cdf (496)
mgu74cv2probe (435)
mguatlas5k (1)
mguatlas5k.db (518)
mgug4104a (1)
mgug4104a.db (535)
mgug4120a (1)
mgug4120a.db (432)
mgug4121a (1)
mgug4121a.db (481)
mgug4122a (3)
mgug4122a.db (648)
mi16cod (1)
mi16cod.db (415)
mirbase.db (1099)
mirna102xgaincdf (547)
mirna10cdf (599)
mirna10probe (475)
mirna20cdf (823)
mm11ksubbmmense (1)
mm11ksubbmmenseprobe (1)
mm24kresogen.db (439)
mm430a2mmense (1)
mm430a2mmenseprobe (1)
mm430a2mmenst (1)
mm430a2mmentrezgprobe (1)
mm430a2mmvegat (2)
mm430bmmensg (1)
mm430bmmugprobe (1)
mm430mmentrezgcdf (3)
mm430mmug (1)
mm74av1mmentrezgcdf (4)
mm74av1mmentrezgprobe (9)
mm74av2mmenst (1)
mm74av2mmug (1)
mm74bv2mmug (1)
mm74bv2mmvegae (1)
mm74bv2mmvegaecdf (1)
mm74cv2mmensgcdf (1)
MmAgilentDesign026655.db (529)
mmuhomology (2)
moe430a (2)
moe430a.db (737)
moe430acdf (745)
moe430aprobe (498)
moe430b (1)
moe430b.db (517)
moe430bcdf (527)
moe430bprobe (463)
moex10stprobeset.db (111)
moex10sttranscriptcluster.db (120)
MoExExonProbesetLocation (570)
mogene.1.0.st.v1frmavecs (281)
mogene10st.db (2)
mogene10stprobeset.db (736)
mogene10sttranscriptcluster.db (1166)
mogene10stv1.r3cdf (2)
mogene10stv1cdf (1278)
mogene10stv1probe (656)
mogene11stprobeset.db (451)
mogene11sttranscriptcluster.db (512)
mogene20stprobeset.db (460)
mogene20sttranscriptcluster.db (644)
mogene21stprobeset.db (331)
mogene21sttranscriptcluster.db (429)
mouse.db0 (623)
mouse4302 (2)
mouse4302.db (2347)
mouse4302cdf (2779)
mouse4302frmavecs (489)
mouse4302probe (1004)
mouse430a2 (3)
mouse430a2.db (887)
mouse430a2cdf (882)
mouse430a2frmavecs (364)
mouse430a2probe (585)
mouseCHRLOC (373)
mouseLLMappings (1)
mpedbarray (1)
mpedbarray.db (436)
mu11ksuba (1)
mu11ksuba.db (467)
mu11ksubacdf (448)
mu11ksubaprobe (417)
mu11ksubb (1)
mu11ksubb.db (472)
mu11ksubbcdf (482)
mu11ksubbprobe (432)
Mu15v1 (1)
Mu15v1.db (458)
mu19ksuba (1)
mu19ksuba.db (422)
mu19ksubacdf (415)
mu19ksubb (1)
mu19ksubb.db (409)
mu19ksubbcdf (434)
mu19ksubc (1)
mu19ksubc.db (461)
mu19ksubccdf (447)
Mu22v3 (1)
Mu22v3.db (436)
mu6500subacdf (396)
mu6500subbcdf (405)
mu6500subccdf (400)
mu6500subdcdf (411)
Mus.musculus (588)
mwgcod (2)
mwgcod.db (472)

N

ncrhomology (1)
Norway981 (1)
Norway981.db (428)
norway981.db (1)
nugohs1a520180.db (472)
nugohs1a520180cdf (451)
nugohs1a520180probe (448)
nugomm1a520177.db (456)
nugomm1a520177cdf (448)
nugomm1a520177probe (461)

