Download stats for Bioconductor Software packagesDownload stats for Bioconductor annotation packages

Download stats for Bioconductor experiment packages

This page was generated on 2016-02-10 05:04:53 -0800 (Wed, 10 Feb 2016).

This page monitors Bioconductor experiment package downloads from http://bioconductor.org/ over the last 12 months. The number reported next to each package name is the number of distinct IPs that “hit” the package over the last 12 months.


Top 15

1ALL (11416)
2affydata (5150)
3geneLenDataBase (4904)
4pasilla (4764)
5airway (4459)
6golubEsets (3399)
7msdata (2371)
8SpikeInSubset (2322)
9bladderbatch (2239)
10faahKO (2165)
11parathyroidSE (2098)
12minfiData (1855)
13COPDSexualDimorphism.data (1799)
14pasillaBamSubset (1796)
15gageData (1753)

All experiment packages

MonthNb of distinct IPsNb of downloads
Mar/2015597444025
Apr/2015720734531
May/2015620922866
Jun/2015615325586
Jul/2015494520660
Aug/2015448721136
Sep/2015522122367
Oct/2015556329497
Nov/2015640531699
Dec/2015612330886
Jan/2016425420350
Feb/201600
All months46622303603

A

ABAData (186)
affy (8)
affycompData (437)
affycoretools (1)
affydata (5150)
Affyhgu133A2Expr (302)
Affyhgu133aExpr (328)
Affyhgu133Plus2Expr (321)
affyio (8)
AffymetrixDataTestFiles (706)
Affymoe4302Expr (285)
Affymoe430Expr (4)
affyPLM (3)
AIMS (1)
airway (4459)
ALL (11416)
ALLMLL (1074)
AmpAffyExample (480)
annotate (10)
AnnotationDbi (6)
AnnotationForge (1)
antiProfilesData (392)
arrayQualityMetrics (1)
ARRmData (942)
AshkenazimSonChr21 (43)

B

ballgown (1)
bcellViper (347)
beadarrayExampleData (578)
BeadArrayUseCases (583)
beta7 (461)
Biobase (23)
BiocInstaller (2)
BiocParallel (2)
biomaRt (1)
Biostrings (15)
biovizBase (4)
bladderbatch (2239)
blimaTestingData (227)
breastCancerMAINZ (581)
breastCancerNKI (719)
breastCancerTRANSBIG (460)
breastCancerUNT (423)
breastCancerUPP (450)
breastCancerVDX (1177)
bronchialIL13 (286)
BSgenome (5)
bsseqData (469)
bumphunter (1)

C

CAMERA (3)
cancerdata (308)
CardinalWorkflows (146)
Category (2)
CCl4 (488)
ccTutorial (269)
ceu1kg (236)
ceu1kgv (194)
ceuhm3 (241)
cgdv17 (555)
ChAMPdata (1713)
charmData (314)
cheung2010 (264)
chimera (1)
ChimpHumanBrainData (188)
ChIPComp (1)
chipenrich (1)
chipenrich.data (959)
ChIPQC (1)
chipseq (1)
ChIPseqR (1)
ChIPsim (1)
ChIPXpressData (766)
chopsticks (1)
chroGPS (1)
chromDraw (1)
ChromHeatMap (1)
cisPath (1)
cleanUpdTSeq (1)
cleaver (1)
clippda (1)
clipper (1)
CLL (1488)
Clomial (1)
Clonality (1)
clonotypeR (1)
clst (2)
clstutils (2)
clusterStab (1)
CMA (1)
cMap2data (1476)
cn.farms (1)
cn.mops (1)
CNAnorm (1)
CNEr (1)
CNORdt (1)
CNORfeeder (1)
CNORfuzzy (1)
CNORode (1)
CNPBayes (1)
CNTools (1)
cnvGSA (1)
cnvGSAdata (214)
CNVPanelizer (1)
CNVrd2 (1)
CNVtools (1)
cobindR (1)
CoCiteStats (1)
codelink (1)
CODEX (1)
CoGAPS (1)
cogena (1)
coGPS (1)
COHCAP (1)
COHCAPanno (1004)
colonCA (412)
coMET (1)
COMPASS (1)
compcodeR (1)
CompGO (1)
ComplexHeatmap (1)
ConnectivityMap (267)
ConsensusClusterPlus (1)
conumee (1)
convert (1)
copa (1)
COPDSexualDimorphism.data (1799)
CopyhelpeR (564)
copynumber (1)
CopyNumber450k (1)
CopyNumber450kData (318)
CopywriteR (1)
CoRegNet (1)
Cormotif (1)
CorMut (1)
coRNAi (1)
CORREP (1)
COSMIC.67 (280)
cosmiq (1)
COSNet (1)
cpvSNP (1)
cqn (1)
CRCL18 (124)
CRImage (1)
crlmm (1)
csaw (1)
CSSP (1)
ctc (1)
cummeRbund (4)
curatedBladderData (244)
curatedBreastData (121)
curatedCRCData (247)
curatedOvarianData (571)
customProDB (1)
cycle (1)
cytofkit (1)

