Download stats for Bioconductor annotation packagesDownload stats for Bioconductor experiment packages

Download stats for Bioconductor Software packages

This page was generated on 2014-07-23 08:35:01 -0700 (Wed, 23 Jul 2014).

This page monitors Bioconductor Software package downloads from http://bioconductor.org/ over the last 12 months. The number reported next to each package name is the number of distinct IPs that “hit” the package over the last 12 months. Core packages (i.e. the BiocInstaller package + packages that get installed the first time biocLite() is called with no arguments) are reported in bold.


Top 50

1BiocInstaller (122982)
2BiocGenerics (93977)
3IRanges (91975)
4Biobase (91129)
5AnnotationDbi (77826)
6limma (58468)
7zlibbioc (55724)
8Biostrings (52252)
9GenomicRanges (49061)
10annotate (45064)
11genefilter (40956)
12Rsamtools (40025)
13biomaRt (39088)
14XVector (37679)
15rtracklayer (37095)
16affy (36892)
17graph (35974)
18preprocessCore (35739)
19GenomicFeatures (35165)
20affyio (33077)
21BSgenome (32672)
22geneplotter (25913)
23multtest (25616)
24edgeR (24586)
25DESeq (22111)
26RBGL (21181)
27GenomeInfoDb (21072)
28flowCore (20599)
29Rgraphviz (19457)
30impute (19322)
31mzR (18240)
32xcms (18239)
33GEOquery (17666)
34biovizBase (17345)
35gcrma (17160)
36VariantAnnotation (15927)
37ShortRead (14930)
38vsn (14293)
39DESeq2 (13915)
40qvalue (13698)
41AnnotationForge (13381)
42affyPLM (13073)
43Gviz (12820)
44GSEABase (12607)
45cummeRbund (11835)
46simpleaffy (11718)
47BiocParallel (11639)
48Category (11444)
49GOstats (10808)
50marray (10638)

All Software packages

MonthNb of distinct IPsNb of downloads
Aug/201318067688596
Sep/2013242021083196
Oct/2013312871041153
Nov/201329406853692
Dec/201328510807082
Jan/201429690725608
Feb/201428993573612
Mar/201434634886794
Apr/201439965777391
May/201438374830827
Jun/201436391728039
Jul/201427290448989
All months2389569444979

A

a4 (2241)
a4Base (2308)
a4Classif (2187)
a4Core (2330)
a4Preproc (2304)
a4Reporting (2113)
ABarray (2095)
ABSSeq (574)
aCGH (2855)
ACME (2068)
ADaCGH2 (1933)
adSplit (1917)
AdvancedR (2)
AdvancedR2011 (8)
AdvancedR2011Data (8)
affxparser (9986)
affy (36892)
affycomp (3019)
AffyCompatible (2217)
affyContam (1975)
affycoretools (4910)
affydata (1)
AffyExpress (2254)
affyILM (1910)
affyio (33077)
affylmGUI (3200)
affyPara (1933)
affypdnn (2300)
affyPLM (13073)
affyQCReport (6390)
affyqcreport (3)
AffyRNADegradation (1920)
AffyTiling (2064)
AGDEX (1807)
Agi4x44PreProcess (1862)
agilp (2118)
agimicrorna (1)
AgiMicroRna (2367)
AllelicImbalance (1333)
alsace (542)
altcdfenvs (1998)
ampliQueso (1300)
annaffy (9707)
AnnBuilder (29)
annmap (899)
annotate (45064)
annotation (273)
AnnotationDbi (77826)
AnnotationForge (13381)
AnnotationFuncs (1999)
AnnotationHub (2878)
annotationTools (2291)
anota (1915)
antiProfiles (1692)
apcluster (1)
apComplex (2050)
aroma.light (5145)
ArrayExpress (4468)
ArrayExpressHTS (1039)
arrayMagic (6)
arrayMvout (1859)
arraymvout (1)
arrayQCplot (4)
arrayQuality (2647)
arrayQualityMetrics (4692)
arrays (433)
ArrayTools (2282)
ArrayTV (1370)
ARRmNormalization (1598)
ASEB (1706)
asmn (599)
ASSET (1185)
ASSIGN (550)
AtlasRDF (567)
attract (1825)