O

oligodata (1)
oligoData (888)
omyhomology (1)
OperonHumanV3 (1)
OperonHumanV3.db (439)
org.Ag.eg.db (683)
org.At.tair.db (2477)
org.Bt.eg.db (1609)
org.bt.eg.db (1)
org.Ce.eg.db (1634)
org.Cf.eg.db (1501)
org.Dm.eg.db (2738)
org.Dr.eg.db (1621)
org.EcK12.eg.db (881)
org.EcSakai.eg.db (592)
org.Gg.eg.db (1477)
org.Hs.eg.db (31652)
org.Hs.ipi.db (537)
org.MeSH.Aca.db (444)
org.MeSH.Aga.PEST.db (101)
org.MeSH.Ame.db (103)
org.MeSH.Aml.db (109)
org.MeSH.Ana.db (116)
org.MeSH.Ani.FGSC.db (107)
org.MeSH.Ath.db (108)
org.MeSH.Atu.K84.db (468)
org.MeSH.Bfl.db (108)
org.MeSH.Bsu.168.db (461)
org.MeSH.Bsu.Bsn5.db (117)
org.MeSH.Bsu.RONN1.db (104)
org.MeSH.Bsu.TUB10.db (112)
org.MeSH.Bsu.W23.db (109)
org.MeSH.Bta.db (121)
org.MeSH.Cal.SC5314.db (119)
org.MeSH.Cbr.db (121)
org.MeSH.Cel.db (113)
org.MeSH.Cfa.db (120)
org.MeSH.Cin.db (107)
org.MeSH.Cja.db (106)
org.MeSH.Cpo.db (109)
org.MeSH.Cre.db (114)
org.MeSH.Dan.db (105)
org.MeSH.Dda.3937.db (109)
org.MeSH.Ddi.AX4.db (122)
org.MeSH.Der.db (112)
org.MeSH.Dgr.db (103)
org.MeSH.Dme.db (124)
org.MeSH.Dmo.db (111)
org.MeSH.Dpe.db (116)
org.MeSH.Dre.db (128)
org.MeSH.Dse.db (120)
org.MeSH.Dsi.db (115)
org.MeSH.Dvi.db (124)
org.MeSH.Dya.db (121)
org.MeSH.Eco.536.db (104)
org.MeSH.Eco.55989.db (118)
org.MeSH.Eco.APEC01.db (109)
org.MeSH.Eco.B.REL606.db (122)
org.MeSH.Eco.BW2952.db (106)
org.MeSH.Eco.CFT073.db (101)
org.MeSH.Eco.E24377A.db (100)
org.MeSH.Eco.ED1a.db (128)
org.MeSH.Eco.HS.db (118)
org.MeSH.Eco.IAI1.db (105)
org.MeSH.Eco.IAI39.db (116)
org.MeSH.Eco.K12.DH10B.db (93)
org.MeSH.Eco.K12.MG1655.db (108)
org.MeSH.Eco.KO11FL.db (122)
org.MeSH.Eco.O103.H2.12009.db (108)
org.MeSH.Eco.O111.H.11128.db (108)
org.MeSH.Eco.O127.H6.E2348.69.db (110)
org.MeSH.Eco.O157.H7.EC4115.db (106)
org.MeSH.Eco.O157.H7.EDL933.db (123)
org.MeSH.Eco.O157.H7.Sakai.db (110)
org.MeSH.Eco.O157.H7.TW14359.db (111)