D

dagLogo (1)
daMA (1)
DAPAR (1)
DART (1)
DASiR (1)
DAVIDQuery (1)
davidTiling (272)
DBChIP (1)
ddCt (1)
ddgraph (1)
DECIPHER (1)
DeconRNASeq (1)
DEDS (1)
deepSNV (1)
DEGraph (1)
DEGseq (2)
derfinderData (270)
DESeq (7)
DESeq2 (3)
DeSousa2013 (1054)
destiny (1)
dexus (1)
DFP (1)
DiffBind (2)
diffGeneAnalysis (1)
diffHic (1)
DiffLogo (1)
diggit (1)
diggitdata (134)
DirichletMultinomial (1)
dks (1)
DLBCL (551)
DmelSGI (98)
DMRcaller (1)
DMRcatedata (1161)
DMRforPairs (1)
DNABarcodes (1)
DNAcopy (1)
domainsignatures (1)
DonaPLLP2013 (179)
DOQTL (1)
DREAM4 (202)
dressCheck (214)
DriverNet (1)
DrugVsDisease (1)
DrugVsDiseasedata (906)
dsQTL (251)
DSS (1)
DTA (1)
dualKS (1)
DupChecker (1)
DvDdata (167)
dyebias (1)
dyebiasexamples (235)
DynDoc (1)

E

EasyqpcR (1)
EatonEtAlChIPseq (362)
EBarrays (1)
EBcoexpress (1)
EBImage (1)
EBSeq (1)
EBSeqHMM (1)
ecoliLeucine (412)
ecolitk (1)
EDDA (1)
edge (1)
edgeR (9)
eisa (1)
ELBOW (1)
ELMER (1)
ELMER.data (220)
EMDomics (1)
ENCODEFig4Band4D (22)
encoDnaseI (234)
EnrichedHeatmap (1)
ensemblVEP (1)
ENVISIONQuery (1)
epigenomix (1)
erccdashboard (1)
erma (1)
estrogen (1281)
eudysbiome (1)
ExiMiR (1)
exomeCopy (1)
explorase (1)
ExpressionView (1)

F

faahKO (2165)
fabia (1)
fabiaData (211)
facopy.annot (756)
facsDorit (326)
factDesign (1)
FANTOM3and4CAGE (233)
farms (1)
fastseg (1)
fCI (1)
fdrame (1)
FEM (1)
ffpe (1)
ffpeExampleData (240)
FGNet (1)
fibroEset (1122)
FindMyFriends (1)
FIs (5)
FISHalyseR (1)
fission (1611)
flagme (2)
Fletcher2013a (233)
Fletcher2013b (237)
flipflop (1)
flowBeads (1)
flowBin (1)
flowcatchR (1)
flowCHIC (1)
flowCL (1)
flowClean (1)
flowClust (1)
flowCore (3)
flowCyBar (1)
flowDensity (1)
flowFit (1)
flowFitExampleData (167)
flowFP (1)
flowMap (1)
flowMatch (1)
flowMeans (1)
flowMerge (1)
flowPeaks (1)
flowPlots (1)
flowQB (1)
FlowRepositoryR (1)
FlowSOM (1)
FlowSorted.Blood.450k (826)
FlowSorted.DLPFC.450k (182)
flowStats (1)
flowTrans (1)
flowType (1)
flowUtils (1)
flowViz (1)
flowVS (1)
flowWorkspace (3)
flowWorkspaceData (427)
fmcsR (1)
focalCall (1)
FourCSeq (1)
FRGEpistasis (1)
frma (1)
frmaExampleData (350)
frmaTools (1)
FunciSNP (1)
FunciSNP.data (1028)
furrowSeg (3)