B

BAC (1744)
BADER (1451)
BAGS (1272)
ballgown (4)
BaseSpaceR (1636)
Basic4Cseq (564)
BasicASE (1)
BayesPeak (2721)
baySeq (4041)
bcellViper (3)
BCRANK (2107)
beadarray (6219)
beadarraySNP (2027)
BeadDataPackR (5666)
beaddatapackr (1)
BeadExplorer (5)
BEAT (570)
betr (1944)
bgafun (1867)
BGmix (917)
bgx (1815)
BHC (2253)
BicARE (1827)
BiGGR (1311)
bigmemoryExtras (966)
bioassayR (1467)
Biobase (91129)
biobase (1)
BiocCaseStudies (1890)
BiocCheck (655)
biocDatasets (30)
BiocGenerics (93977)
biocGraph (2041)
BiocInstaller (122982)
biocinstaller (1)
BiocParallel (11639)
BiocStyle (2761)
biocViews (2316)
bioDist (4415)
biomaRt (39088)
BioMVCClass (2011)
biomvRCNS (1445)
BioNet (2978)
BioSeqClass (1906)
Biostrings (52252)
biostrings (1)
biosvd (570)
biovizbase (1)
biovizBase (17345)
BiRewire (1240)
birta (1747)
BiSeq (2031)
BitSeq (2223)
blima (80)
blimaTestingData (3)
BRAIN (2015)
BrainStars (1724)
bridge (1821)
BSgenome (32672)
bsseq (2127)
BufferedMatrix (1699)
bufferedmatrix (1)
BufferedMatrixMethods (1631)
bumphunter (6458)
BUS (1612)
BuxcoR (21)

C

CAFE (505)
CAGEr (1655)
CALIB (1592)
CAMERA (2841)
cancerclass (1555)
CancerMutationAnalysis (1623)
casper (1523)
Category (11444)
categoryCompare (1637)
ccrepe (572)
cellGrowth (1542)
cellhts (1)
cellHTS (1683)
cellHTS2 (2510)
CellNOptR (1887)
CexoR (1145)
CGEN (1743)
CGHbase (2153)
CGHcall (1996)
cghcall (1)
cghMCR (1706)
CGHnormaliter (1613)
CGHregions (1683)
ChAMP (1993)
ChAMPdata (3)
charm (1857)
ChemmineOB (1482)
ChemmineR (2988)
chemminer (3)
chimera (2229)
chipenrich (1163)
chipenrich.data (3)
ChIPpeakAnno (4296)
ChIPQC (583)
ChIPseeker (658)
chipseq (3509)
ChIPseqR (1832)
ChIPsim (1753)
ChIPXpress (764)
chopsticks (1999)
chroGPS (1505)
ChromHeatMap (1751)
cisPath (1484)
cleanUpdTSeq (1161)
cleaver (1441)
clippda (1559)
clipper (1660)
Clomial (501)
Clonality (1588)
clonotypeR (1143)
clst (1569)
clstutils (1529)
clusterProfiler (2914)
clusterprofiler (2)
clusterStab (1863)
CMA (2337)
cn.farms (1588)
cn.mops (2547)
cnanorm (1)
CNAnorm (1741)
CNEr (609)
CNORdt (1482)
CNORfeeder (1414)
CNORfuzzy (1489)
CNORode (1492)
CNTools (1850)
cnvGSA (1543)
CNVrd2 (1063)
CNVtools (1792)
cnvtools (1)
cobindR (1139)
CoCiteStats (1715)
codelink (1687)
CoGAPS (423)
coGPS (1477)
COHCAP (606)
COHCAPanno (3)
COMPASS (527)
compcodeR (608)
CompGO (524)
ConsensusClusterPlus (2675)
convert (2833)
copa (1769)
COPDSexualDimorphism (488)
COPDSexualDimorphism.data (1)
copynumber (1634)
CopyNumber450k (531)
CopyNumber450kData (3)
Cormotif (1486)
CorMut (1543)
coRNAi (1540)
CORREP (1609)
cosmiq (43)
cosmo (201)
cosmoGUI (233)
CoverageView (311)
cqn (2264)
CRImage (1833)
CRISPRseek (575)
crlmm (3094)
CSAR (1971)
CSSP (1152)
ctc (3854)
cummeRbund (11835)
CummeRbund (1)
customProDB (1237)
cycle (1706)