org.MeSH.Eco.O26.H11.11368.db (112)
org.MeSH.Eco.O26.H7.CB9615.db (109)
org.MeSH.Eco.S88.db (106)
org.MeSH.Eco.SE11.db (105)
org.MeSH.Eco.SMS35.db (105)
org.MeSH.Eco.UMN026.db (120)
org.MeSH.Eco.UTI89.db (130)
org.MeSH.Eqc.db (119)
org.MeSH.Gga.db (113)
org.MeSH.Gma.db (113)
org.MeSH.Hsa.db (457)
org.MeSH.Laf.db (116)
org.MeSH.Lma.db (108)
org.MeSH.Mdo.db (111)
org.MeSH.Mes.db (101)
org.MeSH.Mga.db (109)
org.MeSH.Miy.db (134)
org.MeSH.Mml.db (124)
org.MeSH.Mmu.db (120)
org.MeSH.Mtr.db (100)
org.MeSH.Nle.db (104)
org.MeSH.Oan.db (121)
org.MeSH.Ocu.db (109)
org.MeSH.Oni.db (105)
org.MeSH.Osa.db (117)
org.MeSH.Pab.db (115)
org.MeSH.Pae.LESB58.db (127)
org.MeSH.Pae.PA14.db (120)
org.MeSH.Pae.PA7.db (113)
org.MeSH.Pae.PAO1.db (102)
org.MeSH.Pfa.3D7.db (111)
org.MeSH.Pto.db (109)
org.MeSH.Ptr.db (116)
org.MeSH.Rno.db (107)
org.MeSH.Sau.COL.db (109)
org.MeSH.Sau.ED98.db (111)
org.MeSH.Sau.M013.db (113)
org.MeSH.Sau.MRSA252.db (115)
org.MeSH.Sau.MSHR1132.db (113)
org.MeSH.Sau.MSSA476.db (113)
org.MeSH.Sau.Mu3.db (109)
org.MeSH.Sau.Mu50.db (115)
org.MeSH.Sau.MW2.db (121)
org.MeSH.Sau.N315.db (89)
org.MeSH.Sau.Newman.db (86)
org.MeSH.Sau.RF122.db (112)
org.MeSH.Sau.USA300FPR3757.db (101)
org.MeSH.Sau.USA300TCH1516.db (107)
org.MeSH.Sau.VC40.db (115)
org.MeSH.Sce.S288c.db (107)
org.MeSH.Sco.A32.db (99)
org.MeSH.Sil.db (114)
org.MeSH.Spo.972h.db (108)
org.MeSH.Spu.db (127)
org.MeSH.Ssc.db (111)
org.MeSH.Syn.db (455)
org.MeSH.Tbr.9274.db (100)
org.MeSH.Tgo.ME49.db (113)
org.MeSH.Tgu.db (96)
org.MeSH.Vvi.db (107)
org.MeSH.Xla.db (129)
org.MeSH.Xtr.db (124)
org.MeSH.Zma.db (116)
org.Mm.eg.db (12254)
org.Mmu.eg.db (778)
org.Pf.plasmo.db (691)
org.Pt.eg.db (696)
org.Rn.eg.db (3564)
org.Rn.sp.db (2)
org.Sc.sgd.db (5372)
org.Sco.eg.db (595)
org.Ss.eg.db (849)
org.Tgondii.eg.db (534)
org.Xl.eg.db (704)
osahomology (1)