G

gaga (1)
gage (1)
gageData (1753)
gaggle (1)
gaia (1)
gaschYHS (248)
gatingMLData (247)
gaucho (1)
gcatest (1)
gCMAP (1)
gCMAPWeb (1)
gcrma (7)
gcspikelite (900)
gdsfmt (1)
geecc (1)
genArise (1)
GENE.E (1)
GeneAnswers (1)
GeneBreak (1)
GeneExpressionSignature (1)
genefilter (10)
genefu (1)
geneLenDataBase (4904)
GeneMeta (1)
GeneNetworkBuilder (1)
GeneOverlap (1)
geneplotter (6)
geneRecommender (1)
GeneRegionScan (1)
geneRxCluster (1)
GeneSelectMMD (1)
GeneSelector (1)
GENESIS (1)
geNetClassifier (1)
GeneticsDesign (1)
GeneticsPed (1)
genoCN (1)
genomationData (271)
GenomeGraphs (1)
genomeIntervals (1)
GenomicAlignments (6)
GenomicFeatures (4)
GenomicFeatures.Hsapiens.UCSC.hg18 (15)
GenomicFeatures.Mmusculus.UCSC.mm9 (10)
GenomicRanges (9)
GenomicTuples (1)
Genominator (1)
genoset (2)
genotypeeval (1)
GenoView (1)
GEOmetadb (1)
GEOquery (4)
GEOsubmission (1)
gespeR (1)
geuvPack (631)
geuvStore (128)
GEWIST (1)
GGBase (1)
ggbio (1)
GGdata (433)
ggtut (226)
globaltest (1)
golubEsets (3399)
GOSemSim (1)
GOstats (3)
graph (8)
grndata (542)
GSBenchMark (141)
GSEABase (3)
gskb (134)
GSVAdata (574)
Gviz (2)
GWASdata (547)

H

h5vcData (862)
hapmap100khind (212)
hapmap100kxba (354)
hapmap500knsp (217)
hapmap500ksty (207)
hapmapsnp5 (273)
hapmapsnp6 (455)
harbChIP (422)
HD2013SGI (215)
healthyFlowData (203)
HEEBOdata (263)
hgu133abarcodevecs (161)
hgu133afrmavecs (26)
hgu133plus2barcodevecs (170)
hgu133plus2frmavecs (27)
hgu2beta7 (216)
HiCDataHumanIMR90 (256)
HiCDataLymphoblast (220)
Hiiragi2013 (269)
HIVcDNAvantWout03 (148)
hmyriB36 (243)
HSMMSingleCell (1504)
humanStemCell (521)

I

Illumina450ProbeVariants.db (1732)
IlluminaDataTestFiles (446)
IlluminaHumanMethylation450kmanifest (27)
illuminaio (2)
impute (7)
ind1KG (235)
interactiveDisplayBase (2)
iontreeData (178)
IRanges (25)
ITALICSData (846)
Iyer517 (188)

J

JASPAR2014 (675)
JASPAR2016 (6)

K

KEGGandMetacoreDzPathwaysGEO (224)
KEGGdzPathwaysGEO (964)
KEGGgraph (2)
keggorthology (1)
KEGGprofile (1)
KEGGREST (1)
kidpack (389)

L

leeBamViews (1151)
leukemiasEset (919)
LiebermanAidenHiC2009 (240)
limma (13)
ListerEtAlBSseq (180)
lumi (2)
lumiBarnes (363)
LungCancerACvsSCCGEO (802)
LungCancerLines (286)
lungExpression (344)
lymphoma (6)

M

MafDb.ALL.wgs.phase1.release.v3.20101123 (20)
MafDb.ESP6500SI.V2.SSA137.dbSNP138 (22)
MAIT (1)
mammaPrintData (222)
mAPKLData (102)
maqcExpression4plex (356)
MAQCsubset (251)
MAQCsubsetAFX (252)
MAQCsubsetILM (193)
MEALData (42)
MEDIPSData (405)
MEEBOdata (218)
Metab (1)
metaMS (1)
metaMSdata (238)
methyAnalysis (1)
MethylAidData (97)
MethylMix (2)
methylumi (3)
minfi (3)
minfiData (1855)
minionSummaryData (46)
miRcompData (120)
miRNATarget (243)
mitoODEdata (674)
MMDiffBamSubset (227)
mosaicsExample (236)
mouse4302barcodevecs (139)
mouse4302frmavecs (13)
MSBdata (132)
msd16s (202)
msdata (2371)
MSnbase (1)
mtbls2 (41)
MUGAExampleData (788)
Mulder2012 (208)
multtest (2)
mvoutData (246)
mzID (1)
mzR (3)