D

dagLogo (1080)
dama (2)
daMA (1527)
DART (1578)
DASiR (1569)
DAVIDQuery (2168)
DBChIP (1559)
ddCt (2065)
ddgraph (1561)
DECIPHER (1717)
DeconRNASeq (1546)
DEDS (1671)
deepSNV (1710)
DEGraph (1799)
DEGreport (39)
DEGseq (3511)
deltaGseg (1387)
DESeq (22111)
DESeq2 (13915)
DEXSeq (6915)
dexus (1529)
DFP (1536)
DiffBind (3428)
diffGeneAnalysis (1747)
DirichletMultinomial (1615)
dks (1493)
DMRcate (566)
DMRcatedata (3)
DMRforPairs (509)
DNAcopy (9284)
DNaseR (1195)
domainsignatures (1646)
DOQTL (24)
DOSE (3137)
DriverNet (1453)
DrugVsDisease (1484)
DSS (1719)
DTA (1505)
dualKS (1085)
DupChecker (41)
dyebias (1532)
DynDoc (8336)
dyndoc (1)

E

EasyqpcR (1641)
easyRNASeq (4150)
EBarrays (2118)
EBcoexpress (1649)
EBImage (7212)
EBSeq (2690)
ecolitk (1614)
EDASeq (2506)
edd (68)
EDDA (525)
edger (1)
edgeR (24586)
eiR (750)
eisa (1996)
ELBOW (522)
ensemblVEP (2087)
ENVISIONQuery (1555)
epigenomix (1425)
epivizr (1158)
eQTL (19)
Evomics2012 (1)
Evomics2012Data (1)
ExiMiR (1606)
exomeCopy (2091)
exomePeak (1167)
exonmap (127)
explorase (1312)
ExpressionView (1644)
expressionview (1)
externalVector (565)

F

fabia (2093)
factDesign (1832)
farms (1760)
fastLiquidAssociation (507)
fastseg (1605)
fbat (25)
fdrame (1676)
ffpe (1520)
FGNet (1259)
flagme (1642)
Fletcher2013a (3)
flipflop (1090)
flowBeads (1152)
flowBin (547)
flowCL (506)
flowClean (33)
flowClust (2485)
flowCore (20599)
flowCyBar (511)
flowDensity (40)
flowFit (1127)
flowFlowJo (1689)
flowFP (1770)
flowMap (1127)
flowMatch (518)
flowMeans (1968)
flowMerge (1814)
flowPeaks (1556)
flowPhyto (1510)
flowPlots (1596)
flowQ (1170)
flowq (1)
flowQB (1442)
flowStats (2488)
flowTrack (1)
flowTrans (1668)
flowType (1716)
flowUtils (1861)
flowViz (4514)
flowworkspace (1)
flowWorkspace (2924)
fmcsR (1930)
fOptions (1)
FRGEpistasis (497)
frma (2599)
frmaTools (1777)
FunciSNP (1698)