P

paeg1acdf (517)
paeg1aprobe (422)
PANTHER.db (310)
PartheenMetaData (1)
PartheenMetaData.db (435)
pd.081229.hg18.promoter.medip.hx1 (427)
pd.2006.07.18.hg18.refseq.promoter (473)
pd.2006.07.18.mm8.refseq.promoter (467)
pd.2006.10.31.rn34.refseq.promoter (454)
pd.ag (395)
pd.aragene.1.0.st (448)
pd.aragene.1.1.st (441)
pd.ath1.121501 (468)
pd.barley1 (390)
pd.bovgene.1.0.st (393)
pd.bovgene.1.1.st (396)
pd.bovine (414)
pd.bsubtilis (429)
pd.cangene.1.0.st (385)
pd.cangene.1.1.st (420)
pd.canine (427)
pd.canine.2 (422)
pd.celegans (390)
pd.charm.hg18.example (486)
pd.chicken (433)
pd.citrus (407)
pd.cotton (425)
pd.cyngene.1.0.st (377)
pd.cyngene.1.1.st (381)
pd.cyrgene.1.0.st (393)
pd.cyrgene.1.1.st (424)
pd.cytogenetics.array (436)
pd.drosgenome1 (405)
pd.drosophila.2 (415)
pd.e.coli.2 (435)
pd.ecoli (413)
pd.ecoli.asv2 (411)
pd.equgene.1.0.st (437)
pd.equgene.1.1.st (402)
pd.feinberg.hg18.me.hx1 (465)
pd.feinberg.mm8.me.hx1 (441)
pd.felgene.1.0.st (402)
pd.felgene.1.1.st (402)
pd.genomewidesnp.5 (559)
pd.genomewidesnp.6 (811)
pd.hc.g110 (405)
pd.hg.focus (419)
pd.hg.u133.plus.2 (915)
pd.hg.u133a (634)
pd.hg.u133a.2 (517)
pd.hg.u133a.tag (412)
pd.hg.u133b (435)
pd.hg.u219 (442)
pd.hg.u95a (614)
pd.hg.u95av2 (532)
pd.hg.u95b (410)
pd.hg.u95c (413)
pd.hg.u95d (430)
pd.hg.u95e (435)
pd.hg18.60mer.expr (639)
pd.ht.hg.u133.plus.pm (474)
pd.ht.hg.u133a (487)
pd.ht.mg.430a (403)
pd.hu6800 (397)
pd.huex.1.0.st.v2 (1311)
pd.hugene.1.0.st.v1 (1305)
pd.hugene.1.1.st.v1 (608)
pd.hugene.2.0.st (716)
pd.hugene.2.1.st (496)
pd.maize (409)
pd.mapping250k.nsp (565)
pd.mapping250k.sty (527)
pd.mapping50k.hind240 (543)
pd.mapping50k.xba240 (1605)
pd.medicago (425)
pd.mg.u74a (424)
pd.mg.u74av2 (446)
pd.mg.u74b (414)
pd.mg.u74bv2 (417)
pd.mg.u74c (380)
pd.mg.u74cv2 (389)
pd.mirna.1.0 (444)
pd.mirna.2.0 (402)
pd.mirna.3.0 (565)
pd.mirna.3.1 (384)
pd.moe430a (425)
pd.moe430b (412)
pd.moex.1.0.st.v1 (653)
pd.mogene.1.0.st.v1 (1048)
pd.mogene.1.1.st.v1 (527)
pd.mogene.2.0.st (739)
pd.mogene.2.1.st (425)
pd.mouse430.2 (570)
pd.mouse430a.2 (429)
pd.mu11ksuba (413)
pd.mu11ksubb (390)
pd.nugo.hs1a520180 (121)
pd.nugo.mm1a520177 (115)
pd.ovigene.1.0.st (398)
pd.ovigene.1.1.st (404)
pd.pae.g1a (417)
pd.plasmodium.anopheles (393)
pd.poplar (455)
pd.porcine (417)
pd.porgene.1.0.st (413)
pd.porgene.1.1.st (418)
pd.rae230a (421)
pd.rae230b (429)
pd.raex.1.0.st.v1 (399)
pd.ragene.1.0.st.v1 (469)
pd.ragene.1.1.st.v1 (430)
pd.ragene.2.0.st (397)
pd.ragene.2.1.st (361)
pd.rat230.2 (427)
pd.rcngene.1.1.st (360)
pd.rg.u34a (431)
pd.rg.u34b (420)
pd.rg.u34c (413)
pd.rhegene.1.0.st (384)
pd.rhegene.1.1.st (407)
pd.rhesus (447)
pd.rice (423)
pd.rjpgene.1.1.st (351)
pd.rn.u34 (429)
pd.s.aureus (418)
pd.soybean (417)
pd.soygene.1.1.st (407)
pd.sugar.cane (407)
pd.tomato (422)
pd.u133.x3p (420)
pd.vitis.vinifera (421)
pd.wheat (434)
pd.x.laevis.2 (396)
pd.x.tropicalis (399)
pd.xenopus.laevis (431)
pd.yeast.2 (396)
pd.yg.s98 (419)
pd.zebgene.1.0.st (416)
pd.zebgene.1.1.st (425)
pd.zebrafish (406)
pedbarrayv10.db (423)
pedbarrayv9 (1)
pedbarrayv9.db (413)
pfahomology (1)
PFAM.db (4803)
phastCons100way.UCSC.hg19 (71)
pig.db0 (436)
plasmodiumanophelescdf (488)
plasmodiumanophelesprobe (434)
POCRCannotation.db (430)
PolyPhen.Hsapiens.dbSNP131 (778)
poplarcdf (470)
poplarprobe (435)
porcine.db (503)
porcinecdf (592)
porcineprobe (454)
primeviewcdf (616)
primeviewprobe (484)
ptrhomology (1)