N

ncdfFlow (1)
NCIgraphData (211)
Neve2006 (250)
NGScopyData (175)
NOISeq (1)

O

oligoClasses (2)
OmicCircos (3)
OrganismDbi (1)

P

parathyroid (159)
parathyroidSE (2098)
pasilla (4764)
pasillaBamSubset (1796)
PathNetData (197)
pcaGoPromoter.Hs.hg19 (223)
pcaGoPromoter.Mm.mm9 (220)
pcaGoPromoter.Rn.rn4 (219)
pcaMethods (1)
PCHiCdata (7)
pd.atdschip.tiling (226)
pepDat (135)
PGPC (5)
phastCons100way.UCSC.hg19 (27)
ppiData (1002)
prebsdata (193)
PREDAsampledata (232)
preprocessCore (26)
ProData (325)
pRolocdata (1276)
ProtGenerics (4)
pumadata (310)
PWMEnrich.Dmelanogaster.background (280)
PWMEnrich.Hsapiens.background (331)
PWMEnrich.Mmusculus.background (233)

Q

QDNAseq.hg19 (39)
QDNAseq.mm10 (27)
qvalue (1)

R

RBGL (8)
rcellminerData (282)
ReportingTools (3)
rfcdmin (44)
RforProteomics (1008)
Rgraphviz (5)
rhdf5 (3)
rheumaticConditionWOLLBOLD (233)
RIPSeekerData (239)
RMassBankData (275)
RNAinteractMAPK (214)
RNAseqData.HeLa.bam.chr14 (31)
RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14 (1228)
RNASeqDataSubset (29)
RnaSeqSampleSizeData (452)
RnaSeqTutorial (1047)
RnBeads (1)
RnBeads.hg19 (726)
RnBeads.hg38 (43)
RnBeads.mm10 (131)
RnBeads.mm9 (141)
RnBeads.rn5 (118)
ROC (3)
RRBSdata (167)
rRDPData (168)
Rsamtools (10)
rsbml (1)
RTCGA.clinical (68)
RTCGA.mutations (51)
RTCGA.rnaseq (65)
rtracklayer (11)
RUVnormalizeData (1612)

S

S4Vectors (38)
SCLCBam (125)
seq2pathway.data (505)
seqc (381)
seqCNA.annot (752)
serumStimulation (181)
seventyGeneData (204)
shinyMethylData (256)
ShortRead (2)
siggenes (2)
sigPathway (1)
simpIntLists (769)
simpleaffy (6)
SNAData (235)
SNAGEEdata (786)
SNPhoodData (40)
SomatiCAData (150)
SomaticCancerAlterations (476)
SPIA (1)
SpikeIn (934)
SpikeInSubset (2322)
stemHypoxia (850)
stjudem (247)
SummarizedExperiment (2)
survcomp (1)
sva (1)
SVM2CRMdata (385)
synapterdata (530)
systemPipeRdata (79)

T

TargetScoreData (199)
TargetSearchData (240)
TBX20BamSubset (170)
TCGAcrcmiRNA (138)
TCGAcrcmRNA (201)
TCGAMethylation450k (346)
TimerQuant (23)
tinesath1cdf (160)
tinesath1probe (165)
topGO (1)
tweeDEseqCountData (586)

V

VariantAnnotation (7)
vsn (4)

W

wateRmelon (1)
waveTilingData (218)
WES.1KG.WUGSC (243)

X

xcms (2)
XhybCasneuf (169)
XVector (14)

Y

yeastCC (1208)
yeastExpData (838)
yeastGSData (140)
yeastNagalakshmi (383)
yeastRNASeq (1143)
yri1kgv (226)
yriMulti (2)

Z

zebrafishRNASeq (1018)
zlibbioc (32)