G

gaga (1665)
gage (3713)
gaggle (1559)
gaia (1537)
gaucho (494)
gCMAP (1482)
gCMAPWeb (1367)
gcrma (17160)
genArise (1534)
GENE.E (1620)
gene2pathway (286)
GeneAnswers (3464)
GeneExpressionSignature (1628)
genefilter (40956)
genefu (2036)
GeneGA (873)
GeneGroupAnalysis (535)
GeneMeta (2035)
GeneNetworkBuilder (1516)
GeneOverlap (589)
geneplotter (25913)
GeneR (84)
geneRecommender (1778)
GeneRegionScan (1544)
generegulation (108)
GeneRfold (34)
geneRxCluster (559)
GeneSelectMMD (1572)
GeneSelector (1859)
GeneSpring (22)
geNetClassifier (1413)
GeneticsBase (37)
GeneticsDesign (1655)
GeneticsPed (1792)
GeneTraffic (61)
GeneTS (2)
genoCN (1565)
genomationData (3)
GenomeGraphs (3625)
genomeinfodb (1)
GenomeInfoDb (21072)
genomeIntervals (4178)
genomes (1795)
GenomicAlignments (10523)
GenomicFeatures (35165)
genomicfeatures (1)
GenomicFiles (550)
GenomicRanges (49061)
Genominator (2048)
genoset (2401)
GEOmetadb (2637)
GEOquery (17666)
GEOsubmission (1550)
GEWIST (1462)
gff3Plotter (4)
GGBase (3086)
ggbio (10019)
GGtools (2409)
girafe (1888)
GLAD (2320)
GlobalAncova (1963)
globaltest (3801)
gmapR (980)
GOexpress (1)
gofunction (1)
GOFunction (1858)
goProfiles (2012)
goprofiles (2)
GOSemSim (3893)
gosemsim (1)
goseq (4076)
GOSim (1611)
GOstats (10808)
GOTHiC (596)
goTools (2237)
gpls (2305)
gprege (1491)
graph (35974)
GraphAlignment (1552)
GraphAT (1568)
graphite (2539)
GraphPAC (1386)
GRENITS (1610)
GSAR (58)
GSBenchMark (4)
GSCA (478)
GSEABase (12607)
GSEAlm (2136)
GSRI (1532)
GSVA (2260)
Gviz (12820)
gwascat (1705)
GWASTools (2745)

H

h5vc (1252)
hapFabia (1469)
harshlight (1)
Harshlight (1591)
HCsnip (1328)
HDTD (55)
healthyFlowData (3)
Heatplus (5701)
HELP (1572)
HEM (1506)
hem (1)
hexbin (201)
hiAnnotator (55)
highthroughputassays (36)
HilbertVis (2918)
hilbertvis (1)
HilbertVisGUI (1448)
HiTC (1654)
HMMcopy (1635)
hopach (2804)
hpar (1572)
HSMMSingleCell (3)
HTqPCR (2493)
HTSanalyzeR (2009)
HTSandGeneCentricLabs (1)
HTSeqGenie (429)
htseqtools (2)
htSeqTools (1869)
HTSFilter (1636)
HybridMTest (1477)
hyperdraw (1675)
hypergraph (2177)

I

iASeq (1705)
iBBiG (1547)
ibh (1428)
iBMQ (1260)
Icens (3150)
iChip (1520)
iClusterPlus (574)
idiogram (1610)
IdMappingAnalysis (1449)
IdMappingRetrieval (1465)
iFlow (437)
Illumina450ProbeVariants.db (3)
illuminaio (7977)
imageHTS (1616)
impute (19322)
INPower (484)
inSilicoDb (2147)
inSilicoMerging (1994)
intansv (1226)
interactiveDisplay (1592)
IntermediateSequenceAnalysis2013 (78)
inveRsion (1469)
inversion (1)
iontree (1467)
iPAC (1517)
IPPD (1647)
IRanges (91975)
iranges (1)
iSeq (1530)
isobar (1860)
IsoGeneGUI (1541)
iSPlot (1)
ITALICS (1491)
iterativeBMA (1535)
iterativeBMAsurv (1527)

J

jmosaics (1365)
joda (1444)

K

KCsmart (1525)
KEGGgraph (5945)
keggorth (8)
keggorthology (1766)
KEGGprofile (1829)
KEGGREST (5239)
KEGGSOAP (1003)