R

r10kcod (1)
r10kcod.db (427)
rae230a (4)
rae230a.db (1393)
rae230acdf (565)
rae230aprobe (1034)
rae230b (2)
rae230b.db (463)
rae230bcdf (451)
rae230bprobe (436)
raex10stprobeset.db (109)
raex10sttranscriptcluster.db (111)
RaExExonProbesetLocation (572)
ragene10stprobeset.db (456)
ragene10sttranscriptcluster.db (606)
ragene10stv1.r3cdf (2)
ragene10stv1cdf (520)
ragene10stv1probe (475)
ragene11stprobeset.db (436)
ragene11sttranscriptcluster.db (429)
ragene20stprobeset.db (352)
ragene20sttranscriptcluster.db (370)
ragene21stprobeset.db (366)
ragene21sttranscriptcluster.db (366)
rat.db0 (504)
rat2302 (2)
rat2302.db (934)
rat2302cdf (1074)
rat2302probe (573)
ratCHRLOC (364)
ratLLMappings (4)
rattoxfxcdf (423)
rattoxfxprobe (395)
Rattus.norvegicus (465)
reactome.db (3228)
rgu34a (1)
rgu34a.db (522)
rgu34acdf (527)
rgu34aprobe (444)
rgu34b (1)
rgu34b.db (463)
rgu34bcdf (451)
rgu34bprobe (413)
rgu34c (1)
rgu34c.db (448)
rgu34ccdf (440)
rgu34cprobe (437)
rguatlas4k (2)
rguatlas4k.db (420)
rgug4105a (1)
rgug4105a.db (438)
rgug4130a (1)
rgug4130a.db (443)
rgug4131a.db (492)
rhesus.db0 (418)
rhesuscdf (493)
rhesusprobe (455)
ri16cod (1)
ri16cod.db (411)
ricecdf (682)
riceprobe (494)
RmiR.Hs.miRNA (1840)
RmiR.hsa (499)
rmir.hsa (1)
rn230arnentrezgcdf (1)
rn230rnentrezgcdf (1)
rn230rnug (1)
rn34arnugcdf (1)
RnAgilentDesign028282.db (468)
rnohomology (3)
rnu34 (1)
rnu34.db (407)
rnu34cdf (425)
rnu34probe (527)
Roberts2005Annotation (1)
Roberts2005Annotation.db (403)
rtu34 (1)
rtu34.db (410)
rtu34cdf (431)
rtu34probe (439)
rwgcod (3)
rwgcod.db (422)

S

saureuscdf (426)
saureusprobe (432)
scehomology (1)
seqnames.db (817)
SHDZ (1)
SHDZ.db (428)
SIFT.Hsapiens.dbSNP132 (594)
SIFT.Hsapiens.dbSNP137 (192)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20071016 (24)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20080617 (10)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506 (519)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427 (1390)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109 (797)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20110815 (540)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20111119 (479)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608 (925)
soybeancdf (511)
soybeanprobe (450)
spohomology (1)
sschomology (1)
sugarcanecdf (379)
sugarcaneprobe (408)

T

taehomology (1)
targetscan.Hs.eg.db (730)
targetscan.Mm.eg.db (573)
test1cdf (395)
test2cdf (412)
test3cdf (480)
test3probe (388)
tomatocdf (458)
tomatoprobe (437)
TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart10 (454)
TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart12 (463)
TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart14 (387)
TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart16 (619)
TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart19 (320)
TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart21 (119)
TxDb.Celegans.UCSC.ce6.ensGene (455)
TxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm3.ensGene (1941)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg18.knownGene (926)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene (6299)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.lincRNAsTranscripts (564)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.ensGene (815)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene (803)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene (1254)
TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn4.ensGene (444)
TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn5.refGene (490)
TxDb.Scerevisiae.UCSC.sacCer2.sgdGene (510)
TxDb.Scerevisiae.UCSC.sacCer3.sgdGene (927)

U

u133aaofav2cdf (637)
u133x3p (5)
u133x3p.db (514)
u133x3pcdf (556)
u133x3pprobe (417)

V

vitisviniferacdf (412)
vitisviniferaprobe (416)
vvihomology (1)

W

wheatcdf (507)
wheatprobe (454)
worm.db0 (405)

X

xenopus.db0 (408)
xenopuslaevis (1)
xenopuslaeviscdf (444)
xenopuslaevisprobe (424)
xlaevis.db (433)
xlaevis2cdf (404)
xlaevis2probe (421)
xlahomology (7)
xtrhomology (1)
xtropicaliscdf (433)
xtropicalisprobe (391)

Y

ye6100subacdf (396)
ye6100subbcdf (376)
ye6100subccdf (407)
ye6100subdcdf (402)
YEAST (4)
yeast.db0 (448)
yeast2 (1)
yeast2.db (1036)
yeast2cdf (820)
yeast2probe (630)
ygs98 (2)
ygs98.db (543)
ygs98cdf (618)
ygs98frmavecs (342)
ygs98probe (456)

Z

zebrafish (1)
zebrafish.db (538)
zebrafish.db0 (418)
zebrafishcdf (542)
zebrafishprobe (481)
zmahomology (3)