L

lapmix (1657)
LBE (1839)
les (1520)
limma (58468)
limmaGUI (2929)
LiquidAssociation (1519)
liquidassociation (1)
lmdme (1454)
LMGene (1842)
logicFS (1956)
logitt (1)
logitT (1562)
lol (1525)
LPE (2002)
LPEadj (1474)
lpNet (1411)
lumi (8357)
LVSmiRNA (1601)

M

maanova (2262)
macat (1521)
maCorrPlot (1466)
maDB (623)
madb (1)
made4 (3748)
maigesPack (1528)
makecdfenv (3082)
makePlatformDesign (30)
MANOR (1527)
manta (1528)
MantelCorr (1479)
maPredictDSC (1111)
marray (10638)
maSigPro (2503)
maskBAD (1419)
MassArray (1641)
massiR (499)
MassSpecWavelet (2969)
matchBox (1450)
matchprobes (126)
MBCB (1533)
mBPCR (1503)
mcaGUI (1521)
MCRestimate (1731)
mdqc (1714)
MeasurementError.cor (1433)
MEDIPS (2268)
MEDME (1512)
MergeMaid (2233)
MeSH.AOR.db (3)
MeSH.db (3)
MeSH.PCR.db (3)
MeSHDbi (521)
meshr (494)
messina (497)
metaArray (2144)
metagenomeSeq (2012)
metahdep (1477)
metaMS (512)
metaMSdata (3)
metaR (53)
metaSeq (1092)
metaseqR (494)
methVisual (1626)
methyAnalysis (2078)
MethylAid (39)
methylMnM (1137)
methylPipe (4)
MethylSeekR (1556)
methylumi (7559)
Mfuzz (3337)
mfuzz (1)
mgsa (1699)
MiChip (1476)
microRNA (2335)
MIMOSA (515)
MineICA (1384)
minet (3375)
minfi (8253)
MinimumDistance (1462)
MiPP (1545)
MiRaGE (1457)
miRNApath (1785)
Mirsynergy (503)
mitoODE (1052)
MLInterfaces (2711)
MLP (1572)
MLSeq (523)
MMDiff (1416)
mmnet (576)
MmPalateMiRNA (1585)
monocle (107)
MoPS (45)
mosaics (1783)
MotifDb (2710)
motifRG (1582)
motifStack (2374)
MotIV (2762)
MSIseqData (3)
msmsEDA (1097)
msmsTests (1070)
MSnbase (2810)
msQC (48)
MSstats (1350)
MUGAExampleData (3)
Mulcom (1502)
multiscan (1444)
multtest (25616)
MVCClass (1515)
mzID (1363)
mzR (18240)

N

NarrowPeaks (1515)
ncdfFlow (2599)
NCIgraph (1828)
neaGUI (1160)
nem (1589)
netbiov (1)
NetPathMiner (503)
netresponse (1503)
NetSAM (1209)
networkBMA (1415)
nnNorm (1466)
NOISeq (2699)
nondetects (504)
NormqPCR (1787)
npGSEA (515)
NTW (1474)
nucleR (1590)
nudge (1471)
NuPoP (1512)

O

occugene (1588)
OCplus (1696)
oligo (8988)
oligoClasses (9756)
OLIN (1609)
OLINgui (1499)
omicade4 (1205)
OmicCircos (1529)
oneChannelGUI (2306)
ontoCAT (1645)
ontoTools (49)
openCyto (1068)
oposSOM (19)
OrderedList (2310)
org.MeSH.Aca.db (3)
org.MeSH.Atu.K84.db (3)
org.MeSH.Bsu.168.db (3)
org.MeSH.Hsa.db (3)
org.MeSH.Syn.db (3)
OrganismDbi (2614)
OSAT (1403)
OTUbase (1611)
OutlierD (1675)

P

PADOG (1461)
paircompviz (1110)
pairseqsim (6)
pamr (49)
PAnnBuilder (1704)
panp (1741)
PANR (1487)
PAPi (1381)
parody (1876)
pathifier (1150)
PathNet (1377)
pathRender (1631)
pathview (4329)
PatientGeneSets (100)
Pbase (8)
pcaGoPromoter (1778)
pcaMethods (5848)
pcot2 (1495)
PCpheno (1486)
pdInfoBuilder (2323)
pdmclass (1636)
PECA (621)
pepDat (4)
PGSEA (2153)
pgUtils (749)
phenoDist (1305)
phenoTest (1639)
PhenStat (564)
phyloseq (3779)
piano (2192)
pickgene (1483)
PICS (2224)
PING (1580)
pint (1509)
pkgDepTools (1751)
pkgdeptools (2)
plateCore (1508)
plethy (1081)
plgem (1520)
plier (2854)
PLPE (1613)
plrs (1346)
plw (1469)
Polyfit (13)
ppiStats (1621)
prada (3154)
prebs (1352)
PREDA (1526)
predictionet (827)
preprocessCore (35739)
PROcess (2143)
procoil (1433)
ProCoNA (1109)
pRoloc (1422)
pRolocGUI (20)
PROMISE (1501)
prot2D (1093)
proteinProfiles (1282)
PSICQUIC (1189)
puma (1812)
pvac (1510)
pvca (1547)
Pviz (19)
PWMEnrich (1739)
pxr (3)

Q

qcmetrics (1023)
QDNAseq (566)
qpcrNorm (1656)
qpgraph (2577)
qrqc (1937)
QUALIFIER (1081)
quantsmooth (3168)
QuasR (3534)
qusage (1143)
qvalue (13698)

R

r3Cseq (1558)
R453Plus1Toolbox (1624)
rama (1634)
RamiGO (1998)
ramigo (1)
randpack (1)
randPack (1421)
RankProd (3943)
Rariant (498)
RbcBook1 (1654)
RBGL (21181)
rbioinf (1)
RBioinf (1644)
rBiopaxParser (1508)
Rbowtie (3370)
rbsurv (1617)
Rcade (1434)
RCASPAR (1460)
Rchemcpp (1199)
RchyOptimyx (1528)
Rcpi (827)
RCytoscape (3621)
RDAVIDWebService (1598)
Rdbi (43)
RdbiPgSQL (36)
Rdisop (1836)
RDRToolbox (1869)
ReactomePA (2279)
ReadqPCR (1882)
reb (1468)
RedeR (2006)
REDseq (1698)
RefNet (505)
RefNet.db (3)
RefPlus (1541)
Repitools (2640)
ReportingTools (4722)
ReQON (1500)
Resourcerer (1498)
rflowcyt (32)
rfPred (1104)
rGADEM (3130)
RGalaxy (1548)
rgl (1)
Rgraphviz (19457)
RGSEA (39)
rhdf5 (9437)
rHVDM (1475)
riboSeq (20)
Ringo (3106)
Rintact (9)
RIPSeeker (1659)
Risa (1533)
RLMM (1493)
RMAGEML (27)
rmagpie (1)
Rmagpie (1479)
RMAPPER (1456)
RMassBank (1503)
rMAT (893)
RmiR (1807)
RNAinteract (1505)
RNAither (1575)
rnaither (1)
rnaSeqMap (1517)
RNASeqPower (1511)
roar (549)
ROC (4821)
Roleswitch (1120)
RoleswitchData (3)
Rolexa (1645)
rols (1679)
ROntoTools (1416)
RPA (1665)
RpsiXML (1800)
rpx (533)
rqubic (1516)
Rredland (7)
RRHO (1192)
rrp (1)
Rsamtools (40025)
rsbml (1884)
rSFFreader (782)
RSNPper (5)
Rsubread (2395)
RSVSim (1415)
rTANDEM (1688)
RTCA (1537)
RTN (1209)
RTools4TB (29)
RTopper (1487)
rtracklayer (37095)
Rtreemix (1530)
rTRM (1186)
rTRMui (1088)
Ruuid (56)
RUVnormalizeData (4)
RUVSeq (67)
RWebServices (369)
rxSeq (3)

S

S4Vectors (1152)
safe (1702)
SAGElyzer (1)
sagenhaft (1565)
SAGx (1905)
sagx (1)
SamSPECTRAL (1619)
sangerseqR (555)
SANTA (1308)
sapFinder (537)
savR (473)
SBMLR (1592)
SCAN.UPC (1851)
ScISI (1667)
scsR (476)
SeattleIntro2010 (3)
SeattleIntro2011 (3)
SeattleIntro2011Data (3)
SeattleIntro2012 (3)
SeattleIntro2012Data (4)
segmentSeq (1679)
SemSim (22)
SeqArray (1453)
seqbias (1691)
seqCNA (1133)
SeqGSEA (2009)
seqLogo (5474)
Seqnames (31)
SequenceAnalysis (12)
SequenceAnalysisData (113)
SeqVarTools (1157)
shinyMethyl (12)
shinyMethylData (4)
shinyTANDEM (1069)
ShortRead (14930)
sigaR (1517)
SigFuge (1108)
siggenes (10575)
sigPathway (2045)
SIM (1555)
SimBindProfiles (1052)
simpleaffy (11718)
simulatorAPMS (39)
sizepower (1921)
SJava (442)
SLGI (1497)
slgi (1)
SLqPCR (1864)
SMAP (1471)
SNAGEE (1302)
snapCGH (1977)
snm (1675)
SNPchip (3111)
snpMatrix (295)
snpStats (5407)
SomatiCA (1392)
SomaticSignatures (638)
SpacePAC (1067)
spade (2070)
SpeCond (1538)
SPEM (1287)
SPIA (2790)
spikeLI (1436)
spkTools (1451)
splicegear (1468)
spliceR (1479)
spliceSites (1081)
SplicingGraphs (1418)
splots (2536)
spotSegmentation (1462)
SQUADD (1415)
SRAdb (3195)
sRAP (1167)
sscore (1466)
sSeq (1120)
ssize (1903)
SSPA (1706)
ssviz (28)
stam (5)
STAN (1)
staRank (1380)
Starr (1699)
stepNorm (1488)
stepwiseCM (1441)
Streamer (1657)
STRINGdb (1317)
StudentGWAS (7)
supraHex (1136)
survcomp (3106)
Sushi (563)
sva (6153)
SwimR (1039)
synapter (1549)

T

TargetScore (1159)
TargetSearch (1587)
TCC (1650)
TDARACNE (1591)
TEQC (1681)
ternarynet (1402)
TFBSTools (1434)
tigre (1579)
tilingArray (2263)
timecourse (1952)
TitanCNA (498)
tkWidgets (6509)
topGO (6899)
trackViewer (550)
tRanslatome (1228)
TransView (1518)
triform (1373)
trigger (1491)
trio (1294)
triplex (1411)
tspair (1602)
TSSi (1534)
TurboNorm (1548)
tweeDEseq (1879)
twilight (2434)
typeinfo (1)
TypeInfo (1536)

U

UNDO (494)
unifiedWMWqPCR (506)
UniProt.ws (1760)

V

VanillaICE (1793)
VariantAnnotation (15927)
VariantFiltering (592)
variants (166)
VariantTools (961)
vbmp (1836)
Vega (1483)
VegaMC (1488)
viper (509)
virtualArray (2152)
vsn (14293)
vtpnet (1083)

W

wateRmelon (2691)
wavClusteR (52)
waveTiling (1422)
weaver (1919)
webbioc (1550)
widgetTools (6470)

X

xcms (18239)
XDE (1539)
xmapbridge (1446)
xmapcore (424)
XML2R (2)
xps (2209)
xtable (1)
XVector (37679)

Y

yaqcaffy (1778)

Z

zebrafishRNASeq (6)
zlibbioc (55724)